MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012848	CGA	2	6	655101	655106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113576
14502	NC_012848	GCT	2	6	655131	655136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113576
14503	NC_012848	CG	3	6	655213	655218	0 %	0 %	50 %	50 %	241113576
14504	NC_012848	CG	3	6	655251	655256	0 %	0 %	50 %	50 %	241113576
14505	NC_012848	CGT	2	6	655333	655338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113576
14506	NC_012848	TCG	2	6	655344	655349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113576
14507	NC_012848	CGA	2	6	655365	655370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_012848	GCCG	2	8	655405	655412	0 %	0 %	50 %	50 %	241113577
14509	NC_012848	ACC	2	6	655436	655441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113577
14510	NC_012848	TGCGT	3	15	655507	655521	0 %	40 %	40 %	20 %	241113577
14511	NC_012848	CGG	2	6	655578	655583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14512	NC_012848	CAG	2	6	655642	655647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14513	NC_012848	GGC	2	6	655729	655734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14514	NC_012848	CCA	2	6	655773	655778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113577
14515	NC_012848	GGC	2	6	655810	655815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14516	NC_012848	AGA	2	6	655838	655843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113577
14517	NC_012848	GGA	2	6	655894	655899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113577
14518	NC_012848	GGC	2	6	655921	655926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14519	NC_012848	ACG	2	6	655940	655945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14520	NC_012848	CAT	2	6	655981	655986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113577
14521	NC_012848	TTGCC	2	10	655992	656001	0 %	40 %	20 %	40 %	241113577
14522	NC_012848	TCATC	2	10	656034	656043	20 %	40 %	0 %	40 %	241113577
14523	NC_012848	CCT	2	6	656058	656063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113577
14524	NC_012848	GCCG	2	8	656122	656129	0 %	0 %	50 %	50 %	241113577
14525	NC_012848	CTTG	2	8	656142	656149	0 %	50 %	25 %	25 %	241113577
14526	NC_012848	GC	3	6	656210	656215	0 %	0 %	50 %	50 %	241113577
14527	NC_012848	GGC	3	9	656227	656235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14528	NC_012848	CGT	2	6	656242	656247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14529	NC_012848	CGAT	2	8	656300	656307	25 %	25 %	25 %	25 %	241113577
14530	NC_012848	CTC	2	6	656326	656331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113577
14531	NC_012848	GGC	2	6	656332	656337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14532	NC_012848	CCT	2	6	656406	656411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113577
14533	NC_012848	GCG	2	6	656428	656433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14534	NC_012848	TCG	2	6	656468	656473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14535	NC_012848	CCA	2	6	656586	656591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113577
14536	NC_012848	GCA	2	6	656618	656623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14537	NC_012848	GGC	2	6	656656	656661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14538	NC_012848	CTC	2	6	656668	656673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113577
14539	NC_012848	GCT	2	6	656748	656753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14540	NC_012848	GAT	2	6	656800	656805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113577
14541	NC_012848	TCA	2	6	656814	656819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113577
14542	NC_012848	GGT	2	6	656890	656895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113577
14543	NC_012848	CGG	2	6	656909	656914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14544	NC_012848	TCG	2	6	656915	656920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14545	NC_012848	CCA	2	6	657009	657014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113577
14546	NC_012848	GGC	3	9	657023	657031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113577
14547	NC_012848	GAC	2	6	657061	657066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14548	NC_012848	CTG	2	6	657112	657117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113577
14549	NC_012848	CAATC	2	10	657118	657127	40 %	20 %	0 %	40 %	241113577
14550	NC_012848	CTG	2	6	657141	657146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_012848	AAT	2	6	657209	657214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_012848	TAT	2	6	657254	657259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_012848	ATT	2	6	657286	657291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_012848	CAT	2	6	657340	657345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_012848	TGC	2	6	657374	657379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_012848	CA	3	6	657381	657386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14557	NC_012848	TGC	2	6	657418	657423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_012848	TCG	2	6	657424	657429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_012848	CGC	2	6	657698	657703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113578
14560	NC_012848	GTGC	2	8	657739	657746	0 %	25 %	50 %	25 %	241113578
14561	NC_012848	GCT	2	6	657747	657752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113578
14562	NC_012848	GAT	2	6	657762	657767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113578
