MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_012850	CGA	2	6	899767	899772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203649
21003	NC_012850	TCG	2	6	899778	899783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203649
21004	NC_012850	CCA	2	6	899791	899796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203649
21005	NC_012850	CGC	2	6	899822	899827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203649
21006	NC_012850	ATCACC	2	12	899882	899893	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	241203649
21007	NC_012850	GCC	2	6	899909	899914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203649
21008	NC_012850	CTC	2	6	899945	899950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203649
21009	NC_012850	GGC	2	6	900017	900022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203649
21010	NC_012850	GAA	2	6	900056	900061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203649
21011	NC_012850	TCC	2	6	900093	900098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203649
21012	NC_012850	GCC	2	6	900187	900192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203649
21013	NC_012850	GCC	2	6	900267	900272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203649
21014	NC_012850	GC	3	6	900275	900280	0 %	0 %	50 %	50 %	241203649
21015	NC_012850	GCTG	2	8	900405	900412	0 %	25 %	50 %	25 %	241203649
21016	NC_012850	GTG	2	6	900434	900439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203649
21017	NC_012850	CG	3	6	900455	900460	0 %	0 %	50 %	50 %	241203649
21018	NC_012850	ATG	2	6	900467	900472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203649
21019	NC_012850	TCGA	2	8	900503	900510	25 %	25 %	25 %	25 %	241203649
21020	NC_012850	GGC	2	6	900538	900543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203649
21021	NC_012850	CGCT	2	8	900581	900588	0 %	25 %	25 %	50 %	241203649
21022	NC_012850	CGG	2	6	900633	900638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203649
21023	NC_012850	GAG	2	6	900731	900736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203649
21024	NC_012850	GGA	2	6	900772	900777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203649
21025	NC_012850	TGC	2	6	900789	900794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203649
21026	NC_012850	TCGT	2	8	900948	900955	0 %	50 %	25 %	25 %	241203650
21027	NC_012850	CGC	2	6	900965	900970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203650
21028	NC_012850	CGG	2	6	900977	900982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203650
21029	NC_012850	GTC	2	6	901004	901009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21030	NC_012850	CAT	2	6	901139	901144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203650
21031	NC_012850	GCA	2	6	901165	901170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21032	NC_012850	ACG	2	6	901260	901265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21033	NC_012850	TCG	2	6	901275	901280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21034	NC_012850	GAT	2	6	901292	901297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203650
21035	NC_012850	CGT	2	6	901305	901310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21036	NC_012850	CGG	2	6	901333	901338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203650
21037	NC_012850	TGA	2	6	901378	901383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203650
21038	NC_012850	CAT	2	6	901430	901435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203650
21039	NC_012850	GAAAGG	2	12	901453	901464	50 %	0 %	50 %	0 %	241203650
21040	NC_012850	GCC	2	6	901469	901474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203650
21041	NC_012850	CGG	2	6	901477	901482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203650
21042	NC_012850	CGTC	2	8	901597	901604	0 %	25 %	25 %	50 %	241203650
21043	NC_012850	ATGT	2	8	901610	901617	25 %	50 %	25 %	0 %	241203650
21044	NC_012850	CGA	2	6	901624	901629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203650
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21046	NC_012850	GCCT	2	8	901649	901656	0 %	25 %	25 %	50 %	241203650
21047	NC_012850	CGG	2	6	901694	901699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203650
21048	NC_012850	TCG	2	6	901743	901748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21049	NC_012850	AGC	2	6	901776	901781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203650
21050	NC_012850	TTG	2	6	901821	901826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203650
21051	NC_012850	CGCC	2	8	901834	901841	0 %	0 %	25 %	75 %	241203650
21052	NC_012850	GCG	2	6	901842	901847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203650
21053	NC_012850	GCC	2	6	901857	901862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203650
21054	NC_012850	GTT	2	6	901934	901939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_012850	TGC	2	6	901965	901970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21056	NC_012850	CAA	2	6	901973	901978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21057	NC_012850	GAC	3	9	902002	902010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203651
21058	NC_012850	GCGCC	2	10	902036	902045	0 %	0 %	40 %	60 %	241203651
21059	NC_012850	GCC	2	6	902049	902054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203651
21060	NC_012850	GGC	2	6	902055	902060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203651
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21062	NC_012850	CTG	2	6	902134	902139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203651
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21065	NC_012850	CGT	2	6	902208	902213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203651
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21068	NC_012850	TCT	3	9	902405	902413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203651
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21070	NC_012850	CCA	2	6	902513	902518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203651
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21072	NC_012850	TCG	2	6	902540	902545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203651
21073	NC_012850	TGA	2	6	902558	902563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203651
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21077	NC_012850	GAT	2	6	902700	902705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203651
21078	NC_012850	CGC	2	6	902732	902737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203651
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21081	NC_012850	GCC	3	9	902930	902938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21083	NC_012850	GATA	2	8	903176	903183	50 %	25 %	25 %	0 %	241203652
