MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012849	GCC	2	6	23833	23838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_012849	CGGT	2	8	23844	23851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_012849	CAC	2	6	23863	23868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_012849	TCG	2	6	23901	23906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012849	GCG	2	6	24003	24008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012849	CGG	2	6	24012	24017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012849	GCG	2	6	24101	24106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012849	GGC	2	6	24118	24123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_012849	GC	3	6	24122	24127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_012849	GGC	2	6	24163	24168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012849	GGT	2	6	24264	24269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012849	AC	3	6	24428	24433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_012849	TGG	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012849	GGC	2	6	24500	24505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_012849	CCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_012849	GC	3	6	24652	24657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_012849	AGT	2	6	24728	24733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012849	GCA	2	6	24752	24757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012849	GAACC	2	10	24808	24817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
520	NC_012849	GCTG	2	8	25076	25083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_012849	CGCC	2	8	25124	25131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
522	NC_012849	GT	3	6	25211	25216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012849	TGG	2	6	25253	25258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012849	TCA	2	6	25268	25273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012849	AGA	2	6	25278	25283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012849	GGC	2	6	25308	25313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_012849	TGG	2	6	25406	25411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012849	GC	4	8	25431	25438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_012849	ATG	2	6	25471	25476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012849	CAG	2	6	25491	25496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_012849	TCG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012849	CG	3	6	25611	25616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_012849	TCA	2	6	25672	25677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012849	CTGC	2	8	25811	25818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_012849	GAA	2	6	25833	25838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012849	GC	3	6	25842	25847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_012849	CG	3	6	25899	25904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_012849	CCA	2	6	26003	26008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_012849	CGA	2	6	26117	26122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012849	ATCA	2	8	26148	26155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_012849	GGT	2	6	26185	26190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012849	GCACC	2	10	26249	26258	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
543	NC_012849	GC	3	6	26261	26266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_012849	CAA	2	6	26273	26278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012849	AGC	2	6	26287	26292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012849	CGG	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012849	TGG	2	6	26396	26401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012849	GAA	2	6	26417	26422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012849	GC	3	6	26442	26447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_012849	GGC	2	6	26476	26481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012849	GC	3	6	26496	26501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_012849	GCG	2	6	26505	26510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012849	AGA	2	6	26591	26596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012849	GCC	2	6	26621	26626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_012849	GT	3	6	26627	26632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012849	ACGTG	2	10	26648	26657	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_012849	CGA	2	6	26722	26727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012849	CCG	2	6	26736	26741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_012849	CGA	2	6	26749	26754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012849	GCT	2	6	26766	26771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114122
561	NC_012849	GCC	2	6	26935	26940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114122
562	NC_012849	GT	3	6	26970	26975	0 %	50 %	50 %	0 %	241114122
563	NC_012849	CAG	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114122
564	NC_012849	TTG	2	6	27056	27061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114122
565	NC_012849	ATG	2	6	27086	27091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114122
566	NC_012849	GCT	2	6	27138	27143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114122
567	NC_012849	CAT	2	6	27190	27195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114122
568	NC_012849	TGA	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114122
569	NC_012849	CGG	2	6	27231	27236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114122
570	NC_012849	CTG	2	6	27250	27255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114122
571	NC_012849	ATCC	2	8	27256	27263	25 %	25 %	0 %	50 %	241114122
572	NC_012849	TCG	2	6	27264	27269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114122
573	NC_012849	GCTCAT	2	12	27286	27297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241114122
574	NC_012849	CTCA	2	8	27304	27311	25 %	25 %	0 %	50 %	241114123
575	NC_012849	AG	3	6	27313	27318	50 %	0 %	50 %	0 %	241114123
576	NC_012849	GCG	2	6	27349	27354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114123
