MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 89552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012856	ATC	2	6	220133	220138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661828
5502	NC_012856	ACG	2	6	220146	220151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5503	NC_012856	CAG	2	6	220177	220182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5504	NC_012856	TTC	2	6	220190	220195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661828
5505	NC_012856	TCG	2	6	220221	220226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5506	NC_012856	CCG	2	6	220270	220275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661828
5507	NC_012856	TCG	2	6	220413	220418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5508	NC_012856	CGT	2	6	220555	220560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5509	NC_012856	CGA	2	6	220726	220731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5510	NC_012856	G	6	6	220739	220744	0 %	0 %	100 %	0 %	241661828
5511	NC_012856	GCGAT	2	10	220767	220776	20 %	20 %	40 %	20 %	241661828
5512	NC_012856	CGT	2	6	220834	220839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5513	NC_012856	CGA	2	6	220840	220845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661828
5514	NC_012856	CCGG	2	8	220950	220957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_012856	TCC	2	6	220986	220991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_012856	TGG	2	6	220994	220999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_012856	GAC	2	6	221139	221144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_012856	TCCC	2	8	221200	221207	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5519	NC_012856	CAT	2	6	221223	221228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_012856	GCA	2	6	221234	221239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_012856	GGCT	2	8	221261	221268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_012856	TGC	2	6	221285	221290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_012856	AAC	2	6	221330	221335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_012856	GC	3	6	221377	221382	0 %	0 %	50 %	50 %	241661829
5525	NC_012856	CAA	2	6	221396	221401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661829
5526	NC_012856	GATC	2	8	221405	221412	25 %	25 %	25 %	25 %	241661829
5527	NC_012856	CAC	2	6	221442	221447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661829
5528	NC_012856	GTC	2	6	221452	221457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661829
5529	NC_012856	TC	3	6	221494	221499	0 %	50 %	0 %	50 %	241661829
5530	NC_012856	AGC	2	6	221588	221593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661829
5531	NC_012856	TGC	2	6	221696	221701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661829
5532	NC_012856	ACC	2	6	221704	221709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661829
5533	NC_012856	GGTC	2	8	221838	221845	0 %	25 %	50 %	25 %	241661830
5534	NC_012856	GCC	2	6	222079	222084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661830
5535	NC_012856	TGC	2	6	222086	222091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661830
5536	NC_012856	TGGC	2	8	222112	222119	0 %	25 %	50 %	25 %	241661830
5537	NC_012856	ATG	2	6	222214	222219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661830
5538	NC_012856	AGC	2	6	222361	222366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661830
5539	NC_012856	CTG	2	6	222375	222380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661830
5540	NC_012856	TGGA	2	8	222426	222433	25 %	25 %	50 %	0 %	241661830
5541	NC_012856	GCA	2	6	222452	222457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661830
5542	NC_012856	AATC	2	8	222624	222631	50 %	25 %	0 %	25 %	241661830
5543	NC_012856	C	6	6	222631	222636	0 %	0 %	0 %	100 %	241661830
5544	NC_012856	TGT	2	6	222677	222682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661830
5545	NC_012856	AGC	2	6	222734	222739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661830
5546	NC_012856	CTT	2	6	222746	222751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661830
5547	NC_012856	CCA	2	6	222777	222782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661830
5548	NC_012856	GTT	2	6	222809	222814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_012856	CCT	2	6	222838	222843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_012856	GTC	2	6	222956	222961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5551	NC_012856	GAT	2	6	222969	222974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661831
5552	NC_012856	GCAT	2	8	222991	222998	25 %	25 %	25 %	25 %	241661831
5553	NC_012856	GC	3	6	223057	223062	0 %	0 %	50 %	50 %	241661831
5554	NC_012856	AC	3	6	223091	223096	50 %	0 %	0 %	50 %	241661831
5555	NC_012856	CCAG	2	8	223130	223137	25 %	0 %	25 %	50 %	241661831
5556	NC_012856	ACGGG	2	10	223146	223155	20 %	0 %	60 %	20 %	241661831
5557	NC_012856	CTC	2	6	223188	223193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241661831
5558	NC_012856	CTT	2	6	223218	223223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661831
5559	NC_012856	GTT	2	6	223246	223251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661831
5560	NC_012856	CGC	2	6	223273	223278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661831
5561	NC_012856	GAA	2	6	223287	223292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661831
5562	NC_012856	CG	3	6	223337	223342	0 %	0 %	50 %	50 %	241661831
5563	NC_012856	TCG	2	6	223405	223410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5564	NC_012856	GT	3	6	223472	223477	0 %	50 %	50 %	0 %	241661831
5565	NC_012856	TGG	2	6	223508	223513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661831
5566	NC_012856	CTTCAG	2	12	223515	223526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241661831
5567	NC_012856	GTC	2	6	223623	223628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5568	NC_012856	GCC	3	9	223653	223661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661831
5569	NC_012856	ACT	2	6	223668	223673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661831
