MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012850	GAT	2	6	535251	535256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_012850	CAT	2	6	535301	535306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203263
12503	NC_012850	GCC	3	9	535343	535351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12504	NC_012850	TTCT	2	8	535358	535365	0 %	75 %	0 %	25 %	241203263
12505	NC_012850	GGT	2	6	535391	535396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203263
12506	NC_012850	CAG	2	6	535400	535405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12507	NC_012850	AGC	2	6	535418	535423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12508	NC_012850	CGA	2	6	535459	535464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12509	NC_012850	TCG	2	6	535563	535568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12510	NC_012850	ACGA	2	8	535589	535596	50 %	0 %	25 %	25 %	241203263
12511	NC_012850	GCG	2	6	535610	535615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203263
12512	NC_012850	GTC	2	6	535640	535645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12513	NC_012850	GGA	2	6	535673	535678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203263
12514	NC_012850	CCG	3	9	535695	535703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12515	NC_012850	CGT	2	6	535747	535752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12516	NC_012850	CTT	2	6	535763	535768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12517	NC_012850	GCC	2	6	535793	535798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12518	NC_012850	CGC	2	6	535816	535821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12519	NC_012850	GGT	2	6	535871	535876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203263
12520	NC_012850	TTC	2	6	535877	535882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12521	NC_012850	CGA	2	6	535942	535947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12522	NC_012850	GTG	2	6	535950	535955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203263
12523	NC_012850	CTT	2	6	535976	535981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12524	NC_012850	GCC	2	6	536048	536053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12525	NC_012850	GCG	2	6	536087	536092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203263
12526	NC_012850	GCA	2	6	536118	536123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12527	NC_012850	GCC	2	6	536132	536137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12528	NC_012850	TTG	2	6	536145	536150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203263
12529	NC_012850	ACG	2	6	536151	536156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12530	NC_012850	CGA	2	6	536191	536196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12531	NC_012850	GAG	2	6	536198	536203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203263
12532	NC_012850	ACG	2	6	536220	536225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12533	NC_012850	CTT	2	6	536264	536269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12534	NC_012850	ATC	2	6	536307	536312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203263
12535	NC_012850	CGA	2	6	536371	536376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12536	NC_012850	CGG	2	6	536392	536397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203263
12537	NC_012850	CTT	2	6	536404	536409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12538	NC_012850	TGA	2	6	536416	536421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203263
12539	NC_012850	GACC	2	8	536464	536471	25 %	0 %	25 %	50 %	241203263
12540	NC_012850	CTT	2	6	536512	536517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12541	NC_012850	TCT	2	6	536530	536535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203263
12542	NC_012850	TGGCCT	2	12	536536	536547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12543	NC_012850	ACG	2	6	536559	536564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12544	NC_012850	TTG	2	6	536628	536633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203263
12545	NC_012850	CGT	2	6	536669	536674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12546	NC_012850	GCGCG	2	10	536798	536807	0 %	0 %	60 %	40 %	241203263
12547	NC_012850	GAT	2	6	536822	536827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203263
12548	NC_012850	CGC	2	6	536884	536889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203263
12549	NC_012850	GCA	2	6	536890	536895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203263
12550	NC_012850	CG	4	8	536902	536909	0 %	0 %	50 %	50 %	241203263
12551	NC_012850	GTT	2	6	536963	536968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_012850	GAT	2	6	537020	537025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203264
12553	NC_012850	CTTC	2	8	537040	537047	0 %	50 %	0 %	50 %	241203264
12554	NC_012850	CGA	2	6	537136	537141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203264
12555	NC_012850	CG	4	8	537157	537164	0 %	0 %	50 %	50 %	241203264
12556	NC_012850	CGA	2	6	537178	537183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203264
12557	NC_012850	ATG	3	9	537222	537230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203264
12558	NC_012850	AAC	2	6	537266	537271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203264
