MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012853	GC	3	6	167761	167766	0 %	0 %	50 %	50 %	241518322
3502	NC_012853	CGC	3	9	167776	167784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518322
3503	NC_012853	AGA	2	6	167800	167805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518322
3504	NC_012853	ATG	2	6	167860	167865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518322
3505	NC_012853	ATGCG	2	10	167940	167949	20 %	20 %	40 %	20 %	241518323
3506	NC_012853	CTG	2	6	167950	167955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3507	NC_012853	GGA	2	6	168003	168008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518323
3508	NC_012853	CGA	2	6	168081	168086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3509	NC_012853	GAT	2	6	168159	168164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518323
3510	NC_012853	CCGGCA	2	12	168176	168187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241518323
3511	NC_012853	CAT	2	6	168211	168216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518323
3512	NC_012853	CGA	2	6	168236	168241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3513	NC_012853	CAGA	2	8	168274	168281	50 %	0 %	25 %	25 %	241518323
3514	NC_012853	CG	3	6	168314	168319	0 %	0 %	50 %	50 %	241518323
3515	NC_012853	ACG	2	6	168326	168331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3516	NC_012853	GCGG	2	8	168339	168346	0 %	0 %	75 %	25 %	241518323
3517	NC_012853	TGC	2	6	168368	168373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3518	NC_012853	ATC	2	6	168451	168456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518323
3519	NC_012853	CTG	2	6	168463	168468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3520	NC_012853	GC	3	6	168485	168490	0 %	0 %	50 %	50 %	241518323
3521	NC_012853	GCG	2	6	168509	168514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518323
3522	NC_012853	GATG	2	8	168570	168577	25 %	25 %	50 %	0 %	241518323
3523	NC_012853	TGG	2	6	168641	168646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518323
3524	NC_012853	CGT	3	9	168678	168686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3525	NC_012853	GAC	2	6	168706	168711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3526	NC_012853	CGA	2	6	168767	168772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
3527	NC_012853	CGC	2	6	168816	168821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518323
3528	NC_012853	GC	3	6	168882	168887	0 %	0 %	50 %	50 %	241518323
3529	NC_012853	CGC	2	6	168900	168905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518323
3530	NC_012853	GATG	2	8	168951	168958	25 %	25 %	50 %	0 %	241518324
3531	NC_012853	CGA	2	6	168968	168973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3532	NC_012853	GA	3	6	168972	168977	50 %	0 %	50 %	0 %	241518324
3533	NC_012853	CGG	2	6	169035	169040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518324
3534	NC_012853	GCCG	2	8	169113	169120	0 %	0 %	50 %	50 %	241518324
3535	NC_012853	CGC	2	6	169194	169199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518324
3536	NC_012853	GTC	2	6	169204	169209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3537	NC_012853	CGG	2	6	169253	169258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518324
3538	NC_012853	ACG	2	6	169301	169306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3539	NC_012853	ACC	2	6	169358	169363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518324
3540	NC_012853	CTG	2	6	169375	169380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3541	NC_012853	TCT	2	6	169389	169394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518324
3542	NC_012853	ATG	2	6	169417	169422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518324
3543	NC_012853	CGA	2	6	169446	169451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3544	NC_012853	CTT	2	6	169527	169532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518324
3545	NC_012853	GGC	2	6	169584	169589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518324
3546	NC_012853	TGC	2	6	169601	169606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3547	NC_012853	CGA	2	6	169660	169665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518324
3548	NC_012853	GCC	2	6	169689	169694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518324
3549	NC_012853	TCG	2	6	169724	169729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_012853	GCA	2	6	169778	169783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3551	NC_012853	CAGCCG	2	12	169816	169827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241518325
3552	NC_012853	GTC	2	6	169858	169863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3553	NC_012853	AGC	2	6	169883	169888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3554	NC_012853	ACA	2	6	169905	169910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518325
3555	NC_012853	GC	3	6	169911	169916	0 %	0 %	50 %	50 %	241518325
3556	NC_012853	GCA	2	6	169967	169972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3557	NC_012853	AAG	2	6	170075	170080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518325
3558	NC_012853	ATG	2	6	170090	170095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518325
3559	NC_012853	CAC	2	6	170110	170115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518325
3560	NC_012853	CT	3	6	170149	170154	0 %	50 %	0 %	50 %	241518325
3561	NC_012853	GTC	2	6	170168	170173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3562	NC_012853	GGCA	2	8	170274	170281	25 %	0 %	50 %	25 %	241518325
3563	NC_012853	AGC	2	6	170282	170287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3564	NC_012853	CAG	2	6	170313	170318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3565	NC_012853	CTC	2	6	170401	170406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518325
