MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012853	CGC	2	6	435225	435230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518568
9002	NC_012853	CAT	2	6	435414	435419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518568
9003	NC_012853	CGC	2	6	435449	435454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518568
9004	NC_012853	CCATCG	2	12	435473	435484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241518568
9005	NC_012853	CCAC	2	8	435583	435590	25 %	0 %	0 %	75 %	241518569
9006	NC_012853	TCA	2	6	435654	435659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518569
9007	NC_012853	TGG	2	6	435708	435713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518569
9008	NC_012853	TCA	3	9	435751	435759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518569
9009	NC_012853	CAT	2	6	435767	435772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518569
9010	NC_012853	GCC	2	6	435842	435847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518569
9011	NC_012853	TCG	2	6	435910	435915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518569
9012	NC_012853	AGG	2	6	435949	435954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518569
9013	NC_012853	CGG	2	6	435955	435960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518569
9014	NC_012853	GGTTGA	2	12	436017	436028	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_012853	GTCT	2	8	436032	436039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9016	NC_012853	GCG	2	6	436059	436064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_012853	GAA	2	6	436164	436169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_012853	CAG	2	6	436175	436180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_012853	GTC	2	6	436210	436215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_012853	GGCT	2	8	436258	436265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9021	NC_012853	CGC	2	6	436305	436310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_012853	CAG	2	6	436403	436408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_012853	CCT	2	6	436568	436573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_012853	GGC	2	6	436596	436601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_012853	GA	3	6	436610	436615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_012853	ACCC	2	8	436616	436623	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9027	NC_012853	C	6	6	436621	436626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9028	NC_012853	CGG	2	6	436644	436649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_012853	CGT	2	6	436660	436665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_012853	CAG	2	6	436667	436672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_012853	ACT	2	6	436683	436688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_012853	CTG	2	6	436706	436711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_012853	TCG	2	6	436724	436729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_012853	GCA	2	6	436734	436739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_012853	TCG	2	6	436768	436773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_012853	TCT	2	6	436774	436779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_012853	AGC	2	6	436822	436827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_012853	CAC	2	6	436838	436843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9039	NC_012853	CGC	2	6	436852	436857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_012853	GT	3	6	436944	436949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_012853	AGC	2	6	436972	436977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_012853	TTG	2	6	437008	437013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_012853	ATGG	2	8	437038	437045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_012853	GAA	2	6	437098	437103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_012853	AGG	2	6	437179	437184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518570
9046	NC_012853	GCC	2	6	437214	437219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518570
9047	NC_012853	CAG	2	6	437241	437246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518570
9048	NC_012853	GGC	2	6	437447	437452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_012853	GAAG	2	8	437453	437460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_012853	GAA	2	6	437480	437485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_012853	AAG	2	6	437510	437515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_012853	GAC	2	6	437556	437561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_012853	CG	3	6	437576	437581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_012853	GCG	2	6	437613	437618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_012853	ATG	3	9	437630	437638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518571
9056	NC_012853	GCG	2	6	437677	437682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518571
9057	NC_012853	AGC	2	6	437725	437730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518571
9058	NC_012853	AGC	2	6	437919	437924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518571
9059	NC_012853	GC	3	6	437927	437932	0 %	0 %	50 %	50 %	241518571
9060	NC_012853	CGC	2	6	437957	437962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518571
9061	NC_012853	GCA	3	9	438010	438018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518571
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9064	NC_012853	CGAGG	2	10	438212	438221	20 %	0 %	60 %	20 %	241518571
9065	NC_012853	CA	3	6	438237	438242	50 %	0 %	0 %	50 %	241518571
9066	NC_012853	GCA	2	6	438262	438267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518571
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9072	NC_012853	TCG	2	6	438555	438560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518572
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9081	NC_012853	A	6	6	438843	438848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9084	NC_012853	TCG	2	6	438959	438964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9088	NC_012853	AGG	2	6	439279	439284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9092	NC_012853	GCG	2	6	439414	439419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518573
9093	NC_012853	CG	3	6	439448	439453	0 %	0 %	50 %	50 %	241518573
9094	NC_012853	GCT	2	6	439467	439472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518573
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9097	NC_012853	GCCT	2	8	439659	439666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9098	NC_012853	GAC	2	6	439730	439735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_012853	TCC	2	6	439793	439798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_012853	CTAA	2	8	439808	439815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9104	NC_012853	GAT	2	6	440093	440098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518574
9105	NC_012853	CAT	2	6	440104	440109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518574
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9107	NC_012853	TAG	2	6	440328	440333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518574
9108	NC_012853	TGA	2	6	440347	440352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518574
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9110	NC_012853	CGC	2	6	440441	440446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518575
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9112	NC_012853	GGC	2	6	440521	440526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518575
9113	NC_012853	CG	5	10	440560	440569	0 %	0 %	50 %	50 %	241518575
9114	NC_012853	GCC	2	6	440580	440585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518575
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9118	NC_012853	CGCAA	2	10	440751	440760	40 %	0 %	20 %	40 %	241518575
9119	NC_012853	GCA	2	6	440785	440790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518575
9120	NC_012853	CGGC	2	8	440837	440844	0 %	0 %	50 %	50 %	241518575
9121	NC_012853	GCA	2	6	440890	440895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518575
9122	NC_012853	CAC	2	6	440936	440941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518575
9123	NC_012853	CGC	2	6	441146	441151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518575
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9125	NC_012853	CGA	2	6	441280	441285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518575
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9254	NC_012853	CGA	2	6	447659	447664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518582
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9384	NC_012853	TCG	2	6	453345	453350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518589
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9486	NC_012853	CGGA	2	8	457963	457970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9487	NC_012853	CGT	2	6	458015	458020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9494	NC_012853	TCAGGC	2	12	458209	458220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518594
9495	NC_012853	GCG	2	6	458270	458275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518594
9496	NC_012853	CAT	2	6	458362	458367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518594
9497	NC_012853	TTC	2	6	458399	458404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518595
9498	NC_012853	GAA	3	9	458425	458433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518595
9499	NC_012853	GGC	2	6	458492	458497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518595
9500	NC_012853	AGC	2	6	458505	458510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518595

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