MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012848	GAT	2	6	116624	116629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113103
2502	NC_012848	AGG	2	6	116667	116672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113103
2503	NC_012848	GGA	2	6	116677	116682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113103
2504	NC_012848	CGC	2	6	116704	116709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113103
2505	NC_012848	CCA	2	6	116729	116734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113103
2506	NC_012848	GCC	2	6	116780	116785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113103
2507	NC_012848	TCG	2	6	116874	116879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113103
2508	NC_012848	GAC	2	6	116882	116887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113103
2509	NC_012848	GAT	2	6	116971	116976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113103
2510	NC_012848	ATGG	2	8	117002	117009	25 %	25 %	50 %	0 %	241113103
2511	NC_012848	TCC	2	6	117036	117041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113103
2512	NC_012848	ACC	2	6	117115	117120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113103
2513	NC_012848	ATG	2	6	117225	117230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113103
2514	NC_012848	TCCG	2	8	117323	117330	0 %	25 %	25 %	50 %	241113103
2515	NC_012848	TTG	2	6	117408	117413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113103
2516	NC_012848	CTT	2	6	117422	117427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113103
2517	NC_012848	GTC	2	6	117486	117491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113103
2518	NC_012848	TTG	2	6	117537	117542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113103
2519	NC_012848	GCCG	2	8	117566	117573	0 %	0 %	50 %	50 %	241113103
2520	NC_012848	GCA	2	6	117615	117620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113103
2521	NC_012848	AGG	2	6	117793	117798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113103
2522	NC_012848	TCG	2	6	117938	117943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113104
2523	NC_012848	TCA	2	6	117956	117961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113104
2524	NC_012848	GGC	2	6	117966	117971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113104
2525	NC_012848	AGC	2	6	118054	118059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113104
2526	NC_012848	GCG	2	6	118114	118119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113104
2527	NC_012848	GGCA	2	8	118126	118133	25 %	0 %	50 %	25 %	241113104
2528	NC_012848	GAT	2	6	118158	118163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113104
2529	NC_012848	TGC	2	6	118188	118193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113104
2530	NC_012848	GAA	2	6	118221	118226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113104
2531	NC_012848	GCG	2	6	118331	118336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113104
2532	NC_012848	ATC	2	6	118357	118362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113104
2533	NC_012848	AGC	3	9	118378	118386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113104
2534	NC_012848	TGA	2	6	118466	118471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113104
2535	NC_012848	ATG	2	6	118477	118482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113104
2536	NC_012848	GAA	2	6	118491	118496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113104
2537	NC_012848	GGC	2	6	118558	118563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113104
2538	NC_012848	CCG	3	9	118586	118594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113104
2539	NC_012848	AGG	2	6	118604	118609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113104
2540	NC_012848	GAT	2	6	118702	118707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113104
2541	NC_012848	GGTC	2	8	118736	118743	0 %	25 %	50 %	25 %	241113104
2542	NC_012848	CTG	2	6	118748	118753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113104
2543	NC_012848	CCT	2	6	118765	118770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113105
2544	NC_012848	GAC	2	6	118802	118807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2545	NC_012848	CAG	3	9	118820	118828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2546	NC_012848	CGC	2	6	118841	118846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113105
2547	NC_012848	GAG	2	6	118965	118970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113105
2548	NC_012848	AGAACG	2	12	118980	118991	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113105
2549	NC_012848	TCG	2	6	118999	119004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2550	NC_012848	CGGC	2	8	119046	119053	0 %	0 %	50 %	50 %	241113105
2551	NC_012848	GC	3	6	119063	119068	0 %	0 %	50 %	50 %	241113105
2552	NC_012848	GA	3	6	119086	119091	50 %	0 %	50 %	0 %	241113105
2553	NC_012848	CGA	2	6	119152	119157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2554	NC_012848	CCAG	2	8	119188	119195	25 %	0 %	25 %	50 %	241113105
2555	NC_012848	GAA	2	6	119249	119254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113105
2556	NC_012848	TGG	2	6	119278	119283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113105
2557	NC_012848	GAT	2	6	119300	119305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113105
2558	NC_012848	AGA	2	6	119317	119322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113105
2559	NC_012848	TCT	2	6	119350	119355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113105
2560	NC_012848	CAG	3	9	119372	119380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2561	NC_012848	ATC	2	6	119385	119390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113105
2562	NC_012848	TCA	2	6	119407	119412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113105
2563	NC_012848	AGA	2	6	119446	119451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113105
2564	NC_012848	AGT	2	6	119476	119481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113105
2565	NC_012848	GAC	2	6	119543	119548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113105
2566	NC_012848	CG	3	6	119620	119625	0 %	0 %	50 %	50 %	241113105
2567	NC_012848	TCC	2	6	119658	119663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_012848	TGA	2	6	119686	119691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_012848	TCGA	2	8	119705	119712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_012848	TCGA	2	8	119720	119727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2571	NC_012848	GGA	2	6	119739	119744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_012848	CGGC	2	8	119790	119797	0 %	0 %	50 %	50 %	241113106