3566	NC_012853	CGT	2	6	170529	170534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3567	NC_012853	GC	4	8	170536	170543	0 %	0 %	50 %	50 %	241518325
3568	NC_012853	GCG	2	6	170560	170565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518325
3569	NC_012853	GTTC	2	8	170607	170614	0 %	50 %	25 %	25 %	241518325
3570	NC_012853	CGA	2	6	170661	170666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
3571	NC_012853	GCCG	2	8	170677	170684	0 %	0 %	50 %	50 %	241518325
3572	NC_012853	GATG	2	8	170687	170694	25 %	25 %	50 %	0 %	241518325
3573	NC_012853	CGC	2	6	170747	170752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518325
3574	NC_012853	GGCTG	2	10	170831	170840	0 %	20 %	60 %	20 %	241518325
3575	NC_012853	CAG	2	6	170881	170886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518325
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3577	NC_012853	CTGA	2	8	170953	170960	25 %	25 %	25 %	25 %	241518325
3578	NC_012853	GCG	2	6	171010	171015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518325
3579	NC_012853	ATG	2	6	171017	171022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518325
3580	NC_012853	CGG	2	6	171108	171113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518325
3581	NC_012853	TGC	2	6	171168	171173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_012853	GTT	2	6	171294	171299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_012853	CGA	2	6	171332	171337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3584	NC_012853	CGA	2	6	171395	171400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3585	NC_012853	AC	3	6	171451	171456	50 %	0 %	0 %	50 %	241518326
3586	NC_012853	GGCCGC	2	12	171479	171490	0 %	0 %	50 %	50 %	241518326
3587	NC_012853	GA	3	6	171593	171598	50 %	0 %	50 %	0 %	241518326
3588	NC_012853	GC	3	6	171618	171623	0 %	0 %	50 %	50 %	241518326
3589	NC_012853	CG	3	6	171646	171651	0 %	0 %	50 %	50 %	241518326
3590	NC_012853	TCC	2	6	171652	171657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518326
3591	NC_012853	TCG	2	6	171669	171674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3592	NC_012853	ATCC	2	8	171813	171820	25 %	25 %	0 %	50 %	241518326
3593	NC_012853	ACT	2	6	171883	171888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518326
3594	NC_012853	CAT	2	6	171950	171955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518326
3595	NC_012853	CGC	2	6	171991	171996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518326
3596	NC_012853	TGA	2	6	172003	172008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518326
3597	NC_012853	CGG	2	6	172031	172036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518326
3598	NC_012853	CGA	2	6	172048	172053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3599	NC_012853	AGG	2	6	172075	172080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518326
3600	NC_012853	GTC	3	9	172143	172151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3601	NC_012853	CCG	2	6	172181	172186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518326
3602	NC_012853	CCGG	2	8	172224	172231	0 %	0 %	50 %	50 %	241518326
3603	NC_012853	CCA	2	6	172279	172284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518326
3604	NC_012853	ACG	2	6	172288	172293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3605	NC_012853	GCC	2	6	172335	172340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518326
3606	NC_012853	ACG	2	6	172367	172372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518326
3607	NC_012853	CGG	2	6	172390	172395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518326
3608	NC_012853	ACG	2	6	172445	172450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_012853	GCC	2	6	172554	172559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518327
3610	NC_012853	CGA	2	6	172619	172624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518327
3611	NC_012853	TCGA	2	8	172662	172669	25 %	25 %	25 %	25 %	241518327
3612	NC_012853	GCC	2	6	172783	172788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518328
3613	NC_012853	TTC	2	6	172798	172803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518328
3614	NC_012853	GAC	2	6	172812	172817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518328
3615	NC_012853	CAT	2	6	172833	172838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518328
3616	NC_012853	TCTT	2	8	172876	172883	0 %	75 %	0 %	25 %	241518328
3617	NC_012853	CCGA	2	8	172891	172898	25 %	0 %	25 %	50 %	241518328
3618	NC_012853	GTCG	2	8	172935	172942	0 %	25 %	50 %	25 %	241518328
3619	NC_012853	TGA	2	6	173015	173020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518328
3620	NC_012853	GAG	2	6	173085	173090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518328
3621	NC_012853	CGC	2	6	173102	173107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518328
3622	NC_012853	CTG	2	6	173130	173135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518328
3623	NC_012853	CGA	2	6	173153	173158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518328
3624	NC_012853	CGA	2	6	173168	173173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518328
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3626	NC_012853	TCG	2	6	173383	173388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518328
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3634	NC_012853	TTC	2	6	173669	173674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3746	NC_012853	ATC	2	6	179362	179367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518336
3747	NC_012853	GC	4	8	179373	179380	0 %	0 %	50 %	50 %	241518336
3748	NC_012853	GGT	2	6	179443	179448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518336
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3751	NC_012853	TGC	2	6	179526	179531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518336
