MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_012850	CGG	2	6	982266	982271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203733
23003	NC_012850	TCG	3	9	982346	982354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203733
23004	NC_012850	CGG	2	6	982358	982363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203733
23005	NC_012850	ATT	2	6	982370	982375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203733
23006	NC_012850	CCA	2	6	982405	982410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203733
23007	NC_012850	CCG	2	6	982456	982461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23008	NC_012850	TC	3	6	982468	982473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23009	NC_012850	CAT	2	6	982518	982523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203734
23010	NC_012850	TCC	3	9	982535	982543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203734
23011	NC_012850	ACG	2	6	982606	982611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203734
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23013	NC_012850	TCG	2	6	982694	982699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203734
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23015	NC_012850	GC	3	6	982746	982751	0 %	0 %	50 %	50 %	241203734
23016	NC_012850	GGC	2	6	982813	982818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203734
23017	NC_012850	CGTG	2	8	982848	982855	0 %	25 %	50 %	25 %	241203734
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23020	NC_012850	GCTG	2	8	982985	982992	0 %	25 %	50 %	25 %	241203734
23021	NC_012850	CCTG	2	8	983064	983071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23022	NC_012850	TCA	2	6	983111	983116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23024	NC_012850	GC	4	8	983157	983164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23025	NC_012850	GGC	2	6	983223	983228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23026	NC_012850	TCG	2	6	983284	983289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203735
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23029	NC_012850	GC	3	6	983520	983525	0 %	0 %	50 %	50 %	241203735
23030	NC_012850	CGC	2	6	983601	983606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203735
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23048	NC_012850	GCTT	2	8	984603	984610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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23054	NC_012850	AGG	2	6	985083	985088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_012850	TCG	2	6	985139	985144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203738
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23058	NC_012850	GTC	2	6	985270	985275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203738
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23122	NC_012850	TCG	2	6	987311	987316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203738
23123	NC_012850	CGT	2	6	987351	987356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203738
23124	NC_012850	AGCG	2	8	987406	987413	25 %	0 %	50 %	25 %	241203738
23125	NC_012850	GCC	2	6	987421	987426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203738
23126	NC_012850	TGC	2	6	987504	987509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203739
23127	NC_012850	TGC	3	9	987525	987533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203739
23128	NC_012850	GCG	2	6	987552	987557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203739
23129	NC_012850	CGG	2	6	987565	987570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203739
23130	NC_012850	TCT	2	6	987697	987702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203739
23131	NC_012850	GCATTG	2	12	987842	987853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241203739
23132	NC_012850	GAA	2	6	987854	987859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203739
23133	NC_012850	AGG	2	6	987861	987866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203739
23134	NC_012850	ATG	2	6	987871	987876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203739
23135	NC_012850	TCG	2	6	987896	987901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203740
23136	NC_012850	TTC	2	6	987907	987912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203740
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23138	NC_012850	ATCT	2	8	987922	987929	25 %	50 %	0 %	25 %	241203740
23139	NC_012850	CAT	2	6	987954	987959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203740
23140	NC_012850	CTG	2	6	987994	987999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203740
23141	NC_012850	CG	3	6	988022	988027	0 %	0 %	50 %	50 %	241203740
23142	NC_012850	GCC	2	6	988032	988037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203740
23143	NC_012850	ATC	2	6	988039	988044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203740
23144	NC_012850	CGG	2	6	988046	988051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203740
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23146	NC_012850	CTG	2	6	988144	988149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203740
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23149	NC_012850	CGA	2	6	988218	988223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203740
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23151	NC_012850	GCC	2	6	988322	988327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203741
23152	NC_012850	TC	3	6	988342	988347	0 %	50 %	0 %	50 %	241203741
23153	NC_012850	CTG	2	6	988433	988438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