21084	NC_012850	GCT	2	6	903191	903196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21085	NC_012850	GTC	2	6	903204	903209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21086	NC_012850	AG	3	6	903214	903219	50 %	0 %	50 %	0 %	241203652
21087	NC_012850	CT	3	6	903235	903240	0 %	50 %	0 %	50 %	241203652
21088	NC_012850	ACT	2	6	903241	903246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203652
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21090	NC_012850	TCG	2	6	903280	903285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21091	NC_012850	GCT	2	6	903305	903310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
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21098	NC_012850	GCGGA	2	10	903610	903619	20 %	0 %	60 %	20 %	241203652
21099	NC_012850	CTG	2	6	903654	903659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
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21101	NC_012850	GGC	2	6	903668	903673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203652
21102	NC_012850	GC	4	8	903672	903679	0 %	0 %	50 %	50 %	241203652
21103	NC_012850	CCA	2	6	903685	903690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203652
21104	NC_012850	CGG	2	6	903730	903735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203652
21105	NC_012850	ATC	2	6	903741	903746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203652
21106	NC_012850	GCC	2	6	903747	903752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203652
21107	NC_012850	AG	3	6	903813	903818	50 %	0 %	50 %	0 %	241203652
21108	NC_012850	CG	3	6	903828	903833	0 %	0 %	50 %	50 %	241203652
21109	NC_012850	ACGCCC	2	12	903901	903912	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241203652
21110	NC_012850	CGC	2	6	903947	903952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203652
21111	NC_012850	CCGC	2	8	904135	904142	0 %	0 %	25 %	75 %	241203652
21112	NC_012850	CGGTGC	2	12	904171	904182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241203652
21113	NC_012850	CCG	2	6	904195	904200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203652
21114	NC_012850	GTC	2	6	904206	904211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21115	NC_012850	ACC	2	6	904255	904260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203652
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21117	NC_012850	TTC	2	6	904294	904299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203652
21118	NC_012850	ACG	2	6	904360	904365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21119	NC_012850	CTG	2	6	904374	904379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203652
21120	NC_012850	GGC	2	6	904451	904456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21121	NC_012850	ACG	2	6	904494	904499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_012850	TC	3	6	904584	904589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21123	NC_012850	GCT	2	6	904609	904614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203653
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21147	NC_012850	CG	3	6	905729	905734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21148	NC_012850	CCT	2	6	905885	905890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203654
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21213	NC_012850	GCCG	2	8	908475	908482	0 %	0 %	50 %	50 %	241203656
21214	NC_012850	CTT	2	6	908502	908507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203656
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21218	NC_012850	TCGC	2	8	908639	908646	0 %	25 %	25 %	50 %	241203657
21219	NC_012850	CG	4	8	908662	908669	0 %	0 %	50 %	50 %	241203657
21220	NC_012850	TGCC	2	8	908673	908680	0 %	25 %	25 %	50 %	241203657
21221	NC_012850	TCG	2	6	908718	908723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203657
21222	NC_012850	GCC	2	6	908771	908776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203657
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21230	NC_012850	CGTG	2	8	909185	909192	0 %	25 %	50 %	25 %	241203658
21231	NC_012850	CGCTGT	2	12	909371	909382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203658
21232	NC_012850	GTC	2	6	909554	909559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203658
21233	NC_012850	GGT	2	6	909655	909660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21234	NC_012850	CGC	2	6	909753	909758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203659
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21236	NC_012850	TCT	2	6	909797	909802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203659
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21480	NC_012850	CGTCG	2	10	920478	920487	0 %	20 %	40 %	40 %	241203673
21481	NC_012850	GCA	2	6	920495	920500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203673
21482	NC_012850	CGG	2	6	920526	920531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203674
21483	NC_012850	CCG	2	6	920545	920550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203674
21484	NC_012850	TCG	2	6	920579	920584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203674
21485	NC_012850	GAC	2	6	920590	920595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203674
21486	NC_012850	AGC	2	6	920597	920602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203674
21487	NC_012850	GC	3	6	920601	920606	0 %	0 %	50 %	50 %	241203674
21488	NC_012850	GC	3	6	920615	920620	0 %	0 %	50 %	50 %	241203674
21489	NC_012850	TGGT	2	8	920660	920667	0 %	50 %	50 %	0 %	241203674
21490	NC_012850	TCG	2	6	920672	920677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203674
21491	NC_012850	GCG	3	9	920688	920696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203674
21492	NC_012850	GCCGA	2	10	920699	920708	20 %	0 %	40 %	40 %	241203674
21493	NC_012850	GCCC	2	8	920722	920729	0 %	0 %	25 %	75 %	241203674
21494	NC_012850	GCA	2	6	920730	920735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203674
21495	NC_012850	CGC	2	6	920742	920747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203674
21496	NC_012850	CGG	2	6	920843	920848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203674
21497	NC_012850	GATCGA	2	12	920860	920871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241203674
21498	NC_012850	GGTC	2	8	920910	920917	0 %	25 %	50 %	25 %	241203674
21499	NC_012850	TAA	2	6	920958	920963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203674
21500	NC_012850	CGT	2	6	920974	920979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203674

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