MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012850	GC	3	6	554698	554703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_012850	TTG	2	6	554717	554722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_012850	GTC	2	6	554883	554888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13004	NC_012850	CGC	2	6	554937	554942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13005	NC_012850	CGC	2	6	555002	555007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13006	NC_012850	CCG	3	9	555053	555061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13007	NC_012850	GAC	2	6	555080	555085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13008	NC_012850	CGC	2	6	555110	555115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13009	NC_012850	ATT	2	6	555190	555195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203280
13010	NC_012850	CAT	2	6	555212	555217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203280
13011	NC_012850	GCC	3	9	555259	555267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13012	NC_012850	GCC	3	9	555325	555333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13013	NC_012850	TCA	2	6	555430	555435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203280
13014	NC_012850	AAG	2	6	555501	555506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203280
13015	NC_012850	GCG	2	6	555531	555536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203280
13016	NC_012850	GGAGA	2	10	555552	555561	40 %	0 %	60 %	0 %	241203280
13017	NC_012850	GCC	2	6	555567	555572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13018	NC_012850	ATT	2	6	555615	555620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203280
13019	NC_012850	CGA	2	6	555644	555649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13020	NC_012850	GGC	2	6	555656	555661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203280
13021	NC_012850	CGCC	2	8	555686	555693	0 %	0 %	25 %	75 %	241203280
13022	NC_012850	CGA	2	6	555701	555706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13023	NC_012850	CCG	2	6	555715	555720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13024	NC_012850	TCG	2	6	555790	555795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13025	NC_012850	CGCT	2	8	555798	555805	0 %	25 %	25 %	50 %	241203280
13026	NC_012850	GGC	2	6	555816	555821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203280
13027	NC_012850	AGCC	2	8	555835	555842	25 %	0 %	25 %	50 %	241203280
13028	NC_012850	TC	3	6	555860	555865	0 %	50 %	0 %	50 %	241203280
13029	NC_012850	CGG	2	6	555866	555871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203280
13030	NC_012850	GCAGCG	2	12	555913	555924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203280
13031	NC_012850	CTG	2	6	555972	555977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13032	NC_012850	ACG	3	9	555982	555990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13033	NC_012850	CGC	2	6	555993	555998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13034	NC_012850	CCG	2	6	556021	556026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203280
13035	NC_012850	GCGCG	2	10	556037	556046	0 %	0 %	60 %	40 %	241203280
13036	NC_012850	GCT	2	6	556106	556111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203280
13037	NC_012850	GAG	2	6	556135	556140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203280
13038	NC_012850	CGA	2	6	556141	556146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13039	NC_012850	GCT	2	6	556196	556201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13040	NC_012850	GCTG	2	8	556216	556223	0 %	25 %	50 %	25 %	241203281
13041	NC_012850	CGC	2	6	556250	556255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203281
13042	NC_012850	GCT	2	6	556283	556288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13043	NC_012850	GCC	2	6	556344	556349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203281
13044	NC_012850	TTG	2	6	556378	556383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203281
13045	NC_012850	TGG	2	6	556396	556401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203281
13046	NC_012850	CGA	2	6	556406	556411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13047	NC_012850	CGA	2	6	556427	556432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13048	NC_012850	GCC	2	6	556446	556451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203281
13049	NC_012850	GACC	2	8	556469	556476	25 %	0 %	25 %	50 %	241203281
13050	NC_012850	CTT	2	6	556484	556489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203281
13051	NC_012850	CGG	2	6	556561	556566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203281
13052	NC_012850	CTGCG	2	10	556658	556667	0 %	20 %	40 %	40 %	241203281
13053	NC_012850	GCC	2	6	556794	556799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203281
13054	NC_012850	CGA	2	6	556817	556822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13055	NC_012850	GCT	2	6	556841	556846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203281
