MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012850	TCAG	2	8	618001	618008	25 %	25 %	25 %	25 %	241203336
14502	NC_012850	CCG	2	6	618011	618016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203336
14503	NC_012850	GCTC	2	8	618048	618055	0 %	25 %	25 %	50 %	241203336
14504	NC_012850	CGA	2	6	618062	618067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203336
14505	NC_012850	CGG	2	6	618083	618088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203336
14506	NC_012850	GGC	2	6	618099	618104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203336
14507	NC_012850	TCT	2	6	618124	618129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203336
14508	NC_012850	CG	3	6	618226	618231	0 %	0 %	50 %	50 %	241203336
14509	NC_012850	AAGC	2	8	618239	618246	50 %	0 %	25 %	25 %	241203336
14510	NC_012850	ACG	2	6	618298	618303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203336
14511	NC_012850	CGA	2	6	618371	618376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203336
14512	NC_012850	CAA	2	6	618402	618407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203336
14513	NC_012850	T	7	7	618434	618440	0 %	100 %	0 %	0 %	241203336
14514	NC_012850	TCG	2	6	618448	618453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203336
14515	NC_012850	GGC	2	6	618459	618464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203336
14516	NC_012850	GTTT	2	8	618475	618482	0 %	75 %	25 %	0 %	241203336
14517	NC_012850	GAT	2	6	618494	618499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_012850	GAT	2	6	618581	618586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203337
14519	NC_012850	TGC	2	6	618609	618614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203337
14520	NC_012850	TC	3	6	618661	618666	0 %	50 %	0 %	50 %	241203337
14521	NC_012850	CGG	2	6	618683	618688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203337
14522	NC_012850	ATC	2	6	618713	618718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203337
14523	NC_012850	GGT	2	6	618733	618738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203337
14524	NC_012850	GAAC	2	8	618793	618800	50 %	0 %	25 %	25 %	241203337
14525	NC_012850	AC	3	6	618805	618810	50 %	0 %	0 %	50 %	241203337
14526	NC_012850	GGT	2	6	618828	618833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203337
14527	NC_012850	AATAT	2	10	618921	618930	60 %	40 %	0 %	0 %	241203337
14528	NC_012850	GATTGA	2	12	619093	619104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_012850	GAT	2	6	619221	619226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203338
14530	NC_012850	GCCG	2	8	619259	619266	0 %	0 %	50 %	50 %	241203338
14531	NC_012850	GTG	2	6	619267	619272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203338
14532	NC_012850	CGG	2	6	619318	619323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203338
14533	NC_012850	CGG	2	6	619442	619447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203338
14534	NC_012850	CGA	2	6	619469	619474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203338
14535	NC_012850	GTG	2	6	619503	619508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203338
14536	NC_012850	GCGG	2	8	619554	619561	0 %	0 %	75 %	25 %	241203338
14537	NC_012850	GGAGG	2	10	619614	619623	20 %	0 %	80 %	0 %	241203338
14538	NC_012850	CCGCG	2	10	619637	619646	0 %	0 %	40 %	60 %	241203338
14539	NC_012850	ATGG	2	8	619683	619690	25 %	25 %	50 %	0 %	241203338
14540	NC_012850	CGT	2	6	619734	619739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203338
14541	NC_012850	TTCAT	2	10	619771	619780	20 %	60 %	0 %	20 %	241203338
14542	NC_012850	TCT	2	6	619815	619820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_012850	GCC	2	6	619859	619864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_012850	CCT	2	6	619904	619909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14545	NC_012850	GGTGT	2	10	619957	619966	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_012850	TCG	2	6	620035	620040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_012850	CAA	2	6	620132	620137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14548	NC_012850	AAG	2	6	620160	620165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
14549	NC_012850	CAA	2	6	620192	620197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14550	NC_012850	CGA	2	6	620210	620215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14551	NC_012850	GAA	2	6	620297	620302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
14552	NC_012850	CAA	2	6	620342	620347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14553	NC_012850	CGC	3	9	620375	620383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14554	NC_012850	GACG	2	8	620417	620424	25 %	0 %	50 %	25 %	241203339
14555	NC_012850	AGG	2	6	620428	620433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203339
14556	NC_012850	GCC	2	6	620481	620486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14557	NC_012850	AGC	2	6	620496	620501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14558	NC_012850	ACGGC	2	10	620506	620515	20 %	0 %	40 %	40 %	241203339
14559	NC_012850	GAC	2	6	620528	620533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14560	NC_012850	CGA	2	6	620537	620542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14561	NC_012850	CAA	2	6	620549	620554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14562	NC_012850	GATC	2	8	620591	620598	25 %	25 %	25 %	25 %	241203339
14563	NC_012850	CGT	2	6	620663	620668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14564	NC_012850	GCG	2	6	620680	620685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14565	NC_012850	GCC	2	6	620703	620708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14566	NC_012850	ACGGC	2	10	620740	620749	20 %	0 %	40 %	40 %	241203339
14567	NC_012850	TCA	2	6	620809	620814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
14568	NC_012850	TCGG	2	8	620823	620830	0 %	25 %	50 %	25 %	241203339
14569	NC_012850	CTA	2	6	620840	620845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
14570	NC_012850	CGG	2	6	620857	620862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14571	NC_012850	ACA	2	6	620869	620874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14572	NC_012850	CGA	2	6	620915	620920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14573	NC_012850	ACG	2	6	620955	620960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14574	NC_012850	CCG	2	6	620986	620991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14575	NC_012850	GACC	2	8	621011	621018	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
