MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 7737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012852	GCCGAC	2	12	289359	289370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241258852
6502	NC_012852	AGC	2	6	289390	289395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258852
6503	NC_012852	TCCA	2	8	289518	289525	25 %	25 %	0 %	50 %	241258852
6504	NC_012852	GAA	2	6	289530	289535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258852
6505	NC_012852	TCGG	2	8	289582	289589	0 %	25 %	50 %	25 %	241258852
6506	NC_012852	ACC	2	6	289622	289627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258852
6507	NC_012852	CGC	3	9	289650	289658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258852
6508	NC_012852	GAA	2	6	289692	289697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258852
6509	NC_012852	ACC	2	6	289791	289796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258852
6510	NC_012852	T	6	6	289825	289830	0 %	100 %	0 %	0 %	241258852
6511	NC_012852	AT	3	6	289880	289885	50 %	50 %	0 %	0 %	241258852
6512	NC_012852	CGT	2	6	289886	289891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258852
6513	NC_012852	GC	4	8	289974	289981	0 %	0 %	50 %	50 %	241258852
6514	NC_012852	GCAG	2	8	290014	290021	25 %	0 %	50 %	25 %	241258852
6515	NC_012852	GCC	2	6	290079	290084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258852
6516	NC_012852	CGC	2	6	290112	290117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258852
6517	NC_012852	GAT	2	6	290118	290123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258852
6518	NC_012852	ATA	2	6	290166	290171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241258852
6519	NC_012852	GCC	2	6	290202	290207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258852
6520	NC_012852	GC	3	6	290214	290219	0 %	0 %	50 %	50 %	241258852
6521	NC_012852	GA	3	6	290315	290320	50 %	0 %	50 %	0 %	241258852
6522	NC_012852	TGC	2	6	290360	290365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258852
6523	NC_012852	CGT	2	6	290436	290441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258852
6524	NC_012852	GCAA	2	8	290512	290519	50 %	0 %	25 %	25 %	241258852
6525	NC_012852	CCG	2	6	290566	290571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258853
6526	NC_012852	GCCG	2	8	290599	290606	0 %	0 %	50 %	50 %	241258853
6527	NC_012852	ACA	3	9	290619	290627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258853
6528	NC_012852	AG	3	6	290637	290642	50 %	0 %	50 %	0 %	241258853
6529	NC_012852	ATG	3	9	290646	290654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258853
6530	NC_012852	TGT	2	6	290657	290662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258853
6531	NC_012852	TCA	2	6	290716	290721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258853
6532	NC_012852	AGCCAG	2	12	290748	290759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6533	NC_012852	GCC	2	6	290787	290792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258853
6534	NC_012852	CAG	2	6	290855	290860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6535	NC_012852	CCAT	2	8	290893	290900	25 %	25 %	0 %	50 %	241258853
6536	NC_012852	AGCCGA	2	12	290959	290970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6537	NC_012852	GAT	2	6	290977	290982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258853
6538	NC_012852	AGG	2	6	291087	291092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258853
6539	NC_012852	CGA	2	6	291097	291102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6540	NC_012852	A	6	6	291113	291118	100 %	0 %	0 %	0 %	241258853
6541	NC_012852	CCGA	2	8	291134	291141	25 %	0 %	25 %	50 %	241258853
6542	NC_012852	CGCC	2	8	291244	291251	0 %	0 %	25 %	75 %	241258853
6543	NC_012852	CGC	2	6	291273	291278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258853
6544	NC_012852	ACG	2	6	291300	291305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6545	NC_012852	ATC	2	6	291321	291326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258853
6546	NC_012852	ACCA	2	8	291337	291344	50 %	0 %	0 %	50 %	241258853
6547	NC_012852	GCGA	2	8	291395	291402	25 %	0 %	50 %	25 %	241258853
6548	NC_012852	AAG	2	6	291419	291424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258853
6549	NC_012852	AGC	2	6	291474	291479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6550	NC_012852	GTC	2	6	291555	291560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258853
6551	NC_012852	AGA	2	6	291577	291582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258853
6552	NC_012852	AAG	2	6	291588	291593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258853
6553	NC_012852	TGA	2	6	291640	291645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258853
6554	NC_012852	GC	3	6	291772	291777	0 %	0 %	50 %	50 %	241258853
6555	NC_012852	GAA	2	6	291784	291789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258853
6556	NC_012852	CTTG	2	8	291887	291894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_012852	CCA	3	9	291958	291966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_012852	CCA	2	6	292035	292040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_012852	GTT	2	6	292050	292055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_012852	CTC	2	6	292079	292084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_012852	ACA	2	6	292106	292111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_012852	CGG	2	6	292333	292338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_012852	CATCT	2	10	292389	292398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6564	NC_012852	CG	3	6	292424	292429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_012852	CGA	2	6	292467	292472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_012852	GAG	2	6	292477	292482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_012852	CAA	2	6	292517	292522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258854