2573	NC_012848	TGA	2	6	119823	119828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113106
2574	NC_012848	CGT	2	6	119842	119847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2575	NC_012848	TTG	2	6	119957	119962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113106
2576	NC_012848	CTG	2	6	119995	120000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2577	NC_012848	TCG	2	6	120006	120011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2578	NC_012848	AGT	2	6	120018	120023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113106
2579	NC_012848	CGC	2	6	120034	120039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113106
2580	NC_012848	GCTCTT	2	12	120049	120060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113106
2581	NC_012848	GTC	2	6	120133	120138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2582	NC_012848	GCTG	2	8	120162	120169	0 %	25 %	50 %	25 %	241113106
2583	NC_012848	CCAG	2	8	120171	120178	25 %	0 %	25 %	50 %	241113106
2584	NC_012848	CAT	2	6	120190	120195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113106
2585	NC_012848	TGTT	2	8	120230	120237	0 %	75 %	25 %	0 %	241113106
2586	NC_012848	GAAT	2	8	120295	120302	50 %	25 %	25 %	0 %	241113106
2587	NC_012848	GCC	2	6	120424	120429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113106
2588	NC_012848	CTT	2	6	120532	120537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113106
2589	NC_012848	TGAAGG	2	12	120561	120572	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113106
2590	NC_012848	GCC	2	6	120586	120591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113106
2591	NC_012848	GCA	2	6	120624	120629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2592	NC_012848	TCG	2	6	120632	120637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2593	NC_012848	CGC	2	6	120699	120704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113106
2594	NC_012848	CGAGGC	2	12	120705	120716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113106
2595	NC_012848	AAAT	2	8	120728	120735	75 %	25 %	0 %	0 %	241113106
2596	NC_012848	CAG	2	6	120756	120761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2597	NC_012848	TCG	2	6	120785	120790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2598	NC_012848	GC	3	6	120794	120799	0 %	0 %	50 %	50 %	241113106
2599	NC_012848	GCA	2	6	120872	120877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113106
2600	NC_012848	TTG	2	6	120878	120883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113106
2601	NC_012848	TCC	2	6	121005	121010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_012848	TTG	2	6	121030	121035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_012848	ATG	2	6	121063	121068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_012848	GAT	3	9	121110	121118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113107
2605	NC_012848	GCC	2	6	121240	121245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113107
2606	NC_012848	TGC	2	6	121290	121295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113107
2607	NC_012848	TCA	2	6	121402	121407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113107
2608	NC_012848	GGC	2	6	121428	121433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113107
2609	NC_012848	GC	3	6	121441	121446	0 %	0 %	50 %	50 %	241113107
2610	NC_012848	GTT	2	6	121525	121530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113107
2611	NC_012848	CGC	2	6	121566	121571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113107
2612	NC_012848	CT	3	6	121648	121653	0 %	50 %	0 %	50 %	241113107
2613	NC_012848	GGT	2	6	121748	121753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113108
2614	NC_012848	TCG	3	9	121771	121779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2615	NC_012848	GA	3	6	121815	121820	50 %	0 %	50 %	0 %	241113108
2616	NC_012848	AGT	2	6	121826	121831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113108
2617	NC_012848	CGA	2	6	121835	121840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2618	NC_012848	TCG	2	6	121867	121872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2619	NC_012848	CGC	2	6	121888	121893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113108
2620	NC_012848	ATG	2	6	121897	121902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113108
2621	NC_012848	GCG	2	6	121916	121921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113108
2622	NC_012848	GAA	2	6	121982	121987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113108
2623	NC_012848	TCG	2	6	122002	122007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2624	NC_012848	CGGC	2	8	122018	122025	0 %	0 %	50 %	50 %	241113108
2625	NC_012848	CGCCA	2	10	122040	122049	20 %	0 %	20 %	60 %	241113108
2626	NC_012848	ATCTCC	2	12	122074	122085	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241113108
2627	NC_012848	GGCG	2	8	122177	122184	0 %	0 %	75 %	25 %	241113108
2628	NC_012848	GC	3	6	122185	122190	0 %	0 %	50 %	50 %	241113108
2629	NC_012848	TCG	2	6	122197	122202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2630	NC_012848	CGG	2	6	122231	122236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113108
2631	NC_012848	TGAAGA	2	12	122240	122251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113108
2632	NC_012848	CGC	2	6	122269	122274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113108
2633	NC_012848	TCA	2	6	122378	122383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113108
2634	NC_012848	GCC	2	6	122424	122429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113108
2635	NC_012848	GAT	2	6	122451	122456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113108
2636	NC_012848	GGCGA	2	10	122470	122479	20 %	0 %	60 %	20 %	241113108
2637	NC_012848	CCG	3	9	122554	122562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113108
2638	NC_012848	CCTTGC	2	12	122576	122587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113108
2639	NC_012848	GCC	2	6	122653	122658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113108
2640	NC_012848	GCA	2	6	122669	122674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113108
2641	NC_012848	CTT	2	6	122709	122714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113108
