MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 6523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012854	GAC	2	6	27545	27550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554094
502	NC_012854	CCCCT	2	10	27554	27563	0 %	20 %	0 %	80 %	241554094
503	NC_012854	CCAT	2	8	27570	27577	25 %	25 %	0 %	50 %	241554094
504	NC_012854	GCCA	2	8	27602	27609	25 %	0 %	25 %	50 %	241554094
505	NC_012854	GTC	2	6	27617	27622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554094
506	NC_012854	CCGG	3	12	27630	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	241554094
507	NC_012854	CGG	2	6	27682	27687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554094
508	NC_012854	CGAT	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	241554094
509	NC_012854	GCG	2	6	27769	27774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554094
510	NC_012854	GGCTG	2	10	27784	27793	0 %	20 %	60 %	20 %	241554094
511	NC_012854	TCGG	2	8	27823	27830	0 %	25 %	50 %	25 %	241554094
512	NC_012854	GCA	2	6	27904	27909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554094
513	NC_012854	CTA	2	6	27919	27924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554094
514	NC_012854	AAC	2	6	27926	27931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554094
515	NC_012854	GCT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554094
516	NC_012854	ATT	2	6	28006	28011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012854	GAA	2	6	28028	28033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012854	AGAA	2	8	28052	28059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012854	CCACG	2	10	28142	28151	20 %	0 %	20 %	60 %	241554095
520	NC_012854	GAG	2	6	28236	28241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554095
521	NC_012854	CGC	2	6	28262	28267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554095
522	NC_012854	ACG	2	6	28312	28317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554095
523	NC_012854	ATC	2	6	28337	28342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554095
524	NC_012854	GGC	2	6	28384	28389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554096
525	NC_012854	ATC	2	6	28403	28408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554096
526	NC_012854	TGG	2	6	28461	28466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554096
527	NC_012854	CTT	2	6	28510	28515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554096
528	NC_012854	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	241554096
529	NC_012854	CAT	3	9	28528	28536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554096
530	NC_012854	AGGC	2	8	28571	28578	25 %	0 %	50 %	25 %	241554096
531	NC_012854	GTC	2	6	28599	28604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554096
532	NC_012854	GCT	2	6	28669	28674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554096
533	NC_012854	GCG	2	6	28712	28717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554096
534	NC_012854	AG	3	6	28731	28736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012854	CCCCT	2	10	28777	28786	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
536	NC_012854	GTT	2	6	28813	28818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012854	TGG	2	6	28838	28843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012854	CTT	2	6	28863	28868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012854	CGAT	2	8	28894	28901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_012854	GCG	2	6	28944	28949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012854	A	7	7	28966	28972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012854	GC	4	8	28993	29000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_012854	GGC	2	6	29100	29105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012854	AGC	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012854	TCG	2	6	29304	29309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012854	AGC	2	6	29326	29331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012854	CTAT	2	8	29356	29363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_012854	GCC	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_012854	CGGC	2	8	29408	29415	0 %	0 %	50 %	50 %	241554097
550	NC_012854	CGC	2	6	29476	29481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554097
551	NC_012854	GCC	2	6	29520	29525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554097
552	NC_012854	ATGC	2	8	29536	29543	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
553	NC_012854	GGC	2	6	29580	29585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554097
554	NC_012854	ATCG	2	8	29617	29624	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
555	NC_012854	CCA	2	6	29743	29748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554097
556	NC_012854	TCC	2	6	29782	29787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554097
557	NC_012854	CCCTT	2	10	29816	29825	0 %	40 %	0 %	60 %	241554097
558	NC_012854	TTG	2	6	29969	29974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554097
559	NC_012854	GCTGT	2	10	30047	30056	0 %	40 %	40 %	20 %	241554097
560	NC_012854	TCT	2	6	30130	30135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554097
561	NC_012854	CGG	2	6	30169	30174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554097
562	NC_012854	TCG	2	6	30250	30255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554097
563	NC_012854	GCG	2	6	30269	30274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554097
564	NC_012854	TCG	2	6	30295	30300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554097
565	NC_012854	CCCTG	2	10	30306	30315	0 %	20 %	20 %	60 %	241554097
566	NC_012854	GCA	2	6	30356	30361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554097
567	NC_012854	CGA	2	6	30374	30379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554097
568	NC_012854	GCG	2	6	30382	30387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554097
569	NC_012854	CGC	2	6	30394	30399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554097
570	NC_012854	GCCAT	2	10	30412	30421	20 %	20 %	20 %	40 %	241554097
571	NC_012854	GTTC	2	8	30482	30489	0 %	50 %	25 %	25 %	241554097
572	NC_012854	AGC	2	6	30547	30552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554097
573	NC_012854	GC	3	6	30569	30574	0 %	0 %	50 %	50 %	241554097
574	NC_012854	CCG	2	6	30660	30665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554097
575	NC_012854	CGT	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554097
576	NC_012854	T	6	6	30838	30843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012854	CGG	2	6	30927	30932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
578	NC_012854	CGC	2	6	30970	30975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554098
579	NC_012854	CCA	2	6	31014	31019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554098
580	NC_012854	AAGC	2	8	31020	31027	50 %	0 %	25 %	25 %	241554098
581	NC_012854	GC	3	6	31029	31034	0 %	0 %	50 %	50 %	241554098
582	NC_012854	CAG	2	6	31140	31145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554098
583	NC_012854	GCCC	2	8	31173	31180	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
584	NC_012854	GGCC	2	8	31234	31241	0 %	0 %	50 %	50 %	241554098
585	NC_012854	GATC	2	8	31263	31270	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
586	NC_012854	TGTC	2	8	31308	31315	0 %	50 %	25 %	25 %	241554098
587	NC_012854	GCG	2	6	31363	31368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
588	NC_012854	CTG	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554098
589	NC_012854	CCGC	2	8	31497	31504	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
590	NC_012854	GGC	2	6	31522	31527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
