MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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105002	NC_012850	CGG	2	6	4483671	4483676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207039
105003	NC_012850	CTT	2	6	4483684	4483689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207039
105004	NC_012850	GCC	2	6	4483694	4483699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207039
105005	NC_012850	CGG	2	6	4483710	4483715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207039
105006	NC_012850	GCC	3	9	4483840	4483848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207039
105007	NC_012850	GCG	2	6	4483877	4483882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207039
105008	NC_012850	CG	3	6	4483881	4483886	0 %	0 %	50 %	50 %	241207039
105009	NC_012850	CGT	2	6	4483921	4483926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207039
105010	NC_012850	TCT	3	9	4483938	4483946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207039
105011	NC_012850	GCA	2	6	4483959	4483964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207039
105012	NC_012850	GGTGGC	2	12	4484073	4484084	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241207039
105013	NC_012850	CGG	2	6	4484106	4484111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207039
105014	NC_012850	CCTT	2	8	4484132	4484139	0 %	50 %	0 %	50 %	241207039
105015	NC_012850	CGC	2	6	4484196	4484201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207039
105016	NC_012850	GCG	2	6	4484210	4484215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207039
105017	NC_012850	TTC	2	6	4484216	4484221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207039
105018	NC_012850	CGGT	2	8	4484222	4484229	0 %	25 %	50 %	25 %	241207039
105019	NC_012850	TA	3	6	4484305	4484310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105020	NC_012850	T	6	6	4484348	4484353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105021	NC_012850	G	6	6	4484387	4484392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105022	NC_012850	CG	3	6	4484457	4484462	0 %	0 %	50 %	50 %	241207040
105023	NC_012850	TGG	2	6	4484513	4484518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207040
105024	NC_012850	CGA	2	6	4484559	4484564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207040
105025	NC_012850	CCG	2	6	4484657	4484662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207040
105026	NC_012850	TCG	2	6	4484770	4484775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207040
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105028	NC_012850	GC	3	6	4484904	4484909	0 %	0 %	50 %	50 %	241207040
105029	NC_012850	GC	3	6	4484919	4484924	0 %	0 %	50 %	50 %	241207040
105030	NC_012850	ACG	2	6	4484935	4484940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207040
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105032	NC_012850	GAT	2	6	4484979	4484984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207040
105033	NC_012850	TGC	2	6	4485015	4485020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207040
105034	NC_012850	CATG	2	8	4485057	4485064	25 %	25 %	25 %	25 %	241207040
105035	NC_012850	TTC	2	6	4485106	4485111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207040
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105040	NC_012850	GCT	2	6	4485329	4485334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105041	NC_012850	AAT	2	6	4485371	4485376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105042	NC_012850	CGAA	2	8	4485416	4485423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105043	NC_012850	GGC	2	6	4485436	4485441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207041
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105047	NC_012850	CGT	2	6	4485556	4485561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207041
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105050	NC_012850	CGC	2	6	4485604	4485609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207041
105051	NC_012850	GC	3	6	4485623	4485628	0 %	0 %	50 %	50 %	241207041
105052	NC_012850	TCG	2	6	4485633	4485638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207041
105053	NC_012850	CCCA	2	8	4485653	4485660	25 %	0 %	0 %	75 %	241207041
105054	NC_012850	TCGACG	2	12	4485816	4485827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241207041
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105059	NC_012850	CG	3	6	4486094	4486099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105060	NC_012850	TTA	2	6	4486141	4486146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105115	NC_012850	CGG	2	6	4488162	4488167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207043
105116	NC_012850	GAAG	2	8	4488170	4488177	50 %	0 %	50 %	0 %	241207043
105117	NC_012850	CCG	2	6	4488213	4488218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207043
105118	NC_012850	AGC	2	6	4488275	4488280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105119	NC_012850	GCT	2	6	4488307	4488312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105120	NC_012850	CGAG	2	8	4488319	4488326	25 %	0 %	50 %	25 %	241207043
105121	NC_012850	ACG	2	6	4488357	4488362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105122	NC_012850	GAC	2	6	4488368	4488373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105123	NC_012850	TTG	2	6	4488381	4488386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207043
105124	NC_012850	CTC	2	6	4488389	4488394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207043
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105126	NC_012850	TGC	2	6	4488545	4488550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105127	NC_012850	ACG	2	6	4488618	4488623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207043
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105129	NC_012850	CGA	2	6	4488730	4488735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207043
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105131	NC_012850	GCT	2	6	4488829	4488834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207043
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105134	NC_012850	CTG	2	6	4488893	4488898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207043
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105142	NC_012850	GCT	2	6	4489069	4489074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207043
105143	NC_012850	TTC	2	6	4489085	4489090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207043
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105146	NC_012850	GCG	2	6	4489340	4489345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207043
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105148	NC_012850	GC	5	10	4489443	4489452	0 %	0 %	50 %	50 %	241207043
105149	NC_012850	GGTT	2	8	4489676	4489683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105150	NC_012850	CT	3	6	4489714	4489719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105151	NC_012850	GAT	2	6	4489834	4489839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207044
