MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012848	GGC	2	6	566913	566918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
12502	NC_012848	AGC	2	6	566935	566940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12503	NC_012848	GCC	2	6	566976	566981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113497
12504	NC_012848	GAA	2	6	566982	566987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113497
12505	NC_012848	CGA	2	6	567005	567010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12506	NC_012848	GCG	2	6	567061	567066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
12507	NC_012848	CTT	2	6	567092	567097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113497
12508	NC_012848	ACGG	2	8	567202	567209	25 %	0 %	50 %	25 %	241113497
12509	NC_012848	TCTG	2	8	567242	567249	0 %	50 %	25 %	25 %	241113497
12510	NC_012848	TGT	2	6	567307	567312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113497
12511	NC_012848	GCT	2	6	567315	567320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12512	NC_012848	CGT	2	6	567329	567334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12513	NC_012848	ATC	2	6	567370	567375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113497
12514	NC_012848	CG	3	6	567447	567452	0 %	0 %	50 %	50 %	241113497
12515	NC_012848	AT	3	6	567467	567472	50 %	50 %	0 %	0 %	241113497
12516	NC_012848	CCG	2	6	567550	567555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113497
12517	NC_012848	ACCG	2	8	567585	567592	25 %	0 %	25 %	50 %	241113497
12518	NC_012848	CCG	2	6	567619	567624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113497
12519	NC_012848	CCGTCT	2	12	567628	567639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113497
12520	NC_012848	CGA	2	6	567751	567756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12521	NC_012848	CGCC	2	8	567770	567777	0 %	0 %	25 %	75 %	241113497
12522	NC_012848	CGA	2	6	567848	567853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12523	NC_012848	CGT	2	6	567864	567869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12524	NC_012848	ACG	2	6	567885	567890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12525	NC_012848	GTT	2	6	567939	567944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113497
12526	NC_012848	GGT	2	6	567983	567988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113497
12527	NC_012848	TGA	2	6	568103	568108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_012848	CTC	2	6	568110	568115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12529	NC_012848	GTC	2	6	568197	568202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_012848	GGC	2	6	568257	568262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_012848	CGCGC	2	10	568358	568367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12532	NC_012848	AG	3	6	568449	568454	50 %	0 %	50 %	0 %	241113498
12533	NC_012848	CGC	2	6	568539	568544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113498
12534	NC_012848	TGA	2	6	568596	568601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113498
12535	NC_012848	GTC	2	6	568615	568620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113498
12536	NC_012848	GAA	2	6	568624	568629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113498
12537	NC_012848	CGA	2	6	568770	568775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113499
12538	NC_012848	AAC	2	6	568793	568798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113499
12539	NC_012848	T	6	6	568858	568863	0 %	100 %	0 %	0 %	241113499
12540	NC_012848	CGG	2	6	568881	568886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113499
12541	NC_012848	GC	3	6	568938	568943	0 %	0 %	50 %	50 %	241113499
12542	NC_012848	CGGTGC	2	12	568960	568971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113499
12543	NC_012848	TGA	2	6	569026	569031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113499
12544	NC_012848	A	6	6	569038	569043	100 %	0 %	0 %	0 %	241113499
12545	NC_012848	CGA	2	6	569044	569049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113499
12546	NC_012848	TGG	2	6	569122	569127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113499
12547	NC_012848	ACCGT	2	10	569148	569157	20 %	20 %	20 %	40 %	241113499
12548	NC_012848	TCG	2	6	569199	569204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113499
12549	NC_012848	GCG	2	6	569211	569216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113499
12550	NC_012848	GCG	2	6	569244	569249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113499
12551	NC_012848	CAT	2	6	569306	569311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113499
12552	NC_012848	GAG	3	9	569327	569335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113499
12553	NC_012848	CGA	2	6	569353	569358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113499
12554	NC_012848	GGC	2	6	569376	569381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113499
12555	NC_012848	GC	3	6	569404	569409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_012848	CAA	2	6	569417	569422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_012848	ATG	2	6	569436	569441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_012848	CACG	2	8	569444	569451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_012848	CG	3	6	569551	569556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_012848	AGG	2	6	569572	569577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_012848	TTG	2	6	569578	569583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_012848	CTG	2	6	569593	569598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_012848	GCC	2	6	569607	569612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_012848	TTC	2	6	569679	569684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113500
