MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012858	ATCG	2	8	212500	212507	25 %	25 %	25 %	25 %	241666691
5002	NC_012858	GCG	2	6	212569	212574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666691
5003	NC_012858	TCG	2	6	212624	212629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666691
5004	NC_012858	AGC	3	9	212642	212650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666691
5005	NC_012858	CGC	2	6	212657	212662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666691
5006	NC_012858	GCG	2	6	212677	212682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666691
5007	NC_012858	GAT	2	6	212722	212727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666691
5008	NC_012858	ATG	2	6	212738	212743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666691
5009	NC_012858	GC	3	6	212765	212770	0 %	0 %	50 %	50 %	241666691
5010	NC_012858	CCT	3	9	212772	212780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666691
5011	NC_012858	CGC	2	6	212800	212805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666691
5012	NC_012858	ATCA	2	8	212906	212913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_012858	TC	3	6	212923	212928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_012858	T	6	6	212940	212945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012858	CCG	3	9	212961	212969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_012858	GAG	2	6	213015	213020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_012858	CAT	2	6	213032	213037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666692
5018	NC_012858	AGC	2	6	213211	213216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666692
5019	NC_012858	AGG	2	6	213226	213231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666692
5020	NC_012858	CCG	2	6	213259	213264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666692
5021	NC_012858	GCT	2	6	213269	213274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666692
5022	NC_012858	CGC	2	6	213352	213357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666692
5023	NC_012858	CGG	2	6	213366	213371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666692
5024	NC_012858	TGCA	2	8	213373	213380	25 %	25 %	25 %	25 %	241666692
5025	NC_012858	TGG	2	6	213414	213419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666692
5026	NC_012858	TCG	2	6	213454	213459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666692
5027	NC_012858	AAAGC	2	10	213501	213510	60 %	0 %	20 %	20 %	241666692
5028	NC_012858	CCT	2	6	213577	213582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666692
5029	NC_012858	CAG	2	6	213618	213623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666692
5030	NC_012858	TGC	2	6	213700	213705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_012858	GCG	2	6	213726	213731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_012858	CTC	2	6	213755	213760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_012858	ACG	2	6	213790	213795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012858	CAT	2	6	213797	213802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_012858	A	6	6	213847	213852	100 %	0 %	0 %	0 %	241666693
5036	NC_012858	GAA	2	6	213871	213876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666693
5037	NC_012858	CATT	2	8	213903	213910	25 %	50 %	0 %	25 %	241666693
5038	NC_012858	ACGAG	2	10	213921	213930	40 %	0 %	40 %	20 %	241666693
5039	NC_012858	CTG	2	6	213950	213955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666693
5040	NC_012858	GCA	2	6	214007	214012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666693
5041	NC_012858	CGT	2	6	214023	214028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666693
5042	NC_012858	CGT	2	6	214109	214114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_012858	A	6	6	214239	214244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_012858	AAG	2	6	214273	214278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012858	GAT	2	6	214283	214288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012858	CTC	2	6	214397	214402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666694
5047	NC_012858	CGC	2	6	214408	214413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666694
5048	NC_012858	GCT	2	6	214414	214419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666694
5049	NC_012858	GTC	2	6	214451	214456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666694
5050	NC_012858	TCG	2	6	214464	214469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666694
5051	NC_012858	CTT	2	6	214510	214515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666694
5052	NC_012858	CCG	2	6	214576	214581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_012858	TCC	2	6	214639	214644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_012858	CCGA	2	8	214691	214698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_012858	GAC	2	6	214715	214720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_012858	TCGGTC	2	12	214816	214827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5057	NC_012858	GCCT	2	8	214841	214848	0 %	25 %	25 %	50 %	241666695
5058	NC_012858	CT	3	6	214847	214852	0 %	50 %	0 %	50 %	241666695
5059	NC_012858	GAC	2	6	214981	214986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5060	NC_012858	GCT	2	6	215075	215080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5061	NC_012858	CGC	2	6	215137	215142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5062	NC_012858	CGA	2	6	215147	215152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5063	NC_012858	GCG	2	6	215218	215223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5064	NC_012858	GAA	2	6	215238	215243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666695
5065	NC_012858	GTC	2	6	215271	215276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5066	NC_012858	CGGG	2	8	215280	215287	0 %	0 %	75 %	25 %	241666695
5067	NC_012858	GCG	2	6	215289	215294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5068	NC_012858	CCG	2	6	215299	215304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5069	NC_012858	GTC	2	6	215334	215339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5070	NC_012858	CTT	2	6	215378	215383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666695
5071	NC_012858	GAT	2	6	215394	215399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666695
5072	NC_012858	GGC	2	6	215406	215411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5073	NC_012858	GAA	2	6	215447	215452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666695