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3759	NC_012853	TTG	2	6	179850	179855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3772	NC_012853	CGTT	2	8	180436	180443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3773	NC_012853	CGG	2	6	180461	180466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3774	NC_012853	CTT	2	6	180469	180474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3778	NC_012853	CTT	2	6	180749	180754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3781	NC_012853	CCA	2	6	180912	180917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3782	NC_012853	T	6	6	181050	181055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3871	NC_012853	TGA	2	6	185668	185673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518341
3872	NC_012853	AG	3	6	185749	185754	50 %	0 %	50 %	0 %	241518341
3873	NC_012853	CCT	2	6	185797	185802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518341
3874	NC_012853	CTT	2	6	185805	185810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518341
3875	NC_012853	CGG	2	6	185837	185842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518341
3876	NC_012853	TCG	2	6	185844	185849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518341
3877	NC_012853	CGC	2	6	185939	185944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518341
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3879	NC_012853	GACG	2	8	186055	186062	25 %	0 %	50 %	25 %	241518341
3880	NC_012853	CGG	2	6	186077	186082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518341
3881	NC_012853	GCAC	2	8	186106	186113	25 %	0 %	25 %	50 %	241518341
3882	NC_012853	GGA	2	6	186157	186162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518341
3883	NC_012853	CCT	2	6	186166	186171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518341
3884	NC_012853	TCC	2	6	186192	186197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518341
3885	NC_012853	CGA	2	6	186217	186222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518341
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3893	NC_012853	GAC	2	6	186416	186421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518341
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3915	NC_012853	TCG	3	9	187397	187405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518342
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3922	NC_012853	CGA	2	6	187731	187736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518342
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3929	NC_012853	TC	3	6	187953	187958	0 %	50 %	0 %	50 %	241518342
3930	NC_012853	CTC	2	6	188092	188097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518342
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3938	NC_012853	GCT	2	6	188373	188378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518342
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3944	NC_012853	CTC	2	6	188552	188557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518343
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3948	NC_012853	CGC	2	6	188699	188704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518343
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3951	NC_012853	ACC	2	6	188811	188816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518343
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3954	NC_012853	GCG	2	6	188928	188933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518343
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3968	NC_012853	TCT	2	6	189663	189668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518344
3969	NC_012853	GCC	2	6	189687	189692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518344
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3972	NC_012853	CTC	2	6	189915	189920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518344
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3974	NC_012853	GATG	2	8	189972	189979	25 %	25 %	50 %	0 %	241518344
3975	NC_012853	CGT	2	6	189986	189991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518344
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3978	NC_012853	GGA	2	6	190081	190086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518344
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3982	NC_012853	CTG	2	6	190232	190237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3983	NC_012853	GCCG	2	8	190285	190292	0 %	0 %	50 %	50 %	241518345
3984	NC_012853	CGG	2	6	190468	190473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518345
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3986	NC_012853	CTG	2	6	190502	190507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3987	NC_012853	CTG	2	6	190550	190555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3988	NC_012853	ACA	2	6	190593	190598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518345
3989	NC_012853	GGT	2	6	190697	190702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518345
3990	NC_012853	ATCA	2	8	190706	190713	50 %	25 %	0 %	25 %	241518345
3991	NC_012853	TCGG	2	8	190766	190773	0 %	25 %	50 %	25 %	241518345
3992	NC_012853	TCG	2	6	190788	190793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3993	NC_012853	GCG	2	6	190823	190828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518345
3994	NC_012853	CGGCG	2	10	190852	190861	0 %	0 %	60 %	40 %	241518345
3995	NC_012853	CG	3	6	190860	190865	0 %	0 %	50 %	50 %	241518345
3996	NC_012853	GTC	2	6	190934	190939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3997	NC_012853	CGA	2	6	190948	190953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518345
3998	NC_012853	AAGG	2	8	190994	191001	50 %	0 %	50 %	0 %	241518345
3999	NC_012853	GC	3	6	191048	191053	0 %	0 %	50 %	50 %	241518345
4000	NC_012853	CCG	2	6	191060	191065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518345

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