12559	NC_012850	TCGA	2	8	537322	537329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_012850	CGA	2	6	537396	537401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_012850	GAG	2	6	537422	537427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_012850	CTC	2	6	537589	537594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_012850	CGG	2	6	537626	537631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_012850	GAA	2	6	537633	537638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_012850	ATG	2	6	537748	537753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203265
12566	NC_012850	CGT	2	6	537776	537781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12567	NC_012850	GGC	2	6	537809	537814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203265
12568	NC_012850	TCA	2	6	537859	537864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203265
12569	NC_012850	CGC	2	6	537871	537876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203265
12570	NC_012850	GGT	2	6	537890	537895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203265
12571	NC_012850	CG	3	6	537964	537969	0 %	0 %	50 %	50 %	241203265
12572	NC_012850	GCT	2	6	538028	538033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12573	NC_012850	GCCG	2	8	538054	538061	0 %	0 %	50 %	50 %	241203265
12574	NC_012850	CGA	3	9	538100	538108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12575	NC_012850	GGA	2	6	538121	538126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203265
12576	NC_012850	GAT	2	6	538169	538174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203265
12577	NC_012850	TCG	2	6	538195	538200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12578	NC_012850	CAT	2	6	538214	538219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203265
12579	NC_012850	GCC	2	6	538239	538244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203265
12580	NC_012850	AGC	2	6	538252	538257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12581	NC_012850	CGG	2	6	538259	538264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203265
12582	NC_012850	CCGA	2	8	538383	538390	25 %	0 %	25 %	50 %	241203265
12583	NC_012850	GCG	2	6	538396	538401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203265
12584	NC_012850	CCT	2	6	538421	538426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203265
12585	NC_012850	GCG	2	6	538435	538440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203265
12586	NC_012850	CGA	2	6	538478	538483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203265
12587	NC_012850	CGC	2	6	538517	538522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203265
12588	NC_012850	GTG	2	6	538529	538534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203265
12589	NC_012850	AGCC	2	8	538576	538583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_012850	GCG	2	6	538640	538645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203266
12591	NC_012850	GC	3	6	538723	538728	0 %	0 %	50 %	50 %	241203266
12592	NC_012850	GAT	2	6	538903	538908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203266
12593	NC_012850	TGA	2	6	539009	539014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203266
12594	NC_012850	GTC	2	6	539080	539085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
12595	NC_012850	CG	3	6	539101	539106	0 %	0 %	50 %	50 %	241203266
12596	NC_012850	AGG	2	6	539114	539119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203266
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12599	NC_012850	GCC	2	6	539254	539259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203266
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12601	NC_012850	GCC	3	9	539324	539332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203266
12602	NC_012850	GC	3	6	539351	539356	0 %	0 %	50 %	50 %	241203266
12603	NC_012850	GCT	2	6	539358	539363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
12604	NC_012850	GCG	2	6	539387	539392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203266
12605	NC_012850	CTT	2	6	539421	539426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203266
12606	NC_012850	TCG	2	6	539471	539476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
12607	NC_012850	GCT	2	6	539511	539516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203266
12608	NC_012850	GC	3	6	539537	539542	0 %	0 %	50 %	50 %	241203266
12609	NC_012850	TTC	2	6	539641	539646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_012850	ATG	3	9	539707	539715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_012850	CGGCC	2	10	539724	539733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12612	NC_012850	CG	4	8	539737	539744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_012850	GCC	2	6	539832	539837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12614	NC_012850	GC	3	6	539924	539929	0 %	0 %	50 %	50 %	241203267
12615	NC_012850	GC	3	6	539996	540001	0 %	0 %	50 %	50 %	241203267
12616	NC_012850	CCG	3	9	540004	540012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203267
12617	NC_012850	CCCT	2	8	540041	540048	0 %	25 %	0 %	75 %	241203267
12618	NC_012850	TCA	2	6	540103	540108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203267
12619	NC_012850	CGTT	2	8	540111	540118	0 %	50 %	25 %	25 %	241203267
12620	NC_012850	ACG	2	6	540133	540138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203267
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