MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 89552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012856	GCT	2	6	645168	645173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662227
16002	NC_012856	GAT	2	6	645181	645186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241662227
16003	NC_012856	TTC	2	6	645232	645237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662227
16004	NC_012856	TGCG	2	8	645238	645245	0 %	25 %	50 %	25 %	241662227
16005	NC_012856	GCT	2	6	645249	645254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662227
16006	NC_012856	ATC	2	6	645301	645306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662227
16007	NC_012856	CAT	2	6	645312	645317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662227
16008	NC_012856	AC	3	6	645433	645438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16009	NC_012856	AGCC	2	8	645452	645459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16010	NC_012856	CT	3	6	645490	645495	0 %	50 %	0 %	50 %	241662228
16011	NC_012856	CAC	2	6	645594	645599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241662228
16012	NC_012856	TGA	2	6	645640	645645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241662228
16013	NC_012856	GAC	2	6	645705	645710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662228
16014	NC_012856	GCTG	2	8	645737	645744	0 %	25 %	50 %	25 %	241662228
16015	NC_012856	GAG	2	6	645900	645905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241662228
16016	NC_012856	CG	3	6	645913	645918	0 %	0 %	50 %	50 %	241662228
16017	NC_012856	TCG	2	6	645958	645963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662228
16018	NC_012856	CGC	2	6	645972	645977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662228
16019	NC_012856	CGC	2	6	646013	646018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662228
16020	NC_012856	GC	3	6	646133	646138	0 %	0 %	50 %	50 %	241662228
16021	NC_012856	GTG	2	6	646140	646145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662228
16022	NC_012856	ACA	2	6	646150	646155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662228
16023	NC_012856	GGC	2	6	646197	646202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662228
16024	NC_012856	CGT	2	6	646270	646275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662228
16025	NC_012856	GT	3	6	646282	646287	0 %	50 %	50 %	0 %	241662228
16026	NC_012856	CGC	2	6	646288	646293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662228
16027	NC_012856	GCA	2	6	646295	646300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662228
16028	NC_012856	TCA	2	6	646384	646389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662228
16029	NC_012856	TGAGGC	2	12	646400	646411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241662228
16030	NC_012856	ATT	2	6	646413	646418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241662228
16031	NC_012856	CTGGGC	2	12	646475	646486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241662228
16032	NC_012856	GCC	2	6	646488	646493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662228
16033	NC_012856	GC	3	6	646535	646540	0 %	0 %	50 %	50 %	241662228
16034	NC_012856	CGCCA	2	10	646548	646557	20 %	0 %	20 %	60 %	241662228
16035	NC_012856	CG	3	6	646596	646601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_012856	GCGCG	2	10	646711	646720	0 %	0 %	60 %	40 %	241662229
16037	NC_012856	CGG	2	6	646728	646733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662229
16038	NC_012856	CGG	2	6	646752	646757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662229
16039	NC_012856	TGG	2	6	646775	646780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662229
16040	NC_012856	TCC	2	6	646787	646792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241662229
16041	NC_012856	GCC	2	6	646816	646821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662229
16042	NC_012856	AACG	2	8	646849	646856	50 %	0 %	25 %	25 %	241662229
16043	NC_012856	TTG	2	6	646877	646882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241662229
16044	NC_012856	CTT	2	6	646888	646893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662229
16045	NC_012856	GAA	2	6	646909	646914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241662229
16046	NC_012856	ATC	2	6	646946	646951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662229
16047	NC_012856	CAT	2	6	646971	646976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662229
16048	NC_012856	ATC	2	6	647068	647073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662229
16049	NC_012856	GGT	2	6	647101	647106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662229
16050	NC_012856	GGC	2	6	647161	647166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662229
16051	NC_012856	GCA	2	6	647196	647201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662229
16052	NC_012856	GC	3	6	647228	647233	0 %	0 %	50 %	50 %	241662229
16053	NC_012856	CGGC	2	8	647252	647259	0 %	0 %	50 %	50 %	241662229
