MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 7660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012855	GCA	2	6	151350	151355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3002	NC_012855	GCC	2	6	151586	151591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589691
3003	NC_012855	GTG	2	6	151604	151609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589691
3004	NC_012855	GCGT	2	8	151670	151677	0 %	25 %	50 %	25 %	241589691
3005	NC_012855	CAT	2	6	151692	151697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589691
3006	NC_012855	CGG	2	6	151710	151715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589691
3007	NC_012855	CG	3	6	151728	151733	0 %	0 %	50 %	50 %	241589691
3008	NC_012855	GCT	2	6	151781	151786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3009	NC_012855	CCA	2	6	151818	151823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589691
3010	NC_012855	GGC	2	6	151839	151844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589691
3011	NC_012855	CGG	2	6	151856	151861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589691
3012	NC_012855	AAG	2	6	151868	151873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589691
3013	NC_012855	TGC	2	6	151878	151883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3014	NC_012855	TGC	2	6	151887	151892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3015	NC_012855	CAG	2	6	151960	151965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3016	NC_012855	CGC	2	6	151966	151971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589691
3017	NC_012855	GCA	2	6	152112	152117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3018	NC_012855	TGT	2	6	152127	152132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589691
3019	NC_012855	GCC	2	6	152171	152176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589691
3020	NC_012855	CCA	2	6	152182	152187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589691
3021	NC_012855	CGAG	2	8	152265	152272	25 %	0 %	50 %	25 %	241589691
3022	NC_012855	AGGT	2	8	152273	152280	25 %	25 %	50 %	0 %	241589691
3023	NC_012855	CGAA	2	8	152367	152374	50 %	0 %	25 %	25 %	241589691
3024	NC_012855	GCA	2	6	152487	152492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3025	NC_012855	AGTGC	2	10	152519	152528	20 %	20 %	40 %	20 %	241589691
3026	NC_012855	TGC	3	9	152526	152534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3027	NC_012855	GCT	2	6	152556	152561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3028	NC_012855	GGC	2	6	152573	152578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589691
3029	NC_012855	TTG	2	6	152585	152590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589691
3030	NC_012855	AGC	2	6	152693	152698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589691
3031	NC_012855	C	6	6	152705	152710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3032	NC_012855	TGA	2	6	152767	152772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012855	TGG	2	6	152920	152925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012855	A	6	6	152959	152964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012855	CA	3	6	153040	153045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_012855	GCG	2	6	153182	153187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_012855	CGT	2	6	153200	153205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_012855	GCT	2	6	153257	153262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_012855	CCA	2	6	153297	153302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_012855	CTC	2	6	153308	153313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_012855	GGA	2	6	153319	153324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012855	ACGA	2	8	153332	153339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_012855	CA	3	6	153473	153478	50 %	0 %	0 %	50 %	241589692
3044	NC_012855	CTC	2	6	153569	153574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589692
3045	NC_012855	TTC	2	6	153800	153805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589692
3046	NC_012855	AAG	2	6	153932	153937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589692
3047	NC_012855	TG	3	6	153975	153980	0 %	50 %	50 %	0 %	241589692
3048	NC_012855	CAG	2	6	153982	153987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589692
3049	NC_012855	GAC	2	6	154019	154024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589692
3050	NC_012855	GC	3	6	154082	154087	0 %	0 %	50 %	50 %	241589692
3051	NC_012855	CTT	2	6	154160	154165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589692
3052	NC_012855	TGA	2	6	154213	154218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589692
3053	NC_012855	GGT	2	6	154231	154236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589692
3054	NC_012855	CGG	2	6	154285	154290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589692
3055	NC_012855	GAG	3	9	154319	154327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589692
3056	NC_012855	GAATCG	2	12	154328	154339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241589692
3057	NC_012855	GGA	2	6	154378	154383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589692
3058	NC_012855	GAG	2	6	154385	154390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589692
3059	NC_012855	GGC	2	6	154400	154405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589692
3060	NC_012855	CTAT	2	8	154447	154454	25 %	50 %	0 %	25 %	241589692
3061	NC_012855	ACG	2	6	154455	154460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589692
3062	NC_012855	TGG	2	6	154471	154476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589692
3063	NC_012855	GCGG	2	8	154594	154601	0 %	0 %	75 %	25 %	241589692
3064	NC_012855	GCCA	2	8	154633	154640	25 %	0 %	25 %	50 %	241589692
