MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_012850	GAT	3	9	855115	855123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203598
20005	NC_012850	TGC	2	6	855174	855179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20006	NC_012850	GC	3	6	855285	855290	0 %	0 %	50 %	50 %	241203599
20007	NC_012850	CGA	2	6	855360	855365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203599
20008	NC_012850	CGA	2	6	855411	855416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203599
20009	NC_012850	CAGGC	2	10	855418	855427	20 %	0 %	40 %	40 %	241203599
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20013	NC_012850	CGG	2	6	855621	855626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203599
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20049	NC_012850	TGCCG	2	10	857816	857825	0 %	20 %	40 %	40 %	241203603
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20058	NC_012850	ACT	2	6	858219	858224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203604
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20123	NC_012850	CTT	2	6	860834	860839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203610
20124	NC_012850	GGA	2	6	860915	860920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203610
20125	NC_012850	CA	3	6	860965	860970	50 %	0 %	0 %	50 %	241203610
20126	NC_012850	GCA	2	6	861035	861040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203610
20127	NC_012850	CGCAA	2	10	861052	861061	40 %	0 %	20 %	40 %	241203610
20128	NC_012850	AGC	2	6	861079	861084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203610
20129	NC_012850	ACC	2	6	861094	861099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203610
20130	NC_012850	GC	3	6	861119	861124	0 %	0 %	50 %	50 %	241203610
20131	NC_012850	GGAC	2	8	861166	861173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20132	NC_012850	CAGG	2	8	861250	861257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20133	NC_012850	GCA	2	6	861269	861274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20134	NC_012850	CGC	2	6	861293	861298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203611
20135	NC_012850	ACGGC	2	10	861304	861313	20 %	0 %	40 %	40 %	241203611
20136	NC_012850	TTG	2	6	861324	861329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203611
20137	NC_012850	CGA	2	6	861340	861345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203611
20138	NC_012850	GCA	3	9	861346	861354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203611
20139	NC_012850	CGGC	2	8	861363	861370	0 %	0 %	50 %	50 %	241203611
20140	NC_012850	CGG	2	6	861463	861468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203611
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20142	NC_012850	GCT	2	6	861535	861540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203611
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20145	NC_012850	T	6	6	861710	861715	0 %	100 %	0 %	0 %	241203611
20146	NC_012850	CGC	2	6	861775	861780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203611
20147	NC_012850	TGACG	2	10	861785	861794	20 %	20 %	40 %	20 %	241203611
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20149	NC_012850	CGG	2	6	861835	861840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203611
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20151	NC_012850	GC	3	6	861856	861861	0 %	0 %	50 %	50 %	241203611
20152	NC_012850	GATC	2	8	861937	861944	25 %	25 %	25 %	25 %	241203611
20153	NC_012850	CGA	2	6	861967	861972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203611
20154	NC_012850	TCG	2	6	861984	861989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203611
20155	NC_012850	CCGACG	2	12	862005	862016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241203611
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20158	NC_012850	TCC	2	6	862085	862090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203611
20159	NC_012850	CG	3	6	862162	862167	0 %	0 %	50 %	50 %	241203611
20160	NC_012850	TGCC	2	8	862177	862184	0 %	25 %	25 %	50 %	241203611
20161	NC_012850	GTG	2	6	862191	862196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203611
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20176	NC_012850	GTG	2	6	862795	862800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20177	NC_012850	GGT	2	6	862812	862817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20178	NC_012850	CGT	2	6	862845	862850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20179	NC_012850	CGG	2	6	862917	862922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20180	NC_012850	G	6	6	862921	862926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20181	NC_012850	CGA	2	6	862927	862932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20182	NC_012850	G	6	6	862935	862940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20183	NC_012850	AGA	2	6	862944	862949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20184	NC_012850	AATCT	2	10	863042	863051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20185	NC_012850	AAAT	2	8	863134	863141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20186	NC_012850	CGC	2	6	863171	863176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20187	NC_012850	TTG	2	6	863206	863211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20188	NC_012850	TAG	2	6	863260	863265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20189	NC_012850	ATT	2	6	863273	863278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20190	NC_012850	TCT	2	6	863279	863284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20191	NC_012850	GGCGC	2	10	863380	863389	0 %	0 %	60 %	40 %	241203612