5570	NC_012856	CAG	2	6	223728	223733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5571	NC_012856	TGC	2	6	223764	223769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5572	NC_012856	GTT	2	6	223781	223786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661831
5573	NC_012856	GCT	2	6	223791	223796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5574	NC_012856	ATGA	2	8	223800	223807	50 %	25 %	25 %	0 %	241661831
5575	NC_012856	CCG	2	6	223832	223837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661831
5576	NC_012856	CG	3	6	224003	224008	0 %	0 %	50 %	50 %	241661831
5577	NC_012856	GCCG	2	8	224061	224068	0 %	0 %	50 %	50 %	241661831
5578	NC_012856	TGG	2	6	224193	224198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661831
5579	NC_012856	TCC	2	6	224230	224235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241661831
5580	NC_012856	AAC	2	6	224291	224296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661831
5581	NC_012856	A	7	7	224300	224306	100 %	0 %	0 %	0 %	241661831
5582	NC_012856	GTA	2	6	224428	224433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661831
5583	NC_012856	CG	4	8	224522	224529	0 %	0 %	50 %	50 %	241661831
5584	NC_012856	AC	3	6	224637	224642	50 %	0 %	0 %	50 %	241661831
5585	NC_012856	CCA	2	6	224694	224699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661831
5586	NC_012856	GTC	2	6	224715	224720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661831
5587	NC_012856	CTG	2	6	224797	224802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_012856	CAA	2	6	224895	224900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_012856	AGC	2	6	224934	224939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_012856	AGG	2	6	225007	225012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_012856	G	7	7	225011	225017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_012856	TGG	2	6	225048	225053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5593	NC_012856	GAA	2	6	225088	225093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661832
5594	NC_012856	GAG	2	6	225134	225139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241661832
5595	NC_012856	TGC	2	6	225210	225215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5596	NC_012856	CT	3	6	225219	225224	0 %	50 %	0 %	50 %	241661832
5597	NC_012856	TTCG	2	8	225325	225332	0 %	50 %	25 %	25 %	241661832
5598	NC_012856	TGG	2	6	225339	225344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5599	NC_012856	ACT	2	6	225378	225383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661832
5600	NC_012856	CG	3	6	225391	225396	0 %	0 %	50 %	50 %	241661832
5601	NC_012856	TCG	2	6	225475	225480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5602	NC_012856	GAT	2	6	225545	225550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661832
5603	NC_012856	GCG	3	9	225555	225563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661832
5604	NC_012856	AG	3	6	225584	225589	50 %	0 %	50 %	0 %	241661832
5605	NC_012856	GT	3	6	225699	225704	0 %	50 %	50 %	0 %	241661832
5606	NC_012856	GAA	2	6	225717	225722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661832
5607	NC_012856	TCG	2	6	225796	225801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5608	NC_012856	GTG	2	6	225834	225839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5609	NC_012856	TGG	2	6	225861	225866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5610	NC_012856	GC	3	6	225940	225945	0 %	0 %	50 %	50 %	241661832
5611	NC_012856	ATC	2	6	225984	225989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661832
5612	NC_012856	TGA	2	6	226012	226017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661832
5613	NC_012856	A	6	6	226024	226029	100 %	0 %	0 %	0 %	241661832
5614	NC_012856	GAG	2	6	226058	226063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241661832
5615	NC_012856	GCG	2	6	226109	226114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661832
5616	NC_012856	CTG	2	6	226115	226120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5617	NC_012856	CGT	2	6	226148	226153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5618	NC_012856	TGG	2	6	226158	226163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5619	NC_012856	GCA	2	6	226223	226228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661832
5620	NC_012856	TGG	2	6	226252	226257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661832
5621	NC_012856	AATC	2	8	226263	226270	50 %	25 %	0 %	25 %	241661832
5622	NC_012856	AT	3	6	226311	226316	50 %	50 %	0 %	0 %	241661832
5623	NC_012856	T	6	6	226316	226321	0 %	100 %	0 %	0 %	241661832
5624	NC_012856	A	6	6	226411	226416	100 %	0 %	0 %	0 %	241661832
5625	NC_012856	GCG	2	6	226452	226457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661832
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5666	NC_012856	GGC	2	6	228285	228290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5743	NC_012856	CGCGG	2	10	231258	231267	0 %	0 %	60 %	40 %	241661837
5744	NC_012856	TCG	2	6	231274	231279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661837
5745	NC_012856	CGA	2	6	231317	231322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661837
5746	NC_012856	GC	3	6	231332	231337	0 %	0 %	50 %	50 %	241661837
5747	NC_012856	CATCCG	2	12	231416	231427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241661837
5748	NC_012856	CGG	2	6	231440	231445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661837
5749	NC_012856	CGG	3	9	231586	231594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661838
5750	NC_012856	GCT	2	6	231609	231614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661838
5751	NC_012856	GCCG	2	8	231632	231639	0 %	0 %	50 %	50 %	241661838
5752	NC_012856	GCC	2	6	231651	231656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661838
5753	NC_012856	GCC	3	9	231678	231686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661838
5754	NC_012856	CGGCTG	2	12	231694	231705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241661838
5755	NC_012856	CTG	10	30	231703	231732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661838
5756	NC_012856	CGCC	2	8	231733	231740	0 %	0 %	25 %	75 %	241661838
5757	NC_012856	CAA	2	6	231758	231763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661838