16054	NC_012856	GCG	2	6	647260	647265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662229
16055	NC_012856	ACGA	2	8	647267	647274	50 %	0 %	25 %	25 %	241662229
16056	NC_012856	GTC	2	6	647356	647361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662229
16057	NC_012856	GC	3	6	647432	647437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16058	NC_012856	CAA	2	6	647441	647446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_012856	A	6	6	647445	647450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_012856	GCC	2	6	647451	647456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_012856	GGC	2	6	647460	647465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_012856	CAT	2	6	647498	647503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_012856	TTGA	2	8	647519	647526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_012856	CG	3	6	647595	647600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16065	NC_012856	CAGC	2	8	647630	647637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16066	NC_012856	CTC	2	6	647699	647704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241662230
16067	NC_012856	GC	3	6	647709	647714	0 %	0 %	50 %	50 %	241662230
16068	NC_012856	GCG	2	6	647753	647758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662230
16069	NC_012856	CAG	2	6	647759	647764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662230
16070	NC_012856	GTAG	2	8	647765	647772	25 %	25 %	50 %	0 %	241662230
16071	NC_012856	GCG	2	6	647782	647787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662230
16072	NC_012856	TGG	3	9	647961	647969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662230
16073	NC_012856	CAA	2	6	648047	648052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662230
16074	NC_012856	CAG	2	6	648152	648157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662230
16075	NC_012856	GCT	2	6	648178	648183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662230
16076	NC_012856	GC	3	6	648239	648244	0 %	0 %	50 %	50 %	241662230
16077	NC_012856	GCC	3	9	648318	648326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662230
16078	NC_012856	GC	3	6	648418	648423	0 %	0 %	50 %	50 %	241662230
16079	NC_012856	AAC	2	6	648432	648437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662230
16080	NC_012856	GC	3	6	648471	648476	0 %	0 %	50 %	50 %	241662230
16081	NC_012856	CG	3	6	648516	648521	0 %	0 %	50 %	50 %	241662230
16082	NC_012856	TTC	2	6	648530	648535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662230
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16084	NC_012856	CCT	2	6	648580	648585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16085	NC_012856	GAT	2	6	648645	648650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_012856	GTTCA	2	10	648796	648805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16087	NC_012856	CG	3	6	648839	648844	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
16088	NC_012856	ACC	2	6	648871	648876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241662231
16089	NC_012856	GTC	2	6	648894	648899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662231
16090	NC_012856	CG	3	6	648904	648909	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
16091	NC_012856	AGC	2	6	648910	648915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662231
16092	NC_012856	CGTC	2	8	648926	648933	0 %	25 %	25 %	50 %	241662231
16093	NC_012856	GAT	2	6	648951	648956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241662231
16094	NC_012856	GCG	2	6	648980	648985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662231
16095	NC_012856	GGCC	2	8	649004	649011	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
16096	NC_012856	AACACG	2	12	649042	649053	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241662231
16097	NC_012856	CGGA	2	8	649119	649126	25 %	0 %	50 %	25 %	241662231
16098	NC_012856	TGA	2	6	649142	649147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241662231
16099	NC_012856	AGC	2	6	649264	649269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662231
16100	NC_012856	GGC	2	6	649296	649301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662231
16101	NC_012856	GGCCG	2	10	649326	649335	0 %	0 %	60 %	40 %	241662231
16102	NC_012856	GGT	2	6	649380	649385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662231
16103	NC_012856	GTCCA	2	10	649390	649399	20 %	20 %	20 %	40 %	241662231
16104	NC_012856	CGGC	2	8	649469	649476	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
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16106	NC_012856	GAC	2	6	649617	649622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662231
16107	NC_012856	CG	3	6	649661	649666	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
16108	NC_012856	GGT	2	6	649713	649718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662231
16109	NC_012856	ACC	2	6	649726	649731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241662231
