MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_012850	AGC	2	6	700871	700876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16502	NC_012850	ATGG	2	8	700983	700990	25 %	25 %	50 %	0 %	241203416
16503	NC_012850	CTGGT	2	10	700996	701005	0 %	40 %	40 %	20 %	241203416
16504	NC_012850	CG	3	6	701063	701068	0 %	0 %	50 %	50 %	241203416
16505	NC_012850	GTC	2	6	701086	701091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16506	NC_012850	ATG	2	6	701099	701104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203416
16507	NC_012850	ACG	2	6	701116	701121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16508	NC_012850	CG	3	6	701124	701129	0 %	0 %	50 %	50 %	241203416
16509	NC_012850	CGG	2	6	701163	701168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203416
16510	NC_012850	CCG	2	6	701222	701227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203416
16511	NC_012850	CGC	2	6	701241	701246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203416
16512	NC_012850	CGT	2	6	701268	701273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16513	NC_012850	CGC	2	6	701301	701306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203416
16514	NC_012850	TGC	2	6	701325	701330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16515	NC_012850	GACC	2	8	701355	701362	25 %	0 %	25 %	50 %	241203416
16516	NC_012850	CAA	2	6	701373	701378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203416
16517	NC_012850	GTG	2	6	701404	701409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203416
16518	NC_012850	CGC	2	6	701477	701482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203416
16519	NC_012850	CGAT	3	12	701546	701557	25 %	25 %	25 %	25 %	241203416
16520	NC_012850	GCA	3	9	701559	701567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16521	NC_012850	GAC	2	6	701586	701591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16522	NC_012850	GAA	2	6	701652	701657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203416
16523	NC_012850	CCGG	2	8	701658	701665	0 %	0 %	50 %	50 %	241203416
16524	NC_012850	CGC	2	6	701670	701675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203416
16525	NC_012850	ACG	2	6	701735	701740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16526	NC_012850	CG	4	8	701907	701914	0 %	0 %	50 %	50 %	241203416
16527	NC_012850	TCG	2	6	701933	701938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16528	NC_012850	GCT	2	6	701988	701993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16529	NC_012850	CGA	3	9	702009	702017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16530	NC_012850	TC	3	6	702127	702132	0 %	50 %	0 %	50 %	241203417
16531	NC_012850	GTG	2	6	702149	702154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203417
16532	NC_012850	ATC	2	6	702158	702163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203417
16533	NC_012850	GAC	2	6	702184	702189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16534	NC_012850	TCAGG	2	10	702247	702256	20 %	20 %	40 %	20 %	241203417
16535	NC_012850	ACA	2	6	702276	702281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203417
16536	NC_012850	CAG	2	6	702323	702328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16537	NC_012850	CGG	2	6	702487	702492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203417
16538	NC_012850	CGA	2	6	702553	702558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16539	NC_012850	CGT	2	6	702564	702569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16540	NC_012850	TCG	2	6	702585	702590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16541	NC_012850	ACGTC	2	10	702615	702624	20 %	20 %	20 %	40 %	241203417
16542	NC_012850	CTC	2	6	702641	702646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203417
16543	NC_012850	CGT	2	6	702709	702714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203417
16544	NC_012850	CGC	2	6	702715	702720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203417
16545	NC_012850	TCCA	2	8	702794	702801	25 %	25 %	0 %	50 %	241203417
16546	NC_012850	AAAG	2	8	702804	702811	75 %	0 %	25 %	0 %	241203417
16547	NC_012850	CGC	2	6	702846	702851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203418
16548	NC_012850	TGC	2	6	703064	703069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203418
16549	NC_012850	CGG	2	6	703121	703126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203418
16550	NC_012850	CTA	2	6	703127	703132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203418
16551	NC_012850	TCC	2	6	703159	703164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203418
16552	NC_012850	TCG	2	6	703243	703248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203418
16553	NC_012850	AAG	2	6	703251	703256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203418
16554	NC_012850	CGGC	2	8	703270	703277	0 %	0 %	50 %	50 %	241203418
16555	NC_012850	GGC	3	9	703275	703283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203418
16556	NC_012850	ACG	2	6	703402	703407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203418
16557	NC_012850	CAG	2	6	703452	703457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203418
16558	NC_012850	GCGA	2	8	703473	703480	25 %	0 %	50 %	25 %	241203418
16559	NC_012850	CAA	2	6	703493	703498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203418
16560	NC_012850	GAG	2	6	703524	703529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203418
16561	NC_012850	CAC	2	6	703628	703633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203418
16562	NC_012850	CAT	2	6	703714	703719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203419
16563	NC_012850	GCT	2	6	703729	703734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16564	NC_012850	TCG	2	6	703779	703784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16565	NC_012850	CTG	2	6	703790	703795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16566	NC_012850	ACG	3	9	703805	703813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16567	NC_012850	CAGC	2	8	703840	703847	25 %	0 %	25 %	50 %	241203419
16568	NC_012850	CGT	2	6	703885	703890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16569	NC_012850	TCG	2	6	703902	703907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16570	NC_012850	GTC	2	6	703928	703933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16571	NC_012850	TCGAGG	2	12	703941	703952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203419
16572	NC_012850	TCG	2	6	703980	703985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16573	NC_012850	TGC	2	6	704065	704070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16574	NC_012850	CCTT	2	8	704088	704095	0 %	50 %	0 %	50 %	241203419
16575	NC_012850	AGA	2	6	704097	704102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203419
16576	NC_012850	GTC	2	6	704111	704116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16577	NC_012850	ATC	2	6	704162	704167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203419
16578	NC_012850	ACCAGT	2	12	704256	704267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241203419