577	NC_012849	GT	3	6	27361	27366	0 %	50 %	50 %	0 %	241114123
578	NC_012849	ACG	2	6	27423	27428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114123
579	NC_012849	GGC	2	6	27469	27474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114123
580	NC_012849	CGC	2	6	27484	27489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114123
581	NC_012849	TGG	2	6	27520	27525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114123
582	NC_012849	CGG	2	6	27538	27543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114123
583	NC_012849	GGACG	2	10	27556	27565	20 %	0 %	60 %	20 %	241114123
584	NC_012849	CGG	2	6	27648	27653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114124
585	NC_012849	ACC	2	6	27755	27760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114124
586	NC_012849	CGG	2	6	27829	27834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114124
587	NC_012849	GCC	2	6	27853	27858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114124
588	NC_012849	TG	3	6	27877	27882	0 %	50 %	50 %	0 %	241114124
589	NC_012849	ATG	2	6	27884	27889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114124
590	NC_012849	CCT	2	6	27892	27897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_012849	AAT	2	6	27901	27906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012849	TA	3	6	27909	27914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012849	CTGT	2	8	27924	27931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_012849	AGC	2	6	27945	27950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_012849	CGGA	2	8	28037	28044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
596	NC_012849	GGC	2	6	28060	28065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114125
597	NC_012849	CAT	2	6	28168	28173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114125
598	NC_012849	GCG	2	6	28176	28181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114125
599	NC_012849	A	6	6	28184	28189	100 %	0 %	0 %	0 %	241114125
600	NC_012849	TCG	2	6	28242	28247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114125
601	NC_012849	ACC	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114125
602	NC_012849	GCT	2	6	28463	28468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114125
603	NC_012849	GGGC	2	8	28486	28493	0 %	0 %	75 %	25 %	241114125
604	NC_012849	GTC	2	6	28502	28507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114125
605	NC_012849	GCC	2	6	28568	28573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114125
606	NC_012849	CGCTG	2	10	28606	28615	0 %	20 %	40 %	40 %	241114125
607	NC_012849	GAGC	2	8	28624	28631	25 %	0 %	50 %	25 %	241114125
608	NC_012849	CAAGC	2	10	28644	28653	40 %	0 %	20 %	40 %	241114126
609	NC_012849	ACA	2	6	28718	28723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114126
610	NC_012849	GAA	2	6	28806	28811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114126
611	NC_012849	CAG	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114126
612	NC_012849	AAG	2	6	29011	29016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114126
613	NC_012849	ACG	2	6	29127	29132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012849	CCG	2	6	29203	29208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114127
615	NC_012849	T	6	6	29315	29320	0 %	100 %	0 %	0 %	241114127
616	NC_012849	CGC	2	6	29448	29453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_012849	GC	3	6	29456	29461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_012849	AAG	2	6	29470	29475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012849	CAC	2	6	29497	29502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114128
620	NC_012849	TCG	2	6	29545	29550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114128
621	NC_012849	GCCG	2	8	29566	29573	0 %	0 %	50 %	50 %	241114128
622	NC_012849	GC	3	6	29600	29605	0 %	0 %	50 %	50 %	241114128
623	NC_012849	CGT	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114128
624	NC_012849	CGC	3	9	29682	29690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114128
625	NC_012849	GCG	2	6	29710	29715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114129
626	NC_012849	CAG	2	6	29718	29723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114129
627	NC_012849	TAC	2	6	29798	29803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114129
628	NC_012849	CAA	2	6	29813	29818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114129
629	NC_012849	CGC	2	6	30010	30015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114130
630	NC_012849	TCG	2	6	30018	30023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
631	NC_012849	GCC	2	6	30056	30061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114130
632	NC_012849	CAT	2	6	30079	30084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114130
633	NC_012849	GAGAGC	2	12	30110	30121	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241114130
634	NC_012849	CAC	2	6	30133	30138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114130
635	NC_012849	TGC	2	6	30220	30225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
636	NC_012849	GCT	2	6	30232	30237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
637	NC_012849	TGC	2	6	30330	30335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
638	NC_012849	CAC	2	6	30383	30388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114130
639	NC_012849	GAT	2	6	30394	30399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114130
640	NC_012849	GTC	2	6	30401	30406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
641	NC_012849	TGCG	2	8	30444	30451	0 %	25 %	50 %	25 %	241114130
642	NC_012849	GCCC	2	8	30468	30475	0 %	0 %	25 %	75 %	241114130
643	NC_012849	CTG	2	6	30485	30490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
644	NC_012849	GGA	2	6	30491	30496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114130
645	NC_012849	CGT	2	6	30567	30572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114130
646	NC_012849	CCT	2	6	30642	30647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114130
647	NC_012849	TGG	2	6	30684	30689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114130
648	NC_012849	GGC	2	6	30692	30697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114130
649	NC_012849	G	7	7	30733	30739	0 %	0 %	100 %	0 %	241114130