16110	NC_012856	GC	3	6	649735	649740	0 %	0 %	50 %	50 %	241662231
16111	NC_012856	TTC	2	6	649743	649748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662231
16112	NC_012856	TGG	2	6	649760	649765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662231
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16120	NC_012856	CAG	2	6	650097	650102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662232
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16122	NC_012856	AGG	2	6	650144	650149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241662232
16123	NC_012856	CCG	2	6	650255	650260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662232
16124	NC_012856	CACG	2	8	650282	650289	25 %	0 %	25 %	50 %	241662232
16125	NC_012856	CCG	2	6	650366	650371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662232
16126	NC_012856	CAG	2	6	650379	650384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662232
16127	NC_012856	CAG	2	6	650427	650432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662232
16128	NC_012856	GCA	2	6	650546	650551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662232
16129	NC_012856	CGAT	2	8	650567	650574	25 %	25 %	25 %	25 %	241662232
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16133	NC_012856	CTT	2	6	650699	650704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662232
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16136	NC_012856	CTG	2	6	650834	650839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662232
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16152	NC_012856	AC	3	6	651566	651571	50 %	0 %	0 %	50 %	241662234
16153	NC_012856	GCA	2	6	651674	651679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662234
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16156	NC_012856	CGG	2	6	651785	651790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662234
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16175	NC_012856	GCG	2	6	652447	652452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662234
16176	NC_012856	CCA	3	9	652457	652465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241662234
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16189	NC_012856	GC	3	6	652795	652800	0 %	0 %	50 %	50 %	241662234
16190	NC_012856	CATCAA	2	12	652821	652832	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	241662234
16191	NC_012856	GTGGC	2	10	652838	652847	0 %	20 %	60 %	20 %	241662234
16192	NC_012856	ATC	2	6	652855	652860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241662234
16193	NC_012856	GCCG	2	8	652869	652876	0 %	0 %	50 %	50 %	241662234
16194	NC_012856	CAG	3	9	652938	652946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662234
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16208	NC_012856	CAG	2	6	653848	653853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662236
16209	NC_012856	CTCG	2	8	653872	653879	0 %	25 %	25 %	50 %	241662236
16210	NC_012856	ATCA	2	8	653884	653891	50 %	25 %	0 %	25 %	241662236
16211	NC_012856	CTC	2	6	653893	653898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241662236
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16220	NC_012856	TTGAT	2	10	654389	654398	20 %	60 %	20 %	0 %	241662236
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16222	NC_012856	AAC	2	6	654440	654445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662236
16223	NC_012856	GT	3	6	654602	654607	0 %	50 %	50 %	0 %	241662236
16224	NC_012856	CT	3	6	654654	654659	0 %	50 %	0 %	50 %	241662236
16225	NC_012856	TGCA	2	8	654710	654717	25 %	25 %	25 %	25 %	241662236
16226	NC_012856	CAGC	2	8	654872	654879	25 %	0 %	25 %	50 %	241662237
16227	NC_012856	A	7	7	654910	654916	100 %	0 %	0 %	0 %	241662237
16228	NC_012856	CGG	3	9	655006	655014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662237
16229	NC_012856	A	6	6	655065	655070	100 %	0 %	0 %	0 %	241662237
16230	NC_012856	GAC	3	9	655109	655117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662237
16231	NC_012856	CAG	2	6	655148	655153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662237
16232	NC_012856	T	6	6	655169	655174	0 %	100 %	0 %	0 %	241662237
16233	NC_012856	CGCAA	2	10	655314	655323	40 %	0 %	20 %	40 %	241662237
16234	NC_012856	CCA	2	6	655328	655333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241662237
16235	NC_012856	TGG	2	6	655360	655365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241662237
16236	NC_012856	AG	3	6	655458	655463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16237	NC_012856	AAC	2	6	655506	655511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662238
16238	NC_012856	AGCC	2	8	655539	655546	25 %	0 %	25 %	50 %	241662238
16239	NC_012856	CCG	2	6	655551	655556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662238
16240	NC_012856	CTT	3	9	655616	655624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662238
