MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_012850	CGA	3	9	4651596	4651604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207201
109002	NC_012850	GTT	2	6	4651702	4651707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207201
109003	NC_012850	CGCGCT	2	12	4651752	4651763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241207201
109004	NC_012850	GCC	2	6	4651813	4651818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207201
109005	NC_012850	CGT	2	6	4651819	4651824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207201
109006	NC_012850	GTG	2	6	4651907	4651912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207201
109007	NC_012850	GC	3	6	4651927	4651932	0 %	0 %	50 %	50 %	241207201
109008	NC_012850	AGC	2	6	4651938	4651943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109009	NC_012850	GCC	2	6	4651944	4651949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109010	NC_012850	CTG	2	6	4651974	4651979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109011	NC_012850	GCC	2	6	4652032	4652037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207202
109012	NC_012850	GC	3	6	4652073	4652078	0 %	0 %	50 %	50 %	241207202
109013	NC_012850	GCG	2	6	4652118	4652123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207202
109014	NC_012850	GCG	2	6	4652127	4652132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207202
109015	NC_012850	CGG	2	6	4652164	4652169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207202
109016	NC_012850	GGA	2	6	4652285	4652290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207202
109017	NC_012850	CGA	2	6	4652503	4652508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207202
109018	NC_012850	CGG	2	6	4652576	4652581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207202
109019	NC_012850	GCA	2	6	4652605	4652610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207202
109020	NC_012850	GGC	2	6	4652657	4652662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207202
109021	NC_012850	CT	3	6	4652713	4652718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109022	NC_012850	CGC	2	6	4652729	4652734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109023	NC_012850	AT	3	6	4652736	4652741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109024	NC_012850	GCG	2	6	4652752	4652757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109025	NC_012850	GCATCC	2	12	4652890	4652901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241207203
109026	NC_012850	GAT	2	6	4652934	4652939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207203
109027	NC_012850	TGC	2	6	4652942	4652947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109028	NC_012850	GAT	2	6	4652969	4652974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207203
109029	NC_012850	GCGG	2	8	4652987	4652994	0 %	0 %	75 %	25 %	241207203
109030	NC_012850	GCT	2	6	4653014	4653019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109031	NC_012850	CTGTCG	2	12	4653045	4653056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109032	NC_012850	CTT	2	6	4653059	4653064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207203
109033	NC_012850	CGC	2	6	4653085	4653090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207203
109034	NC_012850	CAG	2	6	4653108	4653113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109035	NC_012850	AT	3	6	4653137	4653142	50 %	50 %	0 %	0 %	241207203
109036	NC_012850	TCG	2	6	4653187	4653192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109037	NC_012850	CGGC	2	8	4653205	4653212	0 %	0 %	50 %	50 %	241207203
109038	NC_012850	C	6	6	4653227	4653232	0 %	0 %	0 %	100 %	241207203
109039	NC_012850	GCA	2	6	4653257	4653262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109040	NC_012850	CGG	2	6	4653295	4653300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207203
109041	NC_012850	CGT	2	6	4653401	4653406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207203
109042	NC_012850	CGG	2	6	4653416	4653421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207203
109043	NC_012850	TTTCA	2	10	4653433	4653442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109044	NC_012850	CCG	2	6	4653475	4653480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207204
109045	NC_012850	AGG	2	6	4653481	4653486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207204
109046	NC_012850	CGG	2	6	4653623	4653628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207204
109047	NC_012850	TCG	2	6	4653664	4653669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207204
109048	NC_012850	GGTG	2	8	4653680	4653687	0 %	25 %	75 %	0 %	241207204
109049	NC_012850	GAA	2	6	4653725	4653730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207204
109050	NC_012850	GCT	2	6	4653731	4653736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207204
109051	NC_012850	GCT	2	6	4653773	4653778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207204
109052	NC_012850	GATG	2	8	4653779	4653786	25 %	25 %	50 %	0 %	241207204
109053	NC_012850	CCG	2	6	4653787	4653792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207204
109054	NC_012850	GCA	2	6	4653801	4653806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207204
109055	NC_012850	TGCTCG	2	12	4653823	4653834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207204
109056	NC_012850	GGC	2	6	4653927	4653932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207204
109057	NC_012850	CCA	2	6	4653940	4653945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207204
109058	NC_012850	CGC	2	6	4654016	4654021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207205
109059	NC_012850	CGCC	2	8	4654031	4654038	0 %	0 %	25 %	75 %	241207205
109060	NC_012850	GCCGC	2	10	4654067	4654076	0 %	0 %	40 %	60 %	241207205
109061	NC_012850	GCA	2	6	4654121	4654126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109062	NC_012850	TGC	2	6	4654185	4654190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109063	NC_012850	ATG	2	6	4654198	4654203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207205
109064	NC_012850	TCG	2	6	4654204	4654209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109065	NC_012850	GC	3	6	4654245	4654250	0 %	0 %	50 %	50 %	241207205
109066	NC_012850	TGGT	2	8	4654264	4654271	0 %	50 %	50 %	0 %	241207205
109067	NC_012850	CAG	2	6	4654275	4654280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109068	NC_012850	GCG	2	6	4654306	4654311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207205
109069	NC_012850	TTC	2	6	4654314	4654319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207205
109070	NC_012850	CAG	2	6	4654320	4654325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109071	NC_012850	AGT	2	6	4654358	4654363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207205