16579	NC_012850	ACCT	2	8	704273	704280	25 %	25 %	0 %	50 %	241203419
16580	NC_012850	GCT	2	6	704302	704307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16581	NC_012850	TCG	2	6	704325	704330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203419
16582	NC_012850	GAT	2	6	704392	704397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203419
16583	NC_012850	AGG	2	6	704417	704422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_012850	TCA	2	6	704423	704428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16585	NC_012850	CTT	2	6	704448	704453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203420
16586	NC_012850	TCG	2	6	704530	704535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16587	NC_012850	TGG	2	6	704551	704556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203420
16588	NC_012850	GCT	2	6	704573	704578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16589	NC_012850	GTC	2	6	704589	704594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16590	NC_012850	GTC	2	6	704604	704609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16591	NC_012850	GCC	2	6	704660	704665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203420
16592	NC_012850	CTCG	2	8	704684	704691	0 %	25 %	25 %	50 %	241203420
16593	NC_012850	TCG	2	6	704740	704745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16594	NC_012850	CCG	2	6	704864	704869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203420
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16596	NC_012850	TCG	2	6	704890	704895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16597	NC_012850	GTC	2	6	704967	704972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16598	NC_012850	CTA	2	6	705014	705019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203420
16599	NC_012850	GTC	2	6	705042	705047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203420
16600	NC_012850	CTTT	2	8	705136	705143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16601	NC_012850	GAT	2	6	705148	705153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_012850	GCA	2	6	705262	705267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203421
16603	NC_012850	AAG	2	6	705304	705309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203421
16604	NC_012850	TCCG	2	8	705343	705350	0 %	25 %	25 %	50 %	241203421
16605	NC_012850	GAT	2	6	705406	705411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203421
16606	NC_012850	GAGG	2	8	705439	705446	25 %	0 %	75 %	0 %	241203421
16607	NC_012850	TTG	2	6	705459	705464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203421
16608	NC_012850	CGA	2	6	705561	705566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203421
16609	NC_012850	CG	3	6	705592	705597	0 %	0 %	50 %	50 %	241203421
16610	NC_012850	CAG	2	6	705654	705659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_012850	GC	3	6	705680	705685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16612	NC_012850	ATC	2	6	705691	705696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16613	NC_012850	TGC	2	6	705707	705712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16614	NC_012850	CGC	2	6	705761	705766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16615	NC_012850	TTA	2	6	705791	705796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_012850	CTG	2	6	705846	705851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203422
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16618	NC_012850	CGC	2	6	705942	705947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203423
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16739	NC_012850	GCGA	2	8	710769	710776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16740	NC_012850	TCCAG	2	10	710997	711006	20 %	20 %	20 %	40 %	241203430
16741	NC_012850	CT	3	6	711030	711035	0 %	50 %	0 %	50 %	241203430
16742	NC_012850	TCT	2	6	711067	711072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203430
16743	NC_012850	CTCGG	2	10	711122	711131	0 %	20 %	40 %	40 %	241203430
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16748	NC_012850	TGC	2	6	711288	711293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203430
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16757	NC_012850	GC	3	6	711679	711684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16758	NC_012850	TCG	2	6	711766	711771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203431
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16770	NC_012850	GGC	2	6	712188	712193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16771	NC_012850	TC	3	6	712195	712200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16772	NC_012850	CG	3	6	712207	712212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16778	NC_012850	GGCG	2	8	712332	712339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16779	NC_012850	ACGC	2	8	712382	712389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16780	NC_012850	CGA	2	6	712392	712397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16799	NC_012850	CG	3	6	713419	713424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16800	NC_012850	TTC	2	6	713573	713578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203433
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16861	NC_012850	GAC	2	6	716109	716114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203435
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16863	NC_012850	GCA	2	6	716168	716173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203436
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16978	NC_012850	TCTT	2	8	721214	721221	0 %	75 %	0 %	25 %	241203439
16979	NC_012850	CGA	2	6	721227	721232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
16980	NC_012850	CAG	2	6	721258	721263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
16981	NC_012850	CGG	2	6	721340	721345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203439
16982	NC_012850	CGC	2	6	721405	721410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203439
16983	NC_012850	GC	3	6	721409	721414	0 %	0 %	50 %	50 %	241203439
16984	NC_012850	AGC	2	6	721448	721453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
16985	NC_012850	CGA	2	6	721465	721470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
16986	NC_012850	TCG	2	6	721497	721502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439
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16988	NC_012850	TCCGG	2	10	721668	721677	0 %	20 %	40 %	40 %	241203439
16989	NC_012850	CCG	2	6	721679	721684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203439
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16991	NC_012850	ATG	2	6	721724	721729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203439
16992	NC_012850	CGT	2	6	721785	721790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439
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16999	NC_012850	CGA	2	6	721995	722000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203439
17000	NC_012850	TCG	2	6	722001	722006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203439

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