MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012853	GCA	2	6	311789	311794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6502	NC_012853	GCGA	2	8	311856	311863	25 %	0 %	50 %	25 %	241518447
6503	NC_012853	GC	3	6	311893	311898	0 %	0 %	50 %	50 %	241518447
6504	NC_012853	GGC	2	6	311936	311941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
6505	NC_012853	GGC	2	6	311950	311955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
6506	NC_012853	AAT	2	6	311988	311993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518447
6507	NC_012853	GTT	2	6	312003	312008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518447
6508	NC_012853	ACC	2	6	312024	312029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518447
6509	NC_012853	T	6	6	312101	312106	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
6510	NC_012853	CCT	2	6	312149	312154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518447
6511	NC_012853	GC	3	6	312157	312162	0 %	0 %	50 %	50 %	241518447
6512	NC_012853	CGC	3	9	312160	312168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518447
6513	NC_012853	AGC	2	6	312172	312177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6514	NC_012853	GCG	2	6	312187	312192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
6515	NC_012853	CTG	2	6	312221	312226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6516	NC_012853	GAA	2	6	312294	312299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518447
6517	NC_012853	CCG	2	6	312304	312309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518447
6518	NC_012853	CGTGG	2	10	312383	312392	0 %	20 %	60 %	20 %	241518447
6519	NC_012853	T	6	6	312397	312402	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
6520	NC_012853	GTC	2	6	312426	312431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6521	NC_012853	GT	3	6	312530	312535	0 %	50 %	50 %	0 %	241518447
6522	NC_012853	TTG	2	6	312559	312564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518447
6523	NC_012853	CG	3	6	312675	312680	0 %	0 %	50 %	50 %	241518447
6524	NC_012853	GCT	2	6	312734	312739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6525	NC_012853	GCG	2	6	312797	312802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
6526	NC_012853	TC	3	6	312806	312811	0 %	50 %	0 %	50 %	241518447
6527	NC_012853	CCT	3	9	312859	312867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518447
6528	NC_012853	CAGCT	2	10	312891	312900	20 %	20 %	20 %	40 %	241518447
6529	NC_012853	TCC	2	6	312964	312969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518447
6530	NC_012853	ACC	2	6	312974	312979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518447
6531	NC_012853	AGC	2	6	312982	312987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518447
6532	NC_012853	TTG	2	6	313071	313076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518447
6533	NC_012853	CGG	2	6	313085	313090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
6534	NC_012853	ATTG	2	8	313095	313102	25 %	50 %	25 %	0 %	241518447
6535	NC_012853	CCACG	2	10	313204	313213	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6536	NC_012853	CGC	2	6	313214	313219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_012853	TGT	2	6	313252	313257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_012853	CGG	2	6	313321	313326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_012853	TGC	2	6	313387	313392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_012853	GCG	2	6	313427	313432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518448
6541	NC_012853	CG	3	6	313436	313441	0 %	0 %	50 %	50 %	241518448
6542	NC_012853	CGG	2	6	313572	313577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518448
6543	NC_012853	GCC	2	6	313614	313619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518448
6544	NC_012853	TGT	2	6	313790	313795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518448
6545	NC_012853	ACG	2	6	313816	313821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518448
6546	NC_012853	CCT	2	6	313835	313840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518448
6547	NC_012853	CCG	2	6	313843	313848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518448
6548	NC_012853	CAG	2	6	313859	313864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518448
6549	NC_012853	GGC	2	6	313889	313894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518448
6550	NC_012853	TCG	2	6	313903	313908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518448
6551	NC_012853	GCCGC	2	10	313927	313936	0 %	0 %	40 %	60 %	241518448
6552	NC_012853	GAT	2	6	313988	313993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518448
6553	NC_012853	CTGGCG	2	12	314040	314051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241518448
6554	NC_012853	CGGG	2	8	314106	314113	0 %	0 %	75 %	25 %	241518448
6555	NC_012853	CAA	2	6	314190	314195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518448
6556	NC_012853	ACG	2	6	314197	314202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518448
6557	NC_012853	CCAG	2	8	314217	314224	25 %	0 %	25 %	50 %	241518448
6558	NC_012853	GAT	2	6	314292	314297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518448
6559	NC_012853	CGC	2	6	314379	314384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518448
6560	NC_012853	TA	3	6	314385	314390	50 %	50 %	0 %	0 %	241518448
6561	NC_012853	CCAGT	2	10	314427	314436	20 %	20 %	20 %	40 %	241518448
6562	NC_012853	CAG	2	6	314516	314521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6563	NC_012853	CTT	2	6	314555	314560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518449
6564	NC_012853	ACC	2	6	314562	314567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518449
6565	NC_012853	CGG	2	6	314577	314582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518449
6566	NC_012853	GGC	2	6	314584	314589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518449
6567	NC_012853	AGG	2	6	314613	314618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518449
6568	NC_012853	TGC	2	6	314679	314684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6569	NC_012853	CGA	2	6	314686	314691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6570	NC_012853	ACCGG	2	10	314708	314717	20 %	0 %	40 %	40 %	241518449
6571	NC_012853	TC	3	6	314758	314763	0 %	50 %	0 %	50 %	241518449
6572	NC_012853	AG	3	6	314772	314777	50 %	0 %	50 %	0 %	241518449
6573	NC_012853	CAC	3	9	314804	314812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518449
6574	NC_012853	CCT	2	6	314836	314841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518449
6575	NC_012853	GCG	2	6	314951	314956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518449
6576	NC_012853	GAA	2	6	314957	314962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518449
6577	NC_012853	CTC	2	6	314975	314980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518449
6578	NC_012853	GCC	2	6	315018	315023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518449
6579	NC_012853	TGCCGG	2	12	315052	315063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241518449
6580	NC_012853	GTT	2	6	315084	315089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518449
