MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012850	GC	3	6	638595	638600	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
15002	NC_012850	TCG	2	6	638618	638623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15003	NC_012850	GC	3	6	638625	638630	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
15004	NC_012850	GTC	2	6	638659	638664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15005	NC_012850	TCC	2	6	638701	638706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203353
15006	NC_012850	CAT	2	6	638721	638726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203353
15007	NC_012850	CGA	2	6	638736	638741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15008	NC_012850	GTC	2	6	638824	638829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15009	NC_012850	GGC	2	6	638868	638873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203353
15010	NC_012850	CAC	2	6	638895	638900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203353
15011	NC_012850	TCG	2	6	638933	638938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15012	NC_012850	ACC	2	6	638990	638995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203353
15013	NC_012850	CG	3	6	639020	639025	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
15014	NC_012850	CCG	2	6	639056	639061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203353
15015	NC_012850	CAA	2	6	639063	639068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203353
15016	NC_012850	GCA	2	6	639084	639089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15017	NC_012850	GAG	2	6	639106	639111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203353
15018	NC_012850	GCCA	2	8	639121	639128	25 %	0 %	25 %	50 %	241203353
15019	NC_012850	AGG	2	6	639140	639145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203353
15020	NC_012850	GAA	2	6	639157	639162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203353
15021	NC_012850	CTG	2	6	639163	639168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
15022	NC_012850	CGC	2	6	639200	639205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203353
15023	NC_012850	GC	3	6	639204	639209	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
15024	NC_012850	CCCG	2	8	639230	639237	0 %	0 %	25 %	75 %	241203353
15025	NC_012850	CGG	2	6	639285	639290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203353
15026	NC_012850	GAAG	2	8	639315	639322	50 %	0 %	50 %	0 %	241203353
15027	NC_012850	GCGG	2	8	639369	639376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15028	NC_012850	T	6	6	639394	639399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_012850	G	6	6	639454	639459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_012850	AGA	2	6	639460	639465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_012850	GCG	2	6	639471	639476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_012850	TCCA	2	8	639675	639682	25 %	25 %	0 %	50 %	241203354
15033	NC_012850	CGAG	2	8	639697	639704	25 %	0 %	50 %	25 %	241203354
15034	NC_012850	GCC	2	6	639770	639775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15035	NC_012850	TGG	2	6	639810	639815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203354
15036	NC_012850	GC	3	6	639860	639865	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15037	NC_012850	CGT	2	6	639875	639880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15038	NC_012850	CGG	2	6	639889	639894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15039	NC_012850	CGG	2	6	639907	639912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15040	NC_012850	AGC	2	6	639948	639953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15041	NC_012850	CCTT	2	8	639966	639973	0 %	50 %	0 %	50 %	241203354
15042	NC_012850	CGC	2	6	640006	640011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15043	NC_012850	CGACGC	2	12	640024	640035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241203354
15044	NC_012850	CGC	2	6	640039	640044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15045	NC_012850	CAT	2	6	640072	640077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203354
15046	NC_012850	TCG	2	6	640116	640121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15047	NC_012850	GCC	3	9	640122	640130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15048	NC_012850	CAC	2	6	640133	640138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203354
15049	NC_012850	GTG	2	6	640152	640157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203354
15050	NC_012850	CGA	2	6	640204	640209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15051	NC_012850	CGT	2	6	640258	640263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15052	NC_012850	GC	3	6	640281	640286	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15053	NC_012850	GCG	2	6	640308	640313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15054	NC_012850	CGG	2	6	640342	640347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15055	NC_012850	GGC	2	6	640442	640447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15056	NC_012850	CGA	2	6	640456	640461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15057	NC_012850	GTC	2	6	640466	640471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15058	NC_012850	GGC	2	6	640475	640480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15059	NC_012850	TGA	2	6	640555	640560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203354
15060	NC_012850	TTG	2	6	640569	640574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203354
15061	NC_012850	CCG	2	6	640603	640608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15062	NC_012850	GCCCTT	2	12	640616	640627	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241203354
