MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012850	CGC	2	6	447603	447608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203184
10502	NC_012850	TGT	2	6	447612	447617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203184
10503	NC_012850	GAT	2	6	447643	447648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203184
10504	NC_012850	AGC	2	6	447649	447654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203184
10505	NC_012850	AAG	2	6	447670	447675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203184
10506	NC_012850	AGA	2	6	447692	447697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203184
10507	NC_012850	AGC	2	6	447713	447718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203184
10508	NC_012850	CGA	2	6	447735	447740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203184
10509	NC_012850	GAG	2	6	447787	447792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203184
10510	NC_012850	CCG	2	6	447830	447835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203184
10511	NC_012850	CGA	2	6	447882	447887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203184
10512	NC_012850	TCA	2	6	447968	447973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203184
10513	NC_012850	GTCG	2	8	448140	448147	0 %	25 %	50 %	25 %	241203185
10514	NC_012850	CG	3	6	448146	448151	0 %	0 %	50 %	50 %	241203185
10515	NC_012850	CGG	2	6	448202	448207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203185
10516	NC_012850	GGC	2	6	448233	448238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203185
10517	NC_012850	TC	3	6	448311	448316	0 %	50 %	0 %	50 %	241203185
10518	NC_012850	CGA	2	6	448335	448340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203185
10519	NC_012850	GC	3	6	448374	448379	0 %	0 %	50 %	50 %	241203185
10520	NC_012850	GCTG	2	8	448412	448419	0 %	25 %	50 %	25 %	241203185
10521	NC_012850	GCCAGG	2	12	448472	448483	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203185
10522	NC_012850	TCG	2	6	448487	448492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203185
10523	NC_012850	GC	3	6	448520	448525	0 %	0 %	50 %	50 %	241203185
10524	NC_012850	GGT	2	6	448599	448604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203185
10525	NC_012850	TGA	2	6	448676	448681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203185
10526	NC_012850	GGC	2	6	448689	448694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203185
10527	NC_012850	CCGGA	2	10	448718	448727	20 %	0 %	40 %	40 %	241203185
10528	NC_012850	GAC	2	6	448742	448747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203185
10529	NC_012850	AC	3	6	448751	448756	50 %	0 %	0 %	50 %	241203186
10530	NC_012850	CGA	2	6	448766	448771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203186
10531	NC_012850	CCG	2	6	448804	448809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10532	NC_012850	GC	3	6	448818	448823	0 %	0 %	50 %	50 %	241203186
10533	NC_012850	GAAG	2	8	448838	448845	50 %	0 %	50 %	0 %	241203186
10534	NC_012850	CCG	2	6	448855	448860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10535	NC_012850	GC	4	8	448878	448885	0 %	0 %	50 %	50 %	241203186
10536	NC_012850	CAAG	2	8	448898	448905	50 %	0 %	25 %	25 %	241203186
10537	NC_012850	GCT	2	6	448916	448921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203186
10538	NC_012850	CG	3	6	448933	448938	0 %	0 %	50 %	50 %	241203186
10539	NC_012850	GCC	2	6	448959	448964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10540	NC_012850	CGC	2	6	448969	448974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10541	NC_012850	TCG	2	6	449015	449020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203186
10542	NC_012850	GC	3	6	449032	449037	0 %	0 %	50 %	50 %	241203186
10543	NC_012850	CGC	2	6	449039	449044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10544	NC_012850	CATCGG	2	12	449081	449092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203186
10545	NC_012850	GC	3	6	449129	449134	0 %	0 %	50 %	50 %	241203186
10546	NC_012850	CCG	2	6	449164	449169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10547	NC_012850	GGA	2	6	449198	449203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203186
10548	NC_012850	GCC	2	6	449208	449213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203186
10549	NC_012850	CTG	3	9	449298	449306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203186
10550	NC_012850	ACGC	2	8	449457	449464	25 %	0 %	25 %	50 %	241203186
10551	NC_012850	CCA	2	6	449577	449582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203187
10552	NC_012850	GGC	2	6	449623	449628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203187
10553	NC_012850	TGA	2	6	449652	449657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203187
10554	NC_012850	TCC	2	6	449678	449683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203187
10555	NC_012850	CCG	2	6	449732	449737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203187
10556	NC_012850	CAG	2	6	449743	449748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203187
10557	NC_012850	CAT	2	6	449791	449796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203187
10558	NC_012850	TTG	2	6	449831	449836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203187
10559	NC_012850	CGC	2	6	449856	449861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203187
10560	NC_012850	GC	3	6	449860	449865	0 %	0 %	50 %	50 %	241203187
10561	NC_012850	TTC	2	6	449959	449964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203187
10562	NC_012850	CGA	2	6	449997	450002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203187
10563	NC_012850	TCG	2	6	450042	450047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203187
10564	NC_012850	CCGC	2	8	450137	450144	0 %	0 %	25 %	75 %	241203187
10565	NC_012850	GCG	2	6	450270	450275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203187
10566	NC_012850	GAT	2	6	450280	450285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203187
10567	NC_012850	GCCA	2	8	450301	450308	25 %	0 %	25 %	50 %	241203187
10568	NC_012850	GTC	2	6	450317	450322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203187
10569	NC_012850	GTA	2	6	450328	450333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203187
10570	NC_012850	ATC	2	6	450335	450340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203187
10571	NC_012850	CCCG	2	8	450409	450416	0 %	0 %	25 %	75 %	241203187
10572	NC_012850	CCT	2	6	450440	450445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203188
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10580	NC_012850	CGG	2	6	450770	450775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203188
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10583	NC_012850	GATG	2	8	451034	451041	25 %	25 %	50 %	0 %	241203188
