MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012850	CGG	2	6	302350	302355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203046
7002	NC_012850	ATCG	2	8	302384	302391	25 %	25 %	25 %	25 %	241203046
7003	NC_012850	CTCAAT	2	12	302396	302407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203046
7004	NC_012850	CGT	2	6	302413	302418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203046
7005	NC_012850	GTC	2	6	302477	302482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203046
7006	NC_012850	TTGC	2	8	302639	302646	0 %	50 %	25 %	25 %	241203046
7007	NC_012850	GGA	2	6	302656	302661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203046
7008	NC_012850	AGG	2	6	302679	302684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203046
7009	NC_012850	ATC	2	6	302723	302728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203046
7010	NC_012850	TCG	2	6	302769	302774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203046
7011	NC_012850	GAG	2	6	302799	302804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203046
7012	NC_012850	CAG	2	6	302821	302826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7013	NC_012850	GGT	2	6	302853	302858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203047
7014	NC_012850	CTG	2	6	302886	302891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7015	NC_012850	GGCG	2	8	302910	302917	0 %	0 %	75 %	25 %	241203047
7016	NC_012850	CCG	2	6	302918	302923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203047
7017	NC_012850	TCG	2	6	302924	302929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7018	NC_012850	TTGCG	2	10	302966	302975	0 %	40 %	40 %	20 %	241203047
7019	NC_012850	ACG	2	6	302987	302992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7020	NC_012850	CGG	2	6	303060	303065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203047
7021	NC_012850	CGGC	2	8	303067	303074	0 %	0 %	50 %	50 %	241203047
7022	NC_012850	ATG	2	6	303154	303159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203047
7023	NC_012850	TCT	2	6	303179	303184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203047
7024	NC_012850	CG	3	6	303191	303196	0 %	0 %	50 %	50 %	241203047
7025	NC_012850	GTC	2	6	303203	303208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7026	NC_012850	GAT	2	6	303210	303215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203047
7027	NC_012850	GGC	2	6	303309	303314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203047
7028	NC_012850	GCC	2	6	303340	303345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203047
7029	NC_012850	CAC	2	6	303355	303360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203047
7030	NC_012850	TGG	3	9	303407	303415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203047
7031	NC_012850	CCTCG	2	10	303513	303522	0 %	20 %	20 %	60 %	241203047
7032	NC_012850	TGA	2	6	303536	303541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203047
7033	NC_012850	CTG	2	6	303576	303581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203047
7034	NC_012850	TTC	2	6	303586	303591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_012850	GC	3	6	303607	303612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_012850	CTG	2	6	303672	303677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_012850	GGA	2	6	303711	303716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_012850	TGA	2	6	303721	303726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203048
7039	NC_012850	CG	3	6	303731	303736	0 %	0 %	50 %	50 %	241203048
7040	NC_012850	GCG	2	6	303864	303869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203048
7041	NC_012850	GCC	2	6	303887	303892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203048
7042	NC_012850	TGC	2	6	303907	303912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7043	NC_012850	AGC	2	6	303928	303933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7044	NC_012850	TGC	2	6	303946	303951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7045	NC_012850	GCGTT	2	10	304033	304042	0 %	40 %	40 %	20 %	241203048
7046	NC_012850	GCC	2	6	304047	304052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203048
7047	NC_012850	GTC	3	9	304056	304064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7048	NC_012850	TGC	2	6	304075	304080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7049	NC_012850	TGCG	2	8	304107	304114	0 %	25 %	50 %	25 %	241203048
7050	NC_012850	GGC	2	6	304253	304258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203048
7051	NC_012850	ATC	2	6	304275	304280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203048
7052	NC_012850	CGT	2	6	304319	304324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7053	NC_012850	GCG	3	9	304357	304365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203048
7054	NC_012850	CCG	2	6	304468	304473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203048
7055	NC_012850	TGC	2	6	304531	304536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203048
7056	NC_012850	CG	3	6	304548	304553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_012850	GGA	2	6	304558	304563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_012850	TGC	2	6	304632	304637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203049
7059	NC_012850	GC	3	6	304639	304644	0 %	0 %	50 %	50 %	241203049
7060	NC_012850	TCG	2	6	304682	304687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203049
7061	NC_012850	GCT	2	6	304710	304715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203049
7062	NC_012850	CGC	2	6	304755	304760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203049
7063	NC_012850	TGC	2	6	304823	304828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203049
7064	NC_012850	TCT	2	6	304869	304874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203049
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7066	NC_012850	GCT	2	6	304958	304963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203049
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7069	NC_012850	GCAT	2	8	305150	305157	25 %	25 %	25 %	25 %	241203049
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7072	NC_012850	AAG	2	6	305218	305223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203049
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7080	NC_012850	CAG	2	6	305554	305559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203049
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7091	NC_012850	CGT	2	6	305948	305953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203050
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7106	NC_012850	CG	3	6	306326	306331	0 %	0 %	50 %	50 %	241203050
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7120	NC_012850	GC	3	6	306937	306942	0 %	0 %	50 %	50 %	241203051
7121	NC_012850	GAC	2	6	306949	306954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203051
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7126	NC_012850	ATC	2	6	307163	307168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203051
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7151	NC_012850	GGA	2	6	308424	308429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7152	NC_012850	GCT	2	6	308512	308517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203053
