MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012853	TGA	2	6	53855	53860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518212
1002	NC_012853	CAG	2	6	53862	53867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1003	NC_012853	TCG	2	6	53885	53890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1004	NC_012853	CGC	2	6	53965	53970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518212
1005	NC_012853	GAT	2	6	54040	54045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518212
1006	NC_012853	TCA	2	6	54065	54070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518212
1007	NC_012853	CCA	2	6	54101	54106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518212
1008	NC_012853	AGC	2	6	54113	54118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1009	NC_012853	ACG	2	6	54127	54132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1010	NC_012853	GAT	2	6	54202	54207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518212
1011	NC_012853	AGA	2	6	54219	54224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518212
1012	NC_012853	CGAA	2	8	54254	54261	50 %	0 %	25 %	25 %	241518212
1013	NC_012853	TCG	2	6	54272	54277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1014	NC_012853	GGT	3	9	54310	54318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518212
1015	NC_012853	GTC	2	6	54345	54350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1016	NC_012853	AAC	2	6	54412	54417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518212
1017	NC_012853	AGTG	2	8	54429	54436	25 %	25 %	50 %	0 %	241518212
1018	NC_012853	TTG	2	6	54482	54487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518212
1019	NC_012853	CTG	2	6	54496	54501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1020	NC_012853	CGA	2	6	54534	54539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1021	NC_012853	GC	3	6	54570	54575	0 %	0 %	50 %	50 %	241518212
1022	NC_012853	TCG	2	6	54617	54622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1023	NC_012853	AGT	2	6	54678	54683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518212
1024	NC_012853	GTA	2	6	54964	54969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518212
1025	NC_012853	GCG	2	6	55003	55008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518212
1026	NC_012853	TCG	2	6	55028	55033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1027	NC_012853	T	6	6	55044	55049	0 %	100 %	0 %	0 %	241518212
1028	NC_012853	GGC	2	6	55075	55080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518212
1029	NC_012853	GGT	2	6	55135	55140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518212
1030	NC_012853	TGC	2	6	55156	55161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1031	NC_012853	CGA	2	6	55179	55184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1032	NC_012853	GAC	2	6	55233	55238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1033	NC_012853	CGG	2	6	55311	55316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518212
1034	NC_012853	GGC	2	6	55321	55326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518212
1035	NC_012853	AGG	2	6	55397	55402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518212
1036	NC_012853	CTCCA	2	10	55404	55413	20 %	20 %	0 %	60 %	241518212
1037	NC_012853	GAA	2	6	55425	55430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518212
1038	NC_012853	ACG	2	6	55436	55441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518212
1039	NC_012853	GCAG	2	8	55484	55491	25 %	0 %	50 %	25 %	241518212
1040	NC_012853	CGCAA	2	10	55583	55592	40 %	0 %	20 %	40 %	241518212
1041	NC_012853	AGG	2	6	55607	55612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518212
1042	NC_012853	TCT	2	6	55677	55682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518212
1043	NC_012853	CAA	2	6	55731	55736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518212
1044	NC_012853	CATA	2	8	55747	55754	50 %	25 %	0 %	25 %	241518212
1045	NC_012853	TGC	2	6	55842	55847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012853	ATC	2	6	55929	55934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012853	CGT	2	6	55947	55952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012853	C	6	6	55980	55985	0 %	0 %	0 %	100 %	241518213
1049	NC_012853	CCTCCC	2	12	55996	56007	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	241518213
1050	NC_012853	CCG	2	6	56041	56046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518213
1051	NC_012853	CGC	2	6	56047	56052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518213
1052	NC_012853	GCG	2	6	56055	56060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518213
1053	NC_012853	CGA	2	6	56140	56145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1054	NC_012853	GCG	2	6	56149	56154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518213
1055	NC_012853	GC	3	6	56182	56187	0 %	0 %	50 %	50 %	241518213
1056	NC_012853	CGG	2	6	56223	56228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518213
1057	NC_012853	AGC	2	6	56255	56260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1058	NC_012853	GGC	2	6	56280	56285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518213
1059	NC_012853	GTTC	2	8	56418	56425	0 %	50 %	25 %	25 %	241518213
1060	NC_012853	GCA	2	6	56451	56456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1061	NC_012853	CCG	2	6	56457	56462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518213
1062	NC_012853	GCA	2	6	56481	56486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1063	NC_012853	CGC	2	6	56487	56492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518213
