MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012850	TCG	2	6	66533	66538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202822
1502	NC_012850	TCC	2	6	66566	66571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202822
1503	NC_012850	CGC	2	6	66577	66582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202822
1504	NC_012850	CTG	2	6	66586	66591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202822
1505	NC_012850	CAT	2	6	66610	66615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202822
1506	NC_012850	TTC	2	6	66629	66634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202822
1507	NC_012850	ACG	2	6	66641	66646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202822
1508	NC_012850	TTG	2	6	66667	66672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202822
1509	NC_012850	TCT	2	6	66765	66770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_012850	GCC	2	6	66811	66816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_012850	AGGC	2	8	66891	66898	25 %	0 %	50 %	25 %	241202823
1512	NC_012850	CGT	2	6	66949	66954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1513	NC_012850	GGC	2	6	66962	66967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202823
1514	NC_012850	ACCG	2	8	66995	67002	25 %	0 %	25 %	50 %	241202823
1515	NC_012850	GCCG	2	8	67213	67220	0 %	0 %	50 %	50 %	241202823
1516	NC_012850	GCG	2	6	67243	67248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202823
1517	NC_012850	GCGG	2	8	67280	67287	0 %	0 %	75 %	25 %	241202823
1518	NC_012850	GC	3	6	67294	67299	0 %	0 %	50 %	50 %	241202823
1519	NC_012850	GCA	2	6	67308	67313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1520	NC_012850	GCA	2	6	67330	67335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1521	NC_012850	TCGGCA	2	12	67374	67385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1522	NC_012850	ACG	2	6	67413	67418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1523	NC_012850	CGC	2	6	67438	67443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202823
1524	NC_012850	CGA	2	6	67444	67449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1525	NC_012850	CAT	2	6	67510	67515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202823
1526	NC_012850	GCA	2	6	67536	67541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202823
1527	NC_012850	CCGG	2	8	67580	67587	0 %	0 %	50 %	50 %	241202823
1528	NC_012850	GC	3	6	67592	67597	0 %	0 %	50 %	50 %	241202823
1529	NC_012850	GCC	2	6	67622	67627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202823
1530	NC_012850	GGC	2	6	67628	67633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202823
1531	NC_012850	TCT	2	6	67745	67750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_012850	GAC	2	6	67761	67766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012850	CTC	2	6	67816	67821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202824
1534	NC_012850	ACC	2	6	67826	67831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202824
1535	NC_012850	AGA	2	6	67841	67846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202824
1536	NC_012850	CGC	2	6	67905	67910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202824
1537	NC_012850	GCGCC	2	10	67940	67949	0 %	0 %	40 %	60 %	241202824
1538	NC_012850	ACC	2	6	67973	67978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202824
1539	NC_012850	TCG	2	6	68033	68038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1540	NC_012850	GGC	2	6	68040	68045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202824
1541	NC_012850	TGCGCC	2	12	68087	68098	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241202824
1542	NC_012850	CAG	2	6	68149	68154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1543	NC_012850	GACGAT	2	12	68164	68175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241202824
1544	NC_012850	GC	3	6	68176	68181	0 %	0 %	50 %	50 %	241202824
1545	NC_012850	CAC	2	6	68197	68202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202824
1546	NC_012850	CGG	2	6	68330	68335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202824
1547	NC_012850	GCG	3	9	68427	68435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202824
1548	NC_012850	CTG	2	6	68488	68493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1549	NC_012850	CGA	2	6	68526	68531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1550	NC_012850	CG	3	6	68562	68567	0 %	0 %	50 %	50 %	241202824
1551	NC_012850	TTG	2	6	68573	68578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202824
1552	NC_012850	CGA	2	6	68598	68603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1553	NC_012850	TCG	2	6	68709	68714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1554	NC_012850	CG	3	6	68777	68782	0 %	0 %	50 %	50 %	241202824
1555	NC_012850	CGC	2	6	68800	68805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202824
1556	NC_012850	GC	3	6	68851	68856	0 %	0 %	50 %	50 %	241202824
1557	NC_012850	TCC	2	6	68885	68890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202824
1558	NC_012850	GCA	2	6	68919	68924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1559	NC_012850	CAG	2	6	68938	68943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202824
1560	NC_012850	CCG	2	6	68963	68968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202824
1561	NC_012850	GCGA	2	8	69011	69018	25 %	0 %	50 %	25 %	241202824