23154	NC_012850	TGC	2	6	988440	988445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
23155	NC_012850	GC	3	6	988444	988449	0 %	0 %	50 %	50 %	241203741
23156	NC_012850	GCG	2	6	988490	988495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203741
23157	NC_012850	GCG	2	6	988511	988516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203741
23158	NC_012850	GCTG	2	8	988566	988573	0 %	25 %	50 %	25 %	241203741
23159	NC_012850	CGG	2	6	988651	988656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203741
23160	NC_012850	CGGC	2	8	988687	988694	0 %	0 %	50 %	50 %	241203741
23161	NC_012850	GCT	2	6	988711	988716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
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23166	NC_012850	GC	3	6	988851	988856	0 %	0 %	50 %	50 %	241203741
23167	NC_012850	GTCGGC	2	12	988901	988912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241203741
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23175	NC_012850	GTC	2	6	989285	989290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
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23190	NC_012850	TCG	2	6	989613	989618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
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23192	NC_012850	GTC	2	6	989646	989651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203741
23193	NC_012850	CGG	2	6	989676	989681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203741
23194	NC_012850	CGC	2	6	989731	989736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203741
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23197	NC_012850	CTG	2	6	989887	989892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203742
23198	NC_012850	TCA	2	6	989978	989983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203742
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23201	NC_012850	TCGC	2	8	990037	990044	0 %	25 %	25 %	50 %	241203742
23202	NC_012850	GGTCAC	2	12	990084	990095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203742
23203	NC_012850	TCA	2	6	990188	990193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203742
23204	NC_012850	CGC	2	6	990235	990240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203742
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23207	NC_012850	CGT	2	6	990422	990427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203743
23208	NC_012850	CCGGA	2	10	990444	990453	20 %	0 %	40 %	40 %	241203743
23209	NC_012850	TCG	2	6	990559	990564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203743
23210	NC_012850	CG	3	6	990604	990609	0 %	0 %	50 %	50 %	241203743
23211	NC_012850	G	6	6	990672	990677	0 %	0 %	100 %	0 %	241203743
23212	NC_012850	AAG	2	6	990678	990683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203743
23213	NC_012850	GAT	2	6	990685	990690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203743
23214	NC_012850	GCAT	2	8	990795	990802	25 %	25 %	25 %	25 %	241203744
23215	NC_012850	GCC	2	6	990848	990853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203744
23216	NC_012850	TCT	2	6	990906	990911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203744
23217	NC_012850	CTG	2	6	990914	990919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203744
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23219	NC_012850	TTC	2	6	991105	991110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23220	NC_012850	T	6	6	991119	991124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23221	NC_012850	ATA	2	6	991142	991147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23222	NC_012850	GTCA	2	8	991417	991424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23223	NC_012850	GCT	2	6	991491	991496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203745
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23225	NC_012850	TGT	2	6	991542	991547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203745
23226	NC_012850	CTG	2	6	991619	991624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203745
23227	NC_012850	TCG	2	6	991631	991636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203745
23228	NC_012850	GCG	2	6	991703	991708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203745
23229	NC_012850	TGA	2	6	991736	991741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203745
23230	NC_012850	GAA	2	6	991762	991767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203745
23231	NC_012850	CCGA	2	8	991789	991796	25 %	0 %	25 %	50 %	241203745
23232	NC_012850	T	6	6	991938	991943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23233	NC_012850	GAA	2	6	991959	991964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23234	NC_012850	GCCA	2	8	992149	992156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23235	NC_012850	CCA	2	6	992252	992257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203746
23236	NC_012850	CGA	2	6	992342	992347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203746
23237	NC_012850	CCAG	2	8	992426	992433	25 %	0 %	25 %	50 %	241203746
23238	NC_012850	CTGG	2	8	992436	992443	0 %	25 %	50 %	25 %	241203746
23239	NC_012850	CTC	2	6	992478	992483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203746
23240	NC_012850	GTC	2	6	992559	992564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203746
23241	NC_012850	GAT	2	6	992565	992570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203746
23242	NC_012850	GCA	2	6	992747	992752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23243	NC_012850	GGCA	2	8	992771	992778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23244	NC_012850	ACC	2	6	992811	992816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23245	NC_012850	CAC	2	6	992878	992883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203747