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5759	NC_012856	TGA	2	6	231808	231813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661838
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5762	NC_012856	ATGCA	2	10	231879	231888	40 %	20 %	20 %	20 %	241661838
5763	NC_012856	TCT	2	6	231895	231900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661838
5764	NC_012856	TCA	3	9	231904	231912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661838
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5777	NC_012856	CGG	2	6	232304	232309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661838
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5781	NC_012856	GCT	2	6	232520	232525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661838
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5784	NC_012856	GCC	2	6	232641	232646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661838
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5798	NC_012856	T	6	6	233105	233110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5799	NC_012856	C	9	9	233117	233125	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5801	NC_012856	TCC	2	6	233207	233212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5802	NC_012856	T	8	8	233271	233278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5803	NC_012856	T	6	6	233285	233290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5804	NC_012856	CTG	2	6	233298	233303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5807	NC_012856	GCT	2	6	233467	233472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661839
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5835	NC_012856	CGT	2	6	234469	234474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661839
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5837	NC_012856	GCAT	2	8	234558	234565	25 %	25 %	25 %	25 %	241661839
5838	NC_012856	CGT	2	6	234655	234660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661839
5839	NC_012856	GC	3	6	234662	234667	0 %	0 %	50 %	50 %	241661839
5840	NC_012856	GACC	2	8	234703	234710	25 %	0 %	25 %	50 %	241661839
5841	NC_012856	CTGAT	2	10	234719	234728	20 %	40 %	20 %	20 %	241661839
5842	NC_012856	TCG	2	6	234776	234781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661840
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5851	NC_012856	C	6	6	235020	235025	0 %	0 %	0 %	100 %	241661840
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5857	NC_012856	CGG	2	6	235398	235403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661840
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5859	NC_012856	GGC	2	6	235464	235469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661840
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5864	NC_012856	GAC	2	6	235701	235706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661840
5865	NC_012856	GGC	2	6	235735	235740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5866	NC_012856	GC	3	6	235739	235744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5867	NC_012856	CCG	2	6	235749	235754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5868	NC_012856	TCC	2	6	235759	235764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5869	NC_012856	ATC	2	6	235865	235870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661841
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5872	NC_012856	CGCGTG	2	12	236102	236113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241661841
5873	NC_012856	CTGG	2	8	236114	236121	0 %	25 %	50 %	25 %	241661841
5874	NC_012856	GC	3	6	236143	236148	0 %	0 %	50 %	50 %	241661841
5875	NC_012856	AAC	2	6	236175	236180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661841
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5880	NC_012856	CAT	2	6	236411	236416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661842
5881	NC_012856	TGA	2	6	236422	236427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661842
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5885	NC_012856	TCA	2	6	236512	236517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661842
5886	NC_012856	GGCGAA	2	12	236529	236540	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241661842
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5888	NC_012856	CGC	2	6	236568	236573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5889	NC_012856	CG	3	6	236619	236624	0 %	0 %	50 %	50 %	241661843
5890	NC_012856	GCG	2	6	236660	236665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661843
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5893	NC_012856	GC	3	6	236746	236751	0 %	0 %	50 %	50 %	241661843
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5901	NC_012856	CGGTCG	2	12	237048	237059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241661843
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5903	NC_012856	TGC	2	6	237117	237122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661843
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5931	NC_012856	CGTT	2	8	238344	238351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5932	NC_012856	CT	3	6	238411	238416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5934	NC_012856	GGA	2	6	238560	238565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5977	NC_012856	A	6	6	240303	240308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5978	NC_012856	GTGCA	2	10	240313	240322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5979	NC_012856	CGGT	2	8	240372	240379	0 %	25 %	50 %	25 %	241661847
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5994	NC_012856	GCA	2	6	241242	241247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661847
5995	NC_012856	CGC	3	9	241248	241256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661847
5996	NC_012856	GTT	2	6	241258	241263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661847
5997	NC_012856	CTT	2	6	241321	241326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661847
5998	NC_012856	CTTC	2	8	241458	241465	0 %	50 %	0 %	50 %	241661847
5999	NC_012856	GC	3	6	241500	241505	0 %	0 %	50 %	50 %	241661847
6000	NC_012856	GTC	2	6	241555	241560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661847

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