MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012850	TCT	2	6	679643	679648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203390
16002	NC_012850	GAT	2	6	679665	679670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203390
16003	NC_012850	CGG	2	6	679671	679676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16004	NC_012850	GC	3	6	679709	679714	0 %	0 %	50 %	50 %	241203390
16005	NC_012850	CAA	2	6	679737	679742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203390
16006	NC_012850	GCT	4	12	679776	679787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16007	NC_012850	TCG	2	6	679796	679801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16008	NC_012850	GGT	2	6	679831	679836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203390
16009	NC_012850	CCG	2	6	679849	679854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203390
16010	NC_012850	CGG	2	6	679880	679885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16011	NC_012850	TCG	2	6	679924	679929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16012	NC_012850	TCA	2	6	679949	679954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203390
16013	NC_012850	GC	3	6	679971	679976	0 %	0 %	50 %	50 %	241203390
16014	NC_012850	GGC	2	6	680068	680073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16015	NC_012850	TGC	2	6	680081	680086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16016	NC_012850	ACCG	2	8	680089	680096	25 %	0 %	25 %	50 %	241203390
16017	NC_012850	CTT	2	6	680112	680117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203390
16018	NC_012850	GGC	3	9	680128	680136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16019	NC_012850	TTC	2	6	680167	680172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203390
16020	NC_012850	CATCCT	2	12	680190	680201	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241203390
16021	NC_012850	CAT	2	6	680226	680231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203390
16022	NC_012850	GAA	2	6	680244	680249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203390
16023	NC_012850	TCG	2	6	680309	680314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16024	NC_012850	CAC	2	6	680323	680328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203390
16025	NC_012850	CGA	2	6	680378	680383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16026	NC_012850	TCT	2	6	680414	680419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203390
16027	NC_012850	CGA	2	6	680429	680434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16028	NC_012850	GGC	2	6	680440	680445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16029	NC_012850	CGG	2	6	680505	680510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16030	NC_012850	CGCT	2	8	680548	680555	0 %	25 %	25 %	50 %	241203390
16031	NC_012850	CGT	2	6	680571	680576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16032	NC_012850	TAC	2	6	680635	680640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203390
16033	NC_012850	TTC	2	6	680728	680733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203390
16034	NC_012850	GCA	2	6	680736	680741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16035	NC_012850	GCCGC	2	10	680763	680772	0 %	0 %	40 %	60 %	241203390
16036	NC_012850	AAG	2	6	680887	680892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203390
16037	NC_012850	ACG	2	6	680929	680934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203390
16038	NC_012850	CGC	3	9	680954	680962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203390
16039	NC_012850	CGC	2	6	681019	681024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_012850	ATG	2	6	681065	681070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203391
16041	NC_012850	GC	3	6	681128	681133	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
16042	NC_012850	ATT	2	6	681135	681140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203391
16043	NC_012850	CATC	2	8	681217	681224	25 %	25 %	0 %	50 %	241203391
16044	NC_012850	CGGCGC	2	12	681262	681273	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
16045	NC_012850	GC	3	6	681279	681284	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
16046	NC_012850	CAT	2	6	681316	681321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203391
16047	NC_012850	CGGC	2	8	681348	681355	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
16048	NC_012850	GGT	2	6	681409	681414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203391
16049	NC_012850	CGGC	2	8	681444	681451	0 %	0 %	50 %	50 %	241203391
16050	NC_012850	TCT	3	9	681468	681476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203391
16051	NC_012850	CGT	2	6	681481	681486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16052	NC_012850	CGC	2	6	681513	681518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203391
16053	NC_012850	CGG	2	6	681532	681537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203391
16054	NC_012850	TGC	2	6	681538	681543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16055	NC_012850	GAT	2	6	681559	681564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203391
16056	NC_012850	TCA	2	6	681618	681623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203391
16057	NC_012850	TGC	2	6	681702	681707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16058	NC_012850	TCG	2	6	681744	681749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16059	NC_012850	CCG	2	6	681765	681770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203391
16060	NC_012850	TCCT	2	8	681788	681795	0 %	50 %	0 %	50 %	241203391
16061	NC_012850	TCG	2	6	681822	681827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16062	NC_012850	CCG	2	6	681828	681833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203391
16063	NC_012850	GAT	2	6	681898	681903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203391
16064	NC_012850	GAA	2	6	681910	681915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203391
16065	NC_012850	TGA	2	6	681963	681968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203391
