MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012850	GCA	2	6	657994	657999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15502	NC_012850	CGA	2	6	658048	658053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15503	NC_012850	GCC	2	6	658081	658086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203370
15504	NC_012850	ATC	2	6	658113	658118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203370
15505	NC_012850	CCG	2	6	658129	658134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203370
15506	NC_012850	CAG	2	6	658136	658141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15507	NC_012850	TGA	2	6	658174	658179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203370
15508	NC_012850	ACG	2	6	658185	658190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15509	NC_012850	ACA	2	6	658207	658212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203370
15510	NC_012850	GGC	2	6	658276	658281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203371
15511	NC_012850	CGG	2	6	658323	658328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203371
15512	NC_012850	GCC	2	6	658332	658337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203371
15513	NC_012850	CAG	2	6	658348	658353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203371
15514	NC_012850	CTCG	2	8	658356	658363	0 %	25 %	25 %	50 %	241203371
15515	NC_012850	TGA	3	9	658392	658400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203371
15516	NC_012850	TGGT	2	8	658463	658470	0 %	50 %	50 %	0 %	241203371
15517	NC_012850	TCG	2	6	658475	658480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203371
15518	NC_012850	GCC	2	6	658523	658528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203371
15519	NC_012850	CGC	2	6	658539	658544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203371
15520	NC_012850	GC	4	8	658557	658564	0 %	0 %	50 %	50 %	241203371
15521	NC_012850	CGC	2	6	658643	658648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203371
15522	NC_012850	GAT	2	6	658687	658692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203371
15523	NC_012850	GCG	2	6	658701	658706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203371
15524	NC_012850	TCT	2	6	658740	658745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203371
15525	NC_012850	CCGA	2	8	658781	658788	25 %	0 %	25 %	50 %	241203371
15526	NC_012850	CGT	2	6	658822	658827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203371
15527	NC_012850	GGA	2	6	658971	658976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_012850	CCG	2	6	659054	659059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15529	NC_012850	CCA	2	6	659100	659105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15530	NC_012850	CAG	2	6	659185	659190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_012850	GAT	2	6	659213	659218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_012850	ATG	2	6	659283	659288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_012850	CGCC	2	8	659320	659327	0 %	0 %	25 %	75 %	241203372
15534	NC_012850	CCG	2	6	659360	659365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203372
15535	NC_012850	TTG	2	6	659390	659395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203372
15536	NC_012850	CAT	2	6	659456	659461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203372
15537	NC_012850	GCT	2	6	659512	659517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203372
15538	NC_012850	GC	3	6	659529	659534	0 %	0 %	50 %	50 %	241203372
15539	NC_012850	ATG	2	6	659553	659558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203372
15540	NC_012850	CTT	2	6	659578	659583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203372
15541	NC_012850	TCA	2	6	659608	659613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203372
15542	NC_012850	GCG	2	6	659649	659654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203372
15543	NC_012850	GGC	2	6	659665	659670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203372
15544	NC_012850	CGG	2	6	659749	659754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203372
15545	NC_012850	TGG	2	6	659756	659761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203372
15546	NC_012850	GCCG	2	8	659822	659829	0 %	0 %	50 %	50 %	241203372
15547	NC_012850	AGA	2	6	659841	659846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203372
15548	NC_012850	CCGA	2	8	659873	659880	25 %	0 %	25 %	50 %	241203372
15549	NC_012850	TCG	2	6	659913	659918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203372
15550	NC_012850	GC	3	6	659934	659939	0 %	0 %	50 %	50 %	241203372
15551	NC_012850	CGGCT	2	10	659945	659954	0 %	20 %	40 %	40 %	241203372
15552	NC_012850	CGA	2	6	660034	660039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203372
15553	NC_012850	CGG	2	6	660070	660075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203372
15554	NC_012850	GC	3	6	660080	660085	0 %	0 %	50 %	50 %	241203372
15555	NC_012850	CCG	2	6	660140	660145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203372
15556	NC_012850	GAT	2	6	660175	660180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203372
15557	NC_012850	ACCGCA	2	12	660186	660197	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241203372
15558	NC_012850	CTT	2	6	660214	660219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203372
15559	NC_012850	GCT	2	6	660280	660285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203372
15560	NC_012850	GAA	2	6	660331	660336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203372
15561	NC_012850	CTGG	2	8	660361	660368	0 %	25 %	50 %	25 %	241203372
15562	NC_012850	GA	3	6	660401	660406	50 %	0 %	50 %	0 %	241203372
15563	NC_012850	CT	3	6	660560	660565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15564	NC_012850	CAG	2	6	660669	660674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15565	NC_012850	CGT	2	6	660680	660685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15566	NC_012850	AGC	2	6	660741	660746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15567	NC_012850	CG	3	6	660814	660819	0 %	0 %	50 %	50 %	241203373
15568	NC_012850	GTG	2	6	660875	660880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203373
15569	NC_012850	GCCGAC	2	12	660881	660892	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241203373
15570	NC_012850	CGC	2	6	660919	660924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203373
15571	NC_012850	TCT	2	6	660940	660945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203373
15572	NC_012850	GAC	2	6	661049	661054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15573	NC_012850	TGC	2	6	661062	661067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15574	NC_012850	CAGGG	2	10	661077	661086	20 %	0 %	60 %	20 %	241203373
15575	NC_012850	GCCTTG	2	12	661098	661109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15576	NC_012850	GCG	2	6	661218	661223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203373
15577	NC_012850	ACC	2	6	661230	661235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203373
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15579	NC_012850	CGT	3	9	661258	661266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15580	NC_012850	GACG	2	8	661396	661403	25 %	0 %	50 %	25 %	241203373
