MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_012850	CGG	2	6	743416	743421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17502	NC_012850	GATG	2	8	743439	743446	25 %	25 %	50 %	0 %	241203462
17503	NC_012850	CGA	2	6	743502	743507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17504	NC_012850	TCG	2	6	743519	743524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17505	NC_012850	TCGCCG	2	12	743537	743548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203462
17506	NC_012850	GGT	2	6	743568	743573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203462
17507	NC_012850	CG	4	8	743615	743622	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17508	NC_012850	CGC	2	6	743691	743696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17509	NC_012850	TGC	2	6	743700	743705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17510	NC_012850	CCG	2	6	743719	743724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17511	NC_012850	CGA	2	6	743730	743735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17512	NC_012850	TGC	2	6	743772	743777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17513	NC_012850	CGA	2	6	743784	743789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17514	NC_012850	CGC	2	6	743798	743803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17515	NC_012850	ATGGCG	2	12	743837	743848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203462
17516	NC_012850	TTG	2	6	743885	743890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203462
17517	NC_012850	CG	3	6	743899	743904	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17518	NC_012850	GCA	2	6	743908	743913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17519	NC_012850	CGC	2	6	743920	743925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17520	NC_012850	GGC	2	6	743973	743978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17521	NC_012850	TGC	2	6	744063	744068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17522	NC_012850	AGA	2	6	744086	744091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203462
17523	NC_012850	AGC	2	6	744117	744122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17524	NC_012850	GCCGAA	2	12	744142	744153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17525	NC_012850	GGCTGC	2	12	744162	744173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241203462
17526	NC_012850	GAG	2	6	744190	744195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203462
17527	NC_012850	GC	3	6	744211	744216	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17528	NC_012850	GTCT	2	8	744227	744234	0 %	50 %	25 %	25 %	241203462
17529	NC_012850	GC	3	6	744253	744258	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17530	NC_012850	TTG	2	6	744266	744271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203462
17531	NC_012850	CCG	2	6	744272	744277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17532	NC_012850	CCG	3	9	744300	744308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17533	NC_012850	GTC	2	6	744313	744318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17534	NC_012850	GCC	2	6	744325	744330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17535	NC_012850	GGA	2	6	744351	744356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203462
17536	NC_012850	CGA	2	6	744420	744425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17537	NC_012850	CAG	2	6	744439	744444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17538	NC_012850	GC	3	6	744467	744472	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17539	NC_012850	CGCC	2	8	744486	744493	0 %	0 %	25 %	75 %	241203462
17540	NC_012850	CAT	2	6	744534	744539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203462
17541	NC_012850	GCGG	2	8	744573	744580	0 %	0 %	75 %	25 %	241203462
17542	NC_012850	CGA	2	6	744672	744677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17543	NC_012850	GAG	2	6	744715	744720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203462
17544	NC_012850	GC	3	6	744721	744726	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17545	NC_012850	GCCAG	2	10	744728	744737	20 %	0 %	40 %	40 %	241203462
17546	NC_012850	GGCCGA	2	12	744747	744758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203462
17547	NC_012850	CGA	2	6	744788	744793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
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17549	NC_012850	GAG	2	6	744841	744846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203462
17550	NC_012850	GCC	2	6	744941	744946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17551	NC_012850	CG	3	6	744971	744976	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17552	NC_012850	CGAGCG	2	12	745008	745019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203462
17553	NC_012850	GC	3	6	745038	745043	0 %	0 %	50 %	50 %	241203462
17554	NC_012850	CGA	2	6	745044	745049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17555	NC_012850	CGA	2	6	745098	745103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17556	NC_012850	GCG	2	6	745130	745135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17557	NC_012850	CGC	2	6	745176	745181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17558	NC_012850	CGG	3	9	745230	745238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17559	NC_012850	CCG	2	6	745241	745246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17560	NC_012850	CGA	2	6	745266	745271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17561	NC_012850	AAG	2	6	745315	745320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203462
17562	NC_012850	GCT	2	6	745335	745340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17563	NC_012850	CGG	2	6	745344	745349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17564	NC_012850	CGA	2	6	745422	745427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17565	NC_012850	CGC	2	6	745436	745441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203462
17566	NC_012850	CGA	2	6	745443	745448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
17567	NC_012850	GGC	2	6	745488	745493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203462
17568	NC_012850	TCA	3	9	745514	745522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203462
17569	NC_012850	GCAGG	2	10	745812	745821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17570	NC_012850	GCG	2	6	745921	745926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_012850	A	6	6	745978	745983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_012850	CT	3	6	745990	745995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17573	NC_012850	GTT	2	6	746048	746053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_012850	CTG	2	6	746073	746078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17575	NC_012850	TGCG	2	8	746115	746122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17576	NC_012850	GTG	2	6	746172	746177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17577	NC_012850	C	6	6	746261	746266	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17578	NC_012850	CGGA	2	8	746283	746290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17579	NC_012850	TTG	2	6	746310	746315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17580	NC_012850	T	7	7	746330	746336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17581	NC_012850	T	6	6	746343	746348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_012850	TTTCA	2	10	746433	746442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17583	NC_012850	G	6	6	746478	746483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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17585	NC_012850	GGC	2	6	746556	746561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203463
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17589	NC_012850	CAGC	2	8	746747	746754	25 %	0 %	25 %	50 %	241203463
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17593	NC_012850	ATG	2	6	746860	746865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203463
17594	NC_012850	CG	3	6	746873	746878	0 %	0 %	50 %	50 %	241203463
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17601	NC_012850	GAG	2	6	747060	747065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203463
17602	NC_012850	GC	5	10	747145	747154	0 %	0 %	50 %	50 %	241203463
17603	NC_012850	GC	3	6	747292	747297	0 %	0 %	50 %	50 %	241203463
17604	NC_012850	CGC	2	6	747355	747360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203463
17605	NC_012850	GAG	2	6	747372	747377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203463
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17609	NC_012850	TGC	2	6	747625	747630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203463
17610	NC_012850	GCT	2	6	747656	747661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203463
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17612	NC_012850	CG	3	6	747679	747684	0 %	0 %	50 %	50 %	241203463
17613	NC_012850	CTG	2	6	747801	747806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203463
17614	NC_012850	GCAT	2	8	747838	747845	25 %	25 %	25 %	25 %	241203463
17615	NC_012850	GCC	2	6	747846	747851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203463
17616	NC_012850	GAC	2	6	747863	747868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203463
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17618	NC_012850	GCG	2	6	747891	747896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203463
17619	NC_012850	CGT	2	6	747926	747931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203463
17620	NC_012850	GCT	2	6	747971	747976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203463
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17986	NC_012850	ACG	2	6	762972	762977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203477
17987	NC_012850	TCA	2	6	762991	762996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203477
17988	NC_012850	GCGG	2	8	763001	763008	0 %	0 %	75 %	25 %	241203477
17989	NC_012850	TGA	2	6	763039	763044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203477
17990	NC_012850	CGG	2	6	763072	763077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17991	NC_012850	AGC	2	6	763094	763099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17993	NC_012850	GTT	2	6	763254	763259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17994	NC_012850	GGC	2	6	763402	763407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17995	NC_012850	CATC	2	8	763467	763474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17996	NC_012850	AGC	2	6	763475	763480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17997	NC_012850	GGGTG	2	10	763518	763527	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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17999	NC_012850	CCG	2	6	763571	763576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203478
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