MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012850	CGC	2	6	722013	722018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203439
17002	NC_012850	AGC	2	6	722051	722056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
17003	NC_012850	CGT	2	6	722083	722088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439
17004	NC_012850	GCG	2	6	722136	722141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203439
17005	NC_012850	TCG	2	6	722174	722179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439
17006	NC_012850	ATC	2	6	722180	722185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203439
17007	NC_012850	GTC	2	6	722197	722202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439
17008	NC_012850	CTT	2	6	722284	722289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203439
17009	NC_012850	CG	3	6	722331	722336	0 %	0 %	50 %	50 %	241203439
17010	NC_012850	CGC	2	6	722382	722387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203439
17011	NC_012850	GGA	2	6	722431	722436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_012850	CGGC	3	12	722441	722452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17013	NC_012850	GCC	2	6	722498	722503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17014	NC_012850	TTTG	2	8	722592	722599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_012850	CGC	2	6	722600	722605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17016	NC_012850	CTG	2	6	722640	722645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_012850	CTCG	2	8	722759	722766	0 %	25 %	25 %	50 %	241203440
17018	NC_012850	GGC	2	6	722772	722777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203440
17019	NC_012850	GTC	2	6	722786	722791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17020	NC_012850	ACG	2	6	722880	722885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17021	NC_012850	CGT	2	6	722906	722911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17022	NC_012850	AAG	2	6	722979	722984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203440
17023	NC_012850	GCA	2	6	722993	722998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17024	NC_012850	CCT	2	6	723013	723018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203440
17025	NC_012850	TCG	2	6	723073	723078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17026	NC_012850	CCGGC	2	10	723097	723106	0 %	0 %	40 %	60 %	241203440
17027	NC_012850	CGT	2	6	723146	723151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17028	NC_012850	CCGA	2	8	723192	723199	25 %	0 %	25 %	50 %	241203440
17029	NC_012850	CGG	2	6	723205	723210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203440
17030	NC_012850	AAG	2	6	723321	723326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203440
17031	NC_012850	AGC	2	6	723327	723332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203440
17032	NC_012850	GCT	2	6	723348	723353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_012850	CCTC	2	8	723374	723381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17034	NC_012850	CGA	2	6	723442	723447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_012850	TC	3	6	723454	723459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17036	NC_012850	AGGA	2	8	723509	723516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_012850	GTG	2	6	723588	723593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_012850	GCC	2	6	723657	723662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203441
17039	NC_012850	GCG	2	6	723666	723671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203441
17040	NC_012850	CGG	2	6	723790	723795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203441
17041	NC_012850	CAA	2	6	723835	723840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203441
17042	NC_012850	CAT	2	6	723977	723982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203441
17043	NC_012850	AGC	2	6	724116	724121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203441
17044	NC_012850	GCA	2	6	724159	724164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203441
17045	NC_012850	TTC	2	6	724205	724210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203441
17046	NC_012850	CCG	2	6	724258	724263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203441
17047	NC_012850	GAT	2	6	724265	724270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203441
17048	NC_012850	CGA	2	6	724279	724284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203441
17049	NC_012850	GAT	2	6	724304	724309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203441
17050	NC_012850	TGC	2	6	724381	724386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17051	NC_012850	CGT	2	6	724459	724464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17052	NC_012850	CGG	2	6	724476	724481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17053	NC_012850	CTCG	2	8	724519	724526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17054	NC_012850	GGGGA	2	10	724542	724551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_012850	GCG	2	6	724605	724610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_012850	CCG	2	6	724660	724665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17057	NC_012850	GCA	2	6	724819	724824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17058	NC_012850	TTGTT	2	10	724827	724836	0 %	80 %	20 %	0 %	241203442
17059	NC_012850	TTG	2	6	724900	724905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203442
17060	NC_012850	AAC	2	6	724963	724968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203442
17061	NC_012850	TTG	2	6	724990	724995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203442
17062	NC_012850	CCCG	2	8	725091	725098	0 %	0 %	25 %	75 %	241203442
17063	NC_012850	CGC	2	6	725147	725152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203442
17064	NC_012850	AGT	2	6	725165	725170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203442
17065	NC_012850	GTT	2	6	725175	725180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203442
17066	NC_012850	TCT	2	6	725203	725208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203442
17067	NC_012850	CGA	2	6	725246	725251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17068	NC_012850	TCA	2	6	725272	725277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203442
17069	NC_012850	GCG	2	6	725322	725327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203442
17070	NC_012850	GCT	2	6	725389	725394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17071	NC_012850	TTC	2	6	725463	725468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203442
17072	NC_012850	CAG	2	6	725484	725489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17073	NC_012850	GGCT	2	8	725497	725504	0 %	25 %	50 %	25 %	241203442
17074	NC_012850	CTT	2	6	725537	725542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203442
17075	NC_012850	CATTGT	2	12	725543	725554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241203442
17076	NC_012850	ACC	2	6	725617	725622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203442
17077	NC_012850	CCA	2	6	725663	725668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203442
17078	NC_012850	ATGG	2	8	725679	725686	25 %	25 %	50 %	0 %	241203442
17079	NC_012850	CTG	2	6	725710	725715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17080	NC_012850	CG	3	6	725751	725756	0 %	0 %	50 %	50 %	241203442
17081	NC_012850	GTTGC	2	10	725885	725894	0 %	40 %	40 %	20 %	241203442
17082	NC_012850	TCA	2	6	725900	725905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203442
17083	NC_012850	CGT	2	6	725907	725912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203442
17084	NC_012850	GAAG	2	8	725924	725931	50 %	0 %	50 %	0 %	241203442