13056	NC_012850	T	6	6	556885	556890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_012850	CGG	2	6	556968	556973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_012850	GC	3	6	556988	556993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_012850	GAT	2	6	557051	557056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203282
13060	NC_012850	TGG	2	6	557076	557081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203282
13061	NC_012850	GCT	3	9	557105	557113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13062	NC_012850	CTTT	2	8	557118	557125	0 %	75 %	0 %	25 %	241203282
13063	NC_012850	GCCA	2	8	557142	557149	25 %	0 %	25 %	50 %	241203282
13064	NC_012850	GC	3	6	557163	557168	0 %	0 %	50 %	50 %	241203282
13065	NC_012850	CGG	2	6	557216	557221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13066	NC_012850	TCGC	2	8	557251	557258	0 %	25 %	25 %	50 %	241203282
13067	NC_012850	GCC	2	6	557259	557264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203282
13068	NC_012850	CAG	2	6	557294	557299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13069	NC_012850	CGG	2	6	557306	557311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13070	NC_012850	CTCG	2	8	557312	557319	0 %	25 %	25 %	50 %	241203282
13071	NC_012850	ACC	2	6	557325	557330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203282
13072	NC_012850	ATC	2	6	557344	557349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203282
13073	NC_012850	CGA	2	6	557369	557374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13074	NC_012850	GTT	2	6	557378	557383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203282
13075	NC_012850	TGG	2	6	557443	557448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203282
13076	NC_012850	TCA	3	9	557464	557472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203282
13077	NC_012850	CGACG	2	10	557528	557537	20 %	0 %	40 %	40 %	241203282
13078	NC_012850	CG	3	6	557536	557541	0 %	0 %	50 %	50 %	241203282
13079	NC_012850	CG	3	6	557580	557585	0 %	0 %	50 %	50 %	241203282
13080	NC_012850	CAG	2	6	557595	557600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13081	NC_012850	CTG	2	6	557619	557624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13082	NC_012850	GGC	3	9	557631	557639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13083	NC_012850	GCC	2	6	557643	557648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203282
13084	NC_012850	GGC	2	6	557666	557671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13085	NC_012850	GC	4	8	557670	557677	0 %	0 %	50 %	50 %	241203282
13086	NC_012850	ACA	2	6	557719	557724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203282
13087	NC_012850	TTC	2	6	557778	557783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203282
13088	NC_012850	TCG	3	9	557812	557820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13089	NC_012850	GAG	3	9	557853	557861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203282
13090	NC_012850	CGA	2	6	557864	557869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13091	NC_012850	CCG	2	6	557881	557886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203282
13092	NC_012850	CAC	2	6	557909	557914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203282
13093	NC_012850	GGC	2	6	557954	557959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13094	NC_012850	TCG	2	6	557965	557970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13095	NC_012850	ATC	2	6	558030	558035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203282
13096	NC_012850	TCG	2	6	558046	558051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203282
13097	NC_012850	GCG	2	6	558062	558067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203282
13098	NC_012850	TGC	2	6	558132	558137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_012850	GTC	2	6	558139	558144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_012850	GGC	2	6	558215	558220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203283
13101	NC_012850	CG	3	6	558276	558281	0 %	0 %	50 %	50 %	241203283
13102	NC_012850	CGA	2	6	558283	558288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203283
13103	NC_012850	GTTC	2	8	558295	558302	0 %	50 %	25 %	25 %	241203283
13104	NC_012850	CAGC	2	8	558335	558342	25 %	0 %	25 %	50 %	241203283
13105	NC_012850	TCT	2	6	558424	558429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203283
13106	NC_012850	CGA	2	6	558487	558492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203283
13107	NC_012850	GAG	2	6	558597	558602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203283
13108	NC_012850	GCAT	2	8	558708	558715	25 %	25 %	25 %	25 %	241203283
13109	NC_012850	GTT	2	6	558739	558744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203283
13110	NC_012850	AAG	2	6	558755	558760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203283
13111	NC_012850	GC	3	6	558793	558798	0 %	0 %	50 %	50 %	241203283
13112	NC_012850	CTCGA	2	10	558882	558891	20 %	20 %	20 %	40 %	241203283
13113	NC_012850	CGTT	2	8	558907	558914	0 %	50 %	25 %	25 %	241203283
13114	NC_012850	CGAT	2	8	558936	558943	25 %	25 %	25 %	25 %	241203283
13115	NC_012850	GCG	2	6	558948	558953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203283
13116	NC_012850	GCG	2	6	559020	559025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203283