5074	NC_012858	CGA	2	6	215528	215533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5075	NC_012858	TGCCG	2	10	215615	215624	0 %	20 %	40 %	40 %	241666695
5076	NC_012858	CGG	2	6	215639	215644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5077	NC_012858	CGG	2	6	215651	215656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5078	NC_012858	TTC	2	6	215661	215666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666695
5079	NC_012858	GCC	2	6	215769	215774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5080	NC_012858	CAG	2	6	215871	215876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5081	NC_012858	AGC	2	6	215882	215887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5082	NC_012858	CAG	2	6	215892	215897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5083	NC_012858	AGA	2	6	215902	215907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666695
5084	NC_012858	ATCG	2	8	215912	215919	25 %	25 %	25 %	25 %	241666695
5085	NC_012858	CGG	2	6	215930	215935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5086	NC_012858	CAA	2	6	215951	215956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666695
5087	NC_012858	CTG	2	6	215958	215963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5088	NC_012858	AG	3	6	216008	216013	50 %	0 %	50 %	0 %	241666695
5089	NC_012858	GCC	2	6	216048	216053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5090	NC_012858	GCC	2	6	216097	216102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5091	NC_012858	GTC	2	6	216123	216128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5092	NC_012858	GAC	2	6	216156	216161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5093	NC_012858	TGC	2	6	216163	216168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5094	NC_012858	CG	3	6	216171	216176	0 %	0 %	50 %	50 %	241666695
5095	NC_012858	GAG	2	6	216183	216188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666695
5096	NC_012858	TGGC	2	8	216295	216302	0 %	25 %	50 %	25 %	241666695
5097	NC_012858	CGA	2	6	216341	216346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5098	NC_012858	CCG	2	6	216376	216381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5099	NC_012858	ATG	2	6	216423	216428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666695
5100	NC_012858	AGG	2	6	216430	216435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666695
5101	NC_012858	TCT	2	6	216460	216465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666695
5102	NC_012858	TCG	2	6	216670	216675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5103	NC_012858	GTC	2	6	216705	216710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5104	NC_012858	CTA	2	6	216731	216736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666695
5105	NC_012858	GC	3	6	216763	216768	0 %	0 %	50 %	50 %	241666695
5106	NC_012858	GCG	2	6	216784	216789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5107	NC_012858	GTC	2	6	216816	216821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5108	NC_012858	GC	3	6	216852	216857	0 %	0 %	50 %	50 %	241666695
5109	NC_012858	GGC	2	6	216930	216935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666695
5110	NC_012858	CG	3	6	216976	216981	0 %	0 %	50 %	50 %	241666695
5111	NC_012858	CGC	2	6	217029	217034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5112	NC_012858	GCGA	2	8	217041	217048	25 %	0 %	50 %	25 %	241666695
5113	NC_012858	TGG	2	6	217108	217113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666695
5114	NC_012858	GAC	2	6	217116	217121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5115	NC_012858	CCG	2	6	217141	217146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666695
5116	NC_012858	TCC	2	6	217210	217215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666695
5117	NC_012858	TCG	2	6	217225	217230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5118	NC_012858	CAT	2	6	217232	217237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666695
5119	NC_012858	TCGG	2	8	217308	217315	0 %	25 %	50 %	25 %	241666695
5120	NC_012858	CAG	2	6	217337	217342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5121	NC_012858	ATC	2	6	217357	217362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666695
5122	NC_012858	TGC	2	6	217375	217380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5123	NC_012858	CAG	2	6	217394	217399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666695
5124	NC_012858	CAA	2	6	217434	217439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666695
5125	NC_012858	GTC	2	6	217547	217552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666696
5126	NC_012858	GC	3	6	217553	217558	0 %	0 %	50 %	50 %	241666696
5127	NC_012858	TCGA	2	8	217566	217573	25 %	25 %	25 %	25 %	241666696
5128	NC_012858	CAT	2	6	217600	217605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666696
5129	NC_012858	GCC	2	6	217616	217621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666696
5130	NC_012858	TCG	2	6	217638	217643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666696
5131	NC_012858	GC	3	6	217656	217661	0 %	0 %	50 %	50 %	241666696
5132	NC_012858	CTGA	2	8	217668	217675	25 %	25 %	25 %	25 %	241666696
5133	NC_012858	AGC	2	6	217708	217713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_012858	GCT	2	6	217867	217872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_012858	AGG	2	6	217983	217988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_012858	GAG	2	6	218054	218059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666697
5137	NC_012858	GAAG	2	8	218086	218093	50 %	0 %	50 %	0 %	241666697
5138	NC_012858	CAA	2	6	218119	218124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666697
5139	NC_012858	GCG	3	9	218130	218138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666697
5140	NC_012858	CAA	2	6	218140	218145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666697
5141	NC_012858	AAG	2	6	218165	218170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666697
5142	NC_012858	TCC	2	6	218183	218188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666697
5143	NC_012858	GGC	2	6	218195	218200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666697
5144	NC_012858	CGG	2	6	218206	218211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666697
5145	NC_012858	CCG	2	6	218220	218225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666697
5146	NC_012858	AGG	2	6	218235	218240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666697
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5148	NC_012858	CCA	2	6	218299	218304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666697
