MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012850	CGA	2	6	280228	280233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6502	NC_012850	CGG	2	6	280302	280307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6503	NC_012850	TCGCCG	2	12	280404	280415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203021
6504	NC_012850	GCT	2	6	280426	280431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6505	NC_012850	CGG	2	6	280501	280506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6506	NC_012850	TGC	2	6	280518	280523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6507	NC_012850	TCC	2	6	280547	280552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203021
6508	NC_012850	GCA	2	6	280606	280611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6509	NC_012850	CGG	2	6	280629	280634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6510	NC_012850	CGT	2	6	280745	280750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203022
6511	NC_012850	ACGAT	2	10	280756	280765	40 %	20 %	20 %	20 %	241203022
6512	NC_012850	GC	3	6	280796	280801	0 %	0 %	50 %	50 %	241203022
6513	NC_012850	CGG	2	6	280856	280861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203022
6514	NC_012850	CAC	2	6	280913	280918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203022
6515	NC_012850	GAA	2	6	280920	280925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203022
6516	NC_012850	GGC	2	6	280926	280931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203022
6517	NC_012850	CGG	2	6	280968	280973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203022
6518	NC_012850	TCG	2	6	281025	281030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203022
6519	NC_012850	CGTCGA	2	12	281206	281217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203023
6520	NC_012850	CGT	2	6	281371	281376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203023
6521	NC_012850	GAG	2	6	281381	281386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203023
6522	NC_012850	GCC	2	6	281406	281411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203023
6523	NC_012850	GAA	2	6	281426	281431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203023
6524	NC_012850	GAT	2	6	281438	281443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203023
6525	NC_012850	ATC	2	6	281456	281461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
6526	NC_012850	CAT	2	6	281480	281485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
6527	NC_012850	GCA	2	6	281486	281491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203023
6528	NC_012850	CGA	2	6	281535	281540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203023
6529	NC_012850	ATC	2	6	281604	281609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
6530	NC_012850	GGCC	2	8	281611	281618	0 %	0 %	50 %	50 %	241203023
6531	NC_012850	ACT	2	6	281632	281637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
6532	NC_012850	GC	4	8	281749	281756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_012850	GAA	2	6	281780	281785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_012850	AGA	2	6	281803	281808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203024
6535	NC_012850	ATC	2	6	281888	281893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203024
6536	NC_012850	AAGT	2	8	282008	282015	50 %	25 %	25 %	0 %	241203024
6537	NC_012850	CGA	2	6	282175	282180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203025
6538	NC_012850	GAA	2	6	282187	282192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203025
6539	NC_012850	GCC	2	6	282245	282250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203025
6540	NC_012850	GCC	2	6	282254	282259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203025
6541	NC_012850	GGT	2	6	282310	282315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203025
6542	NC_012850	CGA	2	6	282355	282360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203025
6543	NC_012850	AGA	2	6	282450	282455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203025
6544	NC_012850	TCG	2	6	282456	282461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203025
6545	NC_012850	TC	3	6	282484	282489	0 %	50 %	0 %	50 %	241203025
6546	NC_012850	TCGAGA	2	12	282495	282506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241203025
6547	NC_012850	AGGC	2	8	282537	282544	25 %	0 %	50 %	25 %	241203025
6548	NC_012850	AGA	2	6	282582	282587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203025
6549	NC_012850	TGG	2	6	282588	282593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203025
6550	NC_012850	GC	3	6	282713	282718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_012850	GGAC	2	8	282815	282822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_012850	GCC	2	6	282848	282853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203026
6553	NC_012850	TC	3	6	282955	282960	0 %	50 %	0 %	50 %	241203026
6554	NC_012850	GCTG	2	8	282963	282970	0 %	25 %	50 %	25 %	241203026
6555	NC_012850	CGA	2	6	282997	283002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203026
6556	NC_012850	GAA	2	6	283028	283033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203026
6557	NC_012850	CCGC	2	8	283046	283053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6558	NC_012850	A	6	6	283101	283106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_012850	CGCT	2	8	283151	283158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_012850	AGC	2	6	283242	283247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_012850	CAC	2	6	283291	283296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_012850	T	7	7	283321	283327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_012850	GC	3	6	283343	283348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_012850	ATT	2	6	283402	283407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_012850	GCC	2	6	283467	283472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_012850	GC	3	6	283502	283507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_012850	ATC	2	6	283515	283520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_012850	TCA	2	6	283596	283601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_012850	CGA	2	6	283603	283608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_012850	GGCC	2	8	283636	283643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_012850	ACC	2	6	283673	283678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_012850	TGC	2	6	283722	283727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203027