591	NC_012854	CTG	2	6	31576	31581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554098
592	NC_012854	GATC	2	8	31677	31684	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
593	NC_012854	GGC	3	9	31729	31737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554098
594	NC_012854	CAT	2	6	32049	32054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554099
595	NC_012854	CAT	2	6	32117	32122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554099
596	NC_012854	GCC	2	6	32172	32177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
597	NC_012854	AG	3	6	32295	32300	50 %	0 %	50 %	0 %	241554099
598	NC_012854	G	7	7	32319	32325	0 %	0 %	100 %	0 %	241554099
599	NC_012854	GAT	2	6	32331	32336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554099
600	NC_012854	GAC	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554099
601	NC_012854	GAA	2	6	32388	32393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554099
602	NC_012854	GTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
603	NC_012854	TGGA	2	8	32683	32690	25 %	25 %	50 %	0 %	241554099
604	NC_012854	GTC	3	9	32692	32700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
605	NC_012854	CGGC	2	8	32754	32761	0 %	0 %	50 %	50 %	241554099
606	NC_012854	TGG	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554099
607	NC_012854	CGCAT	2	10	32803	32812	20 %	20 %	20 %	40 %	241554099
608	NC_012854	GCC	2	6	32845	32850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
609	NC_012854	GGC	2	6	32880	32885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554099
610	NC_012854	AGC	2	6	32917	32922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554099
611	NC_012854	TGC	2	6	32936	32941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
612	NC_012854	CCG	2	6	32946	32951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554099
613	NC_012854	AAC	2	6	32977	32982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554099
614	NC_012854	GCT	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
615	NC_012854	TCG	2	6	33017	33022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554099
616	NC_012854	TCGTC	2	10	33035	33044	0 %	40 %	20 %	40 %	241554099
617	NC_012854	GACTC	2	10	33051	33060	20 %	20 %	20 %	40 %	241554099
618	NC_012854	CT	3	6	33062	33067	0 %	50 %	0 %	50 %	241554099
619	NC_012854	CAA	2	6	33077	33082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554099
620	NC_012854	ACAG	2	8	33193	33200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_012854	A	6	6	33210	33215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012854	GGC	2	6	33260	33265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_012854	ACA	2	6	33320	33325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012854	CGG	2	6	33426	33431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012854	GAGCG	2	10	33511	33520	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
626	NC_012854	GCC	2	6	33600	33605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_012854	CG	3	6	33646	33651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_012854	AGGGG	2	10	33653	33662	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012854	GGC	2	6	33703	33708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012854	CGC	2	6	33715	33720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_012854	AGA	2	6	33746	33751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012854	GC	3	6	33755	33760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_012854	TGC	3	9	33881	33889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012854	GGGGA	2	10	33899	33908	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012854	GCCAG	2	10	34005	34014	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
636	NC_012854	TCA	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_012854	ATC	2	6	34137	34142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_012854	GCA	2	6	34153	34158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_012854	GCC	2	6	34228	34233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_012854	TCT	2	6	34235	34240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_012854	CTT	2	6	34282	34287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_012854	CGG	2	6	34320	34325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_012854	AGGC	2	8	34390	34397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
644	NC_012854	CAT	2	6	34539	34544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
645	NC_012854	GTC	2	6	34557	34562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
646	NC_012854	TCA	2	6	34583	34588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
647	NC_012854	GCG	2	6	34591	34596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554100
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650	NC_012854	CGC	2	6	34758	34763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
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652	NC_012854	TGG	2	6	34817	34822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554100
653	NC_012854	CGT	2	6	34856	34861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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655	NC_012854	GCC	2	6	34899	34904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
656	NC_012854	TCGACG	2	12	35014	35025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554100
657	NC_012854	CGA	2	6	35083	35088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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659	NC_012854	ACG	2	6	35101	35106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
660	NC_012854	TCC	2	6	35179	35184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554100
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665	NC_012854	TCG	2	6	35320	35325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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668	NC_012854	TCG	2	6	35401	35406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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670	NC_012854	GCG	2	6	35524	35529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_012854	CCTTGC	2	12	35578	35589	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
672	NC_012854	GGA	2	6	35679	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554101
673	NC_012854	GCT	2	6	35724	35729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554101
674	NC_012854	CGG	2	6	35808	35813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554101
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687	NC_012854	A	6	6	36463	36468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
688	NC_012854	GTG	2	6	36491	36496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
689	NC_012854	ACG	2	6	36503	36508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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714	NC_012854	GAG	3	9	37515	37523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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718	NC_012854	CA	4	8	37664	37671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
719	NC_012854	T	6	6	37673	37678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
720	NC_012854	GAG	2	6	37685	37690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
721	NC_012854	ATG	2	6	37697	37702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554103
722	NC_012854	CAA	2	6	37710	37715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554103
723	NC_012854	GGC	2	6	37717	37722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554103
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751	NC_012854	CCGCTG	2	12	38547	38558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241554103
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