1562	NC_012850	AGA	2	6	69051	69056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012850	GCG	2	6	69058	69063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_012850	CGC	2	6	69150	69155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_012850	GCG	2	6	69192	69197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012850	CG	4	8	69212	69219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_012850	CAG	2	6	69252	69257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1568	NC_012850	GCG	2	6	69306	69311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1569	NC_012850	CGG	2	6	69356	69361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1570	NC_012850	AAG	2	6	69435	69440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202825
1571	NC_012850	CAG	2	6	69444	69449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1572	NC_012850	GGC	2	6	69471	69476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1573	NC_012850	CGA	2	6	69482	69487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1574	NC_012850	CCG	2	6	69508	69513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202825
1575	NC_012850	GCAT	2	8	69520	69527	25 %	25 %	25 %	25 %	241202825
1576	NC_012850	CGG	2	6	69560	69565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1577	NC_012850	CAT	2	6	69599	69604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202825
1578	NC_012850	CG	3	6	69629	69634	0 %	0 %	50 %	50 %	241202825
1579	NC_012850	GCAAG	2	10	69638	69647	40 %	0 %	40 %	20 %	241202825
1580	NC_012850	CGG	2	6	69667	69672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1581	NC_012850	ATT	2	6	69700	69705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202825
1582	NC_012850	GCGCC	2	10	69740	69749	0 %	0 %	40 %	60 %	241202825
1583	NC_012850	AGC	2	6	69757	69762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1584	NC_012850	GC	3	6	69761	69766	0 %	0 %	50 %	50 %	241202825
1585	NC_012850	AGC	2	6	69799	69804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1586	NC_012850	CAG	2	6	70020	70025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1587	NC_012850	GAG	2	6	70038	70043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202825
1588	NC_012850	GCA	2	6	70058	70063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1589	NC_012850	GCC	2	6	70089	70094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202825
1590	NC_012850	CAG	2	6	70131	70136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1591	NC_012850	GAA	2	6	70142	70147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202825
1592	NC_012850	ATC	2	6	70221	70226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202825
1593	NC_012850	CTG	2	6	70260	70265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1594	NC_012850	GGC	2	6	70286	70291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1595	NC_012850	CGT	2	6	70322	70327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1596	NC_012850	AGC	2	6	70367	70372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1597	NC_012850	CAT	2	6	70481	70486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202825
1598	NC_012850	TCG	2	6	70495	70500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1599	NC_012850	CGC	4	12	70508	70519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202825
1600	NC_012850	CAG	2	6	70584	70589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1601	NC_012850	CGG	2	6	70615	70620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1602	NC_012850	CGC	2	6	70626	70631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202825
1603	NC_012850	GCT	2	6	70661	70666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1604	NC_012850	GCA	2	6	70667	70672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1605	NC_012850	CCGG	2	8	70682	70689	0 %	0 %	50 %	50 %	241202825
1606	NC_012850	TGC	2	6	70706	70711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202825
1607	NC_012850	CCG	2	6	70712	70717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202825
1608	NC_012850	GGC	2	6	70718	70723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202825
1609	NC_012850	A	6	6	70760	70765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012850	TCA	2	6	70841	70846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202826
1611	NC_012850	TTC	2	6	70847	70852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202826
1612	NC_012850	CGA	2	6	70920	70925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202826
1613	NC_012850	GCCGC	2	10	70986	70995	0 %	0 %	40 %	60 %	241202826
1614	NC_012850	TCGC	2	8	71012	71019	0 %	25 %	25 %	50 %	241202826
1615	NC_012850	AGC	2	6	71033	71038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202826
1616	NC_012850	TCA	2	6	71048	71053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202826
1617	NC_012850	GTC	2	6	71062	71067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202826
1618	NC_012850	TCC	2	6	71071	71076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202826
1619	NC_012850	ATT	2	6	71120	71125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202826
1620	NC_012850	GTC	2	6	71149	71154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202826
1621	NC_012850	CCTG	2	8	71219	71226	0 %	25 %	25 %	50 %	241202826
1622	NC_012850	ACC	2	6	71240	71245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202826
1623	NC_012850	GGC	2	6	71316	71321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202826
1624	NC_012850	GCG	2	6	71359	71364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_012850	ATG	2	6	71389	71394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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