2642	NC_012848	TCC	2	6	122729	122734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2643	NC_012848	GAC	2	6	122797	122802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113109
2644	NC_012848	GCCG	2	8	122843	122850	0 %	0 %	50 %	50 %	241113109
2645	NC_012848	TTC	2	6	122875	122880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113109
2646	NC_012848	GAC	2	6	122893	122898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113109
2647	NC_012848	GAG	3	9	122954	122962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113109
2648	NC_012848	TGCC	2	8	122968	122975	0 %	25 %	25 %	50 %	241113109
2649	NC_012848	GCCA	2	8	122983	122990	25 %	0 %	25 %	50 %	241113109
2650	NC_012848	GCC	2	6	123027	123032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113109
2651	NC_012848	TCGG	2	8	123041	123048	0 %	25 %	50 %	25 %	241113109
2652	NC_012848	TCG	2	6	123261	123266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113109
2653	NC_012848	CGCA	2	8	123301	123308	25 %	0 %	25 %	50 %	241113109
2654	NC_012848	TGA	2	6	123318	123323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113109
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2667	NC_012848	CCG	2	6	123938	123943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113109
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2669	NC_012848	CAGGG	2	10	124007	124016	20 %	0 %	60 %	20 %	241113109
2670	NC_012848	GC	3	6	124139	124144	0 %	0 %	50 %	50 %	241113109
2671	NC_012848	CGA	2	6	124245	124250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113109
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2675	NC_012848	CGG	2	6	124588	124593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113109
2676	NC_012848	GCA	2	6	124643	124648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113110
2677	NC_012848	ATCG	2	8	124659	124666	25 %	25 %	25 %	25 %	241113110
2678	NC_012848	GGC	2	6	124692	124697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113110
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2681	NC_012848	TGC	2	6	124777	124782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113110
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2684	NC_012848	GTG	4	12	124858	124869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113110
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2686	NC_012848	ACC	2	6	124996	125001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113110
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2688	NC_012848	ATG	2	6	125152	125157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113110
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2692	NC_012848	CGA	2	6	125426	125431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113110
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2695	NC_012848	CGA	2	6	125579	125584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113110
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2702	NC_012848	TGA	2	6	125769	125774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113111
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2719	NC_012848	CAG	2	6	126340	126345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113111
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2722	NC_012848	GA	3	6	126500	126505	50 %	0 %	50 %	0 %	241113111
2723	NC_012848	GCC	2	6	126511	126516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113111
2724	NC_012848	TGA	3	9	126519	126527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113111
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2726	NC_012848	TGA	2	6	126633	126638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113111
2727	NC_012848	TCA	2	6	126669	126674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113111
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2730	NC_012848	CCT	2	6	126875	126880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113112
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2732	NC_012848	GCC	2	6	126926	126931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113112
2733	NC_012848	CGGCT	2	10	126976	126985	0 %	20 %	40 %	40 %	241113112
2734	NC_012848	TCA	2	6	127013	127018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113112
2735	NC_012848	GAC	2	6	127032	127037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113112
2736	NC_012848	CTG	2	6	127041	127046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113112
2737	NC_012848	GCC	2	6	127050	127055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113112
2738	NC_012848	GA	3	6	127099	127104	50 %	0 %	50 %	0 %	241113112
2739	NC_012848	C	6	6	127139	127144	0 %	0 %	0 %	100 %	241113112
2740	NC_012848	CGG	2	6	127264	127269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113112
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2763	NC_012848	GCT	2	6	128654	128659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113113
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2862	NC_012848	TCT	2	6	132966	132971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113117
2863	NC_012848	CGC	2	6	133000	133005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2864	NC_012848	GCG	2	6	133020	133025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113117
2865	NC_012848	TCA	2	6	133038	133043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113117
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2881	NC_012848	CTC	2	6	133605	133610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2938	NC_012848	CAG	2	6	136454	136459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2975	NC_012848	ACG	2	6	138134	138139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2979	NC_012848	TCGT	2	8	138294	138301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2982	NC_012848	GCG	2	6	138396	138401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2985	NC_012848	GCC	2	6	138480	138485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2986	NC_012848	ATG	2	6	138556	138561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113122
2987	NC_012848	GCCG	2	8	138597	138604	0 %	0 %	50 %	50 %	241113122
2988	NC_012848	TGC	2	6	138729	138734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113122
2989	NC_012848	GGC	2	6	138825	138830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113122
2990	NC_012848	GTG	2	6	138887	138892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113122
2991	NC_012848	GCC	2	6	138949	138954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113122
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