1064	NC_012853	CG	3	6	56507	56512	0 %	0 %	50 %	50 %	241518213
1065	NC_012853	CTT	2	6	56566	56571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518213
1066	NC_012853	AGCG	2	8	56595	56602	25 %	0 %	50 %	25 %	241518213
1067	NC_012853	AGC	2	6	56603	56608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1068	NC_012853	GCA	2	6	56618	56623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1069	NC_012853	TCG	2	6	56651	56656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518213
1070	NC_012853	GCCG	2	8	56707	56714	0 %	0 %	50 %	50 %	241518213
1071	NC_012853	GCCG	2	8	56731	56738	0 %	0 %	50 %	50 %	241518213
1072	NC_012853	CGTC	2	8	56752	56759	0 %	25 %	25 %	50 %	241518213
1073	NC_012853	TGG	2	6	56880	56885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518213
1074	NC_012853	GGA	2	6	56892	56897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518213
1075	NC_012853	GATT	2	8	57209	57216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012853	GCC	2	6	57263	57268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_012853	A	6	6	57304	57309	100 %	0 %	0 %	0 %	241518214
1078	NC_012853	GCG	2	6	57327	57332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1079	NC_012853	GAA	2	6	57337	57342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518214
1080	NC_012853	GCC	2	6	57355	57360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518214
1081	NC_012853	TCC	2	6	57362	57367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518214
1082	NC_012853	CGA	2	6	57381	57386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1083	NC_012853	GACC	2	8	57402	57409	25 %	0 %	25 %	50 %	241518214
1084	NC_012853	ACA	2	6	57455	57460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518214
1085	NC_012853	GGC	2	6	57510	57515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1086	NC_012853	CCCTG	2	10	57527	57536	0 %	20 %	20 %	60 %	241518214
1087	NC_012853	GCT	2	6	57552	57557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1088	NC_012853	TCG	2	6	57566	57571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1089	NC_012853	GCA	2	6	57591	57596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1090	NC_012853	GCCG	2	8	57624	57631	0 %	0 %	50 %	50 %	241518214
1091	NC_012853	CGA	2	6	57636	57641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1092	NC_012853	CGG	2	6	57703	57708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1093	NC_012853	TCGCC	2	10	57786	57795	0 %	20 %	20 %	60 %	241518214
1094	NC_012853	CTG	2	6	57865	57870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1095	NC_012853	CGAC	2	8	57881	57888	25 %	0 %	25 %	50 %	241518214
1096	NC_012853	TTGCCT	2	12	57926	57937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241518214
1097	NC_012853	GGT	2	6	57940	57945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518214
1098	NC_012853	CGG	2	6	57946	57951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1099	NC_012853	AGC	2	6	57980	57985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1100	NC_012853	GCC	2	6	57996	58001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518214
1101	NC_012853	TCCC	2	8	58024	58031	0 %	25 %	0 %	75 %	241518214
1102	NC_012853	CT	3	6	58032	58037	0 %	50 %	0 %	50 %	241518214
1103	NC_012853	CCAT	2	8	58040	58047	25 %	25 %	0 %	50 %	241518214
1104	NC_012853	GAC	2	6	58062	58067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1105	NC_012853	GCG	2	6	58070	58075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1106	NC_012853	GAC	2	6	58081	58086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1107	NC_012853	TGG	2	6	58133	58138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518214
1108	NC_012853	CGAT	2	8	58205	58212	25 %	25 %	25 %	25 %	241518214
1109	NC_012853	ATC	2	6	58231	58236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518214
1110	NC_012853	AGC	2	6	58238	58243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518214
1111	NC_012853	CTGG	2	8	58252	58259	0 %	25 %	50 %	25 %	241518214
1112	NC_012853	GGC	2	6	58314	58319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518214
1113	NC_012853	CAA	2	6	58375	58380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518214
1114	NC_012853	TAC	2	6	58390	58395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518214
1115	NC_012853	AAC	2	6	58396	58401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518214
1116	NC_012853	GCGG	2	8	58415	58422	0 %	0 %	75 %	25 %	241518214
1117	NC_012853	TCT	2	6	58477	58482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012853	GGA	2	6	58488	58493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012853	CGC	2	6	58572	58577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_012853	AG	3	6	58600	58605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012853	A	6	6	58652	58657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012853	GC	3	6	58665	58670	0 %	0 %	50 %	50 %	241518215
1123	NC_012853	G	6	6	58748	58753	0 %	0 %	100 %	0 %	241518215
1124	NC_012853	CATT	2	8	58774	58781	25 %	50 %	0 %	25 %	241518215
1125	NC_012853	ATC	2	6	58807	58812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518215
1126	NC_012853	GCA	2	6	58819	58824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518215
1127	NC_012853	GGA	2	6	58863	58868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518215
1128	NC_012853	GTC	3	9	58882	58890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518215
1129	NC_012853	GCGA	2	8	58896	58903	25 %	0 %	50 %	25 %	241518215
