MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_012850	CGT	2	6	4528352	4528357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207080
106002	NC_012850	CAT	2	6	4528358	4528363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207080
106003	NC_012850	AGC	2	6	4528378	4528383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207080
106004	NC_012850	CTGC	2	8	4528391	4528398	0 %	25 %	25 %	50 %	241207080
106005	NC_012850	GTAT	2	8	4528426	4528433	25 %	50 %	25 %	0 %	241207080
106006	NC_012850	GGA	2	6	4528499	4528504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207080
106007	NC_012850	TGA	2	6	4528570	4528575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207080
106008	NC_012850	CGA	2	6	4528616	4528621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207080
106009	NC_012850	CGC	2	6	4528705	4528710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207080
106010	NC_012850	GTGGA	2	10	4528749	4528758	20 %	20 %	60 %	0 %	241207080
106011	NC_012850	GCT	2	6	4528794	4528799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207081
106012	NC_012850	GCT	2	6	4528803	4528808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207081
106013	NC_012850	GAT	2	6	4528923	4528928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207081
106014	NC_012850	TGC	2	6	4528973	4528978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207081
106015	NC_012850	GAT	2	6	4528983	4528988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207081
106016	NC_012850	GAA	2	6	4528996	4529001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207081
106017	NC_012850	GCTCG	2	10	4529019	4529028	0 %	20 %	40 %	40 %	241207081
106018	NC_012850	CGC	2	6	4529043	4529048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207081
106019	NC_012850	TGCCGG	2	12	4529061	4529072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241207081
106020	NC_012850	GCC	2	6	4529095	4529100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207081
106021	NC_012850	TGC	2	6	4529102	4529107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207081
106022	NC_012850	GAT	2	6	4529124	4529129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207081
106023	NC_012850	CGA	2	6	4529241	4529246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207081
106024	NC_012850	CGC	3	9	4529263	4529271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207081
106025	NC_012850	TAT	2	6	4529293	4529298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241207081
106026	NC_012850	ACCG	2	8	4529359	4529366	25 %	0 %	25 %	50 %	241207081
106027	NC_012850	CAT	2	6	4529367	4529372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207081
106028	NC_012850	CGC	3	9	4529404	4529412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207081
106029	NC_012850	CTC	2	6	4529419	4529424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207081
106030	NC_012850	GCT	2	6	4529469	4529474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106031	NC_012850	CAG	2	6	4529487	4529492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106032	NC_012850	TTA	2	6	4529499	4529504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106033	NC_012850	CATT	2	8	4529556	4529563	25 %	50 %	0 %	25 %	241207082
106034	NC_012850	GC	3	6	4529641	4529646	0 %	0 %	50 %	50 %	241207082
106035	NC_012850	CTG	2	6	4529653	4529658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207082
106036	NC_012850	TTG	2	6	4529662	4529667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207082
106037	NC_012850	ATGG	2	8	4529755	4529762	25 %	25 %	50 %	0 %	241207082
106038	NC_012850	CGA	2	6	4529929	4529934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106039	NC_012850	CTG	2	6	4529971	4529976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106040	NC_012850	CCAT	2	8	4529977	4529984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106041	NC_012850	CAG	2	6	4529988	4529993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106042	NC_012850	ACA	2	6	4530017	4530022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106043	NC_012850	ATT	2	6	4530055	4530060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241207083
106044	NC_012850	TCG	2	6	4530143	4530148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207083
106045	NC_012850	GGC	2	6	4530163	4530168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207083
106046	NC_012850	GGC	2	6	4530185	4530190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207083
106047	NC_012850	GCA	2	6	4530191	4530196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207083
106048	NC_012850	TCG	2	6	4530350	4530355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207083
106049	NC_012850	ATAA	2	8	4530398	4530405	75 %	25 %	0 %	0 %	241207083
106050	NC_012850	ATG	2	6	4530436	4530441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106051	NC_012850	ACA	2	6	4530466	4530471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106052	NC_012850	GAT	2	6	4530499	4530504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106053	NC_012850	ATC	2	6	4530526	4530531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106054	NC_012850	TCGCA	2	10	4530548	4530557	20 %	20 %	20 %	40 %	241207084
106055	NC_012850	TCC	2	6	4530609	4530614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207084
106056	NC_012850	CCG	2	6	4530687	4530692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207084
106057	NC_012850	ATGTTG	2	12	4530717	4530728	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	241207084
106058	NC_012850	TGG	2	6	4530730	4530735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207084
