MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 6523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012854	CG	3	6	113206	113211	0 %	0 %	50 %	50 %	241554184
2502	NC_012854	GCGG	2	8	113248	113255	0 %	0 %	75 %	25 %	241554184
2503	NC_012854	CAG	2	6	113301	113306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2504	NC_012854	GCC	2	6	113344	113349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554184
2505	NC_012854	CTT	2	6	113357	113362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554184
2506	NC_012854	GGC	2	6	113370	113375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2507	NC_012854	CTG	2	6	113379	113384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2508	NC_012854	TG	3	6	113383	113388	0 %	50 %	50 %	0 %	241554184
2509	NC_012854	ATCC	2	8	113394	113401	25 %	25 %	0 %	50 %	241554184
2510	NC_012854	CGG	2	6	113408	113413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2511	NC_012854	CGA	2	6	113456	113461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2512	NC_012854	CTG	2	6	113484	113489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2513	NC_012854	CGC	2	6	113543	113548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554184
2514	NC_012854	GCC	2	6	113596	113601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554184
2515	NC_012854	ACG	2	6	113641	113646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2516	NC_012854	GGC	2	6	113676	113681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2517	NC_012854	CAG	2	6	113703	113708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2518	NC_012854	GAT	2	6	113742	113747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554184
2519	NC_012854	GGA	2	6	113766	113771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554184
2520	NC_012854	ACG	2	6	113806	113811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2521	NC_012854	TTG	2	6	113872	113877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554184
2522	NC_012854	GGT	2	6	113892	113897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554184
2523	NC_012854	AGC	2	6	113913	113918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2524	NC_012854	CTGC	2	8	113939	113946	0 %	25 %	25 %	50 %	241554184
2525	NC_012854	CCGC	2	8	113998	114005	0 %	0 %	25 %	75 %	241554184
2526	NC_012854	GGC	2	6	114039	114044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2527	NC_012854	CTG	2	6	114117	114122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2528	NC_012854	CAGC	2	8	114137	114144	25 %	0 %	25 %	50 %	241554184
2529	NC_012854	TCG	2	6	114337	114342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2530	NC_012854	CG	3	6	114344	114349	0 %	0 %	50 %	50 %	241554184
2531	NC_012854	CGA	2	6	114358	114363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2532	NC_012854	CGA	2	6	114425	114430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2533	NC_012854	CGTG	2	8	114432	114439	0 %	25 %	50 %	25 %	241554184
2534	NC_012854	CGG	3	9	114446	114454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2535	NC_012854	TGC	2	6	114521	114526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2536	NC_012854	CGC	2	6	114533	114538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554184
2537	NC_012854	TTG	2	6	114577	114582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554184
2538	NC_012854	GGCC	2	8	114606	114613	0 %	0 %	50 %	50 %	241554184
2539	NC_012854	GCCG	2	8	114753	114760	0 %	0 %	50 %	50 %	241554184
2540	NC_012854	CGG	2	6	114833	114838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554184
2541	NC_012854	GCT	2	6	114929	114934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2542	NC_012854	CGT	2	6	114947	114952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554184
2543	NC_012854	GC	3	6	115053	115058	0 %	0 %	50 %	50 %	241554184
2544	NC_012854	TTC	2	6	115081	115086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554184
2545	NC_012854	TTG	2	6	115114	115119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554184
2546	NC_012854	CAT	2	6	115293	115298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_012854	CGT	2	6	115324	115329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_012854	A	6	6	115340	115345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_012854	AT	3	6	115354	115359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012854	AG	3	6	115363	115368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_012854	GAG	2	6	115442	115447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012854	GGT	2	6	115457	115462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012854	AGC	2	6	115624	115629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2554	NC_012854	AGC	2	6	115633	115638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2555	NC_012854	GA	3	6	115663	115668	50 %	0 %	50 %	0 %	241554185
2556	NC_012854	AGCG	2	8	115723	115730	25 %	0 %	50 %	25 %	241554185
2557	NC_012854	CCG	2	6	115742	115747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2558	NC_012854	CCAG	2	8	115754	115761	25 %	0 %	25 %	50 %	241554185
2559	NC_012854	GTG	2	6	115762	115767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554185
2560	NC_012854	CCG	4	12	115774	115785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2561	NC_012854	GTC	2	6	115812	115817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2562	NC_012854	CGC	2	6	115826	115831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2563	NC_012854	AGC	2	6	115846	115851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2564	NC_012854	GCT	2	6	115853	115858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2565	NC_012854	GTG	2	6	115957	115962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554185
2566	NC_012854	CGT	2	6	115974	115979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2567	NC_012854	GCG	2	6	116000	116005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554185
2568	NC_012854	CG	3	6	116044	116049	0 %	0 %	50 %	50 %	241554185
2569	NC_012854	AGA	2	6	116084	116089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554185
2570	NC_012854	GGC	2	6	116109	116114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554185
