MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012858	CGA	2	6	349292	349297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666810
8002	NC_012858	CCG	2	6	349306	349311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666810
8003	NC_012858	CT	3	6	349315	349320	0 %	50 %	0 %	50 %	241666810
8004	NC_012858	ACC	2	6	349413	349418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666810
8005	NC_012858	AGG	2	6	349438	349443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666810
8006	NC_012858	CTCG	2	8	349504	349511	0 %	25 %	25 %	50 %	241666810
8007	NC_012858	GTT	2	6	349525	349530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666810
8008	NC_012858	TCCGA	2	10	349562	349571	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8009	NC_012858	GGCGG	2	10	349675	349684	0 %	0 %	80 %	20 %	241666811
8010	NC_012858	GC	3	6	349809	349814	0 %	0 %	50 %	50 %	241666811
8011	NC_012858	GTT	2	6	349882	349887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666811
8012	NC_012858	TCA	2	6	349938	349943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666811
8013	NC_012858	GC	3	6	349964	349969	0 %	0 %	50 %	50 %	241666811
8014	NC_012858	GCCG	2	8	350036	350043	0 %	0 %	50 %	50 %	241666811
8015	NC_012858	C	6	6	350196	350201	0 %	0 %	0 %	100 %	241666811
8016	NC_012858	GTC	2	6	350280	350285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8017	NC_012858	ACA	2	6	350289	350294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666811
8018	NC_012858	ATC	2	6	350318	350323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666811
8019	NC_012858	AGC	2	6	350334	350339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8020	NC_012858	TCA	2	6	350523	350528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666811
8021	NC_012858	TCGG	2	8	350607	350614	0 %	25 %	50 %	25 %	241666811
8022	NC_012858	GTCT	2	8	350618	350625	0 %	50 %	25 %	25 %	241666811
8023	NC_012858	GCTT	2	8	350627	350634	0 %	50 %	25 %	25 %	241666811
8024	NC_012858	CACGC	2	10	350645	350654	20 %	0 %	20 %	60 %	241666811
8025	NC_012858	TTC	3	9	350708	350716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666811
8026	NC_012858	CAGA	2	8	350866	350873	50 %	0 %	25 %	25 %	241666811
8027	NC_012858	CCT	2	6	350875	350880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666811
8028	NC_012858	AGC	2	6	350904	350909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8029	NC_012858	TGA	2	6	350935	350940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666811
8030	NC_012858	GCC	2	6	350943	350948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666811
8031	NC_012858	CCG	2	6	350953	350958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666811
8032	NC_012858	TCG	2	6	351000	351005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8033	NC_012858	CCA	2	6	351068	351073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666811
8034	NC_012858	CCTG	2	8	351120	351127	0 %	25 %	25 %	50 %	241666811
8035	NC_012858	CCG	2	6	351183	351188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666811
8036	NC_012858	CAG	2	6	351191	351196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8037	NC_012858	TGC	2	6	351238	351243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666811
8038	NC_012858	GCT	2	6	351281	351286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_012858	AGGG	2	8	351330	351337	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012858	GCC	2	6	351397	351402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_012858	CAT	2	6	351423	351428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_012858	GCC	2	6	351554	351559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_012858	CCG	2	6	351573	351578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_012858	TTG	2	6	351627	351632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666812
8045	NC_012858	TGA	2	6	351733	351738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666812
8046	NC_012858	GTC	2	6	351753	351758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666812
8047	NC_012858	CGC	2	6	351836	351841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666812
8048	NC_012858	CGAG	2	8	351852	351859	25 %	0 %	50 %	25 %	241666812
8049	NC_012858	CGG	2	6	351868	351873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666812
8050	NC_012858	AGC	2	6	351909	351914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666812
8051	NC_012858	TCG	2	6	351945	351950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666812
8052	NC_012858	GCG	2	6	351965	351970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666812
8053	NC_012858	GA	3	6	352008	352013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_012858	TTG	2	6	352241	352246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666813
8055	NC_012858	CG	3	6	352284	352289	0 %	0 %	50 %	50 %	241666813
8056	NC_012858	CCA	2	6	352302	352307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666813
8057	NC_012858	CGAT	2	8	352370	352377	25 %	25 %	25 %	25 %	241666813
8058	NC_012858	GCG	2	6	352497	352502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666813
8059	NC_012858	GAA	2	6	352563	352568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666813
8060	NC_012858	GAAA	2	8	352598	352605	75 %	0 %	25 %	0 %	241666813
8061	NC_012858	AGC	2	6	352652	352657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666813
8062	NC_012858	GTC	2	6	352684	352689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666813
8063	NC_012858	CGA	2	6	352692	352697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666813
8064	NC_012858	CTC	2	6	352725	352730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
8065	NC_012858	CCTC	2	8	352768	352775	0 %	25 %	0 %	75 %	241666814
8066	NC_012858	TGG	2	6	352862	352867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666814
8067	NC_012858	CT	3	6	352897	352902	0 %	50 %	0 %	50 %	241666814
8068	NC_012858	TTCG	2	8	352947	352954	0 %	50 %	25 %	25 %	241666814
8069	NC_012858	CCGG	2	8	352984	352991	0 %	0 %	50 %	50 %	241666814
8070	NC_012858	CTG	2	6	353043	353048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8071	NC_012858	GCAC	2	8	353065	353072	25 %	0 %	25 %	50 %	241666814
8072	NC_012858	GGC	2	6	353086	353091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8073	NC_012858	ATG	2	6	353137	353142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
8074	NC_012858	CTTCT	2	10	353197	353206	0 %	60 %	0 %	40 %	241666814
8075	NC_012858	ATA	2	6	353230	353235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666814