16066	NC_012850	GCT	2	6	681985	681990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203391
16067	NC_012850	GGTT	2	8	682007	682014	0 %	50 %	50 %	0 %	241203391
16068	NC_012850	AGC	2	6	682043	682048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203392
16069	NC_012850	CGC	2	6	682057	682062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203392
16070	NC_012850	TCG	2	6	682100	682105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203392
16071	NC_012850	TCT	2	6	682109	682114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203392
16072	NC_012850	CGG	2	6	682137	682142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203392
16073	NC_012850	CGC	2	6	682169	682174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203393
16074	NC_012850	GAA	2	6	682178	682183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203393
16075	NC_012850	CAA	2	6	682193	682198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203393
16076	NC_012850	CGT	2	6	682205	682210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203393
16077	NC_012850	ATG	2	6	682212	682217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203393
16078	NC_012850	GCC	2	6	682257	682262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203393
16079	NC_012850	TCT	2	6	682279	682284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203393
16080	NC_012850	ACG	2	6	682308	682313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203393
16081	NC_012850	CGT	2	6	682337	682342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203393
16082	NC_012850	CCG	2	6	682465	682470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203393
16083	NC_012850	CAA	2	6	682544	682549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203393
16084	NC_012850	GAAG	2	8	682799	682806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_012850	AGA	2	6	682841	682846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203394
16086	NC_012850	CAT	2	6	682860	682865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203394
16087	NC_012850	CTCG	2	8	682893	682900	0 %	25 %	25 %	50 %	241203394
16088	NC_012850	TCA	2	6	682907	682912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203394
16089	NC_012850	CGG	2	6	682920	682925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203394
16090	NC_012850	CGG	2	6	682950	682955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203394
16091	NC_012850	TGG	2	6	683041	683046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203394
16092	NC_012850	GAAG	2	8	683058	683065	50 %	0 %	50 %	0 %	241203394
16093	NC_012850	CGT	2	6	683088	683093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16094	NC_012850	TTC	2	6	683146	683151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203394
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16096	NC_012850	CGG	2	6	683229	683234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203394
16097	NC_012850	GCC	2	6	683241	683246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203394
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16099	NC_012850	ACG	2	6	683317	683322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16100	NC_012850	GCT	2	6	683343	683348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16101	NC_012850	CTGACG	2	12	683380	683391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16102	NC_012850	TGC	2	6	683393	683398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
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16104	NC_012850	CTT	2	6	683481	683486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203394
16105	NC_012850	TCG	2	6	683519	683524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16106	NC_012850	TGCGC	2	10	683556	683565	0 %	20 %	40 %	40 %	241203394
16107	NC_012850	GGC	2	6	683601	683606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203394
16108	NC_012850	TCG	2	6	683624	683629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16109	NC_012850	CGT	2	6	683631	683636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203394
16110	NC_012850	TTC	2	6	683650	683655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203394
16111	NC_012850	GGC	2	6	683671	683676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203394
16112	NC_012850	GAT	2	6	683699	683704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203394
16113	NC_012850	T	6	6	683744	683749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_012850	TGG	2	6	683752	683757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_012850	TGT	2	6	684000	684005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_012850	GCA	2	6	684088	684093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_012850	GC	4	8	684201	684208	0 %	0 %	50 %	50 %	241203395
16118	NC_012850	TGG	2	6	684256	684261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203395
16119	NC_012850	TCC	2	6	684379	684384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203395
16120	NC_012850	CCT	2	6	684413	684418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203395
16121	NC_012850	CGC	2	6	684430	684435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203395
16122	NC_012850	CGA	2	6	684467	684472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203395
16123	NC_012850	TGG	2	6	684544	684549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203395
16124	NC_012850	ATGG	2	8	684585	684592	25 %	25 %	50 %	0 %	241203395
16125	NC_012850	CGAT	2	8	684593	684600	25 %	25 %	25 %	25 %	241203395
16126	NC_012850	TGC	2	6	684609	684614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203395
16127	NC_012850	TTC	2	6	684633	684638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203395
16128	NC_012850	CGC	2	6	684653	684658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203395
16129	NC_012850	CG	5	10	684759	684768	0 %	0 %	50 %	50 %	241203395
16130	NC_012850	TCA	2	6	684836	684841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203395
