MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_012850	GCT	2	6	4609882	4609887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207159
108002	NC_012850	GCAGC	2	10	4609942	4609951	20 %	0 %	40 %	40 %	241207159
108003	NC_012850	GC	3	6	4609950	4609955	0 %	0 %	50 %	50 %	241207159
108004	NC_012850	GCAT	2	8	4609978	4609985	25 %	25 %	25 %	25 %	241207159
108005	NC_012850	CGA	2	6	4610020	4610025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207159
108006	NC_012850	GGT	2	6	4610026	4610031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207159
108007	NC_012850	GCC	2	6	4610116	4610121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207159
108008	NC_012850	GATC	2	8	4610197	4610204	25 %	25 %	25 %	25 %	241207159
108009	NC_012850	CATC	2	8	4610227	4610234	25 %	25 %	0 %	50 %	241207159
108010	NC_012850	CGC	2	6	4610245	4610250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207159
108011	NC_012850	GAT	2	6	4610263	4610268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207159
108012	NC_012850	CGG	2	6	4610295	4610300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207159
108013	NC_012850	AAG	2	6	4610348	4610353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207159
108014	NC_012850	CTG	2	6	4610369	4610374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207159
108015	NC_012850	CCT	2	6	4610377	4610382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207159
108016	NC_012850	GA	3	6	4610482	4610487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108017	NC_012850	G	7	7	4610567	4610573	0 %	0 %	100 %	0 %	241207160
108018	NC_012850	CTC	2	6	4610580	4610585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207160
108019	NC_012850	CGC	2	6	4610586	4610591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108020	NC_012850	GCC	3	9	4610600	4610608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108021	NC_012850	CG	3	6	4610646	4610651	0 %	0 %	50 %	50 %	241207160
108022	NC_012850	CAG	2	6	4610663	4610668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108023	NC_012850	CGC	3	9	4610673	4610681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108024	NC_012850	CGC	2	6	4610691	4610696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108025	NC_012850	GCCCG	2	10	4610706	4610715	0 %	0 %	40 %	60 %	241207160
108026	NC_012850	CGAT	2	8	4610769	4610776	25 %	25 %	25 %	25 %	241207160
108027	NC_012850	CAT	2	6	4610842	4610847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108028	NC_012850	GAA	2	6	4610885	4610890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207160
108029	NC_012850	ACG	2	6	4610910	4610915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108030	NC_012850	GC	3	6	4610948	4610953	0 %	0 %	50 %	50 %	241207160
108031	NC_012850	GAC	2	6	4610954	4610959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108032	NC_012850	CAT	2	6	4610968	4610973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108033	NC_012850	CGG	2	6	4611007	4611012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207160
108034	NC_012850	TC	3	6	4611058	4611063	0 %	50 %	0 %	50 %	241207160
108035	NC_012850	GCC	2	6	4611093	4611098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108036	NC_012850	CGA	2	6	4611103	4611108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108037	NC_012850	CGCC	2	8	4611127	4611134	0 %	0 %	25 %	75 %	241207160
108038	NC_012850	CG	3	6	4611147	4611152	0 %	0 %	50 %	50 %	241207160
108039	NC_012850	CGC	3	9	4611165	4611173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108040	NC_012850	TCGA	2	8	4611176	4611183	25 %	25 %	25 %	25 %	241207160
108041	NC_012850	AAG	2	6	4611212	4611217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207160
108042	NC_012850	TGC	2	6	4611279	4611284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108043	NC_012850	ATC	2	6	4611287	4611292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108044	NC_012850	GTC	2	6	4611311	4611316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108045	NC_012850	GGC	2	6	4611323	4611328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207160
108046	NC_012850	TCA	2	6	4611393	4611398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108047	NC_012850	AACTGC	2	12	4611417	4611428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241207160
108048	NC_012850	AGC	2	6	4611429	4611434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108049	NC_012850	CGCC	2	8	4611458	4611465	0 %	0 %	25 %	75 %	241207160
108050	NC_012850	GGCGAG	2	12	4611476	4611487	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241207160
108051	NC_012850	CTGC	2	8	4611514	4611521	0 %	25 %	25 %	50 %	241207160
108052	NC_012850	CAT	2	6	4611538	4611543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108053	NC_012850	CTG	2	6	4611578	4611583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108054	NC_012850	ACG	2	6	4611603	4611608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108055	NC_012850	AC	3	6	4611633	4611638	50 %	0 %	0 %	50 %	241207160
108056	NC_012850	CG	3	6	4611639	4611644	0 %	0 %	50 %	50 %	241207160