15063	NC_012850	GAC	2	6	640634	640639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15064	NC_012850	GCA	2	6	640690	640695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15065	NC_012850	GGT	2	6	640696	640701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203354
15066	NC_012850	GCC	2	6	640760	640765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15067	NC_012850	CG	3	6	640777	640782	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15068	NC_012850	CTT	2	6	640841	640846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203354
15069	NC_012850	GC	3	6	640889	640894	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15070	NC_012850	CGG	2	6	640919	640924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15071	NC_012850	TGTCGT	2	12	640936	640947	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241203354
15072	NC_012850	GC	3	6	640964	640969	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15073	NC_012850	GCCG	2	8	641009	641016	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15074	NC_012850	CGG	2	6	641049	641054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15075	NC_012850	CGG	2	6	641071	641076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15076	NC_012850	GGCC	2	8	641092	641099	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15077	NC_012850	TCGAGG	2	12	641104	641115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203354
15078	NC_012850	GCGCC	2	10	641119	641128	0 %	0 %	40 %	60 %	241203354
15079	NC_012850	CGG	2	6	641154	641159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15080	NC_012850	GCCG	2	8	641209	641216	0 %	0 %	50 %	50 %	241203354
15081	NC_012850	ATC	2	6	641267	641272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203354
15082	NC_012850	CGA	2	6	641311	641316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203354
15083	NC_012850	GCC	2	6	641339	641344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203354
15084	NC_012850	CGG	2	6	641428	641433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203354
15085	NC_012850	G	6	6	641455	641460	0 %	0 %	100 %	0 %	241203354
15086	NC_012850	CGGG	2	8	641479	641486	0 %	0 %	75 %	25 %	241203354
15087	NC_012850	ATG	2	6	641579	641584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_012850	CAT	2	6	641613	641618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_012850	CGG	2	6	641663	641668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_012850	CGATC	2	10	641687	641696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15091	NC_012850	GGA	2	6	641698	641703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_012850	ATC	2	6	641709	641714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_012850	TCA	2	6	641755	641760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203355
15094	NC_012850	TCC	2	6	641794	641799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203355
15095	NC_012850	GAG	3	9	641824	641832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203355
15096	NC_012850	CCA	2	6	641841	641846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203355
15097	NC_012850	GCC	2	6	641869	641874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
15098	NC_012850	CGGC	2	8	641905	641912	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
15099	NC_012850	ATCGC	2	10	641923	641932	20 %	20 %	20 %	40 %	241203355
15100	NC_012850	CCGG	2	8	641933	641940	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
15101	NC_012850	CAG	2	6	641946	641951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
15102	NC_012850	CGG	2	6	641957	641962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203355
15103	NC_012850	GAC	2	6	641982	641987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
15104	NC_012850	GC	3	6	642010	642015	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
15105	NC_012850	CGC	2	6	642146	642151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
15106	NC_012850	GATC	2	8	642200	642207	25 %	25 %	25 %	25 %	241203355
15107	NC_012850	TCC	2	6	642208	642213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203355
15108	NC_012850	GCCA	2	8	642229	642236	25 %	0 %	25 %	50 %	241203355
15109	NC_012850	CAG	2	6	642255	642260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
15110	NC_012850	CGGC	2	8	642310	642317	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
15111	NC_012850	TCA	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203355
15112	NC_012850	ATGCGG	2	12	642423	642434	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203355
15113	NC_012850	GAA	2	6	642486	642491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203355
15114	NC_012850	CGA	2	6	642503	642508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203355
15115	NC_012850	GCC	2	6	642509	642514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
15116	NC_012850	GC	3	6	642530	642535	0 %	0 %	50 %	50 %	241203355
15117	NC_012850	CCG	2	6	642550	642555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203355
15118	NC_012850	GAT	2	6	642573	642578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203355
15119	NC_012850	ATCGC	2	10	642589	642598	20 %	20 %	20 %	40 %	241203355
15120	NC_012850	AAG	2	6	642637	642642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203355
15121	NC_012850	CG	3	6	642707	642712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15122	NC_012850	GC	3	6	642750	642755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_012850	CG	3	6	642756	642761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15124	NC_012850	CG	3	6	642772	642777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15229	NC_012850	TC	4	8	646848	646855	0 %	50 %	0 %	50 %	241203361