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105173	NC_012850	GCGAT	2	10	4490663	4490672	20 %	20 %	40 %	20 %	241207045
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105190	NC_012850	GCA	2	6	4491261	4491266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207045
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105211	NC_012850	GAC	2	6	4492492	4492497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207046
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105215	NC_012850	T	6	6	4492586	4492591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105216	NC_012850	TAA	2	6	4492619	4492624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105217	NC_012850	GCC	2	6	4492625	4492630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105218	NC_012850	GAG	2	6	4492650	4492655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105219	NC_012850	ACC	2	6	4492681	4492686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105220	NC_012850	GCATG	2	10	4492721	4492730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105221	NC_012850	CCA	2	6	4492762	4492767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105222	NC_012850	TCGGC	2	10	4492786	4492795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105223	NC_012850	GAAG	2	8	4492826	4492833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105224	NC_012850	TAT	2	6	4492932	4492937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241207047
105225	NC_012850	TC	3	6	4493022	4493027	0 %	50 %	0 %	50 %	241207047
105226	NC_012850	AAAGA	2	10	4493111	4493120	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105227	NC_012850	CCG	2	6	4493164	4493169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105228	NC_012850	ACG	2	6	4493214	4493219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105230	NC_012850	CGG	2	6	4493259	4493264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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105348	NC_012850	TTGA	2	8	4500667	4500674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105349	NC_012850	ATGT	2	8	4500793	4500800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105350	NC_012850	CGC	3	9	4500860	4500868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207054
105351	NC_012850	ATC	2	6	4500869	4500874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241207054
105352	NC_012850	CGA	2	6	4500881	4500886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207054
105353	NC_012850	CTGG	2	8	4500926	4500933	0 %	25 %	50 %	25 %	241207054
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105367	NC_012850	AGGA	2	8	4501601	4501608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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105448	NC_012850	AT	3	6	4505095	4505100	50 %	50 %	0 %	0 %	241207060
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105451	NC_012850	ACA	2	6	4505175	4505180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105452	NC_012850	GTGTC	2	10	4505222	4505231	0 %	40 %	40 %	20 %	241207061
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105460	NC_012850	A	6	6	4505565	4505570	100 %	0 %	0 %	0 %	241207061
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105462	NC_012850	TCG	2	6	4505680	4505685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207061
105463	NC_012850	CGC	2	6	4505718	4505723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207061
105464	NC_012850	GAT	2	6	4505727	4505732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207061
105465	NC_012850	CGG	2	6	4505763	4505768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207061
105466	NC_012850	TCC	2	6	4505824	4505829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207061
105467	NC_012850	CG	3	6	4505858	4505863	0 %	0 %	50 %	50 %	241207061
105468	NC_012850	ATG	2	6	4505867	4505872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207061
105469	NC_012850	CGG	2	6	4505898	4505903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207061
105470	NC_012850	GAG	2	6	4505923	4505928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207061
105471	NC_012850	GC	3	6	4505934	4505939	0 %	0 %	50 %	50 %	241207061
105472	NC_012850	TCG	2	6	4505972	4505977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207061
105473	NC_012850	CTG	2	6	4506241	4506246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207061
105474	NC_012850	ATG	2	6	4506247	4506252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207061
105475	NC_012850	CGA	2	6	4506336	4506341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207061
105476	NC_012850	CTTCGG	2	12	4506372	4506383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207061
105477	NC_012850	ATA	3	9	4506423	4506431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241207061
105478	NC_012850	CGC	2	6	4506517	4506522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207062
105479	NC_012850	TGC	2	6	4506586	4506591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207062
105480	NC_012850	TGC	2	6	4506612	4506617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207062
105481	NC_012850	ACG	2	6	4506752	4506757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207062
105482	NC_012850	GCGCT	2	10	4506817	4506826	0 %	20 %	40 %	40 %	241207062
105483	NC_012850	TGG	2	6	4506841	4506846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207062
105484	NC_012850	GCTGAC	2	12	4506853	4506864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241207062
105485	NC_012850	CG	3	6	4506879	4506884	0 %	0 %	50 %	50 %	241207062
105486	NC_012850	CG	3	6	4506966	4506971	0 %	0 %	50 %	50 %	241207062
105487	NC_012850	CCG	2	6	4506993	4506998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207062
105488	NC_012850	GCCGGC	2	12	4507016	4507027	0 %	0 %	50 %	50 %	241207062
105489	NC_012850	GC	4	8	4507037	4507044	0 %	0 %	50 %	50 %	241207062
105490	NC_012850	CT	3	6	4507116	4507121	0 %	50 %	0 %	50 %	241207062
105491	NC_012850	TCC	2	6	4507139	4507144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241207062
105492	NC_012850	TCG	2	6	4507167	4507172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207062
105493	NC_012850	GAT	2	6	4507274	4507279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105494	NC_012850	TGT	2	6	4507294	4507299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105495	NC_012850	GAT	2	6	4507302	4507307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105496	NC_012850	GCC	2	6	4507323	4507328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105497	NC_012850	TTC	2	6	4507339	4507344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207063
105498	NC_012850	CGC	2	6	4507382	4507387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207063
105499	NC_012850	CGC	2	6	4507401	4507406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207063
105500	NC_012850	CGA	2	6	4507439	4507444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207063

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