6568	NC_012852	TCG	2	6	292540	292545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6569	NC_012852	TCG	3	9	292597	292605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6570	NC_012852	ACG	2	6	292606	292611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6571	NC_012852	TGC	2	6	292706	292711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6572	NC_012852	TGG	2	6	292761	292766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258854
6573	NC_012852	CCG	2	6	292789	292794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258854
6574	NC_012852	TGGT	2	8	292934	292941	0 %	50 %	50 %	0 %	241258854
6575	NC_012852	TGC	2	6	292991	292996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6576	NC_012852	CAA	2	6	293111	293116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258854
6577	NC_012852	CGC	2	6	293141	293146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258854
6578	NC_012852	TGC	2	6	293149	293154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6579	NC_012852	CGA	2	6	293191	293196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258854
6580	NC_012852	TTTC	2	8	293202	293209	0 %	75 %	0 %	25 %	241258854
6581	NC_012852	CTGA	2	8	293238	293245	25 %	25 %	25 %	25 %	241258854
6582	NC_012852	GCT	3	9	293443	293451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6583	NC_012852	GCG	2	6	293490	293495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258855
6584	NC_012852	GTC	2	6	293513	293518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6585	NC_012852	GATC	2	8	293560	293567	25 %	25 %	25 %	25 %	241258855
6586	NC_012852	CGCT	2	8	293606	293613	0 %	25 %	25 %	50 %	241258855
6587	NC_012852	CTG	2	6	293681	293686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6588	NC_012852	CCGATC	2	12	293732	293743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241258855
6589	NC_012852	GAC	2	6	293746	293751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6590	NC_012852	GTC	3	9	293843	293851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6591	NC_012852	CGG	2	6	293957	293962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258855
6592	NC_012852	GGCGC	3	15	293971	293985	0 %	0 %	60 %	40 %	241258855
6593	NC_012852	CGGA	2	8	294013	294020	25 %	0 %	50 %	25 %	241258855
6594	NC_012852	CGA	2	6	294115	294120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6595	NC_012852	GCG	2	6	294258	294263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258855
6596	NC_012852	GCC	2	6	294275	294280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258855
6597	NC_012852	TGG	2	6	294354	294359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258855
6598	NC_012852	AGC	2	6	294428	294433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258855
6599	NC_012852	CGC	2	6	294474	294479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258855
6600	NC_012852	GGT	2	6	294517	294522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258855
6601	NC_012852	TGA	2	6	294533	294538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258855
6602	NC_012852	GCA	3	9	294577	294585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258856
6603	NC_012852	GGT	2	6	294607	294612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258856
6604	NC_012852	TCG	2	6	294641	294646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258856
6605	NC_012852	TA	3	6	294649	294654	50 %	50 %	0 %	0 %	241258856
6606	NC_012852	AGG	2	6	294668	294673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258856
6607	NC_012852	AC	3	6	294682	294687	50 %	0 %	0 %	50 %	241258856
6608	NC_012852	GGT	2	6	294713	294718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258856
6609	NC_012852	TGA	2	6	294758	294763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258856
6610	NC_012852	GCA	2	6	294824	294829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258856
6611	NC_012852	ACGACT	2	12	294896	294907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241258856
6612	NC_012852	CG	4	8	294909	294916	0 %	0 %	50 %	50 %	241258856
6613	NC_012852	CAA	2	6	294940	294945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258856
6614	NC_012852	ACG	2	6	295018	295023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258856
6615	NC_012852	GTC	2	6	295051	295056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258856
6616	NC_012852	TG	3	6	295066	295071	0 %	50 %	50 %	0 %	241258856
6617	NC_012852	CGGC	2	8	295128	295135	0 %	0 %	50 %	50 %	241258856
6618	NC_012852	GCC	2	6	295258	295263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258856
6619	NC_012852	GGCT	2	8	295294	295301	0 %	25 %	50 %	25 %	241258856
6620	NC_012852	CGA	2	6	295308	295313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258856
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6622	NC_012852	CAC	2	6	295419	295424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258856
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6747	NC_012852	CGT	2	6	302282	302287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6748	NC_012852	CCT	2	6	302305	302310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258860
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6750	NC_012852	CGT	2	6	302402	302407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
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6992	NC_012852	TCG	2	6	315997	316002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258870
6993	NC_012852	AGG	2	6	316027	316032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258870
6994	NC_012852	GAG	2	6	316047	316052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258870
6995	NC_012852	GTC	2	6	316112	316117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258870
6996	NC_012852	GCTTCC	2	12	316132	316143	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241258870
6997	NC_012852	GAC	2	6	316242	316247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258870
6998	NC_012852	ATC	2	6	316315	316320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258870
6999	NC_012852	GAG	2	6	316353	316358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258870
7000	NC_012852	GCC	2	6	316559	316564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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