5149	NC_012858	GCCA	2	8	218335	218342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5150	NC_012858	CA	3	6	218341	218346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5151	NC_012858	GCGAT	2	10	218408	218417	20 %	20 %	40 %	20 %	241666698
5152	NC_012858	GAAG	2	8	218424	218431	50 %	0 %	50 %	0 %	241666698
5153	NC_012858	CCG	2	6	218483	218488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666698
5154	NC_012858	CGC	2	6	218500	218505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666698
5155	NC_012858	CG	3	6	218557	218562	0 %	0 %	50 %	50 %	241666698
5156	NC_012858	GCG	2	6	218583	218588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666698
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5161	NC_012858	ATG	2	6	218785	218790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666699
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5164	NC_012858	GTC	2	6	218941	218946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666699
5165	NC_012858	TCG	2	6	218975	218980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666699
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5167	NC_012858	GCTC	2	8	219052	219059	0 %	25 %	25 %	50 %	241666699
5168	NC_012858	GCC	2	6	219061	219066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666699
5169	NC_012858	TGC	2	6	219113	219118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666699
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5171	NC_012858	CGCCT	2	10	219322	219331	0 %	20 %	20 %	60 %	241666699
5172	NC_012858	GTAAAA	2	12	219459	219470	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_012858	GAA	2	6	219542	219547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666700
5174	NC_012858	GC	3	6	219664	219669	0 %	0 %	50 %	50 %	241666700
5175	NC_012858	CCG	2	6	219700	219705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666700
5176	NC_012858	GCG	2	6	219865	219870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666700
5177	NC_012858	CAC	2	6	219872	219877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666700
5178	NC_012858	GCC	2	6	219890	219895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666700
5179	NC_012858	TTCAA	2	10	219942	219951	40 %	40 %	0 %	20 %	241666700
5180	NC_012858	GCT	3	9	219954	219962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666700
5181	NC_012858	C	6	6	220045	220050	0 %	0 %	0 %	100 %	241666700
5182	NC_012858	GCA	2	6	220114	220119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666700
5183	NC_012858	CAA	2	6	220235	220240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666700
5184	NC_012858	GAC	2	6	220256	220261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666700
5185	NC_012858	CCG	2	6	220285	220290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666700
5186	NC_012858	GTA	2	6	220292	220297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666700
5187	NC_012858	TTC	2	6	220396	220401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666700
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5189	NC_012858	GCGA	2	8	220499	220506	25 %	0 %	50 %	25 %	241666701
5190	NC_012858	GAT	2	6	220507	220512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666701
5191	NC_012858	GGAT	2	8	220517	220524	25 %	25 %	50 %	0 %	241666701
5192	NC_012858	GT	3	6	220548	220553	0 %	50 %	50 %	0 %	241666701
5193	NC_012858	CGGC	2	8	220597	220604	0 %	0 %	50 %	50 %	241666701
5194	NC_012858	CG	3	6	220623	220628	0 %	0 %	50 %	50 %	241666701
5195	NC_012858	GCC	2	6	220640	220645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666701
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5202	NC_012858	AGC	2	6	220988	220993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666701
5203	NC_012858	GTC	2	6	220994	220999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666701
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5210	NC_012858	TCG	2	6	221273	221278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666701
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5232	NC_012858	CAG	2	6	222223	222228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666702
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5238	NC_012858	GGATC	2	10	222453	222462	20 %	20 %	40 %	20 %	241666702
5239	NC_012858	GAA	2	6	222478	222483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666702
5240	NC_012858	GGC	2	6	222513	222518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666702
5241	NC_012858	GGC	2	6	222616	222621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666702
5242	NC_012858	TCG	2	6	222668	222673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666702
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5244	NC_012858	CGG	2	6	222744	222749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666702
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5367	NC_012858	GCA	2	6	227997	228002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666706
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5372	NC_012858	CGA	2	6	228248	228253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666706
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5483	NC_012858	CACCGT	2	12	232922	232933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666708
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5487	NC_012858	TCA	2	6	233048	233053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666708
5488	NC_012858	GAAA	2	8	233063	233070	75 %	0 %	25 %	0 %	241666708
5489	NC_012858	GAAT	2	8	233210	233217	50 %	25 %	25 %	0 %	241666708
5490	NC_012858	CTC	2	6	233256	233261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666708
5491	NC_012858	AGT	2	6	233264	233269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666708
5492	NC_012858	GGT	2	6	233292	233297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666708
5493	NC_012858	CAG	2	6	233313	233318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5494	NC_012858	A	6	6	233387	233392	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
5495	NC_012858	CGC	2	6	233398	233403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666708
5496	NC_012858	GCAGG	2	10	233412	233421	20 %	0 %	60 %	20 %	241666708
5497	NC_012858	CGA	2	6	233426	233431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5498	NC_012858	GAT	2	6	233547	233552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666708
5499	NC_012858	GTTC	2	8	233574	233581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_012858	CGC	2	6	233592	233597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666709

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