2571	NC_012854	GCC	2	6	116125	116130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2572	NC_012854	GCC	2	6	116139	116144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2573	NC_012854	GTC	2	6	116169	116174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2574	NC_012854	CAC	2	6	116193	116198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554185
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2577	NC_012854	CGC	2	6	116400	116405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554185
2578	NC_012854	GGT	3	9	116466	116474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554185
2579	NC_012854	GCG	2	6	116479	116484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554185
2580	NC_012854	GGC	2	6	116513	116518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554185
2581	NC_012854	GC	3	6	116537	116542	0 %	0 %	50 %	50 %	241554185
2582	NC_012854	CTTG	2	8	116569	116576	0 %	50 %	25 %	25 %	241554185
2583	NC_012854	TGT	2	6	116597	116602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554185
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2585	NC_012854	CGT	2	6	116642	116647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
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2587	NC_012854	TGC	2	6	116689	116694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554185
2588	NC_012854	TG	4	8	116700	116707	0 %	50 %	50 %	0 %	241554185
2589	NC_012854	GGA	2	6	116726	116731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554185
2590	NC_012854	GCC	2	6	116754	116759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554186
2591	NC_012854	CTG	3	9	116765	116773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2592	NC_012854	GGCG	2	8	116799	116806	0 %	0 %	75 %	25 %	241554186
2593	NC_012854	CGT	2	6	116831	116836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2594	NC_012854	GAC	2	6	116882	116887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2595	NC_012854	CGA	2	6	116893	116898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2596	NC_012854	CGG	2	6	116924	116929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2597	NC_012854	ATG	2	6	116931	116936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554186
2598	NC_012854	GCA	2	6	116949	116954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2599	NC_012854	GCATC	2	10	116974	116983	20 %	20 %	20 %	40 %	241554186
2600	NC_012854	ACC	2	6	117006	117011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554186
2601	NC_012854	TTG	2	6	117066	117071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554186
2602	NC_012854	GGC	2	6	117100	117105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2603	NC_012854	TTG	2	6	117108	117113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554186
2604	NC_012854	TAT	2	6	117121	117126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554186
2605	NC_012854	CAGG	2	8	117127	117134	25 %	0 %	50 %	25 %	241554186
2606	NC_012854	GC	3	6	117188	117193	0 %	0 %	50 %	50 %	241554186
2607	NC_012854	GCTTCC	2	12	117255	117266	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241554186
2608	NC_012854	GCC	2	6	117269	117274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554186
2609	NC_012854	CAG	2	6	117302	117307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2610	NC_012854	CCGG	2	8	117313	117320	0 %	0 %	50 %	50 %	241554186
2611	NC_012854	GCC	2	6	117337	117342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554186
2612	NC_012854	ATC	2	6	117399	117404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554186
2613	NC_012854	GCGG	2	8	117413	117420	0 %	0 %	75 %	25 %	241554186
2614	NC_012854	GGC	2	6	117481	117486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2615	NC_012854	GAA	2	6	117512	117517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554186
2616	NC_012854	CGA	2	6	117532	117537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2617	NC_012854	CGA	2	6	117631	117636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2618	NC_012854	TTC	2	6	117693	117698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554186
2619	NC_012854	CGT	2	6	117713	117718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2620	NC_012854	GAC	2	6	117719	117724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2621	NC_012854	GGC	2	6	117731	117736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2622	NC_012854	GTC	2	6	117801	117806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2623	NC_012854	CGA	2	6	117817	117822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2624	NC_012854	GCC	2	6	117852	117857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554186
2625	NC_012854	GC	3	6	117880	117885	0 %	0 %	50 %	50 %	241554186
2626	NC_012854	CGA	2	6	117897	117902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2627	NC_012854	CGA	2	6	117949	117954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554186
2628	NC_012854	CGG	2	6	117979	117984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2629	NC_012854	GGC	2	6	118052	118057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554186
2630	NC_012854	ATG	2	6	118061	118066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554186
2631	NC_012854	ATG	2	6	118077	118082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554186
2632	NC_012854	TCC	2	6	118128	118133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_012854	GGC	2	6	118159	118164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554187
2634	NC_012854	GAG	2	6	118198	118203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554187
2635	NC_012854	GATC	2	8	118257	118264	25 %	25 %	25 %	25 %	241554187
2636	NC_012854	GGC	2	6	118281	118286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554187
2637	NC_012854	TCG	2	6	118289	118294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554187
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2640	NC_012854	CTG	2	6	118495	118500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554187
2641	NC_012854	CCT	2	6	118578	118583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554187
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2645	NC_012854	CCG	2	6	118837	118842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554187
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2651	NC_012854	GATC	2	8	119018	119025	25 %	25 %	25 %	25 %	241554188
2652	NC_012854	TGG	2	6	119042	119047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554188
