MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_012850	TCG	2	6	4441229	4441234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207006
104002	NC_012850	TTG	2	6	4441259	4441264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207006
104003	NC_012850	TTCT	2	8	4441276	4441283	0 %	75 %	0 %	25 %	241207006
104004	NC_012850	GATC	2	8	4441362	4441369	25 %	25 %	25 %	25 %	241207006
104005	NC_012850	GC	3	6	4441373	4441378	0 %	0 %	50 %	50 %	241207006
104006	NC_012850	GTG	2	6	4441379	4441384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207006
104007	NC_012850	ACG	2	6	4441400	4441405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207006
104008	NC_012850	TGC	2	6	4441408	4441413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207006
104009	NC_012850	GAT	2	6	4441441	4441446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207006
104010	NC_012850	CAG	2	6	4441453	4441458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207006
104011	NC_012850	GGC	2	6	4441488	4441493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207006
104012	NC_012850	GCA	2	6	4441500	4441505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207006
104013	NC_012850	CGC	2	6	4441519	4441524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207006
104014	NC_012850	ATCC	2	8	4441553	4441560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104015	NC_012850	ACATT	2	10	4441580	4441589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104016	NC_012850	AAC	2	6	4441592	4441597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104017	NC_012850	GAA	2	6	4441704	4441709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207007
104018	NC_012850	CGGC	2	8	4441739	4441746	0 %	0 %	50 %	50 %	241207007
104019	NC_012850	TCGA	2	8	4441849	4441856	25 %	25 %	25 %	25 %	241207007
104020	NC_012850	AGA	2	6	4441871	4441876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241207007
104021	NC_012850	TCGA	2	8	4441957	4441964	25 %	25 %	25 %	25 %	241207007
104022	NC_012850	TGA	2	6	4442039	4442044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207007
104023	NC_012850	CCG	2	6	4442047	4442052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207007
104024	NC_012850	TG	3	6	4442055	4442060	0 %	50 %	50 %	0 %	241207007
104025	NC_012850	CAC	2	6	4442073	4442078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207007
104026	NC_012850	CGG	2	6	4442123	4442128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207007
104027	NC_012850	CGG	2	6	4442168	4442173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207007
104028	NC_012850	GCC	2	6	4442191	4442196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207007
104029	NC_012850	TTG	2	6	4442200	4442205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207007
104030	NC_012850	CATCG	2	10	4442295	4442304	20 %	20 %	20 %	40 %	241207007
104031	NC_012850	CAG	2	6	4442325	4442330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104032	NC_012850	CAG	2	6	4442391	4442396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104033	NC_012850	TC	3	6	4442419	4442424	0 %	50 %	0 %	50 %	241207007
104034	NC_012850	TTC	2	6	4442467	4442472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207007
104035	NC_012850	GCT	2	6	4442486	4442491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104036	NC_012850	TGCT	2	8	4442506	4442513	0 %	50 %	25 %	25 %	241207007
104037	NC_012850	GAC	2	6	4442520	4442525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104038	NC_012850	GAT	2	6	4442538	4442543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207007
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104040	NC_012850	GCA	2	6	4442666	4442671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104041	NC_012850	CAG	2	6	4442709	4442714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104042	NC_012850	CCTT	2	8	4442722	4442729	0 %	50 %	0 %	50 %	241207007
104043	NC_012850	TGA	2	6	4442762	4442767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207007
104044	NC_012850	GCC	2	6	4442769	4442774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207007
104045	NC_012850	TTG	3	9	4442794	4442802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207007
104046	NC_012850	CGA	2	6	4442810	4442815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104047	NC_012850	CGG	2	6	4442834	4442839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207007
104048	NC_012850	GCG	2	6	4442846	4442851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207007
104049	NC_012850	CGC	2	6	4442856	4442861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207007
104050	NC_012850	GAAGCC	2	12	4442865	4442876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104051	NC_012850	CGA	2	6	4442906	4442911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207007
104052	NC_012850	ACCGG	2	10	4442962	4442971	20 %	0 %	40 %	40 %	241207007
104053	NC_012850	TTG	2	6	4443023	4443028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207008
104054	NC_012850	GTT	2	6	4443041	4443046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207008
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104058	NC_012850	CTT	2	6	4443179	4443184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207008
104059	NC_012850	TCG	2	6	4443246	4443251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207008
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104113	NC_012850	GTC	2	6	4445466	4445471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207009
104114	NC_012850	CGGCTG	2	12	4445475	4445486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241207009
104115	NC_012850	CCA	2	6	4445501	4445506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207009
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104216	NC_012850	TGC	2	6	4450192	4450197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207012
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104223	NC_012850	GCG	2	6	4450524	4450529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104224	NC_012850	GTT	2	6	4450540	4450545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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104226	NC_012850	ATT	2	6	4450606	4450611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104227	NC_012850	AGT	2	6	4450666	4450671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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104229	NC_012850	TTA	2	6	4450702	4450707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104230	NC_012850	AGG	2	6	4450718	4450723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104231	NC_012850	ATAA	2	8	4450764	4450771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104232	NC_012850	GGC	2	6	4450896	4450901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207013
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104343	NC_012850	GGA	2	6	4455493	4455498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241207017
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104458	NC_012850	TTTCCG	2	12	4461105	4461116	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241207021
104459	NC_012850	CCGA	2	8	4461131	4461138	25 %	0 %	25 %	50 %	241207021
104460	NC_012850	CCG	2	6	4461186	4461191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207021
104461	NC_012850	TCG	2	6	4461203	4461208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207021
104462	NC_012850	TGC	2	6	4461266	4461271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207021
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104483	NC_012850	TTG	2	6	4462181	4462186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241207022
104484	NC_012850	ACC	2	6	4462202	4462207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241207022
104485	NC_012850	AAGG	2	8	4462297	4462304	50 %	0 %	50 %	0 %	241207022
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104487	NC_012850	CAG	2	6	4462453	4462458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207022
104488	NC_012850	ATG	2	6	4462465	4462470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207022
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104491	NC_012850	GTC	2	6	4462721	4462726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241207022
104492	NC_012850	TGA	2	6	4462740	4462745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241207022
104493	NC_012850	ACG	2	6	4462772	4462777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241207022
104494	NC_012850	AGCA	2	8	4462834	4462841	50 %	0 %	25 %	25 %	241207022
104495	NC_012850	GCG	2	6	4462863	4462868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241207022
104496	NC_012850	GC	3	6	4462892	4462897	0 %	0 %	50 %	50 %	241207022
104497	NC_012850	CGC	2	6	4462899	4462904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241207022
104498	NC_012850	TTC	2	6	4462913	4462918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241207022
104499	NC_012850	TGG	2	6	4462980	4462985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241207022
104500	NC_012850	TCC	2	6	4463039	4463044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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