14563	NC_012848	CAA	2	6	657791	657796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113578
14564	NC_012848	TCCATC	2	12	657808	657819	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241113578
14565	NC_012848	GCG	2	6	658129	658134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113579
14566	NC_012848	AGG	2	6	658139	658144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113579
14567	NC_012848	CGA	2	6	658336	658341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14568	NC_012848	GGC	2	6	658362	658367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113579
14569	NC_012848	TGA	2	6	658495	658500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113579
14570	NC_012848	ATCG	2	8	658504	658511	25 %	25 %	25 %	25 %	241113579
14571	NC_012848	TTGC	2	8	658538	658545	0 %	50 %	25 %	25 %	241113579
14572	NC_012848	GCC	2	6	658580	658585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113579
14573	NC_012848	TGC	2	6	658600	658605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14574	NC_012848	TCG	2	6	658735	658740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14575	NC_012848	CGT	2	6	658748	658753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14576	NC_012848	GCGG	2	8	658835	658842	0 %	0 %	75 %	25 %	241113579
14577	NC_012848	CAG	2	6	658856	658861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14578	NC_012848	GACC	2	8	658876	658883	25 %	0 %	25 %	50 %	241113579
14579	NC_012848	GCCG	2	8	658906	658913	0 %	0 %	50 %	50 %	241113579
14580	NC_012848	GTC	2	6	658929	658934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14581	NC_012848	TGT	2	6	658954	658959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113579
14582	NC_012848	GAT	2	6	658964	658969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113579
14583	NC_012848	CGA	2	6	658993	658998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14584	NC_012848	CCG	2	6	659007	659012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113579
14585	NC_012848	TGGA	2	8	659043	659050	25 %	25 %	50 %	0 %	241113579
14586	NC_012848	CCG	2	6	659061	659066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113579
14587	NC_012848	GCG	2	6	659097	659102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113579
14588	NC_012848	CAG	2	6	659141	659146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113579
14589	NC_012848	GCG	2	6	659201	659206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113580
14590	NC_012848	CTC	2	6	659230	659235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113580
14591	NC_012848	GCT	2	6	659266	659271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14592	NC_012848	GCC	2	6	659272	659277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113580
14593	NC_012848	GTC	2	6	659281	659286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14594	NC_012848	TTG	2	6	659309	659314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113580
14595	NC_012848	AGC	2	6	659324	659329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14596	NC_012848	CCT	2	6	659337	659342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113580
14597	NC_012848	TCG	2	6	659354	659359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14598	NC_012848	GCC	2	6	659366	659371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113580
14599	NC_012848	CGT	2	6	659388	659393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14600	NC_012848	TCA	2	6	659430	659435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113580
14601	NC_012848	CGG	2	6	659489	659494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113580
14602	NC_012848	GAG	2	6	659522	659527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113580
14603	NC_012848	ACG	2	6	659561	659566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113580
14604	NC_012848	CCAG	2	8	659577	659584	25 %	0 %	25 %	50 %	241113580
14605	NC_012848	CCG	2	6	659651	659656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113580
14606	NC_012848	GGT	2	6	659758	659763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113580
14607	NC_012848	AGGA	2	8	659765	659772	50 %	0 %	50 %	0 %	241113580
14608	NC_012848	GGC	2	6	659901	659906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113580
14609	NC_012848	GAA	2	6	659907	659912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113580
14610	NC_012848	GC	3	6	660023	660028	0 %	0 %	50 %	50 %	241113580
14611	NC_012848	AAC	2	6	660041	660046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113580
14612	NC_012848	AC	3	6	660045	660050	50 %	0 %	0 %	50 %	241113580
14613	NC_012848	TGG	2	6	660172	660177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_012848	CGC	2	6	660192	660197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14615	NC_012848	GC	3	6	660294	660299	0 %	0 %	50 %	50 %	241113581
14616	NC_012848	CAG	2	6	660357	660362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113581
14617	NC_012848	TCG	2	6	660457	660462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113581
14618	NC_012848	TGC	2	6	660467	660472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113581
14619	NC_012848	CGA	2	6	660473	660478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113581
14620	NC_012848	GAT	2	6	660492	660497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113581
14621	NC_012848	AAGC	2	8	660503	660510	50 %	0 %	25 %	25 %	241113581
14622	NC_012848	CGT	2	6	660543	660548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113581
