MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012850	CGT	2	6	344024	344029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203086
8002	NC_012850	CGA	2	6	344039	344044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203086
8003	NC_012850	CTG	2	6	344082	344087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203086
8004	NC_012850	GGA	2	6	344200	344205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203086
8005	NC_012850	GTT	2	6	344234	344239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203087
8006	NC_012850	GAC	2	6	344240	344245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8007	NC_012850	CGA	2	6	344250	344255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8008	NC_012850	CCG	2	6	344271	344276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8009	NC_012850	TCA	2	6	344448	344453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203087
8010	NC_012850	GCG	2	6	344495	344500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203087
8011	NC_012850	GCC	2	6	344585	344590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8012	NC_012850	GC	3	6	344591	344596	0 %	0 %	50 %	50 %	241203087
8013	NC_012850	CGC	2	6	344623	344628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8014	NC_012850	TCG	2	6	344676	344681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8015	NC_012850	CGG	2	6	344698	344703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203087
8016	NC_012850	TGC	2	6	344724	344729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8017	NC_012850	CCG	2	6	344750	344755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8018	NC_012850	TCA	2	6	344760	344765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203087
8019	NC_012850	GCC	2	6	344776	344781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8020	NC_012850	GGT	2	6	344830	344835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203087
8021	NC_012850	CGAC	2	8	344844	344851	25 %	0 %	25 %	50 %	241203087
8022	NC_012850	ATCT	2	8	344876	344883	25 %	50 %	0 %	25 %	241203087
8023	NC_012850	CGG	2	6	344890	344895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203087
8024	NC_012850	TGC	2	6	344933	344938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8025	NC_012850	ATTCG	2	10	344992	345001	20 %	40 %	20 %	20 %	241203087
8026	NC_012850	GCC	2	6	345065	345070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8027	NC_012850	TTG	2	6	345074	345079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203087
8028	NC_012850	A	6	6	345120	345125	100 %	0 %	0 %	0 %	241203087
8029	NC_012850	AGC	3	9	345177	345185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203087
8030	NC_012850	GAA	2	6	345206	345211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203087
8031	NC_012850	GCC	2	6	345227	345232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203087
8032	NC_012850	AAGG	2	8	345236	345243	50 %	0 %	50 %	0 %	241203087
8033	NC_012850	TCG	2	6	345285	345290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203088
8034	NC_012850	TGC	2	6	345312	345317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203088
8035	NC_012850	CGGTGA	2	12	345364	345375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241203088
8036	NC_012850	AGC	2	6	345399	345404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203088
8037	NC_012850	CAC	2	6	345407	345412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203088
8038	NC_012850	GATG	2	8	345442	345449	25 %	25 %	50 %	0 %	241203088
8039	NC_012850	CTTC	2	8	345457	345464	0 %	50 %	0 %	50 %	241203088
8040	NC_012850	AAG	2	6	345491	345496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203088
8041	NC_012850	TCA	2	6	345504	345509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203088
8042	NC_012850	GGC	2	6	345547	345552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203088
8043	NC_012850	CAA	2	6	345565	345570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203088
8044	NC_012850	CGC	2	6	345661	345666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203089
8045	NC_012850	CAT	2	6	345672	345677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203089
8046	NC_012850	CGTG	2	8	345737	345744	0 %	25 %	50 %	25 %	241203089
8047	NC_012850	CGG	2	6	345777	345782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203089
8048	NC_012850	CTG	2	6	345796	345801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203089
8049	NC_012850	GGC	2	6	345829	345834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203089
8050	NC_012850	CTG	2	6	345868	345873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203089
8051	NC_012850	CGG	2	6	345930	345935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203089
8052	NC_012850	GGT	2	6	346020	346025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203089
8053	NC_012850	CGG	2	6	346038	346043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203089
8054	NC_012850	AGC	2	6	346139	346144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203089
8055	NC_012850	CGC	2	6	346149	346154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203089
8056	NC_012850	T	7	7	346186	346192	0 %	100 %	0 %	0 %	241203089
8057	NC_012850	GAT	2	6	346225	346230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203090
8058	NC_012850	TCT	2	6	346593	346598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203090
8059	NC_012850	CT	3	6	346633	346638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_012850	TGA	2	6	346760	346765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_012850	GAAT	2	8	346808	346815	50 %	25 %	25 %	0 %	241203091
8062	NC_012850	TGA	2	6	346874	346879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203091
8063	NC_012850	CAA	2	6	346938	346943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203091
8064	NC_012850	CCT	2	6	347174	347179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203091
8065	NC_012850	AGG	2	6	347186	347191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203091
8066	NC_012850	CG	4	8	347259	347266	0 %	0 %	50 %	50 %	241203091
8067	NC_012850	ACCG	2	8	347316	347323	25 %	0 %	25 %	50 %	241203091
8068	NC_012850	ACC	2	6	347350	347355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203091
8069	NC_012850	GCG	2	6	347365	347370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203091
8070	NC_012850	TCG	2	6	347387	347392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8071	NC_012850	CCG	2	6	347441	347446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203091
8072	NC_012850	CTC	2	6	347452	347457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203091
8073	NC_012850	CGA	2	6	347466	347471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8074	NC_012850	CGCT	2	8	347494	347501	0 %	25 %	25 %	50 %	241203091
8075	NC_012850	CAG	2	6	347521	347526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