650	NC_012849	CTT	2	6	30743	30748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114130
651	NC_012849	CCGA	2	8	30767	30774	25 %	0 %	25 %	50 %	241114130
652	NC_012849	CAT	2	6	30811	30816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114130
653	NC_012849	CCG	2	6	30876	30881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114130
654	NC_012849	TGGGAA	2	12	30934	30945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241114130
655	NC_012849	TC	3	6	30988	30993	0 %	50 %	0 %	50 %	241114130
656	NC_012849	CCT	2	6	31015	31020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114130
657	NC_012849	CTGC	2	8	31054	31061	0 %	25 %	25 %	50 %	241114130
658	NC_012849	GAT	2	6	31066	31071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114130
659	NC_012849	GGGT	2	8	31103	31110	0 %	25 %	75 %	0 %	241114130
660	NC_012849	TC	3	6	31128	31133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
661	NC_012849	GTGCT	2	10	31193	31202	0 %	40 %	40 %	20 %	241114131
662	NC_012849	TGA	2	6	31215	31220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114131
663	NC_012849	CGG	2	6	31280	31285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114131
664	NC_012849	CATG	2	8	31302	31309	25 %	25 %	25 %	25 %	241114131
665	NC_012849	AAC	2	6	31423	31428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114131
666	NC_012849	CTC	2	6	31479	31484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114132
667	NC_012849	CGC	3	9	31503	31511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114132
668	NC_012849	GAC	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114132
669	NC_012849	GTC	2	6	31582	31587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114132
670	NC_012849	TC	3	6	31715	31720	0 %	50 %	0 %	50 %	241114132
671	NC_012849	TGA	2	6	31778	31783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
672	NC_012849	AGTTG	2	10	31793	31802	20 %	40 %	40 %	0 %	241114132
673	NC_012849	TGC	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114132
674	NC_012849	GC	4	8	31834	31841	0 %	0 %	50 %	50 %	241114132
675	NC_012849	CCAG	2	8	31844	31851	25 %	0 %	25 %	50 %	241114132
676	NC_012849	CCA	2	6	31904	31909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114132
677	NC_012849	GAT	2	6	31974	31979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
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680	NC_012849	CCG	2	6	32208	32213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
681	NC_012849	AACT	2	8	32270	32277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
682	NC_012849	CG	3	6	32329	32334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
683	NC_012849	C	6	6	32344	32349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
684	NC_012849	AGC	2	6	32350	32355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_012849	TTG	2	6	32379	32384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
686	NC_012849	ATG	2	6	32533	32538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114133
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689	NC_012849	GCG	2	6	32634	32639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114133
690	NC_012849	GTG	2	6	32643	32648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114133
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692	NC_012849	GC	3	6	32793	32798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
693	NC_012849	GC	4	8	32803	32810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
694	NC_012849	CG	3	6	32850	32855	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
695	NC_012849	GCC	2	6	32890	32895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
696	NC_012849	GTC	2	6	32901	32906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
697	NC_012849	CTCGCG	2	12	32934	32945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241114134
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700	NC_012849	TGC	3	9	32998	33006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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705	NC_012849	GGC	2	6	33201	33206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
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711	NC_012849	GCAG	2	8	33437	33444	25 %	0 %	50 %	25 %	241114134
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714	NC_012849	GCC	3	9	33483	33491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
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719	NC_012849	CATC	2	8	33763	33770	25 %	25 %	0 %	50 %	241114134
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723	NC_012849	GCC	2	6	33825	33830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
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732	NC_012849	GCT	2	6	34007	34012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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749	NC_012849	GCTGAG	2	12	34679	34690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241114135
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751	NC_012849	CG	4	8	34720	34727	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
752	NC_012849	GCCG	2	8	34769	34776	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
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759	NC_012849	CAG	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114135
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763	NC_012849	GAC	2	6	35315	35320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114135
764	NC_012849	TCG	2	6	35387	35392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
765	NC_012849	TGC	2	6	35420	35425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
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767	NC_012849	GGT	2	6	35736	35741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114136
768	NC_012849	CG	3	6	35768	35773	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
769	NC_012849	AAGGC	2	10	35798	35807	40 %	0 %	40 %	20 %	241114136
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783	NC_012849	AAG	2	6	36346	36351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114136
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833	NC_012849	CGG	2	6	38439	38444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114136
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