MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012850	TCG	2	6	471831	471836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11002	NC_012850	GGC	2	6	471851	471856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203206
11003	NC_012850	TTC	2	6	471859	471864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203206
11004	NC_012850	GCT	2	6	471892	471897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11005	NC_012850	GAA	2	6	471913	471918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203206
11006	NC_012850	CAG	2	6	471972	471977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11007	NC_012850	GGT	2	6	472000	472005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203206
11008	NC_012850	AGC	2	6	472083	472088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11009	NC_012850	GCA	2	6	472241	472246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11010	NC_012850	TAT	2	6	472261	472266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203206
11011	NC_012850	TC	3	6	472267	472272	0 %	50 %	0 %	50 %	241203206
11012	NC_012850	ATC	2	6	472323	472328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203206
11013	NC_012850	A	6	6	472335	472340	100 %	0 %	0 %	0 %	241203206
11014	NC_012850	ACT	2	6	472355	472360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_012850	AC	3	6	472377	472382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_012850	GCT	2	6	472393	472398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_012850	GCT	2	6	472405	472410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_012850	GC	3	6	472471	472476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11019	NC_012850	ATTCTG	2	12	472478	472489	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11020	NC_012850	CATG	2	8	472490	472497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_012850	ACT	2	6	472562	472567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_012850	GA	3	6	472589	472594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_012850	CG	3	6	472667	472672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_012850	TGC	2	6	472719	472724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203207
11025	NC_012850	TGT	2	6	472748	472753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203207
11026	NC_012850	TGGT	2	8	472782	472789	0 %	50 %	50 %	0 %	241203207
11027	NC_012850	CGC	2	6	472792	472797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203207
11028	NC_012850	TGG	2	6	472833	472838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203207
11029	NC_012850	GGC	2	6	472851	472856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203207
11030	NC_012850	GCG	2	6	473029	473034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203207
11031	NC_012850	CTGC	3	12	473035	473046	0 %	25 %	25 %	50 %	241203207
11032	NC_012850	ATG	2	6	473047	473052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203207
11033	NC_012850	GAC	2	6	473217	473222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203207
11034	NC_012850	TA	3	6	473257	473262	50 %	50 %	0 %	0 %	241203207
11035	NC_012850	GGCG	2	8	473295	473302	0 %	0 %	75 %	25 %	241203207
11036	NC_012850	T	8	8	473310	473317	0 %	100 %	0 %	0 %	241203207
11037	NC_012850	GCG	2	6	473377	473382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203207
11038	NC_012850	ATG	2	6	473429	473434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203207
11039	NC_012850	GTG	2	6	473437	473442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203207
11040	NC_012850	AT	3	6	473455	473460	50 %	50 %	0 %	0 %	241203207
11041	NC_012850	CAT	2	6	473472	473477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203207
11042	NC_012850	GTG	2	6	473509	473514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203207
11043	NC_012850	ATC	2	6	473570	473575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203207
11044	NC_012850	TGA	2	6	473582	473587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203207
11045	NC_012850	GGA	2	6	473607	473612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203207
11046	NC_012850	GCA	4	12	473631	473642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203207
11047	NC_012850	GAG	2	6	473731	473736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203207
11048	NC_012850	CGA	2	6	473952	473957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203207
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11050	NC_012850	AAAGC	2	10	474011	474020	60 %	0 %	20 %	20 %	241203207
11051	NC_012850	GATG	2	8	474153	474160	25 %	25 %	50 %	0 %	241203207
11052	NC_012850	GAA	2	6	474169	474174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203207
11053	NC_012850	CTT	3	9	474261	474269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203207
11054	NC_012850	GCC	2	6	474315	474320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203207
11055	NC_012850	ATAG	2	8	474334	474341	50 %	25 %	25 %	0 %	241203207
11056	NC_012850	GAC	2	6	474346	474351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203207
11057	NC_012850	CAT	2	6	474396	474401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203207
11058	NC_012850	GGC	2	6	474498	474503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203208
11059	NC_012850	CGAG	2	8	474592	474599	25 %	0 %	50 %	25 %	241203208
11060	NC_012850	GTTTC	2	10	474641	474650	0 %	60 %	20 %	20 %	241203208
11061	NC_012850	CG	3	6	474654	474659	0 %	0 %	50 %	50 %	241203208
11062	NC_012850	CAA	2	6	474662	474667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203208
11063	NC_012850	GCA	2	6	474689	474694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203208
11064	NC_012850	TAT	2	6	474863	474868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203208
11065	NC_012850	CAT	2	6	474938	474943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203208
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11067	NC_012850	GCT	2	6	474974	474979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203208
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11071	NC_012850	TCG	2	6	475147	475152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203208
11072	NC_012850	GATG	2	8	475162	475169	25 %	25 %	50 %	0 %	241203208
11073	NC_012850	ACGA	2	8	475197	475204	50 %	0 %	25 %	25 %	241203208
11074	NC_012850	TTC	2	6	475235	475240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203208
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11081	NC_012850	GCT	2	6	475460	475465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203208
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11083	NC_012850	CTG	3	9	475619	475627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203209
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11087	NC_012850	GCG	2	6	475856	475861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203209
11088	NC_012850	TCT	2	6	475957	475962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203209
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11091	NC_012850	T	6	6	476098	476103	0 %	100 %	0 %	0 %	241203209
11092	NC_012850	CTA	2	6	476107	476112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203209
11093	NC_012850	AGGC	2	8	476145	476152	25 %	0 %	50 %	25 %	241203209
11094	NC_012850	CTG	2	6	476165	476170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203209
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11099	NC_012850	GCCT	2	8	476386	476393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_012850	CGA	2	6	476410	476415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_012850	GCT	2	6	476443	476448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_012850	GAA	2	6	476489	476494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_012850	ATG	2	6	476604	476609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203210