109072	NC_012850	CG	3	6	4654434	4654439	0 %	0 %	50 %	50 %	241207205
109073	NC_012850	GAT	3	9	4654443	4654451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207205
109074	NC_012850	GAA	2	6	4654470	4654475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207205
109075	NC_012850	CTG	2	6	4654479	4654484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109076	NC_012850	CAG	2	6	4654485	4654490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207205
109077	NC_012850	AG	3	6	4654529	4654534	50 %	0 %	50 %	0 %	241207205
109078	NC_012850	TCGG	2	8	4654543	4654550	0 %	25 %	50 %	25 %	241207205
109079	NC_012850	ATGA	2	8	4654557	4654564	50 %	25 %	25 %	0 %	241207205
109080	NC_012850	ATT	2	6	4654643	4654648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109081	NC_012850	CG	3	6	4654666	4654671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109082	NC_012850	T	6	6	4654674	4654679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109083	NC_012850	TCAA	2	8	4654710	4654717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109084	NC_012850	GCG	2	6	4654843	4654848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207206
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109087	NC_012850	GGCGA	2	10	4654984	4654993	20 %	0 %	60 %	20 %	241207206
109088	NC_012850	CGC	2	6	4655014	4655019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207206
109089	NC_012850	CCAG	2	8	4655021	4655028	25 %	0 %	25 %	50 %	241207206
109090	NC_012850	TCG	2	6	4655045	4655050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207206
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109100	NC_012850	CGC	2	6	4655353	4655358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207206
109101	NC_012850	CATG	2	8	4655394	4655401	25 %	25 %	25 %	25 %	241207206
109102	NC_012850	CGA	2	6	4655427	4655432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207206
109103	NC_012850	GGCGAG	2	12	4655437	4655448	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241207206
109104	NC_012850	GCC	2	6	4655478	4655483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207206
109105	NC_012850	GTC	2	6	4655560	4655565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207206
109106	NC_012850	CGATC	2	10	4655595	4655604	20 %	20 %	20 %	40 %	241207206
109107	NC_012850	CTT	2	6	4655607	4655612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207206
109108	NC_012850	GAT	2	6	4655649	4655654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207206
109109	NC_012850	CCG	2	6	4655761	4655766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109110	NC_012850	CGA	2	6	4655772	4655777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207207
109111	NC_012850	GC	3	6	4655821	4655826	0 %	0 %	50 %	50 %	241207207
109112	NC_012850	CTAT	2	8	4655834	4655841	25 %	50 %	0 %	25 %	241207207
109113	NC_012850	GAT	2	6	4655856	4655861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207207
109114	NC_012850	AGC	2	6	4655870	4655875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207207
109115	NC_012850	GCG	2	6	4655926	4655931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207207
109116	NC_012850	ACA	2	6	4655975	4655980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241207207
109117	NC_012850	CGA	2	6	4655988	4655993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207207
109118	NC_012850	GCG	2	6	4656032	4656037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207207
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109120	NC_012850	AGCT	2	8	4656065	4656072	25 %	25 %	25 %	25 %	241207207
109121	NC_012850	GC	3	6	4656156	4656161	0 %	0 %	50 %	50 %	241207207
109122	NC_012850	CCG	2	6	4656174	4656179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207207
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109127	NC_012850	GCTT	2	8	4656609	4656616	0 %	50 %	25 %	25 %	241207208
109128	NC_012850	ATC	2	6	4656625	4656630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207208
109129	NC_012850	GCC	2	6	4656634	4656639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207208
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109160	NC_012850	GC	3	6	4657893	4657898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109161	NC_012850	GTC	2	6	4657903	4657908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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109166	NC_012850	T	6	6	4657953	4657958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109222	NC_012850	GCG	2	6	4660778	4660783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207212
109223	NC_012850	CCT	2	6	4660816	4660821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109224	NC_012850	GTT	2	6	4660822	4660827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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109228	NC_012850	GAA	2	6	4661130	4661135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207213
109229	NC_012850	TCG	2	6	4661149	4661154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207213
109230	NC_012850	CCG	2	6	4661175	4661180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207213
109231	NC_012850	AGA	2	6	4661224	4661229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207213
109232	NC_012850	GC	3	6	4661241	4661246	0 %	0 %	50 %	50 %	241207213
109233	NC_012850	AAG	2	6	4661247	4661252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207213
109234	NC_012850	AGA	2	6	4661254	4661259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207213
109235	NC_012850	CTT	2	6	4661339	4661344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207213
109236	NC_012850	CGA	2	6	4661345	4661350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207213
109237	NC_012850	CAAGGT	2	12	4661357	4661368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241207213
109238	NC_012850	CCA	2	6	4661399	4661404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207213
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109243	NC_012850	TCC	2	6	4661621	4661626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109244	NC_012850	GC	3	6	4661664	4661669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109245	NC_012850	TCG	2	6	4661725	4661730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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109248	NC_012850	T	6	6	4661807	4661812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109249	NC_012850	GC	3	6	4661819	4661824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109250	NC_012850	GGA	2	6	4661827	4661832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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109265	NC_012850	AAG	2	6	4662635	4662640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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