16241	NC_012856	CAG	2	6	655634	655639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662238
16242	NC_012856	CTG	2	6	655655	655660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662238
16243	NC_012856	AAT	2	6	655674	655679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241662238
16244	NC_012856	TCT	2	6	655719	655724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662238
16245	NC_012856	GC	3	6	655737	655742	0 %	0 %	50 %	50 %	241662238
16246	NC_012856	AGC	2	6	655749	655754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662238
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16248	NC_012856	GGGC	2	8	655765	655772	0 %	0 %	75 %	25 %	241662238
16249	NC_012856	CTGC	2	8	655813	655820	0 %	25 %	25 %	50 %	241662238
16250	NC_012856	CTT	2	6	655834	655839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241662238
16251	NC_012856	GATC	2	8	655852	655859	25 %	25 %	25 %	25 %	241662238
16252	NC_012856	GACT	2	8	655868	655875	25 %	25 %	25 %	25 %	241662238
16253	NC_012856	ACGTG	2	10	655950	655959	20 %	20 %	40 %	20 %	241662238
16254	NC_012856	TCGT	2	8	655998	656005	0 %	50 %	25 %	25 %	241662238
16255	NC_012856	CG	4	8	656089	656096	0 %	0 %	50 %	50 %	241662238
16256	NC_012856	GCC	2	6	656238	656243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662238
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16261	NC_012856	GACC	2	8	656461	656468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16262	NC_012856	TCA	2	6	656484	656489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16266	NC_012856	GAC	2	6	656658	656663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662239
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16272	NC_012856	CAA	2	6	656972	656977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241662239
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16295	NC_012856	TCG	2	6	657821	657826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662240
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16301	NC_012856	CG	3	6	658068	658073	0 %	0 %	50 %	50 %	241662241
16302	NC_012856	GC	3	6	658096	658101	0 %	0 %	50 %	50 %	241662241
16303	NC_012856	GC	3	6	658143	658148	0 %	0 %	50 %	50 %	241662241
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16351	NC_012856	CAG	2	6	659733	659738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662241
16352	NC_012856	CGA	2	6	659750	659755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662241
16353	NC_012856	TCTT	2	8	659779	659786	0 %	75 %	0 %	25 %	241662241
16354	NC_012856	GCGG	2	8	659873	659880	0 %	0 %	75 %	25 %	241662242
16355	NC_012856	GC	3	6	659881	659886	0 %	0 %	50 %	50 %	241662242
16356	NC_012856	GGC	2	6	659922	659927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241662242
16357	NC_012856	GC	3	6	660006	660011	0 %	0 %	50 %	50 %	241662242
16358	NC_012856	GCA	2	6	660033	660038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662242
16359	NC_012856	ATCAGC	2	12	660052	660063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241662242
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16361	NC_012856	GC	4	8	660133	660140	0 %	0 %	50 %	50 %	241662242
16362	NC_012856	CGC	2	6	660197	660202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662242
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16482	NC_012856	CCT	2	6	665057	665062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16483	NC_012856	GC	3	6	665118	665123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16484	NC_012856	CCGG	2	8	665134	665141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16485	NC_012856	CGA	2	6	665165	665170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16486	NC_012856	TCG	2	6	665173	665178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16487	NC_012856	GCC	2	6	665185	665190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16488	NC_012856	CGT	2	6	665201	665206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16489	NC_012856	GAA	2	6	665217	665222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16490	NC_012856	CA	3	6	665330	665335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16491	NC_012856	CCG	2	6	665459	665464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16492	NC_012856	CTG	2	6	665544	665549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241662245
16493	NC_012856	ATCGTG	2	12	665575	665586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241662245
16494	NC_012856	CGGC	2	8	665633	665640	0 %	0 %	50 %	50 %	241662245
16495	NC_012856	GC	3	6	665650	665655	0 %	0 %	50 %	50 %	241662245
16496	NC_012856	CCG	2	6	665692	665697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241662245
16497	NC_012856	CAG	2	6	665736	665741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241662245
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16500	NC_012856	TGT	2	6	666022	666027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241662245

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