MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105501	NC_012850	GCA	2	6	4507445	4507450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207063
105502	NC_012850	GGC	2	6	4507451	4507456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207063
105503	NC_012850	CGC	3	9	4507457	4507465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207063
105504	NC_012850	GGGT	2	8	4507536	4507543	0 %	25 %	75 %	0 %	241207063
105505	NC_012850	ATG	2	6	4507546	4507551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207063
105506	NC_012850	AGA	2	6	4507598	4507603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207063
105507	NC_012850	GA	3	6	4507726	4507731	50 %	0 %	50 %	0 %	241207063
105508	NC_012850	CAGG	2	8	4507778	4507785	25 %	0 %	50 %	25 %	241207063
105509	NC_012850	CAG	2	6	4507794	4507799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207063
105510	NC_012850	CCG	2	6	4507910	4507915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207063
105511	NC_012850	GCCG	3	12	4507912	4507923	0 %	0 %	50 %	50 %	241207063
105512	NC_012850	ACG	2	6	4508029	4508034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207063
105513	NC_012850	GCC	2	6	4508040	4508045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207063
105514	NC_012850	GCG	2	6	4508068	4508073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207063
105515	NC_012850	GCTTC	2	10	4508150	4508159	0 %	40 %	20 %	40 %	241207063
105516	NC_012850	CAG	2	6	4508172	4508177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207063
105517	NC_012850	GGC	2	6	4508220	4508225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207063
105518	NC_012850	GCCT	2	8	4508247	4508254	0 %	25 %	25 %	50 %	241207063
105519	NC_012850	CTCGCC	2	12	4508277	4508288	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241207063
105520	NC_012850	GCT	2	6	4508343	4508348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207063
105521	NC_012850	GTCTC	2	10	4508353	4508362	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105522	NC_012850	CG	3	6	4508450	4508455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105523	NC_012850	CGCGC	2	10	4508561	4508570	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105524	NC_012850	A	6	6	4508581	4508586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105525	NC_012850	GGC	2	6	4508627	4508632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105526	NC_012850	CTT	2	6	4508644	4508649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207064
105527	NC_012850	CTT	3	9	4508651	4508659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207064
105528	NC_012850	CGA	2	6	4508692	4508697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105529	NC_012850	TCG	2	6	4508727	4508732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105530	NC_012850	AGC	2	6	4508739	4508744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105531	NC_012850	CCTT	2	8	4508763	4508770	0 %	50 %	0 %	50 %	241207064
105532	NC_012850	GAC	2	6	4508771	4508776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105533	NC_012850	GAA	2	6	4508843	4508848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207064
105534	NC_012850	CGG	2	6	4508869	4508874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207064
105535	NC_012850	GAC	2	6	4508879	4508884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105536	NC_012850	CGA	2	6	4508920	4508925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105537	NC_012850	CGA	2	6	4509028	4509033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105538	NC_012850	GCC	2	6	4509050	4509055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207064
105539	NC_012850	CGG	2	6	4509271	4509276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207064
105540	NC_012850	GGT	2	6	4509307	4509312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207064
105541	NC_012850	GGACA	2	10	4509332	4509341	40 %	0 %	40 %	20 %	241207064
105542	NC_012850	AGCG	2	8	4509422	4509429	25 %	0 %	50 %	25 %	241207064
105543	NC_012850	GAC	2	6	4509485	4509490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105544	NC_012850	GCA	2	6	4509523	4509528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105545	NC_012850	CGGA	2	8	4509530	4509537	25 %	0 %	50 %	25 %	241207064
105546	NC_012850	CG	3	6	4509539	4509544	0 %	0 %	50 %	50 %	241207064
105547	NC_012850	AGGG	2	8	4509616	4509623	25 %	0 %	75 %	0 %	241207064
105548	NC_012850	CGC	2	6	4509730	4509735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207064
105549	NC_012850	GGA	2	6	4509928	4509933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207064
105550	NC_012850	CGG	2	6	4509967	4509972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207064
105551	NC_012850	AGT	2	6	4510057	4510062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207064
105552	NC_012850	CG	3	6	4510078	4510083	0 %	0 %	50 %	50 %	241207064
105553	NC_012850	GGC	2	6	4510091	4510096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207064
105554	NC_012850	TGA	2	6	4510111	4510116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207064
105555	NC_012850	ATG	2	6	4510170	4510175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207064
105556	NC_012850	CCA	2	6	4510204	4510209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207064
105557	NC_012850	CGA	3	9	4510234	4510242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105558	NC_012850	TCG	2	6	4510266	4510271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207064
105559	NC_012850	CG	3	6	4510312	4510317	0 %	0 %	50 %	50 %	241207064
105560	NC_012850	CCG	2	6	4510320	4510325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207064