6573	NC_012850	GAC	2	6	283736	283741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203027
6574	NC_012850	CG	3	6	283768	283773	0 %	0 %	50 %	50 %	241203027
6575	NC_012850	CGT	2	6	283822	283827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203027
6576	NC_012850	GCTG	2	8	283897	283904	0 %	25 %	50 %	25 %	241203027
6577	NC_012850	AGG	2	6	283956	283961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203027
6578	NC_012850	GC	3	6	283992	283997	0 %	0 %	50 %	50 %	241203027
6579	NC_012850	GGC	2	6	284043	284048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_012850	TGT	2	6	284051	284056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_012850	TGC	2	6	284066	284071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_012850	CG	3	6	284132	284137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_012850	CAA	2	6	284163	284168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_012850	CT	3	6	284172	284177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6585	NC_012850	GCC	2	6	284231	284236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203028
6586	NC_012850	CTT	2	6	284260	284265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203028
6587	NC_012850	TCC	2	6	284282	284287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203028
6588	NC_012850	GTC	3	9	284437	284445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203028
6589	NC_012850	GAG	2	6	284504	284509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203029
6590	NC_012850	GCT	2	6	284534	284539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6591	NC_012850	TCG	2	6	284629	284634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6592	NC_012850	ATAC	2	8	284683	284690	50 %	25 %	0 %	25 %	241203029
6593	NC_012850	CGC	2	6	284718	284723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203029
6594	NC_012850	AGG	2	6	284736	284741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203029
6595	NC_012850	AGA	2	6	284829	284834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203029
6596	NC_012850	CGA	2	6	284836	284841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6597	NC_012850	TG	3	6	284873	284878	0 %	50 %	50 %	0 %	241203029
6598	NC_012850	GTC	2	6	284939	284944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6599	NC_012850	GA	3	6	285079	285084	50 %	0 %	50 %	0 %	241203029
6600	NC_012850	CTG	2	6	285104	285109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6601	NC_012850	CTT	3	9	285153	285161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203029
6602	NC_012850	TGC	2	6	285233	285238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6603	NC_012850	GC	3	6	285244	285249	0 %	0 %	50 %	50 %	241203029
6604	NC_012850	CGA	2	6	285256	285261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6605	NC_012850	TGC	2	6	285389	285394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6606	NC_012850	CGC	2	6	285424	285429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203029
6607	NC_012850	GGCG	2	8	285448	285455	0 %	0 %	75 %	25 %	241203029
6608	NC_012850	CTTC	2	8	285459	285466	0 %	50 %	0 %	50 %	241203029
6609	NC_012850	TCG	2	6	285519	285524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6610	NC_012850	GCCC	2	8	285541	285548	0 %	0 %	25 %	75 %	241203029
6611	NC_012850	GCG	2	6	285667	285672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203029
6612	NC_012850	GACC	2	8	285677	285684	25 %	0 %	25 %	50 %	241203029
6613	NC_012850	CGA	2	6	285697	285702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6614	NC_012850	ACA	2	6	285735	285740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203029
6615	NC_012850	G	7	7	285765	285771	0 %	0 %	100 %	0 %	241203029
6616	NC_012850	CTG	2	6	285851	285856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
6617	NC_012850	CGCT	2	8	285977	285984	0 %	25 %	25 %	50 %	241203030
6618	NC_012850	ATG	2	6	286016	286021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203030
6619	NC_012850	TTG	2	6	286028	286033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203030
6620	NC_012850	ACG	2	6	286070	286075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203030
6621	NC_012850	TCG	2	6	286154	286159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203030
6622	NC_012850	GCC	2	6	286187	286192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203030
6623	NC_012850	CGT	2	6	286287	286292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203030
6624	NC_012850	GCG	2	6	286310	286315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203030
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6627	NC_012850	CCG	2	6	286373	286378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203030
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6728	NC_012850	ATC	3	9	290916	290924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203034
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6734	NC_012850	TGC	2	6	291116	291121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203034
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6742	NC_012850	CGG	2	6	291626	291631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6743	NC_012850	CGTT	2	8	291634	291641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6744	NC_012850	CCGT	2	8	291689	291696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6989	NC_012850	GCA	2	6	301921	301926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203045
6990	NC_012850	GCCG	2	8	301930	301937	0 %	0 %	50 %	50 %	241203045
6991	NC_012850	TC	3	6	302002	302007	0 %	50 %	0 %	50 %	241203045
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