13117	NC_012850	TCT	2	6	559062	559067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203283
13118	NC_012850	GCCT	2	8	559143	559150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_012850	GCC	2	6	559220	559225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_012850	TTG	2	6	559376	559381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203284
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13122	NC_012850	CTCG	2	8	559413	559420	0 %	25 %	25 %	50 %	241203284
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13228	NC_012850	CCTC	2	8	564955	564962	0 %	25 %	0 %	75 %	241203288
13229	NC_012850	CTG	2	6	565005	565010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203288
13230	NC_012850	GCCGCG	2	12	565045	565056	0 %	0 %	50 %	50 %	241203288
13231	NC_012850	CG	3	6	565075	565080	0 %	0 %	50 %	50 %	241203288
13232	NC_012850	GC	3	6	565100	565105	0 %	0 %	50 %	50 %	241203288
13233	NC_012850	CAT	2	6	565136	565141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203288
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13237	NC_012850	GCC	2	6	565326	565331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203288
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13239	NC_012850	TC	3	6	565376	565381	0 %	50 %	0 %	50 %	241203288
13240	NC_012850	AGC	3	9	565410	565418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203288
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13244	NC_012850	CGA	2	6	565559	565564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203288
13245	NC_012850	CAAGAT	2	12	565616	565627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241203288
13246	NC_012850	ATC	2	6	565677	565682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203288
13247	NC_012850	CTGGAG	2	12	565710	565721	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203288
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13250	NC_012850	GCA	2	6	565902	565907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13251	NC_012850	TAC	2	6	565948	565953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13252	NC_012850	GTC	2	6	566091	566096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203289
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13268	NC_012850	TGG	2	6	566666	566671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13270	NC_012850	GCAA	2	8	566792	566799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13353	NC_012850	GTGA	2	8	570123	570130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_012850	ACGGCG	2	12	570145	570156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203294
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13356	NC_012850	TGG	2	6	570304	570309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203294
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13358	NC_012850	GCT	2	6	570317	570322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203294
13359	NC_012850	CGC	2	6	570374	570379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203294
13360	NC_012850	GC	3	6	570378	570383	0 %	0 %	50 %	50 %	241203294
13361	NC_012850	GC	3	6	570390	570395	0 %	0 %	50 %	50 %	241203294
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13480	NC_012850	CTTTTT	2	12	575013	575024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	241203297
13481	NC_012850	GGCT	2	8	575035	575042	0 %	25 %	50 %	25 %	241203297
13482	NC_012850	AG	3	6	575073	575078	50 %	0 %	50 %	0 %	241203298
13483	NC_012850	CGAA	2	8	575084	575091	50 %	0 %	25 %	25 %	241203298
13484	NC_012850	CGC	2	6	575102	575107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203298
13485	NC_012850	CGT	2	6	575142	575147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13486	NC_012850	TCA	2	6	575234	575239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203298
13487	NC_012850	TGA	2	6	575252	575257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203298
13488	NC_012850	ATC	2	6	575272	575277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203298
13489	NC_012850	ACG	2	6	575318	575323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13490	NC_012850	GGC	2	6	575329	575334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203298
13491	NC_012850	GCT	2	6	575343	575348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13492	NC_012850	TGA	2	6	575357	575362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203298
13493	NC_012850	TGC	2	6	575393	575398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13494	NC_012850	GCGAT	2	10	575429	575438	20 %	20 %	40 %	20 %	241203298
13495	NC_012850	GGT	2	6	575526	575531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203298
13496	NC_012850	GCT	2	6	575541	575546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13497	NC_012850	TCG	2	6	575549	575554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203298
13498	NC_012850	CG	3	6	575561	575566	0 %	0 %	50 %	50 %	241203298
13499	NC_012850	TTC	2	6	575587	575592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203298
13500	NC_012850	GCC	3	9	575626	575634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203298

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