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2658	NC_012854	CG	3	6	119340	119345	0 %	0 %	50 %	50 %	241554188
2659	NC_012854	ATCC	2	8	119557	119564	25 %	25 %	0 %	50 %	241554188
2660	NC_012854	GCCGA	2	10	119569	119578	20 %	0 %	40 %	40 %	241554188
2661	NC_012854	AGCC	2	8	119675	119682	25 %	0 %	25 %	50 %	241554188
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2663	NC_012854	GAC	2	6	119725	119730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554188
2664	NC_012854	TCTCC	2	10	119780	119789	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2665	NC_012854	TTG	2	6	119882	119887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554189
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2686	NC_012854	GAAACC	2	12	120963	120974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2687	NC_012854	A	6	6	121020	121025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2688	NC_012854	GCA	2	6	121093	121098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2695	NC_012854	CAAA	2	8	121470	121477	75 %	0 %	0 %	25 %	241554190
2696	NC_012854	ATCG	2	8	121562	121569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2697	NC_012854	TTC	2	6	121648	121653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554191
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2708	NC_012854	CATCG	2	10	122190	122199	20 %	20 %	20 %	40 %	241554191
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2718	NC_012854	TGTT	2	8	122704	122711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2719	NC_012854	TCC	2	6	122759	122764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554192
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2727	NC_012854	CAGG	2	8	123272	123279	25 %	0 %	50 %	25 %	241554192
2728	NC_012854	ACC	2	6	123286	123291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554192
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2730	NC_012854	CAG	2	6	123384	123389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554192
2731	NC_012854	GAC	2	6	123432	123437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554192
2732	NC_012854	ATC	2	6	123547	123552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554192
2733	NC_012854	CAGC	2	8	123554	123561	25 %	0 %	25 %	50 %	241554192
2734	NC_012854	GAT	2	6	123573	123578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554192
2735	NC_012854	TCT	2	6	123707	123712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554192
2736	NC_012854	GATGCG	2	12	123811	123822	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241554193
2737	NC_012854	TGA	2	6	123827	123832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554193
2738	NC_012854	CGT	2	6	123840	123845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554193
2739	NC_012854	CAGT	2	8	123857	123864	25 %	25 %	25 %	25 %	241554193
2740	NC_012854	CG	3	6	123881	123886	0 %	0 %	50 %	50 %	241554193
2741	NC_012854	GC	3	6	123896	123901	0 %	0 %	50 %	50 %	241554193
2742	NC_012854	CGG	2	6	124019	124024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554193
2743	NC_012854	CAG	2	6	124041	124046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554193
2744	NC_012854	GCCA	2	8	124060	124067	25 %	0 %	25 %	50 %	241554193
2745	NC_012854	CGA	2	6	124073	124078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554193
2746	NC_012854	CTG	2	6	124086	124091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554193
2747	NC_012854	GCC	2	6	124095	124100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554193
2748	NC_012854	CGC	2	6	124181	124186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554193
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2750	NC_012854	AGGA	2	8	124195	124202	50 %	0 %	50 %	0 %	241554193
2751	NC_012854	AGGT	2	8	124234	124241	25 %	25 %	50 %	0 %	241554193
2752	NC_012854	CTC	2	6	124275	124280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554193
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2756	NC_012854	GAT	2	6	124575	124580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554193
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2775	NC_012854	ATGT	2	8	125326	125333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2830	NC_012854	TGA	2	6	127774	127779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554197
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2851	NC_012854	GCA	2	6	129009	129014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2852	NC_012854	ATGCCG	2	12	129052	129063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554198
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2855	NC_012854	GCC	2	6	129148	129153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554198
2856	NC_012854	GCT	2	6	129204	129209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
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2859	NC_012854	TCG	2	6	129293	129298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
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2861	NC_012854	GC	3	6	129331	129336	0 %	0 %	50 %	50 %	241554198
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2864	NC_012854	GCGG	2	8	129447	129454	0 %	0 %	75 %	25 %	241554198
2865	NC_012854	GGC	2	6	129511	129516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
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2986	NC_012854	TCA	2	6	135684	135689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554203
2987	NC_012854	GAC	2	6	135716	135721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554203
2988	NC_012854	GCC	2	6	135734	135739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554203
2989	NC_012854	GAG	2	6	135776	135781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554203
2990	NC_012854	GC	3	6	135805	135810	0 %	0 %	50 %	50 %	241554203
2991	NC_012854	CG	4	8	135901	135908	0 %	0 %	50 %	50 %	241554204
2992	NC_012854	CGT	2	6	135946	135951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554204
2993	NC_012854	GAC	2	6	135965	135970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554204
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2998	NC_012854	GAC	2	6	136217	136222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554204
2999	NC_012854	TCG	2	6	136231	136236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554204
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