1130	NC_012853	TGC	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012853	CCGA	2	8	59014	59021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_012853	CTA	2	6	59184	59189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012853	CAA	2	6	59190	59195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_012853	CAGAA	2	10	59198	59207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_012853	CGGG	2	8	59211	59218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_012853	TCC	2	6	59329	59334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_012853	GAT	2	6	59346	59351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518216
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1139	NC_012853	GAC	2	6	59436	59441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518216
1140	NC_012853	ATCT	2	8	59476	59483	25 %	50 %	0 %	25 %	241518216
1141	NC_012853	CAGC	2	8	59538	59545	25 %	0 %	25 %	50 %	241518216
1142	NC_012853	GGAA	2	8	59638	59645	50 %	0 %	50 %	0 %	241518216
1143	NC_012853	CTG	2	6	59659	59664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518216
1144	NC_012853	CATC	2	8	59675	59682	25 %	25 %	0 %	50 %	241518216
1145	NC_012853	GGC	2	6	59797	59802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518216
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1148	NC_012853	CTTG	2	8	59892	59899	0 %	50 %	25 %	25 %	241518216
1149	NC_012853	GCG	2	6	59925	59930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518216
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1151	NC_012853	CTC	2	6	60049	60054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518216
1152	NC_012853	ACG	2	6	60057	60062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518216
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1157	NC_012853	ACG	2	6	60408	60413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518216
1158	NC_012853	TCG	2	6	60416	60421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518216
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1160	NC_012853	GGC	2	6	60745	60750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1161	NC_012853	TCA	2	6	60784	60789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1162	NC_012853	CGA	2	6	60862	60867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_012853	TGC	2	6	60896	60901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1164	NC_012853	CT	3	6	60937	60942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1165	NC_012853	CGA	2	6	61211	61216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518217
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1182	NC_012853	AGAT	2	8	62162	62169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1185	NC_012853	GCG	2	6	62255	62260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1186	NC_012853	CG	3	6	62283	62288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1188	NC_012853	T	6	6	62374	62379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1191	NC_012853	TGGT	2	8	62695	62702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1192	NC_012853	GAT	2	6	62729	62734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1193	NC_012853	TCCG	2	8	62781	62788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1194	NC_012853	TTTCA	2	10	62801	62810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1234	NC_012853	TTG	2	6	64997	65002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_012853	CTC	2	6	65224	65229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518219
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1252	NC_012853	GA	3	6	65720	65725	50 %	0 %	50 %	0 %	241518219
1253	NC_012853	ACC	2	6	65759	65764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518219
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1256	NC_012853	CTTG	2	8	65865	65872	0 %	50 %	25 %	25 %	241518219
1257	NC_012853	CGA	2	6	65928	65933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518219
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1261	NC_012853	CTT	2	6	66336	66341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518220
1262	NC_012853	CCA	2	6	66374	66379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518220
1263	NC_012853	CGA	2	6	66425	66430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518220
1264	NC_012853	CGT	2	6	66446	66451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518220
1265	NC_012853	TGA	2	6	66467	66472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518220
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1288	NC_012853	CGG	2	6	67314	67319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518220
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1323	NC_012853	ATC	2	6	69281	69286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518222
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1372	NC_012853	GCCT	2	8	71237	71244	0 %	25 %	25 %	50 %	241518225
1373	NC_012853	TC	3	6	71292	71297	0 %	50 %	0 %	50 %	241518225
1374	NC_012853	ACCC	2	8	71357	71364	25 %	0 %	0 %	75 %	241518225
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1379	NC_012853	CGG	2	6	71580	71585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518225
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1494	NC_012853	GAG	2	6	76610	76615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_012853	G	6	6	76617	76622	0 %	0 %	100 %	0 %	241518232
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1500	NC_012853	CAT	2	6	76855	76860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518232

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