MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012848	CGCC	2	8	725703	725710	0 %	0 %	25 %	75 %	241113650
16002	NC_012848	GCA	2	6	725717	725722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113650
16003	NC_012848	GCC	2	6	725746	725751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113650
16004	NC_012848	CGA	2	6	725835	725840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113650
16005	NC_012848	GCA	2	6	725856	725861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113650
16006	NC_012848	TTG	2	6	725873	725878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113650
16007	NC_012848	CTT	2	6	725920	725925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113650
16008	NC_012848	GTT	2	6	725980	725985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113650
16009	NC_012848	CGGA	2	8	725988	725995	25 %	0 %	50 %	25 %	241113650
16010	NC_012848	GCG	2	6	726062	726067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113650
16011	NC_012848	GTT	2	6	726076	726081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113650
16012	NC_012848	GCA	2	6	726152	726157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113650
16013	NC_012848	CTT	2	6	726163	726168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113650
16014	NC_012848	TTG	2	6	726224	726229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113650
16015	NC_012848	CGG	2	6	726312	726317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113650
16016	NC_012848	GAT	2	6	726373	726378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113650
16017	NC_012848	TCA	2	6	726381	726386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113650
16018	NC_012848	CGG	2	6	726432	726437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113650
16019	NC_012848	TC	4	8	726471	726478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_012848	CGT	2	6	726552	726557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_012848	CGG	2	6	726596	726601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113651
16022	NC_012848	GAT	2	6	726682	726687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113651
16023	NC_012848	GCC	2	6	726754	726759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113651
16024	NC_012848	GCGCC	2	10	726765	726774	0 %	0 %	40 %	60 %	241113651
16025	NC_012848	TGCC	2	8	726816	726823	0 %	25 %	25 %	50 %	241113651
16026	NC_012848	CGG	2	6	726831	726836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113651
16027	NC_012848	GAG	2	6	726848	726853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113651
16028	NC_012848	GAT	2	6	726901	726906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113651
16029	NC_012848	GA	3	6	726932	726937	50 %	0 %	50 %	0 %	241113651
16030	NC_012848	GCA	2	6	726941	726946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113651
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16032	NC_012848	TTG	2	6	727121	727126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113651
16033	NC_012848	TCA	2	6	727143	727148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113651
16034	NC_012848	CGAG	2	8	727182	727189	25 %	0 %	50 %	25 %	241113651
16035	NC_012848	CGA	2	6	727191	727196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113651
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16037	NC_012848	TGA	2	6	727266	727271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113651
16038	NC_012848	CGA	2	6	727272	727277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113651
16039	NC_012848	CGG	2	6	727288	727293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113651
16040	NC_012848	CCGA	2	8	727376	727383	25 %	0 %	25 %	50 %	241113651
16041	NC_012848	GCC	2	6	727393	727398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113651
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16044	NC_012848	GAT	2	6	727516	727521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113651
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16046	NC_012848	GGCCC	2	10	727540	727549	0 %	0 %	40 %	60 %	241113651
16047	NC_012848	TGAC	2	8	727623	727630	25 %	25 %	25 %	25 %	241113651
16048	NC_012848	GGC	2	6	727682	727687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113652
16049	NC_012848	GAT	2	6	727751	727756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113652
16050	NC_012848	CATT	2	8	727776	727783	25 %	50 %	0 %	25 %	241113652
16051	NC_012848	GC	3	6	727824	727829	0 %	0 %	50 %	50 %	241113652
16052	NC_012848	TCA	2	6	727887	727892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113652
16053	NC_012848	GAC	2	6	727934	727939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16054	NC_012848	CTG	2	6	727943	727948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16055	NC_012848	GCC	2	6	727952	727957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113652
16056	NC_012848	GAGC	2	8	727961	727968	25 %	0 %	50 %	25 %	241113652
16057	NC_012848	CCG	2	6	728006	728011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113652
16058	NC_012848	GCACGA	2	12	728149	728160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16059	NC_012848	GTCCT	2	10	728201	728210	0 %	40 %	20 %	40 %	241113652
16060	NC_012848	GC	3	6	728235	728240	0 %	0 %	50 %	50 %	241113652
16061	NC_012848	GCCCC	2	10	728275	728284	0 %	0 %	20 %	80 %	241113652
16062	NC_012848	GCAC	2	8	728316	728323	25 %	0 %	25 %	50 %	241113652
16063	NC_012848	GA	3	6	728327	728332	50 %	0 %	50 %	0 %	241113652
16064	NC_012848	AGC	2	6	728354	728359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16065	NC_012848	TCC	2	6	728421	728426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113652
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16067	NC_012848	GAT	2	6	728569	728574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113652
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16069	NC_012848	CGA	2	6	728719	728724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16070	NC_012848	CTG	3	9	728726	728734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113652
16071	NC_012848	CG	3	6	728755	728760	0 %	0 %	50 %	50 %	241113652
16072	NC_012848	CTC	2	6	728813	728818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113652
16073	NC_012848	CGA	2	6	728830	728835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
