MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 7737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012852	CGG	2	6	20467	20472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258621
502	NC_012852	ATC	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258621
503	NC_012852	ACG	2	6	20565	20570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258621
504	NC_012852	TCG	2	6	20607	20612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258621
505	NC_012852	ATC	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258621
506	NC_012852	GAC	2	6	20633	20638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258621
507	NC_012852	CGATC	2	10	20641	20650	20 %	20 %	20 %	40 %	241258621
508	NC_012852	TCC	2	6	20670	20675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_012852	TGC	2	6	20748	20753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012852	A	7	7	20756	20762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012852	GC	3	6	20799	20804	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
512	NC_012852	GCC	3	9	20820	20828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258622
513	NC_012852	TGG	2	6	20833	20838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258622
514	NC_012852	TGC	2	6	20877	20882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
515	NC_012852	GTCGAG	2	12	20961	20972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241258622
516	NC_012852	TCG	2	6	20978	20983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
517	NC_012852	TCG	2	6	20986	20991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
518	NC_012852	CGG	2	6	21006	21011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258622
519	NC_012852	CGC	2	6	21050	21055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258622
520	NC_012852	TCG	2	6	21085	21090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
521	NC_012852	GC	4	8	21116	21123	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
522	NC_012852	CAG	2	6	21288	21293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258622
523	NC_012852	ATG	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258622
524	NC_012852	ACG	2	6	21349	21354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258622
525	NC_012852	TTC	2	6	21403	21408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258622
526	NC_012852	GCG	2	6	21434	21439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258622
527	NC_012852	GGC	2	6	21467	21472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258622
528	NC_012852	GGC	2	6	21478	21483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258622
529	NC_012852	TCT	2	6	21497	21502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258622
530	NC_012852	CTT	2	6	21507	21512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258622
531	NC_012852	GC	4	8	21544	21551	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
532	NC_012852	CTG	2	6	21594	21599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
533	NC_012852	CTG	3	9	21615	21623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
534	NC_012852	GCT	3	9	21641	21649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
535	NC_012852	GAT	2	6	21702	21707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258622
536	NC_012852	TCA	2	6	21749	21754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
537	NC_012852	GC	3	6	21758	21763	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
538	NC_012852	TCC	2	6	21784	21789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258622
539	NC_012852	TCG	2	6	21829	21834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
540	NC_012852	AGC	2	6	21835	21840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258622
541	NC_012852	GAG	2	6	21858	21863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258622
542	NC_012852	GCC	2	6	21894	21899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258622
543	NC_012852	CAT	2	6	21924	21929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
544	NC_012852	GAT	2	6	22032	22037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258622
545	NC_012852	TGT	2	6	22046	22051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258622
546	NC_012852	GCC	2	6	22075	22080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258622
547	NC_012852	GACCG	2	10	22113	22122	20 %	0 %	40 %	40 %	241258622
548	NC_012852	TCA	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
549	NC_012852	GGCC	2	8	22154	22161	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
550	NC_012852	TCG	2	6	22225	22230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
551	NC_012852	GCT	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
552	NC_012852	ATC	2	6	22249	22254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
553	NC_012852	CAA	2	6	22289	22294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258622
554	NC_012852	TCT	2	6	22301	22306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258622
555	NC_012852	GCT	2	6	22358	22363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
556	NC_012852	GC	3	6	22421	22426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_012852	ATG	2	6	22485	22490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012852	CAT	2	6	22519	22524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012852	CTT	2	6	22531	22536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012852	ATA	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012852	CCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258623
562	NC_012852	CG	3	6	22680	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	241258623
563	NC_012852	GCC	2	6	22728	22733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258623