106059	NC_012850	GGT	2	6	4530794	4530799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207084
106060	NC_012850	GAC	2	6	4530800	4530805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207084
106061	NC_012850	CCG	2	6	4530814	4530819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207084
106062	NC_012850	TCG	2	6	4530840	4530845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207084
106063	NC_012850	ACG	2	6	4530855	4530860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207084
106064	NC_012850	GAT	2	6	4530902	4530907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207084
106065	NC_012850	CGG	2	6	4530925	4530930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207084
106066	NC_012850	GGC	2	6	4530947	4530952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207084
106067	NC_012850	GCC	2	6	4530987	4530992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207084
106068	NC_012850	GAT	2	6	4531154	4531159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207084
106069	NC_012850	GCA	2	6	4531177	4531182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207084
106070	NC_012850	TGG	2	6	4531185	4531190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207084
106071	NC_012850	ATC	2	6	4531230	4531235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207084
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106073	NC_012850	GGCAG	2	10	4531288	4531297	20 %	0 %	60 %	20 %	241207084
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106075	NC_012850	CGG	2	6	4531445	4531450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207085
106076	NC_012850	GCT	2	6	4531523	4531528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207085
106077	NC_012850	CGAG	2	8	4531562	4531569	25 %	0 %	50 %	25 %	241207085
106078	NC_012850	ATG	2	6	4531614	4531619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207085
106079	NC_012850	GC	3	6	4531651	4531656	0 %	0 %	50 %	50 %	241207085
106080	NC_012850	GCG	2	6	4531718	4531723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207085
106081	NC_012850	TCG	2	6	4531735	4531740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207085
106082	NC_012850	CG	3	6	4531803	4531808	0 %	0 %	50 %	50 %	241207085
106083	NC_012850	GATC	2	8	4531820	4531827	25 %	25 %	25 %	25 %	241207085
106084	NC_012850	GAT	2	6	4531854	4531859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207085
106085	NC_012850	GAC	2	6	4531941	4531946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207085
106086	NC_012850	CGG	3	9	4531955	4531963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207085
106087	NC_012850	CGT	2	6	4531985	4531990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207085
106088	NC_012850	CGA	3	9	4531997	4532005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207085
106089	NC_012850	GC	3	6	4532029	4532034	0 %	0 %	50 %	50 %	241207085
106090	NC_012850	ATC	2	6	4532050	4532055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207085
106091	NC_012850	GC	3	6	4532109	4532114	0 %	0 %	50 %	50 %	241207085
106092	NC_012850	CG	3	6	4532253	4532258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106093	NC_012850	GCT	2	6	4532343	4532348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207086
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106097	NC_012850	TGCCGT	2	12	4532478	4532489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207086
106098	NC_012850	AAG	2	6	4532545	4532550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207086
106099	NC_012850	GGTC	2	8	4532592	4532599	0 %	25 %	50 %	25 %	241207086
106100	NC_012850	GCA	2	6	4532684	4532689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207086
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106104	NC_012850	CGC	2	6	4532859	4532864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207086
106105	NC_012850	GCCCG	2	10	4532902	4532911	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106106	NC_012850	ACG	2	6	4532985	4532990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106107	NC_012850	CGT	2	6	4533046	4533051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207087
106108	NC_012850	TCG	2	6	4533060	4533065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207087
106109	NC_012850	GGC	2	6	4533067	4533072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207087
106110	NC_012850	GGA	2	6	4533133	4533138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207087
106111	NC_012850	GAG	2	6	4533178	4533183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207087
106112	NC_012850	CGC	2	6	4533190	4533195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207087
106113	NC_012850	GCA	4	12	4533210	4533221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207087
106114	NC_012850	TC	3	6	4533274	4533279	0 %	50 %	0 %	50 %	241207087
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106132	NC_012850	GC	3	6	4534003	4534008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106133	NC_012850	TGC	2	6	4534033	4534038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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106453	NC_012850	CG	3	6	4547043	4547048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106454	NC_012850	GC	3	6	4547067	4547072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106455	NC_012850	GCA	2	6	4547074	4547079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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106457	NC_012850	TCG	2	6	4547200	4547205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207099
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