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8077	NC_012850	CAG	2	6	347620	347625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8078	NC_012850	CAG	2	6	347692	347697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8079	NC_012850	GCA	2	6	347700	347705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8080	NC_012850	CGA	2	6	347723	347728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8081	NC_012850	GGC	2	6	347751	347756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203091
8082	NC_012850	CGG	2	6	347766	347771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203091
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8084	NC_012850	GAC	2	6	347844	347849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
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8091	NC_012850	TCG	2	6	347987	347992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203091
8092	NC_012850	CGG	2	6	347996	348001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203091
8093	NC_012850	GCG	2	6	348020	348025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203091
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8099	NC_012850	CTT	2	6	348162	348167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203091
8100	NC_012850	GGT	2	6	348168	348173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203091
8101	NC_012850	GCGAC	2	10	348236	348245	20 %	0 %	40 %	40 %	241203091
8102	NC_012850	CGGC	2	8	348254	348261	0 %	0 %	50 %	50 %	241203091
8103	NC_012850	CGA	3	9	348372	348380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203091
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8105	NC_012850	CGC	2	6	348456	348461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203091
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8108	NC_012850	T	6	6	348524	348529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_012850	TGA	2	6	348674	348679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_012850	CCTC	2	8	348734	348741	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8111	NC_012850	GCG	2	6	349007	349012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203092
8112	NC_012850	TGA	2	6	349033	349038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203092
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8114	NC_012850	GTCTG	2	10	349084	349093	0 %	40 %	40 %	20 %	241203092
8115	NC_012850	TAC	2	6	349124	349129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203092
8116	NC_012850	GC	3	6	349136	349141	0 %	0 %	50 %	50 %	241203092
8117	NC_012850	TCC	2	6	349149	349154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203092
8118	NC_012850	ATGC	2	8	349264	349271	25 %	25 %	25 %	25 %	241203092
8119	NC_012850	GCC	2	6	349332	349337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203092
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8121	NC_012850	GCTT	2	8	349440	349447	0 %	50 %	25 %	25 %	241203092
8122	NC_012850	CTTC	2	8	349465	349472	0 %	50 %	0 %	50 %	241203092
8123	NC_012850	GCG	2	6	349476	349481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203092
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8126	NC_012850	GAT	2	6	349573	349578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203092
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8145	NC_012850	CG	3	6	350472	350477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8177	NC_012850	GCTTT	2	10	352033	352042	0 %	60 %	20 %	20 %	241203095
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8181	NC_012850	GCC	2	6	352280	352285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8182	NC_012850	GAG	2	6	352395	352400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8240	NC_012850	CGGAA	2	10	354293	354302	40 %	0 %	40 %	20 %	241203098
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8246	NC_012850	CGG	2	6	354577	354582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203098
8247	NC_012850	GC	4	8	354587	354594	0 %	0 %	50 %	50 %	241203098
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8353	NC_012850	T	6	6	359081	359086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8358	NC_012850	GCC	2	6	359208	359213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8364	NC_012850	GAG	2	6	359580	359585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203103
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8467	NC_012850	TCGT	2	8	363972	363979	0 %	50 %	25 %	25 %	241203110
8468	NC_012850	CGG	2	6	364045	364050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203110
8469	NC_012850	GCA	2	6	364072	364077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203110
8470	NC_012850	CG	3	6	364083	364088	0 %	0 %	50 %	50 %	241203110
8471	NC_012850	CAG	2	6	364091	364096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203110
8472	NC_012850	CGC	2	6	364113	364118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203110
8473	NC_012850	ACG	2	6	364130	364135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8479	NC_012850	TCG	2	6	364257	364262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203111
8480	NC_012850	AGG	2	6	364284	364289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203111
8481	NC_012850	AAG	3	9	364316	364324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203111
8482	NC_012850	GC	3	6	364340	364345	0 %	0 %	50 %	50 %	241203111
8483	NC_012850	CAA	2	6	364360	364365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203111
8484	NC_012850	CGT	2	6	364366	364371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203111
8485	NC_012850	GCT	2	6	364438	364443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203111
8486	NC_012850	GCC	2	6	364453	364458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203111
8487	NC_012850	CAG	2	6	364523	364528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203111
8488	NC_012850	CG	3	6	364539	364544	0 %	0 %	50 %	50 %	241203111
8489	NC_012850	TCGC	2	8	364588	364595	0 %	25 %	25 %	50 %	241203111
8490	NC_012850	GCC	2	6	364663	364668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203112
8491	NC_012850	ATG	2	6	364669	364674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203112
8492	NC_012850	CAG	2	6	364699	364704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203112
8493	NC_012850	GACT	2	8	364710	364717	25 %	25 %	25 %	25 %	241203112
8494	NC_012850	CGC	2	6	364746	364751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203112
8495	NC_012850	ATC	2	6	364756	364761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203112
8496	NC_012850	CTG	2	6	364774	364779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203112
8497	NC_012850	TCA	2	6	364835	364840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203112
8498	NC_012850	CTC	2	6	364875	364880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203112
8499	NC_012850	TGTCGC	2	12	364904	364915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203112
8500	NC_012850	GCT	2	6	364980	364985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203112

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