564	NC_012852	TTC	2	6	22815	22820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258623
565	NC_012852	CAA	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258623
566	NC_012852	GCG	2	6	22924	22929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012852	TCC	2	6	23075	23080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258624
568	NC_012852	TCG	2	6	23184	23189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
569	NC_012852	CGT	2	6	23365	23370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
570	NC_012852	CGG	2	6	23403	23408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258624
571	NC_012852	CGT	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
572	NC_012852	GGC	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258624
573	NC_012852	TCA	2	6	23559	23564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258624
574	NC_012852	GCCCT	2	10	23573	23582	0 %	20 %	20 %	60 %	241258624
575	NC_012852	GCCG	2	8	23594	23601	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
576	NC_012852	GAT	2	6	23638	23643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258624
577	NC_012852	GC	3	6	23751	23756	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
578	NC_012852	G	6	6	23800	23805	0 %	0 %	100 %	0 %	241258624
579	NC_012852	CGAG	2	8	23808	23815	25 %	0 %	50 %	25 %	241258624
580	NC_012852	GACA	2	8	23898	23905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_012852	CCA	2	6	23961	23966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258625
582	NC_012852	GAC	2	6	24074	24079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
583	NC_012852	TGC	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
584	NC_012852	GAT	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
585	NC_012852	TGCCG	2	10	24260	24269	0 %	20 %	40 %	40 %	241258625
586	NC_012852	GCC	2	6	24275	24280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
587	NC_012852	GCA	2	6	24289	24294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
588	NC_012852	GGC	3	9	24311	24319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258625
589	NC_012852	GTG	2	6	24345	24350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258625
590	NC_012852	AGC	2	6	24457	24462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
591	NC_012852	TCA	3	9	24517	24525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258625
592	NC_012852	AGC	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
593	NC_012852	GCT	2	6	24700	24705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
594	NC_012852	CGA	2	6	24763	24768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
595	NC_012852	GAG	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258625
596	NC_012852	TCC	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258625
597	NC_012852	TTG	2	6	24828	24833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258625
598	NC_012852	CTT	2	6	24835	24840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258625
599	NC_012852	TGA	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
600	NC_012852	GCT	2	6	24928	24933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
601	NC_012852	ATG	2	6	24963	24968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
602	NC_012852	TGA	2	6	24985	24990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
603	NC_012852	AGA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258625
604	NC_012852	GCCA	2	8	25003	25010	25 %	0 %	25 %	50 %	241258625
605	NC_012852	CCG	2	6	25029	25034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
606	NC_012852	GCT	2	6	25096	25101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
607	NC_012852	CGC	2	6	25153	25158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
608	NC_012852	GCA	2	6	25180	25185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
609	NC_012852	ATC	2	6	25188	25193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258625
610	NC_012852	GCG	2	6	25265	25270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258625
611	NC_012852	AGA	2	6	25276	25281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258625
612	NC_012852	ACG	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
613	NC_012852	AGG	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258625
614	NC_012852	GCC	2	6	25376	25381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
615	NC_012852	TGC	2	6	25517	25522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
616	NC_012852	TGG	2	6	25525	25530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258625
617	NC_012852	GGAC	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
618	NC_012852	CGG	2	6	25628	25633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
619	NC_012852	GAC	2	6	25671	25676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
620	NC_012852	GGC	2	6	25705	25710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
621	NC_012852	AGC	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
622	NC_012852	GGCC	2	8	25808	25815	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
623	NC_012852	GTC	2	6	25867	25872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
624	NC_012852	CGAC	2	8	25877	25884	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
625	NC_012852	GGC	2	6	26022	26027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
626	NC_012852	CAG	2	6	26052	26057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
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631	NC_012852	CTG	2	6	26139	26144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