14623	NC_012848	CAGGCT	2	12	660626	660637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113582
14624	NC_012848	CGA	2	6	660733	660738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113582
14625	NC_012848	TGC	2	6	660822	660827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113582
14626	NC_012848	GAC	3	9	660926	660934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113582
14627	NC_012848	CGA	2	6	660980	660985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113582
14628	NC_012848	GTCC	2	8	661058	661065	0 %	25 %	25 %	50 %	241113582
14629	NC_012848	TGA	2	6	661102	661107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113582
14630	NC_012848	CCG	2	6	661198	661203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113582
14631	NC_012848	GGCT	2	8	661221	661228	0 %	25 %	50 %	25 %	241113582
14632	NC_012848	CCG	2	6	661242	661247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113582
14633	NC_012848	CCG	2	6	661309	661314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113582
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14647	NC_012848	GA	3	6	661919	661924	50 %	0 %	50 %	0 %	241113583
14648	NC_012848	CTCG	2	8	662068	662075	0 %	25 %	25 %	50 %	241113583
14649	NC_012848	GAC	2	6	662077	662082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113583
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14685	NC_012848	CCGT	2	8	663456	663463	0 %	25 %	25 %	50 %	241113584
14686	NC_012848	CTG	2	6	663505	663510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113584
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14708	NC_012848	CG	3	6	664591	664596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14709	NC_012848	TCC	2	6	664717	664722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14710	NC_012848	CGT	2	6	664837	664842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
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14716	NC_012848	ATCGTC	2	12	665159	665170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113585
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14718	NC_012848	CTG	2	6	665210	665215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
14719	NC_012848	CGAC	2	8	665242	665249	25 %	0 %	25 %	50 %	241113585
14720	NC_012848	TCC	2	6	665301	665306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113585
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14722	NC_012848	CTG	2	6	665405	665410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
14723	NC_012848	CGCTG	2	10	665500	665509	0 %	20 %	40 %	40 %	241113585
14724	NC_012848	T	7	7	665525	665531	0 %	100 %	0 %	0 %	241113585
14725	NC_012848	AGGAT	2	10	665548	665557	40 %	20 %	40 %	0 %	241113585
14726	NC_012848	TAGGAA	2	12	665589	665600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113585
14727	NC_012848	GTC	2	6	665625	665630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113585
14728	NC_012848	TGA	2	6	665678	665683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14729	NC_012848	A	6	6	665718	665723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14730	NC_012848	ATC	2	6	665790	665795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14731	NC_012848	CGA	2	6	665807	665812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113586
14732	NC_012848	GGCC	2	8	665838	665845	0 %	0 %	50 %	50 %	241113586
14733	NC_012848	CGA	2	6	665858	665863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113586
14734	NC_012848	TCG	2	6	665881	665886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
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14736	NC_012848	GTC	2	6	665940	665945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113586
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14846	NC_012848	CG	3	6	671091	671096	0 %	0 %	50 %	50 %	241113589
14847	NC_012848	GC	3	6	671163	671168	0 %	0 %	50 %	50 %	241113589
14848	NC_012848	GC	4	8	671206	671213	0 %	0 %	50 %	50 %	241113589
14849	NC_012848	CGG	2	6	671258	671263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113589
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14852	NC_012848	CG	4	8	671425	671432	0 %	0 %	50 %	50 %	241113589
14853	NC_012848	CGC	2	6	671494	671499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113589
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14976	NC_012848	GCA	2	6	676973	676978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14977	NC_012848	ACGA	2	8	676990	676997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14978	NC_012848	A	6	6	677033	677038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14979	NC_012848	CAT	2	6	677124	677129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14980	NC_012848	TCC	2	6	677138	677143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14981	NC_012848	GCA	2	6	677200	677205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14982	NC_012848	CT	3	6	677275	677280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14983	NC_012848	CAC	2	6	677319	677324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14984	NC_012848	TCC	2	6	677367	677372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14985	NC_012848	A	6	6	677409	677414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14986	NC_012848	TCT	2	6	677457	677462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113597
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15000	NC_012848	CCCGCG	2	12	678249	678260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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