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15240	NC_012850	GTGG	2	8	647136	647143	0 %	25 %	75 %	0 %	241203361
15241	NC_012850	CGT	2	6	647176	647181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203361
15242	NC_012850	GCG	2	6	647182	647187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203361
15243	NC_012850	TCG	2	6	647374	647379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203361
15244	NC_012850	GAATT	2	10	647411	647420	40 %	40 %	20 %	0 %	241203361
15245	NC_012850	CATA	2	8	647478	647485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15246	NC_012850	CTT	2	6	647492	647497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15247	NC_012850	TAC	2	6	647543	647548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15248	NC_012850	CGA	2	6	647559	647564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15249	NC_012850	AGC	2	6	647570	647575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15250	NC_012850	CAG	2	6	647618	647623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15251	NC_012850	AG	3	6	647625	647630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_012850	CTTC	2	8	647650	647657	0 %	50 %	0 %	50 %	241203362
15253	NC_012850	TGC	2	6	647668	647673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203362
15254	NC_012850	CG	3	6	647716	647721	0 %	0 %	50 %	50 %	241203362
15255	NC_012850	TGC	2	6	647767	647772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203362
15256	NC_012850	GC	3	6	647833	647838	0 %	0 %	50 %	50 %	241203362
15257	NC_012850	GC	3	6	647851	647856	0 %	0 %	50 %	50 %	241203362
15258	NC_012850	TGC	2	6	647872	647877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203362
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15262	NC_012850	ATC	2	6	648201	648206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203362
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15265	NC_012850	CCG	2	6	648272	648277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203362
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15272	NC_012850	CGA	2	6	648412	648417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203362
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15275	NC_012850	TGC	2	6	648610	648615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203362
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15316	NC_012850	ACA	2	6	650630	650635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15317	NC_012850	GGAG	2	8	650656	650663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15318	NC_012850	CTG	2	6	650698	650703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
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15355	NC_012850	GCGATC	2	12	651829	651840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203364
15356	NC_012850	CGA	3	9	651842	651850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203364
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15358	NC_012850	CCA	2	6	651872	651877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203364
15359	NC_012850	GC	3	6	651881	651886	0 %	0 %	50 %	50 %	241203364
15360	NC_012850	GTC	2	6	651889	651894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
15361	NC_012850	GCT	2	6	651936	651941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
15362	NC_012850	ATC	2	6	651964	651969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203364
15363	NC_012850	TCG	2	6	651977	651982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
15364	NC_012850	TCG	2	6	651995	652000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203364
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15366	NC_012850	ACA	2	6	652138	652143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15367	NC_012850	TGA	3	9	652162	652170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15402	NC_012850	CCA	3	9	654087	654095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15403	NC_012850	ACC	2	6	654098	654103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15481	NC_012850	CGAG	2	8	657559	657566	25 %	0 %	50 %	25 %	241203369
15482	NC_012850	CGG	2	6	657569	657574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203369
15483	NC_012850	CAG	2	6	657575	657580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203369
15484	NC_012850	GAT	2	6	657593	657598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203369
15485	NC_012850	TCA	2	6	657637	657642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203369
15486	NC_012850	GCC	2	6	657676	657681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203370
15487	NC_012850	CG	4	8	657688	657695	0 %	0 %	50 %	50 %	241203370
15488	NC_012850	CGC	2	6	657701	657706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203370
15489	NC_012850	GAT	2	6	657737	657742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203370
15490	NC_012850	GCG	2	6	657745	657750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203370
15491	NC_012850	AGC	2	6	657753	657758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15492	NC_012850	GTC	2	6	657759	657764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15493	NC_012850	CGA	2	6	657820	657825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15494	NC_012850	GCA	2	6	657841	657846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15495	NC_012850	TCG	2	6	657870	657875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203370
15496	NC_012850	GCGG	2	8	657901	657908	0 %	0 %	75 %	25 %	241203370
15497	NC_012850	TCG	2	6	657924	657929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203370
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