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23254	NC_012850	GCGA	2	8	993507	993514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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23257	NC_012850	GATC	2	8	993750	993757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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23259	NC_012850	TGCG	2	8	993779	993786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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23341	NC_012850	GCCG	2	8	997131	997138	0 %	0 %	50 %	50 %	241203750
23342	NC_012850	CAG	2	6	997202	997207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203750
23343	NC_012850	TTCGG	2	10	997236	997245	0 %	40 %	40 %	20 %	241203750
23344	NC_012850	AGCGC	2	10	997254	997263	20 %	0 %	40 %	40 %	241203750
23345	NC_012850	GCC	2	6	997270	997275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203750
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23347	NC_012850	CA	4	8	997425	997432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23348	NC_012850	CATGT	2	10	997440	997449	20 %	40 %	20 %	20 %	241203751
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23351	NC_012850	CCCG	2	8	997620	997627	0 %	0 %	25 %	75 %	241203751
23352	NC_012850	TCGA	2	8	997707	997714	25 %	25 %	25 %	25 %	241203751
23353	NC_012850	TCA	2	6	997762	997767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203751
23354	NC_012850	TGC	2	6	997772	997777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203751
23355	NC_012850	CCA	2	6	997831	997836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203751
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23357	NC_012850	GC	4	8	997897	997904	0 %	0 %	50 %	50 %	241203751
23358	NC_012850	GTC	2	6	997905	997910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203751
23359	NC_012850	CG	3	6	997921	997926	0 %	0 %	50 %	50 %	241203751
23360	NC_012850	TCT	2	6	997933	997938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203751
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23363	NC_012850	CGG	2	6	998090	998095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203751
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23376	NC_012850	TGC	2	6	998484	998489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23459	NC_012850	CG	3	6	1002126	1002131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23460	NC_012850	CGGC	2	8	1002183	1002190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23461	NC_012850	ACG	2	6	1002384	1002389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23464	NC_012850	CGT	2	6	1002618	1002623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203757
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23466	NC_012850	AGCG	2	8	1002756	1002763	25 %	0 %	50 %	25 %	241203758
23467	NC_012850	GC	3	6	1002799	1002804	0 %	0 %	50 %	50 %	241203758
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23472	NC_012850	CCGA	2	8	1002965	1002972	25 %	0 %	25 %	50 %	241203758
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23475	NC_012850	CGC	2	6	1003198	1003203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203758
23476	NC_012850	GAT	2	6	1003234	1003239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203758
23477	NC_012850	GCA	2	6	1003248	1003253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203758
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23479	NC_012850	CGG	2	6	1003360	1003365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203759
23480	NC_012850	GCCA	2	8	1003419	1003426	25 %	0 %	25 %	50 %	241203759
23481	NC_012850	TCGA	2	8	1003455	1003462	25 %	25 %	25 %	25 %	241203759
23482	NC_012850	GCA	2	6	1003483	1003488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203759
23483	NC_012850	GTC	2	6	1003521	1003526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203759
23484	NC_012850	CCG	3	9	1003528	1003536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203759
23485	NC_012850	GCC	2	6	1003541	1003546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203759
23486	NC_012850	CGG	2	6	1003552	1003557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203759
23487	NC_012850	GGC	2	6	1003581	1003586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203759
23488	NC_012850	CG	3	6	1003626	1003631	0 %	0 %	50 %	50 %	241203759
23489	NC_012850	TCG	3	9	1003635	1003643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203759
23490	NC_012850	AGC	2	6	1003683	1003688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203759
23491	NC_012850	CGC	2	6	1003828	1003833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203759
23492	NC_012850	CGA	2	6	1003840	1003845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203759
23493	NC_012850	CGGCAA	2	12	1004013	1004024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23494	NC_012850	AT	3	6	1004034	1004039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23495	NC_012850	GGCG	2	8	1004043	1004050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23496	NC_012850	TTC	2	6	1004131	1004136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203760
23497	NC_012850	CTT	2	6	1004151	1004156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203760
23498	NC_012850	GTCG	2	8	1004163	1004170	0 %	25 %	50 %	25 %	241203760
23499	NC_012850	GGC	3	9	1004226	1004234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203760
23500	NC_012850	GC	3	6	1004287	1004292	0 %	0 %	50 %	50 %	241203760

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