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16076	NC_012848	TCA	2	6	729025	729030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113652
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16087	NC_012848	TGGT	2	8	729368	729375	0 %	50 %	50 %	0 %	241113653
16088	NC_012848	ACC	2	6	729452	729457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113653
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16090	NC_012848	TCG	2	6	729555	729560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113653
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16102	NC_012848	TGC	2	6	729826	729831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113653
16103	NC_012848	GAT	3	9	729901	729909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_012848	GGC	2	6	729914	729919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_012848	CGG	2	6	729951	729956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_012848	CCT	2	6	730002	730007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_012848	CAA	2	6	730008	730013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_012848	CGG	2	6	730017	730022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_012848	TCC	2	6	730028	730033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_012848	GTTA	2	8	730090	730097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_012848	TA	3	6	730113	730118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_012848	TCA	2	6	730183	730188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_012848	GCAGC	2	10	730193	730202	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16114	NC_012848	CCAT	2	8	730260	730267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16115	NC_012848	GCC	2	6	730324	730329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_012848	C	6	6	730328	730333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16117	NC_012848	GC	3	6	730346	730351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16118	NC_012848	A	7	7	730383	730389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_012848	CGAG	2	8	730443	730450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16120	NC_012848	GC	3	6	730469	730474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16121	NC_012848	GCG	2	6	730494	730499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_012848	CAT	2	6	730544	730549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_012848	AG	3	6	730553	730558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_012848	GGA	2	6	730570	730575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_012848	CGC	2	6	730605	730610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16126	NC_012848	TGG	2	6	730622	730627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_012848	AGA	2	6	730656	730661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113654
16128	NC_012848	TCA	2	6	730662	730667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113654
16129	NC_012848	TCA	2	6	730692	730697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113654
16130	NC_012848	GCC	2	6	730722	730727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113654
16131	NC_012848	TCG	2	6	730911	730916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16132	NC_012848	CG	4	8	730960	730967	0 %	0 %	50 %	50 %	241113654
16133	NC_012848	ACG	2	6	730973	730978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16134	NC_012848	CGG	2	6	730993	730998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113654
16135	NC_012848	ACCGGC	2	12	731027	731038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113654
16136	NC_012848	CAG	2	6	731051	731056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16137	NC_012848	TCT	2	6	731095	731100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113654
16138	NC_012848	GCACT	2	10	731117	731126	20 %	20 %	20 %	40 %	241113654
16139	NC_012848	ATG	2	6	731220	731225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113654
16140	NC_012848	CGT	2	6	731227	731232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16141	NC_012848	ATC	2	6	731279	731284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113654
16142	NC_012848	GGC	2	6	731320	731325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113654
16143	NC_012848	CTT	2	6	731339	731344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113654
16144	NC_012848	TGA	2	6	731382	731387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113654
16145	NC_012848	GCG	2	6	731412	731417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113654
16146	NC_012848	CTGC	2	8	731427	731434	0 %	25 %	25 %	50 %	241113654
16147	NC_012848	CGA	2	6	731436	731441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16148	NC_012848	GC	3	6	731464	731469	0 %	0 %	50 %	50 %	241113654
16149	NC_012848	CGC	2	6	731602	731607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113654
16150	NC_012848	AGGC	2	8	731622	731629	25 %	0 %	50 %	25 %	241113654
16151	NC_012848	TGCA	2	8	731640	731647	25 %	25 %	25 %	25 %	241113654
16152	NC_012848	ACC	2	6	731706	731711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113654
16153	NC_012848	GGCG	2	8	731725	731732	0 %	0 %	75 %	25 %	241113654
16154	NC_012848	GC	4	8	731759	731766	0 %	0 %	50 %	50 %	241113654
16155	NC_012848	CTG	2	6	731807	731812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16156	NC_012848	GAA	2	6	731879	731884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113654
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16158	NC_012848	CGC	2	6	731969	731974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113654
16159	NC_012848	GAG	2	6	731975	731980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113654
16160	NC_012848	CGGC	2	8	731988	731995	0 %	0 %	50 %	50 %	241113654
16161	NC_012848	GAT	2	6	732001	732006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113654
16162	NC_012848	ATTGC	2	10	732045	732054	20 %	40 %	20 %	20 %	241113654
16163	NC_012848	CGC	2	6	732066	732071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113654
16164	NC_012848	GCCGCA	2	12	732182	732193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113654
16165	NC_012848	ACG	2	6	732194	732199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113654
16166	NC_012848	GC	3	6	732210	732215	0 %	0 %	50 %	50 %	241113654