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20202	NC_012850	GCCG	2	8	863735	863742	0 %	0 %	50 %	50 %	241203612
20203	NC_012850	TCA	2	6	863746	863751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203612
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20207	NC_012850	CTG	2	6	863901	863906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203612
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20210	NC_012850	AGCC	2	8	863999	864006	25 %	0 %	25 %	50 %	241203612
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20214	NC_012850	GAC	2	6	864245	864250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203612
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20216	NC_012850	CGA	2	6	864314	864319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203612
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20218	NC_012850	CAT	2	6	864356	864361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203612
20219	NC_012850	CG	3	6	864364	864369	0 %	0 %	50 %	50 %	241203612
20220	NC_012850	ATT	2	6	864451	864456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20221	NC_012850	GAA	2	6	864489	864494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203613
20222	NC_012850	ATA	2	6	864498	864503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203613
20223	NC_012850	TC	3	6	864512	864517	0 %	50 %	0 %	50 %	241203613
20224	NC_012850	TTCG	2	8	864533	864540	0 %	50 %	25 %	25 %	241203613
20225	NC_012850	AG	3	6	864575	864580	50 %	0 %	50 %	0 %	241203613
20226	NC_012850	GAG	2	6	864626	864631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203613
20227	NC_012850	CGCGT	2	10	864663	864672	0 %	20 %	40 %	40 %	241203613
20228	NC_012850	TAT	2	6	864698	864703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203613
20229	NC_012850	CTGC	2	8	864709	864716	0 %	25 %	25 %	50 %	241203613
20230	NC_012850	GAA	2	6	864746	864751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203613
20231	NC_012850	GACG	2	8	864886	864893	25 %	0 %	50 %	25 %	241203613
20232	NC_012850	GCT	2	6	864994	864999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203613
20233	NC_012850	GTCC	2	8	865021	865028	0 %	25 %	25 %	50 %	241203613
20234	NC_012850	GCA	2	6	865039	865044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203613
20235	NC_012850	CGT	2	6	865072	865077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203613
20236	NC_012850	TGA	2	6	865137	865142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203613
20237	NC_012850	GCG	2	6	865181	865186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203613
20238	NC_012850	CG	3	6	865185	865190	0 %	0 %	50 %	50 %	241203613
20239	NC_012850	GCC	2	6	865199	865204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203613
20240	NC_012850	TGGT	2	8	865232	865239	0 %	50 %	50 %	0 %	241203613
20241	NC_012850	TCT	2	6	865246	865251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203613
20242	NC_012850	GAC	2	6	865253	865258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203613
20243	NC_012850	TCG	2	6	865359	865364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203613
20244	NC_012850	CA	3	6	865454	865459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20245	NC_012850	CGCCA	2	10	865498	865507	20 %	0 %	20 %	60 %	241203614
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20247	NC_012850	GCA	2	6	865653	865658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203614
20248	NC_012850	GCA	2	6	865675	865680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203614
20249	NC_012850	ATC	2	6	865746	865751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203614
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20366	NC_012850	CGA	2	6	871560	871565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203620
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20486	NC_012850	CAA	2	6	877429	877434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203627
20487	NC_012850	ACT	2	6	877469	877474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203627
20488	NC_012850	GAT	2	6	877492	877497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203627
20489	NC_012850	AC	3	6	877529	877534	50 %	0 %	0 %	50 %	241203627
20490	NC_012850	CTGC	2	8	877541	877548	0 %	25 %	25 %	50 %	241203627
20491	NC_012850	ATC	2	6	877574	877579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203627
20492	NC_012850	TGA	2	6	877650	877655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203627
20493	NC_012850	GCA	2	6	877672	877677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203627
20494	NC_012850	GCTG	2	8	877681	877688	0 %	25 %	50 %	25 %	241203627
20495	NC_012850	CGG	2	6	877719	877724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203627
20496	NC_012850	CGC	2	6	877813	877818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203627
20497	NC_012850	CGC	2	6	877915	877920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203627
20498	NC_012850	GC	3	6	877981	877986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20499	NC_012850	GCG	2	6	878005	878010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20500	NC_012850	TTGA	2	8	878028	878035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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