8076	NC_012858	TCC	2	6	353254	353259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
8077	NC_012858	GAA	2	6	353270	353275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666814
8078	NC_012858	CTG	2	6	353277	353282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8079	NC_012858	GCA	3	9	353312	353320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8080	NC_012858	GTT	2	6	353337	353342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666814
8081	NC_012858	CGA	2	6	353382	353387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8082	NC_012858	GCCG	2	8	353397	353404	0 %	0 %	50 %	50 %	241666814
8083	NC_012858	CGG	2	6	353467	353472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8084	NC_012858	CCT	2	6	353475	353480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
8085	NC_012858	GAT	2	6	353499	353504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
8086	NC_012858	GCC	2	6	353526	353531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666814
8087	NC_012858	C	6	6	353530	353535	0 %	0 %	0 %	100 %	241666814
8088	NC_012858	CCA	2	6	353537	353542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666814
8089	NC_012858	TCC	2	6	353557	353562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
8090	NC_012858	CTC	2	6	353569	353574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666814
8091	NC_012858	CGG	2	6	353598	353603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8092	NC_012858	GCC	2	6	353757	353762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666814
8093	NC_012858	GAC	2	6	353763	353768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8094	NC_012858	GC	3	6	353807	353812	0 %	0 %	50 %	50 %	241666814
8095	NC_012858	TCTG	2	8	353828	353835	0 %	50 %	25 %	25 %	241666814
8096	NC_012858	TCGCG	2	10	353837	353846	0 %	20 %	40 %	40 %	241666814
8097	NC_012858	GAT	2	6	353895	353900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666814
8098	NC_012858	TCG	2	6	353938	353943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8099	NC_012858	GTC	2	6	353965	353970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
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8101	NC_012858	CAGC	2	8	354018	354025	25 %	0 %	25 %	50 %	241666814
8102	NC_012858	CGA	2	6	354050	354055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8103	NC_012858	TCT	2	6	354158	354163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666814
8104	NC_012858	CGG	2	6	354164	354169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8105	NC_012858	CGG	2	6	354185	354190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8106	NC_012858	CGA	2	6	354191	354196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8107	NC_012858	CGA	2	6	354230	354235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8108	NC_012858	TCG	2	6	354242	354247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666814
8109	NC_012858	GCG	2	6	354279	354284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666814
8110	NC_012858	CGC	2	6	354285	354290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666814
8111	NC_012858	GC	3	6	354318	354323	0 %	0 %	50 %	50 %	241666814
8112	NC_012858	GA	3	6	354349	354354	50 %	0 %	50 %	0 %	241666814
8113	NC_012858	CAG	2	6	354425	354430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666814
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8118	NC_012858	CAA	2	6	354558	354563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666814
8119	NC_012858	GCAGC	2	10	354568	354577	20 %	0 %	40 %	40 %	241666814
8120	NC_012858	C	6	6	354616	354621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8121	NC_012858	CGT	2	6	354653	354658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_012858	ACT	2	6	354671	354676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_012858	CA	3	6	354686	354691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8124	NC_012858	GCA	2	6	354725	354730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8126	NC_012858	CGA	2	6	354832	354837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8241	NC_012858	GCCGAC	2	12	360424	360435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666818
8242	NC_012858	AC	3	6	360434	360439	50 %	0 %	0 %	50 %	241666818
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8244	NC_012858	GGC	2	6	360595	360600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666818
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8358	NC_012858	GCAA	2	8	365863	365870	50 %	0 %	25 %	25 %	241666822
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8364	NC_012858	CGA	2	6	365999	366004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666822
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8367	NC_012858	CG	4	8	366083	366090	0 %	0 %	50 %	50 %	241666822
8368	NC_012858	CGC	2	6	366178	366183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666823
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8371	NC_012858	GAC	2	6	366239	366244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666823
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8373	NC_012858	GAC	2	6	366284	366289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666823
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8485	NC_012858	CCCAG	2	10	371703	371712	20 %	0 %	20 %	60 %	241666830
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8489	NC_012858	CGG	2	6	371849	371854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666830
8490	NC_012858	CAG	2	6	371865	371870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8491	NC_012858	CT	3	6	371936	371941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8492	NC_012858	CCA	2	6	371966	371971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666831
8493	NC_012858	GCG	2	6	372036	372041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666831
8494	NC_012858	GC	3	6	372066	372071	0 %	0 %	50 %	50 %	241666831
8495	NC_012858	CAG	2	6	372153	372158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666831
8496	NC_012858	CGT	2	6	372174	372179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666831
8497	NC_012858	ATCGGC	2	12	372186	372197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666831
8498	NC_012858	CTC	2	6	372231	372236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666831
8499	NC_012858	CG	3	6	372250	372255	0 %	0 %	50 %	50 %	241666831
8500	NC_012858	GAC	2	6	372273	372278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666831

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