MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_012850	ATC	2	6	1105931	1105936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203866
26003	NC_012850	GCT	2	6	1105942	1105947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203866
26004	NC_012850	GGCC	2	8	1105948	1105955	0 %	0 %	50 %	50 %	241203866
26005	NC_012850	TCG	2	6	1105971	1105976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203866
26006	NC_012850	GAT	3	9	1106050	1106058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203866
26007	NC_012850	GCG	2	6	1106099	1106104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203866
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26009	NC_012850	GCA	2	6	1106467	1106472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203867
26010	NC_012850	GCC	2	6	1106488	1106493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203867
26011	NC_012850	TCGCAG	2	12	1106525	1106536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203867
26012	NC_012850	GCG	2	6	1106537	1106542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203867
26013	NC_012850	TCT	2	6	1106550	1106555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203867
26014	NC_012850	TGA	2	6	1106561	1106566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26016	NC_012850	C	6	6	1106652	1106657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26017	NC_012850	CG	3	6	1106781	1106786	0 %	0 %	50 %	50 %	241203868
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26031	NC_012850	GATC	2	8	1107236	1107243	25 %	25 %	25 %	25 %	241203868
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26118	NC_012850	GAC	2	6	1110388	1110393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203872
26119	NC_012850	CCG	2	6	1110431	1110436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203872
26120	NC_012850	GCC	2	6	1110529	1110534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203872
26121	NC_012850	CGT	2	6	1110550	1110555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203872
26122	NC_012850	CCG	2	6	1110563	1110568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203872
26123	NC_012850	GC	3	6	1110574	1110579	0 %	0 %	50 %	50 %	241203872
26124	NC_012850	AGGGC	2	10	1110606	1110615	20 %	0 %	60 %	20 %	241203872
26125	NC_012850	TCCA	2	8	1110650	1110657	25 %	25 %	0 %	50 %	241203872
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26129	NC_012850	GGC	2	6	1110793	1110798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203872
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26133	NC_012850	GGGT	2	8	1110962	1110969	0 %	25 %	75 %	0 %	241203872
26134	NC_012850	GAC	3	9	1111000	1111008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203872
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26140	NC_012850	GC	3	6	1111280	1111285	0 %	0 %	50 %	50 %	241203872
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26147	NC_012850	GTC	2	6	1111610	1111615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203872
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26151	NC_012850	TCTT	2	8	1111804	1111811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26152	NC_012850	TCCC	2	8	1111822	1111829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26153	NC_012850	CGC	2	6	1111880	1111885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26155	NC_012850	TCCC	2	8	1111941	1111948	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26156	NC_012850	CGGC	2	8	1112036	1112043	0 %	0 %	50 %	50 %	241203873
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26212	NC_012850	TCC	2	6	1113926	1113931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26213	NC_012850	AAT	2	6	1113971	1113976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26214	NC_012850	GCC	2	6	1114058	1114063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203874
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26221	NC_012850	GGCGA	2	10	1114339	1114348	20 %	0 %	60 %	20 %	241203874
26222	NC_012850	TGG	2	6	1114354	1114359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203874
26223	NC_012850	TCG	2	6	1114561	1114566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203874
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26227	NC_012850	GGC	2	6	1114776	1114781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203874
26228	NC_012850	CTTGC	2	10	1114807	1114816	0 %	40 %	20 %	40 %	241203874
26229	NC_012850	GAT	2	6	1114821	1114826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203874
26230	NC_012850	TGC	2	6	1114829	1114834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203874
26231	NC_012850	CG	3	6	1114850	1114855	0 %	0 %	50 %	50 %	241203874
26232	NC_012850	CG	3	6	1114861	1114866	0 %	0 %	50 %	50 %	241203874
26233	NC_012850	GAA	2	6	1115008	1115013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26234	NC_012850	CG	3	6	1115070	1115075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26235	NC_012850	GGA	2	6	1115083	1115088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26236	NC_012850	GGCG	2	8	1115286	1115293	0 %	0 %	75 %	25 %	241203875
26237	NC_012850	CGT	2	6	1115317	1115322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203875
26238	NC_012850	CAC	2	6	1115329	1115334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203875
26239	NC_012850	TGC	2	6	1115365	1115370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203875
26240	NC_012850	ATGCCG	2	12	1115421	1115432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203875
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26255	NC_012850	ATC	2	6	1116416	1116421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203876
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26289	NC_012850	TCT	2	6	1117864	1117869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26291	NC_012850	TC	3	6	1117959	1117964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26292	NC_012850	CGAG	2	8	1117970	1117977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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26305	NC_012850	TCT	2	6	1118832	1118837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203877
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26342	NC_012850	CGC	2	6	1120340	1120345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203878
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26345	NC_012850	GCTT	2	8	1120475	1120482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26346	NC_012850	AGG	2	6	1120506	1120511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203879
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26350	NC_012850	CG	3	6	1120668	1120673	0 %	0 %	50 %	50 %	241203879
26351	NC_012850	GCC	2	6	1120750	1120755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203879
26352	NC_012850	GC	3	6	1120785	1120790	0 %	0 %	50 %	50 %	241203879
26353	NC_012850	TGT	2	6	1120845	1120850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203879
26354	NC_012850	GCA	2	6	1120890	1120895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203879