3065	NC_012855	TCGC	2	8	154689	154696	0 %	25 %	25 %	50 %	241589692
3066	NC_012855	GCG	2	6	154697	154702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589692
3067	NC_012855	TCA	2	6	154752	154757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589692
3068	NC_012855	ATGGC	2	10	154827	154836	20 %	20 %	40 %	20 %	241589692
3069	NC_012855	ACGT	2	8	154838	154845	25 %	25 %	25 %	25 %	241589692
3070	NC_012855	GTCG	2	8	154873	154880	0 %	25 %	50 %	25 %	241589692
3071	NC_012855	CTT	2	6	154883	154888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589692
3072	NC_012855	CTG	2	6	154899	154904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589692
3073	NC_012855	TGT	2	6	154920	154925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589692
3074	NC_012855	AAG	2	6	154957	154962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012855	GCA	2	6	154968	154973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012855	GAGG	2	8	155123	155130	25 %	0 %	75 %	0 %	241589693
3077	NC_012855	CAG	2	6	155215	155220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589693
3078	NC_012855	CAC	2	6	155285	155290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_012855	CAA	2	6	155355	155360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589694
3080	NC_012855	ATG	2	6	155552	155557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589694
3081	NC_012855	CTG	2	6	155600	155605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589694
3082	NC_012855	CTGG	2	8	155700	155707	0 %	25 %	50 %	25 %	241589694
3083	NC_012855	AAG	2	6	155806	155811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589694
3084	NC_012855	GGT	2	6	155827	155832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589694
3085	NC_012855	GTC	2	6	155856	155861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589694
3086	NC_012855	GC	3	6	155899	155904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_012855	TTC	2	6	155920	155925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_012855	TTC	2	6	155990	155995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012855	TGGGT	2	10	156079	156088	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012855	AGG	2	6	156166	156171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012855	ATC	2	6	156207	156212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012855	CG	3	6	156297	156302	0 %	0 %	50 %	50 %	241589695
3093	NC_012855	GCC	2	6	156356	156361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589695
3094	NC_012855	GGC	2	6	156410	156415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589695
3095	NC_012855	GGT	2	6	156436	156441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589695
3096	NC_012855	GCG	2	6	156492	156497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589695
3097	NC_012855	GTC	2	6	156543	156548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_012855	AGC	2	6	156613	156618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589696
3099	NC_012855	CGC	2	6	156630	156635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589696
3100	NC_012855	TCC	2	6	156889	156894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589696
3101	NC_012855	TGA	2	6	156923	156928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012855	CCT	2	6	156975	156980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_012855	TGC	2	6	157142	157147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_012855	GCG	2	6	157234	157239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589697
3105	NC_012855	GCG	2	6	157248	157253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589697
3106	NC_012855	AG	3	6	157259	157264	50 %	0 %	50 %	0 %	241589697
3107	NC_012855	AGT	2	6	157281	157286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589697
3108	NC_012855	CAA	2	6	157307	157312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589697
3109	NC_012855	GTG	2	6	157353	157358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589697
3110	NC_012855	GGC	2	6	157373	157378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589697
3111	NC_012855	CGGC	2	8	157444	157451	0 %	0 %	50 %	50 %	241589697
3112	NC_012855	CACG	2	8	157563	157570	25 %	0 %	25 %	50 %	241589697
3113	NC_012855	CG	3	6	157672	157677	0 %	0 %	50 %	50 %	241589698
3114	NC_012855	GAA	2	6	157724	157729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589698
3115	NC_012855	AGC	2	6	157869	157874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589698
3116	NC_012855	ACG	2	6	157923	157928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589698
3117	NC_012855	CGGC	2	8	157954	157961	0 %	0 %	50 %	50 %	241589698
3118	NC_012855	CTG	2	6	157994	157999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589698
3119	NC_012855	CGG	2	6	158014	158019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589698
3120	NC_012855	CCG	2	6	158076	158081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_012855	GTG	2	6	158085	158090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012855	GAG	2	6	158135	158140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_012855	GC	3	6	158164	158169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_012855	GAA	2	6	158275	158280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012855	TGC	2	6	158335	158340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_012855	TCC	2	6	158354	158359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_012855	CTT	2	6	158455	158460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_012855	GAACG	2	10	158461	158470	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3129	NC_012855	CTCG	2	8	158471	158478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_012855	GTC	2	6	158599	158604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3132	NC_012855	GCC	2	6	158782	158787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_012855	GT	3	6	158918	158923	0 %	50 %	50 %	0 %	241589699