108057	NC_012850	GAT	2	6	4611667	4611672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207160
108058	NC_012850	G	6	6	4611679	4611684	0 %	0 %	100 %	0 %	241207160
108059	NC_012850	GTC	2	6	4611737	4611742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207160
108060	NC_012850	GGC	2	6	4611748	4611753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207160
108061	NC_012850	CGC	2	6	4611773	4611778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108062	NC_012850	TCA	3	9	4611819	4611827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207160
108063	NC_012850	GCC	2	6	4611873	4611878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108064	NC_012850	CGGC	2	8	4611883	4611890	0 %	0 %	50 %	50 %	241207160
108065	NC_012850	GCC	3	9	4611962	4611970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207160
108066	NC_012850	TCG	2	6	4612040	4612045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108067	NC_012850	CGC	2	6	4612050	4612055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207161
108068	NC_012850	CGG	3	9	4612064	4612072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207161
108069	NC_012850	TGT	2	6	4612085	4612090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207161
108070	NC_012850	GTCAAG	2	12	4612162	4612173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241207161
108071	NC_012850	AAG	2	6	4612267	4612272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207161
108072	NC_012850	GGCC	2	8	4612302	4612309	0 %	0 %	50 %	50 %	241207161
108073	NC_012850	CGG	2	6	4612319	4612324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207161
108074	NC_012850	TCA	2	6	4612337	4612342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207161
108075	NC_012850	TGC	2	6	4612361	4612366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108076	NC_012850	TCG	2	6	4612370	4612375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108077	NC_012850	GTC	2	6	4612381	4612386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108078	NC_012850	ATGGTC	2	12	4612399	4612410	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241207161
108079	NC_012850	CGT	2	6	4612419	4612424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108080	NC_012850	GCC	2	6	4612472	4612477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207161
108081	NC_012850	GAAC	2	8	4612491	4612498	50 %	0 %	25 %	25 %	241207161
108082	NC_012850	TTA	2	6	4612517	4612522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241207161
108083	NC_012850	TCAA	2	8	4612528	4612535	50 %	25 %	0 %	25 %	241207161
108084	NC_012850	GCA	2	6	4612626	4612631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108085	NC_012850	GC	4	8	4612658	4612665	0 %	0 %	50 %	50 %	241207161
108086	NC_012850	CTT	2	6	4612698	4612703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207161
108087	NC_012850	CGG	2	6	4612734	4612739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207161
108088	NC_012850	TGC	2	6	4612775	4612780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108089	NC_012850	TCG	2	6	4612868	4612873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207161
108090	NC_012850	ATG	2	6	4612906	4612911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207161
108091	NC_012850	CG	3	6	4612928	4612933	0 %	0 %	50 %	50 %	241207161
108092	NC_012850	TCG	2	6	4613087	4613092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207162
108093	NC_012850	GCG	2	6	4613144	4613149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207162
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108095	NC_012850	TCG	2	6	4613285	4613290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207162
108096	NC_012850	CGA	2	6	4613319	4613324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207162
108097	NC_012850	CAA	2	6	4613334	4613339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241207162
108098	NC_012850	GCC	2	6	4613347	4613352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207162
108099	NC_012850	TGG	2	6	4613387	4613392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207162
108100	NC_012850	CTG	2	6	4613401	4613406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207162
108101	NC_012850	TTCCTG	2	12	4613410	4613421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241207162
108102	NC_012850	GC	3	6	4613577	4613582	0 %	0 %	50 %	50 %	241207162
108103	NC_012850	TCGA	2	8	4613632	4613639	25 %	25 %	25 %	25 %	241207162
108104	NC_012850	GT	3	6	4613654	4613659	0 %	50 %	50 %	0 %	241207162
108105	NC_012850	GAG	2	6	4613695	4613700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207162
108106	NC_012850	TCCT	2	8	4613725	4613732	0 %	50 %	0 %	50 %	241207162
108107	NC_012850	GCG	2	6	4613746	4613751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207162
108108	NC_012850	AGGA	2	8	4613867	4613874	50 %	0 %	50 %	0 %	241207162
108109	NC_012850	CGA	2	6	4613877	4613882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207162
108110	NC_012850	A	7	7	4613900	4613906	100 %	0 %	0 %	0 %	241207162