26355	NC_012850	CG	4	8	1120899	1120906	0 %	0 %	50 %	50 %	241203879
26356	NC_012850	CGC	2	6	1120909	1120914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203879
26357	NC_012850	CGG	2	6	1120920	1120925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203879
26358	NC_012850	GA	3	6	1121078	1121083	50 %	0 %	50 %	0 %	241203879
26359	NC_012850	TGA	2	6	1121084	1121089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203879
26360	NC_012850	TGC	2	6	1121110	1121115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203879
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26363	NC_012850	CGG	2	6	1121193	1121198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203879
26364	NC_012850	CGC	2	6	1121344	1121349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203879
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26381	NC_012850	CCT	2	6	1122000	1122005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203879
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26386	NC_012850	CG	3	6	1122160	1122165	0 %	0 %	50 %	50 %	241203879
26387	NC_012850	GCG	2	6	1122218	1122223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203879
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26394	NC_012850	ATTC	2	8	1122656	1122663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26395	NC_012850	GC	3	6	1122700	1122705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26396	NC_012850	GAT	2	6	1122713	1122718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26397	NC_012850	GAG	2	6	1122782	1122787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26415	NC_012850	A	6	6	1123758	1123763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26427	NC_012850	ATC	2	6	1124462	1124467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203882
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26434	NC_012850	T	6	6	1124889	1124894	0 %	100 %	0 %	0 %	241203882
26435	NC_012850	CCAAT	2	10	1124917	1124926	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26436	NC_012850	TAAA	2	8	1124958	1124965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26437	NC_012850	TTTCGA	2	12	1124980	1124991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26438	NC_012850	ATT	2	6	1125011	1125016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26439	NC_012850	AT	3	6	1125018	1125023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26440	NC_012850	GAC	2	6	1125187	1125192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26443	NC_012850	CGACAA	2	12	1125327	1125338	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241203883
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26451	NC_012850	GCT	2	6	1125558	1125563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203883
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26453	NC_012850	CGA	2	6	1125600	1125605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203883
26454	NC_012850	CTA	2	6	1125606	1125611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203883
26455	NC_012850	TCGCA	2	10	1125634	1125643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26456	NC_012850	CGA	2	6	1125706	1125711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26457	NC_012850	ATT	2	6	1125751	1125756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26458	NC_012850	TG	3	6	1125762	1125767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26459	NC_012850	GC	3	6	1125784	1125789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26460	NC_012850	TTTTAT	2	12	1125790	1125801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26461	NC_012850	ATG	2	6	1125817	1125822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203884
26462	NC_012850	CTG	2	6	1125880	1125885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26463	NC_012850	GC	3	6	1125930	1125935	0 %	0 %	50 %	50 %	241203884
26464	NC_012850	GCG	2	6	1125938	1125943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203884
26465	NC_012850	CGC	2	6	1125972	1125977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203884
26466	NC_012850	CGA	2	6	1126007	1126012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26467	NC_012850	CTG	2	6	1126024	1126029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26468	NC_012850	ACG	2	6	1126048	1126053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26469	NC_012850	CG	3	6	1126058	1126063	0 %	0 %	50 %	50 %	241203884
26470	NC_012850	GCC	2	6	1126097	1126102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203884
26471	NC_012850	AAG	2	6	1126126	1126131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203884
26472	NC_012850	GCT	3	9	1126179	1126187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26473	NC_012850	CGA	2	6	1126197	1126202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26474	NC_012850	TGC	2	6	1126211	1126216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26475	NC_012850	GAG	2	6	1126294	1126299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203884
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26477	NC_012850	AAG	2	6	1126456	1126461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203884
26478	NC_012850	AGA	2	6	1126529	1126534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203884
26479	NC_012850	AGC	2	6	1126583	1126588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26480	NC_012850	TCG	2	6	1126616	1126621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26481	NC_012850	CGT	2	6	1126674	1126679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26482	NC_012850	CAC	2	6	1126740	1126745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203884
26483	NC_012850	TCG	2	6	1126748	1126753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26484	NC_012850	CCAG	2	8	1126760	1126767	25 %	0 %	25 %	50 %	241203884
26485	NC_012850	CGC	2	6	1126824	1126829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203884
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26490	NC_012850	CGAT	2	8	1127048	1127055	25 %	25 %	25 %	25 %	241203884
26491	NC_012850	CAT	2	6	1127118	1127123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203884
26492	NC_012850	CGA	2	6	1127151	1127156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26493	NC_012850	ATC	2	6	1127164	1127169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203884
26494	NC_012850	CCG	2	6	1127188	1127193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203884
26495	NC_012850	GCC	2	6	1127194	1127199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203884
26496	NC_012850	GAG	2	6	1127203	1127208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203884
26497	NC_012850	TCG	2	6	1127210	1127215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203884
26498	NC_012850	GC	4	8	1127227	1127234	0 %	0 %	50 %	50 %	241203884
26499	NC_012850	GCAA	2	8	1127267	1127274	50 %	0 %	25 %	25 %	241203884
26500	NC_012850	CG	3	6	1127336	1127341	0 %	0 %	50 %	50 %	241203884

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