16167	NC_012848	GCA	2	6	732225	732230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16168	NC_012848	CATGA	2	10	732244	732253	40 %	20 %	20 %	20 %	241113655
16169	NC_012848	CCGAAC	2	12	732254	732265	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113655
16170	NC_012848	CGG	2	6	732285	732290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113655
16171	NC_012848	TGC	2	6	732321	732326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113655
16172	NC_012848	TCG	2	6	732382	732387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113655
16173	NC_012848	GGC	2	6	732409	732414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113655
16174	NC_012848	TGC	2	6	732476	732481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113655
16175	NC_012848	CGC	2	6	732486	732491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113655
16176	NC_012848	ATC	2	6	732499	732504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113655
16177	NC_012848	GGA	2	6	732537	732542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113655
16178	NC_012848	ATC	2	6	732584	732589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113655
16179	NC_012848	CGG	2	6	732591	732596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113655
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16181	NC_012848	AC	3	6	732671	732676	50 %	0 %	0 %	50 %	241113655
16182	NC_012848	CGA	2	6	732705	732710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113655
16183	NC_012848	CGCC	2	8	732711	732718	0 %	0 %	25 %	75 %	241113655
16184	NC_012848	CAGCG	2	10	732738	732747	20 %	0 %	40 %	40 %	241113655
16185	NC_012848	GCCG	2	8	732777	732784	0 %	0 %	50 %	50 %	241113655
16186	NC_012848	CAT	2	6	732903	732908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113655
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16191	NC_012848	CGC	2	6	733113	733118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113655
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16193	NC_012848	ACG	2	6	733187	733192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113655
16194	NC_012848	TGC	2	6	733193	733198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113655
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16202	NC_012848	GCG	2	6	733427	733432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113655
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16205	NC_012848	TCG	2	6	733628	733633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113655
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16210	NC_012848	GCC	2	6	733767	733772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16211	NC_012848	TCA	2	6	733894	733899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113656
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16220	NC_012848	GAT	2	6	734348	734353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113656
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16225	NC_012848	GCA	2	6	734724	734729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16226	NC_012848	CGG	2	6	734738	734743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16227	NC_012848	CGC	2	6	734747	734752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16228	NC_012848	TGA	2	6	734774	734779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113657
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16230	NC_012848	CGTG	2	8	734802	734809	0 %	25 %	50 %	25 %	241113657
16231	NC_012848	GGT	2	6	734830	734835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113657
16232	NC_012848	CGC	2	6	734857	734862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113657
16233	NC_012848	CGT	2	6	734919	734924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113657
16234	NC_012848	TCG	2	6	734948	734953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113657
16235	NC_012848	GT	3	6	734955	734960	0 %	50 %	50 %	0 %	241113657
16236	NC_012848	GC	3	6	735045	735050	0 %	0 %	50 %	50 %	241113657
16237	NC_012848	GCCGGC	2	12	735061	735072	0 %	0 %	50 %	50 %	241113657
16238	NC_012848	GCG	2	6	735095	735100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113657
16239	NC_012848	CCG	3	9	735140	735148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113657
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16241	NC_012848	GAA	2	6	735174	735179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113657
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16480	NC_012848	CCT	2	6	745948	745953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16481	NC_012848	GTC	2	6	745979	745984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113669
16482	NC_012848	GTG	2	6	746084	746089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113669
16483	NC_012848	ACG	2	6	746108	746113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113669
16484	NC_012848	AGA	2	6	746129	746134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113669
16485	NC_012848	CGG	2	6	746148	746153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113669
16486	NC_012848	CAGC	2	8	746160	746167	25 %	0 %	25 %	50 %	241113669
16487	NC_012848	A	6	6	746222	746227	100 %	0 %	0 %	0 %	241113669
16488	NC_012848	GGC	2	6	746245	746250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113669
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16491	NC_012848	GC	3	6	746392	746397	0 %	0 %	50 %	50 %	241113669
16492	NC_012848	TCC	2	6	746423	746428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113669
16493	NC_012848	GA	3	6	746462	746467	50 %	0 %	50 %	0 %	241113669
16494	NC_012848	AAGGAT	2	12	746482	746493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113669
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16496	NC_012848	TCT	2	6	746601	746606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113669
16497	NC_012848	CTT	2	6	746629	746634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113669
16498	NC_012848	TCCC	2	8	746692	746699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16499	NC_012848	ATG	2	6	746763	746768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16500	NC_012848	GC	3	6	746820	746825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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