108111	NC_012850	GCC	2	6	4613911	4613916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207162
108112	NC_012850	GCC	2	6	4613919	4613924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207162
108113	NC_012850	GAT	2	6	4613940	4613945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207162
108114	NC_012850	TTC	2	6	4613950	4613955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207162
108115	NC_012850	CCGG	2	8	4613986	4613993	0 %	0 %	50 %	50 %	241207162
108116	NC_012850	GCGCCG	2	12	4614024	4614035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108117	NC_012850	AGA	2	6	4614058	4614063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108118	NC_012850	GACG	2	8	4614142	4614149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108119	NC_012850	GC	3	6	4614185	4614190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108120	NC_012850	AG	3	6	4614203	4614208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108121	NC_012850	TCT	2	6	4614219	4614224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207163
108122	NC_012850	TCA	2	6	4614235	4614240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207163
108123	NC_012850	TCG	3	9	4614289	4614297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207163
108124	NC_012850	CGG	2	6	4614362	4614367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207163
108125	NC_012850	GCT	2	6	4614407	4614412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207163
108126	NC_012850	GGC	2	6	4614453	4614458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207163
108127	NC_012850	GGA	2	6	4614490	4614495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207163
108128	NC_012850	CG	3	6	4614540	4614545	0 %	0 %	50 %	50 %	241207163
108129	NC_012850	GCT	2	6	4614569	4614574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207163
108130	NC_012850	CAT	2	6	4614599	4614604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207163
108131	NC_012850	TCG	2	6	4614661	4614666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207163
108132	NC_012850	GGT	2	6	4614700	4614705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207163
108133	NC_012850	GCC	2	6	4614759	4614764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207163
108134	NC_012850	GGC	2	6	4614801	4614806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207163
108135	NC_012850	TCTG	2	8	4614857	4614864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108136	NC_012850	CGA	2	6	4614881	4614886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108137	NC_012850	CTG	2	6	4614917	4614922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207164
108138	NC_012850	GCG	2	6	4614926	4614931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207164
108139	NC_012850	GGC	2	6	4614942	4614947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207164
108140	NC_012850	CTG	2	6	4614966	4614971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207164
108141	NC_012850	CTG	2	6	4615011	4615016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207164
108142	NC_012850	CGA	2	6	4615073	4615078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207164
108143	NC_012850	GGCT	2	8	4615117	4615124	0 %	25 %	50 %	25 %	241207164
108144	NC_012850	GGC	2	6	4615125	4615130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207164
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108147	NC_012850	GGCC	2	8	4615367	4615374	0 %	0 %	50 %	50 %	241207164
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108151	NC_012850	CTG	2	6	4615437	4615442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207164
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108153	NC_012850	CG	3	6	4615517	4615522	0 %	0 %	50 %	50 %	241207164
108154	NC_012850	GTC	2	6	4615639	4615644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207164
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108158	NC_012850	CCG	2	6	4615862	4615867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108159	NC_012850	GA	3	6	4615899	4615904	50 %	0 %	50 %	0 %	241207165
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108162	NC_012850	GCT	3	9	4616042	4616050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207165
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108182	NC_012850	GTC	2	6	4616724	4616729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207165
108183	NC_012850	CGA	2	6	4616858	4616863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207165
108184	NC_012850	CTT	2	6	4616942	4616947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207165
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108188	NC_012850	GAT	2	6	4617000	4617005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207165
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108193	NC_012850	GGCGC	2	10	4617485	4617494	0 %	0 %	60 %	40 %	241207167
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108219	NC_012850	GGCT	2	8	4618612	4618619	0 %	25 %	50 %	25 %	241207168
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