14576	NC_012850	GC	3	6	621099	621104	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
14577	NC_012850	GGC	2	6	621137	621142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14578	NC_012850	GAA	2	6	621155	621160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
14579	NC_012850	TAT	2	6	621162	621167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203339
14580	NC_012850	CTG	2	6	621210	621215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14581	NC_012850	GCG	2	6	621399	621404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14582	NC_012850	ACC	2	6	621417	621422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
14583	NC_012850	CGG	2	6	621430	621435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14584	NC_012850	CAT	2	6	621488	621493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
14585	NC_012850	TCG	2	6	621577	621582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14586	NC_012850	CAC	2	6	621698	621703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
14587	NC_012850	GCG	2	6	621720	621725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14588	NC_012850	CTTCAA	2	12	621905	621916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
14589	NC_012850	CAG	2	6	621968	621973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14590	NC_012850	GCC	2	6	621984	621989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14591	NC_012850	GC	3	6	621993	621998	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
14592	NC_012850	GAC	2	6	622002	622007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14593	NC_012850	CG	3	6	622013	622018	0 %	0 %	50 %	50 %	241203339
14594	NC_012850	CGA	2	6	622024	622029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14595	NC_012850	GAT	2	6	622041	622046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
14596	NC_012850	GCC	3	9	622155	622163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14597	NC_012850	GTC	2	6	622218	622223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14598	NC_012850	ACC	2	6	622254	622259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203339
14599	NC_012850	GAC	2	6	622284	622289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14600	NC_012850	CGA	2	6	622295	622300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14601	NC_012850	CGA	2	6	622307	622312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14602	NC_012850	CAG	3	9	622346	622354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14603	NC_012850	CTG	2	6	622356	622361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14604	NC_012850	GCA	2	6	622399	622404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14605	NC_012850	GCC	2	6	622410	622415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14606	NC_012850	GACC	2	8	622481	622488	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
14607	NC_012850	GAT	2	6	622505	622510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
14608	NC_012850	GGC	2	6	622622	622627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14609	NC_012850	TGA	2	6	622702	622707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203339
14610	NC_012850	GCA	2	6	622731	622736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14611	NC_012850	CGA	2	6	622796	622801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14612	NC_012850	GCC	2	6	622816	622821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203339
14613	NC_012850	GACC	2	8	622823	622830	25 %	0 %	25 %	50 %	241203339
14614	NC_012850	AAC	2	6	622845	622850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203339
14615	NC_012850	GAA	2	6	622883	622888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
14616	NC_012850	GAC	2	6	622908	622913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14617	NC_012850	AAG	2	6	622914	622919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203339
14618	NC_012850	TCG	2	6	622960	622965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14619	NC_012850	GGC	2	6	623030	623035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14620	NC_012850	GAG	2	6	623037	623042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203339
14621	NC_012850	CAG	2	6	623064	623069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14622	NC_012850	ACG	2	6	623098	623103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14623	NC_012850	TCA	2	6	623191	623196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203339
14624	NC_012850	AGC	2	6	623245	623250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
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14626	NC_012850	GCT	2	6	623312	623317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14627	NC_012850	CAG	2	6	623358	623363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
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14629	NC_012850	CGG	3	9	623387	623395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203339
14630	NC_012850	GCA	2	6	623399	623404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203339
14631	NC_012850	CTG	2	6	623422	623427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_012850	GCA	2	6	623431	623436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14633	NC_012850	GC	3	6	623517	623522	0 %	0 %	50 %	50 %	241203340
14634	NC_012850	GCG	2	6	623528	623533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203340
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14638	NC_012850	GGC	2	6	623681	623686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203340
14639	NC_012850	CGC	2	6	623774	623779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
14640	NC_012850	CTT	2	6	623788	623793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203340
14641	NC_012850	CTG	2	6	623912	623917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203340
14642	NC_012850	GCG	2	6	623928	623933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203340
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14646	NC_012850	TGA	2	6	624262	624267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203340