12565	NC_012848	GC	3	6	569705	569710	0 %	0 %	50 %	50 %	241113500
12566	NC_012848	CTGG	2	8	569765	569772	0 %	25 %	50 %	25 %	241113500
12567	NC_012848	TCG	2	6	569964	569969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12568	NC_012848	CGA	2	6	570030	570035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12569	NC_012848	ATC	2	6	570068	570073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113500
12570	NC_012848	GGC	2	6	570101	570106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113500
12571	NC_012848	GAT	2	6	570118	570123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113500
12572	NC_012848	CGA	2	6	570259	570264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12573	NC_012848	GAG	2	6	570305	570310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113500
12574	NC_012848	TCG	2	6	570318	570323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12575	NC_012848	CTGCC	2	10	570372	570381	0 %	20 %	20 %	60 %	241113500
12576	NC_012848	CGA	2	6	570391	570396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12577	NC_012848	GT	3	6	570549	570554	0 %	50 %	50 %	0 %	241113500
12578	NC_012848	GTC	2	6	570566	570571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12579	NC_012848	CAA	2	6	570643	570648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113500
12580	NC_012848	GAA	2	6	570691	570696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113500
12581	NC_012848	CG	3	6	570713	570718	0 %	0 %	50 %	50 %	241113500
12582	NC_012848	CGA	2	6	570736	570741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113500
12583	NC_012848	TCA	2	6	570793	570798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_012848	GC	3	6	570818	570823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12585	NC_012848	CGGC	2	8	570831	570838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12586	NC_012848	GC	3	6	570883	570888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_012848	GAT	2	6	570953	570958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_012848	CAC	2	6	570971	570976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_012848	ACC	2	6	571033	571038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_012848	CGT	2	6	571044	571049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_012848	TTG	2	6	571113	571118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_012848	GCA	2	6	571126	571131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_012848	GTC	2	6	571143	571148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_012848	GCC	2	6	571173	571178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113501
12595	NC_012848	GCC	2	6	571225	571230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113501
12596	NC_012848	TGG	2	6	571253	571258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113501
12597	NC_012848	TCGG	2	8	571279	571286	0 %	25 %	50 %	25 %	241113501
12598	NC_012848	ATG	3	9	571363	571371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113501
12599	NC_012848	ATG	2	6	571375	571380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113501
12600	NC_012848	CGA	2	6	571412	571417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12601	NC_012848	GC	3	6	571420	571425	0 %	0 %	50 %	50 %	241113501
12602	NC_012848	TCA	2	6	571454	571459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113501
12603	NC_012848	G	6	6	571558	571563	0 %	0 %	100 %	0 %	241113501
12604	NC_012848	TCAAG	2	10	571638	571647	40 %	20 %	20 %	20 %	241113501
12605	NC_012848	CTG	2	6	571648	571653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12606	NC_012848	CGA	2	6	571683	571688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12607	NC_012848	GT	3	6	571689	571694	0 %	50 %	50 %	0 %	241113501
12608	NC_012848	CAG	2	6	571729	571734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12609	NC_012848	GTG	2	6	571789	571794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113501
12610	NC_012848	TCGC	2	8	571835	571842	0 %	25 %	25 %	50 %	241113501
12611	NC_012848	ACC	2	6	571858	571863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113501
12612	NC_012848	AAC	2	6	571871	571876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113501
12613	NC_012848	TCA	2	6	572035	572040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113501
12614	NC_012848	GGT	2	6	572052	572057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113501
12615	NC_012848	GCG	3	9	572059	572067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113501
12616	NC_012848	GAC	2	6	572097	572102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12617	NC_012848	GAG	2	6	572224	572229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113501
12618	NC_012848	CGA	2	6	572282	572287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
12619	NC_012848	CAAT	2	8	572336	572343	50 %	25 %	0 %	25 %	241113501
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12621	NC_012848	CAG	2	6	572398	572403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113501
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12978	NC_012848	TTC	2	6	587876	587881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113515
12979	NC_012848	CGA	2	6	587916	587921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113515
12980	NC_012848	CTGG	2	8	587929	587936	0 %	25 %	50 %	25 %	241113515
12981	NC_012848	AT	3	6	587980	587985	50 %	50 %	0 %	0 %	241113515
12982	NC_012848	GAT	2	6	587986	587991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113515
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12986	NC_012848	CAT	2	6	588115	588120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113515
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12991	NC_012848	GCC	2	6	588235	588240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113515
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