6581	NC_012853	CCT	2	6	315094	315099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518449
6582	NC_012853	ACC	3	9	315101	315109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518449
6583	NC_012853	TCG	2	6	315117	315122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6584	NC_012853	GAC	3	9	315197	315205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6585	NC_012853	GCCTTC	2	12	315206	315217	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241518449
6586	NC_012853	GCG	3	9	315281	315289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518449
6587	NC_012853	CGC	2	6	315292	315297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518449
6588	NC_012853	TTC	2	6	315302	315307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518449
6589	NC_012853	CCT	2	6	315352	315357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518449
6590	NC_012853	ACG	2	6	315405	315410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6591	NC_012853	AGGA	2	8	315423	315430	50 %	0 %	50 %	0 %	241518449
6592	NC_012853	GGC	2	6	315511	315516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518449
6593	NC_012853	GTC	2	6	315599	315604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6594	NC_012853	CGCC	2	8	315733	315740	0 %	0 %	25 %	75 %	241518449
6595	NC_012853	GC	3	6	315793	315798	0 %	0 %	50 %	50 %	241518449
6596	NC_012853	GCA	2	6	315802	315807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518449
6597	NC_012853	CCA	2	6	315855	315860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518449
6598	NC_012853	CTC	2	6	316035	316040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518450
6599	NC_012853	GCG	3	9	316050	316058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518450
6600	NC_012853	GTT	2	6	316078	316083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518450
6601	NC_012853	TCG	2	6	316146	316151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_012853	CGT	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_012853	ACGC	2	8	316257	316264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_012853	GCTG	2	8	316411	316418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6605	NC_012853	TGA	2	6	316455	316460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_012853	GCT	2	6	316477	316482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_012853	CATCG	2	10	316513	316522	20 %	20 %	20 %	40 %	241518451
6608	NC_012853	GC	3	6	316543	316548	0 %	0 %	50 %	50 %	241518451
6609	NC_012853	GAG	2	6	316550	316555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518451
6610	NC_012853	CGA	2	6	316630	316635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6611	NC_012853	GAT	2	6	316651	316656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518451
6612	NC_012853	GGA	2	6	316681	316686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518451
6613	NC_012853	GCA	2	6	316699	316704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6614	NC_012853	TCA	2	6	316746	316751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
6615	NC_012853	CGC	2	6	316884	316889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518451
6616	NC_012853	CTC	2	6	316892	316897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518451
6617	NC_012853	TGG	2	6	316962	316967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518451
6618	NC_012853	CTCGAG	2	12	316988	316999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6619	NC_012853	TCA	2	6	317067	317072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
6620	NC_012853	GTC	2	6	317105	317110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6621	NC_012853	CCTGC	2	10	317131	317140	0 %	20 %	20 %	60 %	241518451
6622	NC_012853	CGA	2	6	317143	317148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6623	NC_012853	TTC	2	6	317162	317167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518451
6624	NC_012853	CGT	2	6	317203	317208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6625	NC_012853	GGC	2	6	317210	317215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518451
6626	NC_012853	CAT	2	6	317224	317229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
6627	NC_012853	AGC	3	9	317262	317270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518451
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6629	NC_012853	CTA	2	6	317392	317397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
6630	NC_012853	CGT	2	6	317398	317403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6631	NC_012853	TCG	3	9	317415	317423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518451
6632	NC_012853	CCG	2	6	317476	317481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6633	NC_012853	CA	3	6	317540	317545	50 %	0 %	0 %	50 %	241518452
6634	NC_012853	CGT	2	6	317583	317588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518452
6635	NC_012853	CG	3	6	317640	317645	0 %	0 %	50 %	50 %	241518452
6636	NC_012853	GCGAG	2	10	317655	317664	20 %	0 %	60 %	20 %	241518452
6637	NC_012853	TCA	2	6	317693	317698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518452
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6641	NC_012853	ACA	2	6	317911	317916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518453
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6643	NC_012853	CGGC	2	8	317953	317960	0 %	0 %	50 %	50 %	241518453
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6653	NC_012853	CCG	2	6	318453	318458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518454
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6663	NC_012853	GCC	2	6	319226	319231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6679	NC_012853	GCCG	2	8	320017	320024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6680	NC_012853	TCG	2	6	320028	320033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6684	NC_012853	CGC	2	6	320313	320318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6727	NC_012853	TCGGC	2	10	322187	322196	0 %	20 %	40 %	40 %	241518457
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6733	NC_012853	TGC	2	6	322476	322481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6736	NC_012853	TTG	2	6	322750	322755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6737	NC_012853	TATCA	2	10	322883	322892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6742	NC_012853	TTCT	2	8	323248	323255	0 %	75 %	0 %	25 %	241518458
6743	NC_012853	GCA	2	6	323261	323266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518458
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6745	NC_012853	GAC	2	6	323482	323487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6746	NC_012853	AGC	2	6	323567	323572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6748	NC_012853	TCT	2	6	323716	323721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6998	NC_012853	CGG	2	6	335671	335676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518466
6999	NC_012853	ACCGAT	2	12	335754	335765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241518466
7000	NC_012853	CG	3	6	335771	335776	0 %	0 %	50 %	50 %	241518466

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