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7241	NC_012850	GGT	2	6	312176	312181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203056
7242	NC_012850	CGC	3	9	312311	312319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203056
7243	NC_012850	CGA	2	6	312378	312383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203056
7244	NC_012850	CAA	2	6	312402	312407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203056
7245	NC_012850	CCT	2	6	312437	312442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203056
7246	NC_012850	GAC	2	6	312532	312537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203056
7247	NC_012850	CGC	2	6	312542	312547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203056
7248	NC_012850	GC	3	6	312546	312551	0 %	0 %	50 %	50 %	241203056
7249	NC_012850	TC	3	6	312588	312593	0 %	50 %	0 %	50 %	241203056
7250	NC_012850	GAC	2	6	312710	312715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
7251	NC_012850	GAA	2	6	312739	312744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203057
7252	NC_012850	CGG	2	6	312767	312772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203057
7253	NC_012850	CAG	2	6	312815	312820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
7254	NC_012850	AAG	2	6	312866	312871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203057
7255	NC_012850	TGA	2	6	312940	312945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203057
7256	NC_012850	GGC	2	6	312971	312976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203057
7257	NC_012850	CGA	3	9	313006	313014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
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7260	NC_012850	GAAA	2	8	313094	313101	75 %	0 %	25 %	0 %	241203057
7261	NC_012850	GCC	2	6	313179	313184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203057
7262	NC_012850	CGC	2	6	313222	313227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203057
7263	NC_012850	CGC	2	6	313241	313246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203057
7264	NC_012850	GAA	2	6	313355	313360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203057
7265	NC_012850	CTG	2	6	313413	313418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203057
7266	NC_012850	AGC	2	6	313449	313454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
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7268	NC_012850	A	7	7	313579	313585	100 %	0 %	0 %	0 %	241203057
7269	NC_012850	GCA	2	6	313605	313610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
7270	NC_012850	TGC	2	6	313613	313618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203057
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7272	NC_012850	CA	3	6	313655	313660	50 %	0 %	0 %	50 %	241203057
7273	NC_012850	GCC	2	6	313665	313670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203057
7274	NC_012850	ATT	2	6	313706	313711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203057
7275	NC_012850	CCTG	2	8	313747	313754	0 %	25 %	25 %	50 %	241203058
7276	NC_012850	CAT	2	6	313842	313847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203058
7277	NC_012850	AGG	2	6	313879	313884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203058
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7280	NC_012850	CAC	2	6	313962	313967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203058
7281	NC_012850	ACGA	2	8	313969	313976	50 %	0 %	25 %	25 %	241203058
7282	NC_012850	GAT	2	6	313983	313988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203058
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7300	NC_012850	GCGACG	2	12	314692	314703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241203058
7301	NC_012850	GCG	2	6	314780	314785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203058
7302	NC_012850	AGCA	2	8	314824	314831	50 %	0 %	25 %	25 %	241203058
7303	NC_012850	CCT	2	6	314900	314905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203058
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7307	NC_012850	ACC	2	6	315105	315110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7308	NC_012850	GCG	2	6	315143	315148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203059
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7318	NC_012850	CGA	2	6	315633	315638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203059
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7323	NC_012850	TC	3	6	315940	315945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7324	NC_012850	ACCG	2	8	315993	316000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7325	NC_012850	CCG	2	6	316046	316051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7326	NC_012850	GACA	2	8	316086	316093	50 %	0 %	25 %	25 %	241203060
7327	NC_012850	CTCG	2	8	316131	316138	0 %	25 %	25 %	50 %	241203060
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7337	NC_012850	TCGA	2	8	316399	316406	25 %	25 %	25 %	25 %	241203060
7338	NC_012850	CGT	2	6	316503	316508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203060
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7347	NC_012850	GAA	2	6	316698	316703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203060
7348	NC_012850	GATCC	2	10	316726	316735	20 %	20 %	20 %	40 %	241203060
7349	NC_012850	GAT	2	6	316752	316757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203060
7350	NC_012850	AGA	2	6	316769	316774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203060
7351	NC_012850	GAA	2	6	316779	316784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203060
7352	NC_012850	GGC	2	6	316785	316790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203060
7353	NC_012850	TCA	2	6	316832	316837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203060
7354	NC_012850	GAA	2	6	316854	316859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203060
7355	NC_012850	GGC	2	6	316866	316871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203060
7356	NC_012850	GGC	2	6	316876	316881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203060
7357	NC_012850	AT	3	6	316929	316934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7358	NC_012850	GC	3	6	316951	316956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7359	NC_012850	CG	3	6	317022	317027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7360	NC_012850	CGCC	2	8	317055	317062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7361	NC_012850	CTT	2	6	317087	317092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203061
7362	NC_012850	GC	3	6	317108	317113	0 %	0 %	50 %	50 %	241203061
7363	NC_012850	CTT	3	9	317120	317128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203061
7364	NC_012850	CTT	2	6	317138	317143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203061
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7484	NC_012850	TGA	2	6	321899	321904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203067
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7487	NC_012850	AGC	2	6	322006	322011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203067
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