105561	NC_012850	GCGG	2	8	4510468	4510475	0 %	0 %	75 %	25 %	241207064
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105568	NC_012850	GCGG	2	8	4510726	4510733	0 %	0 %	75 %	25 %	241207064
105569	NC_012850	TG	4	8	4510754	4510761	0 %	50 %	50 %	0 %	241207064
105570	NC_012850	GCGCA	2	10	4510817	4510826	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105571	NC_012850	CAAT	2	8	4510837	4510844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105572	NC_012850	GGTT	2	8	4510980	4510987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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105583	NC_012850	GTC	2	6	4511439	4511444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105584	NC_012850	GTC	2	6	4511525	4511530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105599	NC_012850	ATGA	2	8	4512192	4512199	50 %	25 %	25 %	0 %	241207066
105600	NC_012850	CGG	2	6	4512320	4512325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207066
105601	NC_012850	ATCGC	2	10	4512457	4512466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105602	NC_012850	GTC	2	6	4512665	4512670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207067
105603	NC_012850	TGA	2	6	4512673	4512678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207067
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105606	NC_012850	GCC	2	6	4512735	4512740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207067
105607	NC_012850	AGCG	2	8	4512785	4512792	25 %	0 %	50 %	25 %	241207067
105608	NC_012850	CGA	2	6	4512820	4512825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207067
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105611	NC_012850	GC	3	6	4512931	4512936	0 %	0 %	50 %	50 %	241207067
105612	NC_012850	GGCA	2	8	4512949	4512956	25 %	0 %	50 %	25 %	241207067
105613	NC_012850	CG	3	6	4513015	4513020	0 %	0 %	50 %	50 %	241207067
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105615	NC_012850	AT	3	6	4513092	4513097	50 %	50 %	0 %	0 %	241207067
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105729	NC_012850	TCA	2	6	4517227	4517232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207070
105730	NC_012850	AGC	2	6	4517253	4517258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207070
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105732	NC_012850	GC	3	6	4517308	4517313	0 %	0 %	50 %	50 %	241207070
105733	NC_012850	CTT	2	6	4517324	4517329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207070
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105736	NC_012850	TCG	2	6	4517514	4517519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207070
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105740	NC_012850	CTT	2	6	4517583	4517588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207071
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105836	NC_012850	GCTG	2	8	4521156	4521163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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105839	NC_012850	CGT	2	6	4521217	4521222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105840	NC_012850	TGC	2	6	4521225	4521230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105841	NC_012850	CGCATC	2	12	4521425	4521436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105842	NC_012850	AT	3	6	4521526	4521531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105843	NC_012850	GCG	2	6	4521544	4521549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105844	NC_012850	TGCG	2	8	4521582	4521589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105845	NC_012850	CGA	2	6	4521655	4521660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105846	NC_012850	CGAT	2	8	4521678	4521685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105847	NC_012850	CAT	2	6	4521689	4521694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105848	NC_012850	CTAG	2	8	4521700	4521707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105849	NC_012850	CGCC	2	8	4521737	4521744	0 %	0 %	25 %	75 %	241207073
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105962	NC_012850	ATC	2	6	4526493	4526498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207078
105963	NC_012850	CCTT	2	8	4526526	4526533	0 %	50 %	0 %	50 %	241207078
105964	NC_012850	TCG	2	6	4526542	4526547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207078
105965	NC_012850	GCG	2	6	4526579	4526584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207078
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105968	NC_012850	TCG	2	6	4526730	4526735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207078
105969	NC_012850	GC	3	6	4526753	4526758	0 %	0 %	50 %	50 %	241207078
105970	NC_012850	CCGG	2	8	4526764	4526771	0 %	0 %	50 %	50 %	241207078
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105975	NC_012850	GC	3	6	4526954	4526959	0 %	0 %	50 %	50 %	241207078
105976	NC_012850	CGT	3	9	4526960	4526968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207078
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105979	NC_012850	GA	3	6	4527206	4527211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105980	NC_012850	GCT	2	6	4527254	4527259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105981	NC_012850	CCA	3	9	4527296	4527304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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105984	NC_012850	A	6	6	4527359	4527364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105991	NC_012850	AG	3	6	4527764	4527769	50 %	0 %	50 %	0 %	241207079
105992	NC_012850	TCA	2	6	4527802	4527807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207079
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