11104	NC_012850	CGT	2	6	476632	476637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203210
11105	NC_012850	GGC	2	6	476665	476670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203210
11106	NC_012850	GGCC	2	8	476695	476702	0 %	0 %	50 %	50 %	241203210
11107	NC_012850	CGT	2	6	476707	476712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203210
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11120	NC_012850	CGG	2	6	477115	477120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203210
11121	NC_012850	CCGA	2	8	477239	477246	25 %	0 %	25 %	50 %	241203210
11122	NC_012850	GCG	2	6	477252	477257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203210
11123	NC_012850	CCT	2	6	477277	477282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203210
11124	NC_012850	GCG	2	6	477291	477296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203210
11125	NC_012850	CGA	2	6	477334	477339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203210
11126	NC_012850	CGC	2	6	477373	477378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203210
11127	NC_012850	GTG	2	6	477385	477390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203210
11128	NC_012850	AGCC	2	8	477432	477439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11129	NC_012850	GCCC	2	8	477479	477486	0 %	0 %	25 %	75 %	241203211
11130	NC_012850	GCG	2	6	477496	477501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203211
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11132	NC_012850	CGT	2	6	477580	477585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203211
11133	NC_012850	ATA	2	6	477632	477637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_012850	GA	3	6	477638	477643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_012850	CAT	2	6	477657	477662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11137	NC_012850	CAA	2	6	477803	477808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11138	NC_012850	GCG	2	6	477935	477940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11139	NC_012850	CGG	2	6	477951	477956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11140	NC_012850	ACA	2	6	477973	477978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11141	NC_012850	GCG	2	6	477997	478002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11142	NC_012850	CG	3	6	478015	478020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11143	NC_012850	GAC	2	6	478081	478086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11145	NC_012850	ATG	2	6	478186	478191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11151	NC_012850	GCT	2	6	478608	478613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203213
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11157	NC_012850	GCA	2	6	479204	479209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203213
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11159	NC_012850	TCG	2	6	479323	479328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203213
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11193	NC_012850	AGC	2	6	480786	480791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203214
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11216	NC_012850	CGG	2	6	482068	482073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11217	NC_012850	TGCGG	2	10	482076	482085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11218	NC_012850	GCA	2	6	482101	482106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11219	NC_012850	CAGC	2	8	482153	482160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11220	NC_012850	CGA	2	6	482234	482239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11221	NC_012850	AG	3	6	482244	482249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_012850	TTCA	2	8	482251	482258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11223	NC_012850	GCC	2	6	482274	482279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11224	NC_012850	GGTCC	2	10	482347	482356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11225	NC_012850	ATC	2	6	482406	482411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11226	NC_012850	CTC	2	6	482426	482431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11227	NC_012850	CGA	2	6	482485	482490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11228	NC_012850	ATC	2	6	482513	482518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11229	NC_012850	GAC	2	6	482519	482524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11230	NC_012850	CCA	2	6	482596	482601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11231	NC_012850	TCGC	2	8	482632	482639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11232	NC_012850	ACC	2	6	482645	482650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11233	NC_012850	TCC	2	6	482673	482678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11234	NC_012850	AGC	2	6	482730	482735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_012850	GCG	2	6	482759	482764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11236	NC_012850	TCGC	2	8	482789	482796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11237	NC_012850	ATC	2	6	482807	482812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11238	NC_012850	CGCC	2	8	482867	482874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11239	NC_012850	CTCAT	2	10	482880	482889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11240	NC_012850	TCA	2	6	482896	482901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11241	NC_012850	CAC	2	6	482936	482941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203215
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11362	NC_012850	GAA	2	6	488374	488379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_012850	AAT	2	6	488421	488426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203217
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11386	NC_012850	TGT	2	6	489709	489714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11387	NC_012850	GTTT	2	8	489766	489773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11484	NC_012850	TGG	2	6	493922	493927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203223
11485	NC_012850	GCG	2	6	493969	493974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203223
11486	NC_012850	GCC	2	6	494041	494046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203223
11487	NC_012850	CT	3	6	494074	494079	0 %	50 %	0 %	50 %	241203223
11488	NC_012850	CTC	2	6	494115	494120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11489	NC_012850	CTG	2	6	494162	494167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11490	NC_012850	GAT	2	6	494321	494326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203224
11491	NC_012850	CGC	2	6	494365	494370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203224
11492	NC_012850	CGG	2	6	494398	494403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203224
11493	NC_012850	CTG	2	6	494432	494437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203224
11494	NC_012850	CAT	2	6	494476	494481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203224
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11496	NC_012850	AGC	3	9	494544	494552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203224
11497	NC_012850	GAT	2	6	494558	494563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203224
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