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652	NC_012852	TGA	2	6	26756	26761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_012852	GCT	2	6	31355	31360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258632
754	NC_012852	CTTT	2	8	31363	31370	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
755	NC_012852	CTTT	2	8	31466	31473	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
756	NC_012852	GA	3	6	31503	31508	50 %	0 %	50 %	0 %	241258632
757	NC_012852	CGG	2	6	31562	31567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258632
758	NC_012852	GCC	2	6	31632	31637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258632
759	NC_012852	CTGG	2	8	31676	31683	0 %	25 %	50 %	25 %	241258632
760	NC_012852	CCAT	2	8	31690	31697	25 %	25 %	0 %	50 %	241258632
761	NC_012852	TCC	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258632
762	NC_012852	AAG	2	6	32128	32133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258632
763	NC_012852	CCGGG	2	10	32139	32148	0 %	0 %	60 %	40 %	241258632
764	NC_012852	GCTC	2	8	32162	32169	0 %	25 %	25 %	50 %	241258632
765	NC_012852	CAG	2	6	32180	32185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258632
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768	NC_012852	GCA	2	6	32281	32286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258632
769	NC_012852	CGT	2	6	32300	32305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258632
770	NC_012852	AGA	2	6	32529	32534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258633
771	NC_012852	CG	3	6	32544	32549	0 %	0 %	50 %	50 %	241258633
772	NC_012852	TTCT	2	8	32574	32581	0 %	75 %	0 %	25 %	241258633
773	NC_012852	TTC	2	6	32602	32607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258633
774	NC_012852	CGC	2	6	32763	32768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258633
775	NC_012852	GCGTCA	2	12	32847	32858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241258633
776	NC_012852	GCC	2	6	32863	32868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258633
777	NC_012852	CTG	2	6	32878	32883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258633
778	NC_012852	GGA	2	6	32908	32913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258633
779	NC_012852	TTCG	2	8	32948	32955	0 %	50 %	25 %	25 %	241258633
780	NC_012852	CTG	2	6	32976	32981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258633
781	NC_012852	CGC	2	6	33081	33086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258633
782	NC_012852	CGC	2	6	33094	33099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258633
783	NC_012852	ACAGA	2	10	33251	33260	60 %	0 %	20 %	20 %	241258633
784	NC_012852	GGC	2	6	33393	33398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258633
785	NC_012852	CGC	2	6	33405	33410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258633
786	NC_012852	CCA	2	6	33419	33424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258633
787	NC_012852	ACC	2	6	33440	33445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258633
788	NC_012852	GTG	2	6	33480	33485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258633
789	NC_012852	TCCC	2	8	33494	33501	0 %	25 %	0 %	75 %	241258633
790	NC_012852	CAG	2	6	33502	33507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258633
791	NC_012852	CT	3	6	33523	33528	0 %	50 %	0 %	50 %	241258633
792	NC_012852	AAG	2	6	33658	33663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258633
793	NC_012852	ACC	2	6	33727	33732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258633
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803	NC_012852	ACC	2	6	34391	34396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
804	NC_012852	AAT	2	6	34429	34434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
805	NC_012852	TATC	2	8	34462	34469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
806	NC_012852	CGG	2	6	34502	34507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258634
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820	NC_012852	CAGC	2	8	35344	35351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
821	NC_012852	GC	3	6	35363	35368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
822	NC_012852	GCC	2	6	35437	35442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
823	NC_012852	TCG	2	6	35515	35520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
824	NC_012852	CG	3	6	35710	35715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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833	NC_012852	GAC	2	6	36004	36009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258635
834	NC_012852	CGC	2	6	36131	36136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
835	NC_012852	GGCC	2	8	36157	36164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
836	NC_012852	GGC	2	6	36183	36188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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839	NC_012852	GA	3	6	36453	36458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
840	NC_012852	CGT	2	6	36473	36478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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845	NC_012852	CGC	2	6	36695	36700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258636
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864	NC_012852	GTG	2	6	37285	37290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
865	NC_012852	CAC	2	6	37300	37305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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879	NC_012852	GCCG	2	8	37918	37925	0 %	0 %	50 %	50 %	241258637
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881	NC_012852	CG	3	6	38002	38007	0 %	0 %	50 %	50 %	241258637
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