MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 6523

< Previous1234567891011121314Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012854	GCAG	2	8	93243	93250	25 %	0 %	50 %	25 %	241554164
2002	NC_012854	GGC	2	6	93278	93283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554164
2003	NC_012854	GCC	2	6	93320	93325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554164
2004	NC_012854	TCG	3	9	93349	93357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554164
2005	NC_012854	GCC	2	6	93407	93412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554164
2006	NC_012854	AGC	2	6	93423	93428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554164
2007	NC_012854	GCC	2	6	93485	93490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554164
2008	NC_012854	AGC	2	6	93513	93518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554164
2009	NC_012854	GGC	2	6	93536	93541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554164
2010	NC_012854	GCG	2	6	93575	93580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554164
2011	NC_012854	GAT	2	6	93606	93611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554164
2012	NC_012854	TGC	2	6	93625	93630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554164
2013	NC_012854	GTG	2	6	93644	93649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554165
2014	NC_012854	CGA	2	6	93669	93674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554165
2015	NC_012854	CGA	2	6	93714	93719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554165
2016	NC_012854	GCC	2	6	93795	93800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554165
2017	NC_012854	CGC	2	6	93858	93863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554165
2018	NC_012854	GAG	2	6	93877	93882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554165
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2021	NC_012854	CGGG	2	8	93958	93965	0 %	0 %	75 %	25 %	241554165
2022	NC_012854	GC	3	6	93991	93996	0 %	0 %	50 %	50 %	241554165
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2024	NC_012854	CGAG	2	8	94059	94066	25 %	0 %	50 %	25 %	241554165
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2030	NC_012854	CGA	2	6	94284	94289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554165
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2032	NC_012854	CGG	2	6	94332	94337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554165
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2035	NC_012854	AGTGC	2	10	94550	94559	20 %	20 %	40 %	20 %	241554165
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2041	NC_012854	ACG	2	6	94877	94882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554165
2042	NC_012854	CG	3	6	94896	94901	0 %	0 %	50 %	50 %	241554165
2043	NC_012854	GCC	2	6	94904	94909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554165
2044	NC_012854	CGA	2	6	94938	94943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554165
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2094	NC_012854	GCC	3	9	97202	97210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554167
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2097	NC_012854	GTC	2	6	97396	97401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2109	NC_012854	TGT	2	6	98130	98135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554168
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2115	NC_012854	TCG	2	6	98480	98485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554168
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2123	NC_012854	GCC	2	6	98654	98659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
2124	NC_012854	CGA	2	6	98682	98687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554168
2125	NC_012854	AAC	2	6	98689	98694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554168
2126	NC_012854	TCG	2	6	98750	98755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554168
2127	NC_012854	GCC	2	6	98829	98834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
2128	NC_012854	CGA	2	6	98853	98858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554168
2129	NC_012854	TCG	2	6	98861	98866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554168
2130	NC_012854	GCCT	2	8	98945	98952	0 %	25 %	25 %	50 %	241554168
2131	NC_012854	GCA	2	6	98995	99000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554168
2132	NC_012854	GAG	2	6	99005	99010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554168
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2134	NC_012854	GCC	2	6	99057	99062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554169
2135	NC_012854	GC	3	6	99261	99266	0 %	0 %	50 %	50 %	241554169
2136	NC_012854	GAT	2	6	99272	99277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554169
2137	NC_012854	GTG	2	6	99323	99328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554169
2138	NC_012854	CGATC	2	10	99385	99394	20 %	20 %	20 %	40 %	241554169
2139	NC_012854	GGCGCT	2	12	99418	99429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241554169
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2146	NC_012854	TCG	2	6	99639	99644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554169
2147	NC_012854	CGA	2	6	99660	99665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554169
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2149	NC_012854	GCC	2	6	99686	99691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554169
2150	NC_012854	GAT	2	6	99694	99699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554169
2151	NC_012854	CAA	2	6	99706	99711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554169