17085	NC_012850	CCT	2	6	725942	725947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203442
17086	NC_012850	A	6	6	725964	725969	100 %	0 %	0 %	0 %	241203442
17087	NC_012850	TGA	2	6	725999	726004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203442
17088	NC_012850	TCA	2	6	726037	726042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203442
17089	NC_012850	TCC	2	6	726097	726102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_012850	ACA	2	6	726123	726128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17091	NC_012850	TTA	2	6	726157	726162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_012850	CTG	2	6	726263	726268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_012850	GTC	2	6	726300	726305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17094	NC_012850	CCG	2	6	726335	726340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17095	NC_012850	GC	3	6	726345	726350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17096	NC_012850	GAA	2	6	726363	726368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_012850	CAG	2	6	726375	726380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_012850	CCG	2	6	726385	726390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17099	NC_012850	AGC	2	6	726498	726503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_012850	GCC	2	6	726510	726515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203443
17101	NC_012850	CCA	2	6	726643	726648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203443
17102	NC_012850	CTG	2	6	726659	726664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203443
17103	NC_012850	CGG	2	6	726688	726693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203443
17104	NC_012850	CT	3	6	726722	726727	0 %	50 %	0 %	50 %	241203443
17105	NC_012850	CTGG	2	8	726797	726804	0 %	25 %	50 %	25 %	241203443
17106	NC_012850	CGC	2	6	726823	726828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203443
17107	NC_012850	TTCCAC	2	12	726830	726841	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241203443
17108	NC_012850	GCC	2	6	726876	726881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203443
17109	NC_012850	CAG	2	6	726983	726988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203443
17110	NC_012850	TCG	2	6	727008	727013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203443
17111	NC_012850	CTG	2	6	727037	727042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203443
17112	NC_012850	GCG	2	6	727058	727063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203443
17113	NC_012850	CTT	2	6	727069	727074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203443
17114	NC_012850	GGC	2	6	727103	727108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203443
17115	NC_012850	CGTG	2	8	727133	727140	0 %	25 %	50 %	25 %	241203443
17116	NC_012850	TCG	2	6	727143	727148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203443
17117	NC_012850	TGATC	2	10	727180	727189	20 %	40 %	20 %	20 %	241203443
17118	NC_012850	GCG	2	6	727197	727202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203443
17119	NC_012850	GA	3	6	727211	727216	50 %	0 %	50 %	0 %	241203443
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17121	NC_012850	GTTCG	2	10	727228	727237	0 %	40 %	40 %	20 %	241203443
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17241	NC_012850	CGG	2	6	732253	732258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203450
17242	NC_012850	ATGC	2	8	732306	732313	25 %	25 %	25 %	25 %	241203450
17243	NC_012850	CGA	2	6	732364	732369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203450
17244	NC_012850	ACC	2	6	732434	732439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17245	NC_012850	TTC	2	6	732440	732445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17246	NC_012850	GAA	2	6	732465	732470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_012850	CCTCGC	2	12	732577	732588	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241203451
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17249	NC_012850	GCG	2	6	732652	732657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203451
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17343	NC_012850	ATCG	2	8	736580	736587	25 %	25 %	25 %	25 %	241203456
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17347	NC_012850	GC	3	6	736714	736719	0 %	0 %	50 %	50 %	241203456
17348	NC_012850	CGAG	2	8	736827	736834	25 %	0 %	50 %	25 %	241203456
17349	NC_012850	CGC	2	6	736931	736936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203456
17350	NC_012850	CTGCGG	2	12	736939	736950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241203456
17351	NC_012850	TGG	2	6	737065	737070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203457
17352	NC_012850	TGA	2	6	737098	737103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203457
17353	NC_012850	CGA	2	6	737129	737134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203457
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17356	NC_012850	CG	4	8	737192	737199	0 %	0 %	50 %	50 %	241203457
17357	NC_012850	TATC	2	8	737210	737217	25 %	50 %	0 %	25 %	241203457
17358	NC_012850	GGC	2	6	737269	737274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203457
17359	NC_012850	TGG	2	6	737404	737409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203457
17360	NC_012850	GC	3	6	737427	737432	0 %	0 %	50 %	50 %	241203457
17361	NC_012850	ATC	2	6	737442	737447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203457
17362	NC_012850	CGA	2	6	737453	737458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203457
17363	NC_012850	CGG	2	6	737464	737469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203457
17364	NC_012850	GCAG	2	8	737477	737484	25 %	0 %	50 %	25 %	241203457
17365	NC_012850	GCG	2	6	737530	737535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203457
17366	NC_012850	GAC	2	6	737645	737650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203457
17367	NC_012850	GAC	2	6	737652	737657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203457
17368	NC_012850	GCA	2	6	737665	737670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203457
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17372	NC_012850	TCG	2	6	737803	737808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203457
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17374	NC_012850	GTG	2	6	737875	737880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203457
17375	NC_012850	CG	3	6	737926	737931	0 %	0 %	50 %	50 %	241203457
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17380	NC_012850	CTG	2	6	738210	738215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203457
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17382	NC_012850	CTG	2	6	738270	738275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203457
17383	NC_012850	CTT	2	6	738316	738321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203457
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17385	NC_012850	CG	3	6	738398	738403	0 %	0 %	50 %	50 %	241203457
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17391	NC_012850	TCGGCA	2	12	738602	738613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203458
17392	NC_012850	GATC	2	8	738639	738646	25 %	25 %	25 %	25 %	241203458
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17394	NC_012850	TC	3	6	738738	738743	0 %	50 %	0 %	50 %	241203458
17395	NC_012850	TCG	2	6	738755	738760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203458
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17480	NC_012850	CGA	2	6	742767	742772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203462
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