3134	NC_012855	GGC	2	6	158953	158958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589699
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3141	NC_012855	GAT	2	6	159143	159148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589700
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3150	NC_012855	CTG	2	6	159601	159606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589701
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3154	NC_012855	AGCC	2	8	159828	159835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_012855	CCGG	2	8	159878	159885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_012855	GCCA	2	8	159974	159981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_012855	GCG	2	6	160003	160008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3166	NC_012855	GCCGT	2	10	160514	160523	0 %	20 %	40 %	40 %	241589703
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3229	NC_012855	AGGAC	2	10	164170	164179	40 %	0 %	40 %	20 %	241589712
3230	NC_012855	CGG	2	6	164251	164256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589712
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3235	NC_012855	GCC	2	6	164416	164421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3236	NC_012855	GC	3	6	164525	164530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3237	NC_012855	GCA	2	6	164591	164596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589713
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3240	NC_012855	CG	5	10	164689	164698	0 %	0 %	50 %	50 %	241589713
3241	NC_012855	TGA	2	6	164723	164728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589713
3242	NC_012855	CGA	2	6	164762	164767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589713
3243	NC_012855	GCAG	2	8	164822	164829	25 %	0 %	50 %	25 %	241589713
3244	NC_012855	AGC	2	6	164855	164860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589713
3245	NC_012855	CCA	2	6	164865	164870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589713
3246	NC_012855	AAC	2	6	164895	164900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589713
3247	NC_012855	GAA	2	6	164923	164928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589713
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3249	NC_012855	ATCG	2	8	165020	165027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3373	NC_012855	CGA	2	6	169748	169753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589719
3374	NC_012855	TGC	2	6	169765	169770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589719
3375	NC_012855	CTG	2	6	169773	169778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589719
3376	NC_012855	GCT	2	6	169823	169828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589719
3377	NC_012855	TGC	2	6	169916	169921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589719
3378	NC_012855	TTCCT	2	10	169955	169964	0 %	60 %	0 %	40 %	241589720
3379	NC_012855	CTG	2	6	170085	170090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589720
3380	NC_012855	GATGC	2	10	170116	170125	20 %	20 %	40 %	20 %	241589720
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3382	NC_012855	G	6	6	170140	170145	0 %	0 %	100 %	0 %	241589720
3383	NC_012855	TAC	2	6	170250	170255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589720
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3386	NC_012855	CG	3	6	170326	170331	0 %	0 %	50 %	50 %	241589720
3387	NC_012855	CGG	2	6	170348	170353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589720
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3392	NC_012855	GAT	2	6	170590	170595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589720
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3394	NC_012855	TGC	2	6	170797	170802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589721
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3402	NC_012855	CTG	2	6	171339	171344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589722
3403	NC_012855	GAT	2	6	171379	171384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589722
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3431	NC_012855	GCG	2	6	172979	172984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3438	NC_012855	GCTG	3	12	173540	173551	0 %	25 %	50 %	25 %	241589726
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3447	NC_012855	CG	3	6	173976	173981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3448	NC_012855	CAC	2	6	173986	173991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3452	NC_012855	TCAC	2	8	174093	174100	25 %	25 %	0 %	50 %	241589728
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3479	NC_012855	AGGCTG	2	12	175855	175866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241589732
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3481	NC_012855	TGGC	2	8	175965	175972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3482	NC_012855	AGC	2	6	176027	176032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589733
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3492	NC_012855	ACG	2	6	176693	176698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589733
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3496	NC_012855	TTG	2	6	176942	176947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589734
3497	NC_012855	GTT	2	6	177067	177072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589734
3498	NC_012855	GAT	2	6	177136	177141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589734
3499	NC_012855	GAG	2	6	177163	177168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589734
3500	NC_012855	GTA	2	6	177286	177291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589734

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