2152	NC_012854	GCC	2	6	99803	99808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554169
2153	NC_012854	AGCCG	2	10	99855	99864	20 %	0 %	40 %	40 %	241554169
2154	NC_012854	CCA	2	6	99902	99907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2155	NC_012854	CGC	2	6	99971	99976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554170
2156	NC_012854	GCCA	2	8	100008	100015	25 %	0 %	25 %	50 %	241554170
2157	NC_012854	GGT	2	6	100017	100022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554170
2158	NC_012854	CGC	2	6	100040	100045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554170
2159	NC_012854	CGGCC	2	10	100106	100115	0 %	0 %	40 %	60 %	241554170
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2163	NC_012854	TCG	2	6	100204	100209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554170
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2165	NC_012854	CGG	2	6	100381	100386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554170
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2195	NC_012854	GAC	2	6	101483	101488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554171
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2197	NC_012854	ATCT	2	8	101520	101527	25 %	50 %	0 %	25 %	241554171
2198	NC_012854	GATCCT	2	12	101537	101548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241554171
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2200	NC_012854	TTCG	2	8	101625	101632	0 %	50 %	25 %	25 %	241554171
2201	NC_012854	GCT	2	6	101645	101650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554171
2202	NC_012854	GC	4	8	101688	101695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2203	NC_012854	GCG	2	6	101715	101720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2204	NC_012854	CG	3	6	101719	101724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2205	NC_012854	GGA	2	6	101744	101749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2206	NC_012854	CCG	2	6	101816	101821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554172
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2209	NC_012854	CGTC	2	8	101908	101915	0 %	25 %	25 %	50 %	241554172
2210	NC_012854	ATC	2	6	101955	101960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554172
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2212	NC_012854	CTGG	2	8	102009	102016	0 %	25 %	50 %	25 %	241554172
2213	NC_012854	CAGAG	2	10	102037	102046	40 %	0 %	40 %	20 %	241554172
2214	NC_012854	ACG	2	6	102061	102066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
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2224	NC_012854	CAT	2	6	102417	102422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554172
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2231	NC_012854	GAT	2	6	102564	102569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554172
2232	NC_012854	CAG	2	6	102579	102584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
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2235	NC_012854	GAT	2	6	102633	102638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554172
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2238	NC_012854	CCA	2	6	102711	102716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554172
2239	NC_012854	AGC	2	6	102763	102768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
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2243	NC_012854	CCA	2	6	102831	102836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554172
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2246	NC_012854	GGC	2	6	102915	102920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554172
2247	NC_012854	AAC	2	6	102958	102963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554172
2248	NC_012854	CGA	2	6	103037	103042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
2249	NC_012854	CGATC	2	10	103092	103101	20 %	20 %	20 %	40 %	241554172
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2251	NC_012854	ATG	2	6	103114	103119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554172
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2259	NC_012854	AG	3	6	103354	103359	50 %	0 %	50 %	0 %	241554172
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2271	NC_012854	GGC	2	6	103751	103756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2487	NC_012854	TGA	2	6	112582	112587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554183
2488	NC_012854	GCC	2	6	112596	112601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554183
2489	NC_012854	GGCGA	2	10	112659	112668	20 %	0 %	60 %	20 %	241554183
2490	NC_012854	CTCG	2	8	112685	112692	0 %	25 %	25 %	50 %	241554183
2491	NC_012854	TCA	2	6	112717	112722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554183
2492	NC_012854	GCT	2	6	112757	112762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554183
2493	NC_012854	CGG	2	6	112763	112768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554183
2494	NC_012854	TCG	2	6	112855	112860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554183
2495	NC_012854	CGG	3	9	112865	112873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554183
2496	NC_012854	CGG	2	6	112925	112930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554183
2497	NC_012854	CTG	2	6	112956	112961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554183
2498	NC_012854	GCA	2	6	113053	113058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_012854	GCTTT	2	10	113086	113095	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2500	NC_012854	ATC	2	6	113197	113202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554184

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