10584	NC_012850	TGC	2	6	451065	451070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203188
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10588	NC_012850	GAC	3	9	451161	451169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203188
10589	NC_012850	TCAC	2	8	451195	451202	25 %	25 %	0 %	50 %	241203188
10590	NC_012850	GAT	2	6	451245	451250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203188
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10592	NC_012850	CCA	3	9	451388	451396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10593	NC_012850	TGG	2	6	451483	451488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_012850	ATAGC	2	10	451494	451503	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10599	NC_012850	ATT	2	6	451819	451824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_012850	GAT	2	6	451881	451886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_012850	CGCT	2	8	451887	451894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10602	NC_012850	GTC	2	6	451934	451939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_012850	TCG	2	6	451979	451984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_012850	GCA	2	6	451995	452000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_012850	CG	3	6	452048	452053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_012850	CCG	2	6	452100	452105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10607	NC_012850	CCG	2	6	452136	452141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10608	NC_012850	GCGAG	2	10	452256	452265	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10609	NC_012850	GCT	2	6	452437	452442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203189
10610	NC_012850	TGT	2	6	452443	452448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203189
10611	NC_012850	AGAA	2	8	452456	452463	75 %	0 %	25 %	0 %	241203189
10612	NC_012850	CCAT	2	8	452469	452476	25 %	25 %	0 %	50 %	241203189
10613	NC_012850	CGT	2	6	452503	452508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203189
10614	NC_012850	AG	3	6	452542	452547	50 %	0 %	50 %	0 %	241203189
10615	NC_012850	CCGG	2	8	452607	452614	0 %	0 %	50 %	50 %	241203189
10616	NC_012850	CTG	2	6	452650	452655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203189
10617	NC_012850	GC	3	6	452713	452718	0 %	0 %	50 %	50 %	241203189
10618	NC_012850	GCAG	2	8	452722	452729	25 %	0 %	50 %	25 %	241203189
10619	NC_012850	GAAA	2	8	452822	452829	75 %	0 %	25 %	0 %	241203189
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10621	NC_012850	GTT	2	6	452938	452943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203189
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10863	NC_012850	CAT	2	6	464159	464164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203198
10864	NC_012850	CGAT	2	8	464245	464252	25 %	25 %	25 %	25 %	241203198
10865	NC_012850	GCTG	2	8	464350	464357	0 %	25 %	50 %	25 %	241203198
10866	NC_012850	TTCGG	2	10	464361	464370	0 %	40 %	40 %	20 %	241203198
10867	NC_012850	CGC	2	6	464411	464416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203198
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10933	NC_012850	TGA	3	9	467879	467887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203202
10934	NC_012850	TAT	2	6	467890	467895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203202
10935	NC_012850	TGA	2	6	467921	467926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203202
10936	NC_012850	TGA	2	6	467948	467953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203202
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10968	NC_012850	TCC	2	6	469776	469781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203204
10969	NC_012850	AGA	2	6	469990	469995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203204
10970	NC_012850	TCA	2	6	470053	470058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203204
10971	NC_012850	ATG	2	6	470075	470080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203204
10972	NC_012850	GTG	2	6	470084	470089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203204
10973	NC_012850	CAC	2	6	470191	470196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203204
10974	NC_012850	A	6	6	470303	470308	100 %	0 %	0 %	0 %	241203204
10975	NC_012850	CGACA	2	10	470311	470320	40 %	0 %	20 %	40 %	241203204
10976	NC_012850	ACG	2	6	470370	470375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203204
10977	NC_012850	GCTC	2	8	470410	470417	0 %	25 %	25 %	50 %	241203204
10978	NC_012850	GGT	2	6	470420	470425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203204
10979	NC_012850	TCAGGA	2	12	470508	470519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241203204
10980	NC_012850	CGA	2	6	470557	470562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203204
10981	NC_012850	CGA	2	6	470616	470621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10982	NC_012850	ACG	2	6	470690	470695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203205
10983	NC_012850	CCT	2	6	470714	470719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203205
10984	NC_012850	TTC	2	6	470831	470836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203205
10985	NC_012850	TGA	2	6	470970	470975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203205
10986	NC_012850	CAT	2	6	471013	471018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203205
10987	NC_012850	AG	3	6	471042	471047	50 %	0 %	50 %	0 %	241203205
10988	NC_012850	TCGACG	2	12	471137	471148	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203205
10989	NC_012850	CAG	2	6	471245	471250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203205
10990	NC_012850	CTG	2	6	471259	471264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203205
10991	NC_012850	ATTAG	2	10	471366	471375	40 %	40 %	20 %	0 %	241203205
10992	NC_012850	GA	3	6	471441	471446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10993	NC_012850	GT	3	6	471514	471519	0 %	50 %	50 %	0 %	241203206
10994	NC_012850	ATA	2	6	471626	471631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203206
10995	NC_012850	AAG	2	6	471647	471652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203206
10996	NC_012850	GGCCA	2	10	471656	471665	20 %	0 %	40 %	40 %	241203206
10997	NC_012850	GAC	2	6	471694	471699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203206
10998	NC_012850	TATG	2	8	471704	471711	25 %	50 %	25 %	0 %	241203206
10999	NC_012850	CGA	2	6	471721	471726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203206
11000	NC_012850	TGG	2	6	471795	471800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203206

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