14647	NC_012850	GGC	2	6	624334	624339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203340
14648	NC_012850	CCG	2	6	624429	624434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
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14650	NC_012850	GCC	2	6	624452	624457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
14651	NC_012850	CCGAG	2	10	624475	624484	20 %	0 %	40 %	40 %	241203340
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14656	NC_012850	GCC	2	6	624650	624655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203340
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14662	NC_012850	GAG	2	6	624866	624871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203340
14663	NC_012850	TCC	2	6	624900	624905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14664	NC_012850	CG	3	6	624923	624928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14665	NC_012850	TGC	2	6	624968	624973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14666	NC_012850	GCA	2	6	625008	625013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14667	NC_012850	TCGCC	2	10	625062	625071	0 %	20 %	20 %	60 %	241203341
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14673	NC_012850	GCGAG	2	10	625308	625317	20 %	0 %	60 %	20 %	241203341
14674	NC_012850	CGC	2	6	625336	625341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203341
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14679	NC_012850	TCG	2	6	625452	625457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203341
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14686	NC_012850	CTGC	2	8	625956	625963	0 %	25 %	25 %	50 %	241203341
14687	NC_012850	ATCG	2	8	625978	625985	25 %	25 %	25 %	25 %	241203341
14688	NC_012850	CCG	2	6	626033	626038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14689	NC_012850	GAT	2	6	626066	626071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203342
14690	NC_012850	CTGC	2	8	626122	626129	0 %	25 %	25 %	50 %	241203342
14691	NC_012850	ACCG	2	8	626166	626173	25 %	0 %	25 %	50 %	241203342
14692	NC_012850	CGG	2	6	626191	626196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203342
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14702	NC_012850	CTT	2	6	626629	626634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203342
14703	NC_012850	TTC	2	6	626671	626676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14704	NC_012850	GGTC	2	8	626677	626684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14705	NC_012850	CAG	3	9	626690	626698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14707	NC_012850	GGCT	2	8	626747	626754	0 %	25 %	50 %	25 %	241203343
14708	NC_012850	GATATC	2	12	626791	626802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241203343
14709	NC_012850	GTC	2	6	626922	626927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203343
14710	NC_012850	GAAGGA	2	12	627006	627017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14711	NC_012850	GC	3	6	627023	627028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14712	NC_012850	CCG	2	6	627031	627036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14733	NC_012850	GCC	2	6	627804	627809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203344
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14735	NC_012850	GC	3	6	627908	627913	0 %	0 %	50 %	50 %	241203344
14736	NC_012850	CGA	2	6	627932	627937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203344
14737	NC_012850	TGC	2	6	627964	627969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203344
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14740	NC_012850	TGC	2	6	628030	628035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203344
14741	NC_012850	GAC	2	6	628061	628066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203344
14742	NC_012850	GAA	2	6	628116	628121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203344
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14744	NC_012850	TCG	2	6	628165	628170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203344
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14748	NC_012850	GCAT	2	8	628364	628371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14749	NC_012850	CAT	2	6	628402	628407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14767	NC_012850	GGT	2	6	629198	629203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14855	NC_012850	ACG	2	6	632586	632591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203348
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14978	NC_012850	GAC	2	6	637968	637973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353
14979	NC_012850	GCT	2	6	637974	637979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
14980	NC_012850	CGG	2	6	637983	637988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203353
14981	NC_012850	CCTCG	2	10	637992	638001	0 %	20 %	20 %	60 %	241203353
14982	NC_012850	GTC	2	6	638053	638058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203353
14983	NC_012850	TCGCC	2	10	638079	638088	0 %	20 %	20 %	60 %	241203353
14984	NC_012850	CGAC	2	8	638117	638124	25 %	0 %	25 %	50 %	241203353
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14986	NC_012850	GGC	2	6	638175	638180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203353
14987	NC_012850	GACC	2	8	638208	638215	25 %	0 %	25 %	50 %	241203353
14988	NC_012850	CGA	2	6	638223	638228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353
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14990	NC_012850	GC	3	6	638266	638271	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
14991	NC_012850	GGCG	2	8	638307	638314	0 %	0 %	75 %	25 %	241203353
14992	NC_012850	GGCC	2	8	638343	638350	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
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14994	NC_012850	TCGG	2	8	638437	638444	0 %	25 %	50 %	25 %	241203353
14995	NC_012850	GCCGGC	2	12	638467	638478	0 %	0 %	50 %	50 %	241203353
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14998	NC_012850	AGC	2	6	638519	638524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353
14999	NC_012850	GCC	2	6	638530	638535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203353
15000	NC_012850	GAC	3	9	638568	638576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203353

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