16131	NC_012850	TCT	4	12	684843	684854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_012850	CG	3	6	684879	684884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16133	NC_012850	CGG	2	6	684965	684970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16134	NC_012850	AAT	2	6	685006	685011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_012850	GCA	2	6	685028	685033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16136	NC_012850	GGCCGC	2	12	685042	685053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16137	NC_012850	GCT	2	6	685134	685139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203396
16138	NC_012850	GCC	2	6	685199	685204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203396
16139	NC_012850	ATT	2	6	685215	685220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203396
16140	NC_012850	CGGCC	2	10	685240	685249	0 %	0 %	40 %	60 %	241203396
16141	NC_012850	TCG	2	6	685266	685271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203396
16142	NC_012850	TCATCG	2	12	685275	685286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241203396
16143	NC_012850	GCC	2	6	685318	685323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203396
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16150	NC_012850	GCA	2	6	685608	685613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203397
16151	NC_012850	GGC	2	6	685646	685651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203397
16152	NC_012850	GGC	2	6	685656	685661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203397
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16154	NC_012850	CTT	2	6	685721	685726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203397
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16162	NC_012850	CCGG	2	8	686052	686059	0 %	0 %	50 %	50 %	241203397
16163	NC_012850	CGG	2	6	686069	686074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203397
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16172	NC_012850	GTC	2	6	686601	686606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
16173	NC_012850	TCG	2	6	686635	686640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203398
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16189	NC_012850	CAGGG	2	10	687179	687188	20 %	0 %	60 %	20 %	241203398
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16226	NC_012850	ATA	2	6	689046	689051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203401
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16230	NC_012850	ACC	2	6	689160	689165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203401
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16238	NC_012850	GGCA	2	8	689538	689545	25 %	0 %	50 %	25 %	241203401
16239	NC_012850	GCT	2	6	689675	689680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203401
16240	NC_012850	AAC	2	6	689697	689702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203401
16241	NC_012850	GTC	2	6	689710	689715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203401
16242	NC_012850	CAG	2	6	689790	689795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203401
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16246	NC_012850	CAGC	2	8	689951	689958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16247	NC_012850	AGCGG	2	10	690004	690013	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16248	NC_012850	GCC	2	6	690024	690029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16249	NC_012850	TCC	2	6	690086	690091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16250	NC_012850	CAA	2	6	690115	690120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16251	NC_012850	CGC	2	6	690142	690147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203402
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16360	NC_012850	G	6	6	695008	695013	0 %	0 %	100 %	0 %	241203407
16361	NC_012850	GACG	2	8	695037	695044	25 %	0 %	50 %	25 %	241203407
16362	NC_012850	ATC	2	6	695053	695058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203407
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16365	NC_012850	CCG	2	6	695278	695283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16480	NC_012850	ATG	2	6	700140	700145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203415
16481	NC_012850	GTG	2	6	700148	700153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203415
16482	NC_012850	TC	3	6	700156	700161	0 %	50 %	0 %	50 %	241203415
16483	NC_012850	CAT	2	6	700180	700185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203415
16484	NC_012850	CGCT	2	8	700188	700195	0 %	25 %	25 %	50 %	241203415
16485	NC_012850	CGA	2	6	700222	700227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203415
16486	NC_012850	CGGG	2	8	700238	700245	0 %	0 %	75 %	25 %	241203415
16487	NC_012850	GAT	2	6	700261	700266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203415
16488	NC_012850	TCG	2	6	700326	700331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203415
16489	NC_012850	GCG	2	6	700347	700352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203415
16490	NC_012850	CGC	2	6	700450	700455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203415
16491	NC_012850	GCG	2	6	700466	700471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203415
16492	NC_012850	CG	4	8	700470	700477	0 %	0 %	50 %	50 %	241203415
16493	NC_012850	GGC	2	6	700517	700522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203415
16494	NC_012850	CGG	2	6	700549	700554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203415
16495	NC_012850	CTGG	2	8	700650	700657	0 %	25 %	50 %	25 %	241203416
16496	NC_012850	TCC	2	6	700680	700685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203416
16497	NC_012850	CGT	2	6	700689	700694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16498	NC_012850	GTC	2	6	700708	700713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16499	NC_012850	CGT	2	6	700716	700721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203416
16500	NC_012850	ATC	2	6	700723	700728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203416

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