15581	NC_012850	GTC	2	6	661457	661462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15582	NC_012850	CGTGC	2	10	661481	661490	0 %	20 %	40 %	40 %	241203373
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15584	NC_012850	GTTGAG	2	12	661553	661564	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241203373
15585	NC_012850	CTTC	2	8	661576	661583	0 %	50 %	0 %	50 %	241203373
15586	NC_012850	GC	3	6	661591	661596	0 %	0 %	50 %	50 %	241203373
15587	NC_012850	TCT	2	6	661633	661638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203373
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15589	NC_012850	CGA	2	6	661660	661665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15590	NC_012850	GTC	2	6	661694	661699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15591	NC_012850	GAC	3	9	661703	661711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15592	NC_012850	CGA	2	6	661744	661749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203373
15593	NC_012850	TCGCC	2	10	661849	661858	0 %	20 %	20 %	60 %	241203374
15594	NC_012850	ATCG	2	8	661934	661941	25 %	25 %	25 %	25 %	241203374
15595	NC_012850	GAG	2	6	661962	661967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203374
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15600	NC_012850	TCG	2	6	662082	662087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203374
15601	NC_012850	CGG	3	9	662110	662118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203374
15602	NC_012850	CAG	2	6	662165	662170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203374
15603	NC_012850	GC	3	6	662206	662211	0 %	0 %	50 %	50 %	241203374
15604	NC_012850	GGCC	2	8	662215	662222	0 %	0 %	50 %	50 %	241203374
15605	NC_012850	GAG	2	6	662262	662267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203374
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15607	NC_012850	TCC	2	6	662295	662300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203374
15608	NC_012850	CGC	2	6	662315	662320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
15609	NC_012850	GAA	2	6	662330	662335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203374
15610	NC_012850	GTCCCA	2	12	662354	662365	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203374
15611	NC_012850	GCG	2	6	662369	662374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203374
15612	NC_012850	GC	3	6	662404	662409	0 %	0 %	50 %	50 %	241203374
15613	NC_012850	GGCG	2	8	662437	662444	0 %	0 %	75 %	25 %	241203374
15614	NC_012850	GCC	2	6	662447	662452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
15615	NC_012850	GGC	2	6	662453	662458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203374
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15617	NC_012850	GAG	2	6	662484	662489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203374
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15620	NC_012850	CGC	2	6	662703	662708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203374
15621	NC_012850	CGA	2	6	662800	662805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203374
15622	NC_012850	GGT	2	6	662840	662845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203374
15623	NC_012850	GC	3	6	662897	662902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15624	NC_012850	A	7	7	662950	662956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_012850	CTTT	2	8	662972	662979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15626	NC_012850	CGTT	2	8	663013	663020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15627	NC_012850	GCG	2	6	663032	663037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15628	NC_012850	GCC	2	6	663044	663049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15632	NC_012850	GCC	2	6	663116	663121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203375
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15645	NC_012850	CAG	2	6	663558	663563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203375
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15659	NC_012850	GCATC	2	10	664217	664226	20 %	20 %	20 %	40 %	241203375
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15730	NC_012850	GGC	2	6	666999	667004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15737	NC_012850	CG	4	8	667496	667503	0 %	0 %	50 %	50 %	241203377
15738	NC_012850	CGA	2	6	667522	667527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203377
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15740	NC_012850	TGA	2	6	667722	667727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203378
15741	NC_012850	GCG	2	6	667878	667883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203378
15742	NC_012850	GGC	2	6	667933	667938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203378
15743	NC_012850	GTCAGC	2	12	668090	668101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203378
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15755	NC_012850	GATC	2	8	668553	668560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15756	NC_012850	ATC	2	6	668604	668609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15758	NC_012850	GTC	2	6	668702	668707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203379
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15981	NC_012850	TGACG	2	10	678760	678769	20 %	20 %	40 %	20 %	241203389
15982	NC_012850	CAGTGG	2	12	678788	678799	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203389
15983	NC_012850	CTG	2	6	678851	678856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203389
15984	NC_012850	CGC	3	9	678871	678879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203389
15985	NC_012850	TCT	2	6	678910	678915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203389
15986	NC_012850	CAA	2	6	678946	678951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203389
15987	NC_012850	CCGA	2	8	678980	678987	25 %	0 %	25 %	50 %	241203389
15988	NC_012850	CCTT	2	8	679010	679017	0 %	50 %	0 %	50 %	241203389
15989	NC_012850	TGCCG	2	10	679033	679042	0 %	20 %	40 %	40 %	241203389
15990	NC_012850	GCC	2	6	679044	679049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203389
15991	NC_012850	CGT	2	6	679150	679155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203389
15992	NC_012850	GCC	2	6	679190	679195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203389
15993	NC_012850	ACG	2	6	679316	679321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203390
15994	NC_012850	CGC	2	6	679338	679343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203390
15995	NC_012850	CAT	2	6	679345	679350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203390
15996	NC_012850	GCTG	2	8	679406	679413	0 %	25 %	50 %	25 %	241203390
15997	NC_012850	ACCA	2	8	679420	679427	50 %	0 %	0 %	50 %	241203390
15998	NC_012850	CAT	2	6	679473	679478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203390
15999	NC_012850	CGG	2	6	679479	679484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203390
16000	NC_012850	GGCCT	2	10	679543	679552	0 %	20 %	40 %	40 %	241203390

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