MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012848	ATA	2	6	544324	544329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113480
12002	NC_012848	CAT	2	6	544339	544344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113480
12003	NC_012848	CGA	2	6	544386	544391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113480
12004	NC_012848	TGT	2	6	544486	544491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113480
12005	NC_012848	CTG	2	6	544495	544500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
12006	NC_012848	CGGTCA	2	12	544530	544541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113480
12007	NC_012848	CGG	2	6	544548	544553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113480
12008	NC_012848	GGC	2	6	544558	544563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113480
12009	NC_012848	GTC	2	6	544569	544574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113480
12010	NC_012848	TCA	2	6	544590	544595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113480
12011	NC_012848	TCAG	2	8	544676	544683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12012	NC_012848	GCT	2	6	544830	544835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113481
12013	NC_012848	GAT	2	6	544837	544842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113481
12014	NC_012848	GTG	2	6	544848	544853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113481
12015	NC_012848	GC	3	6	544888	544893	0 %	0 %	50 %	50 %	241113481
12016	NC_012848	ACG	2	6	544904	544909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113481
12017	NC_012848	GCG	2	6	544910	544915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113481
12018	NC_012848	GA	3	6	544927	544932	50 %	0 %	50 %	0 %	241113481
12019	NC_012848	TCA	2	6	544962	544967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113481
12020	NC_012848	ATG	2	6	545017	545022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113481
12021	NC_012848	TGA	2	6	545142	545147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113481
12022	NC_012848	GTC	2	6	545170	545175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113481
12023	NC_012848	CGA	2	6	545220	545225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113481
12024	NC_012848	GATGTC	2	12	545245	545256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113481
12025	NC_012848	GCGAG	2	10	545259	545268	20 %	0 %	60 %	20 %	241113481
12026	NC_012848	GCCA	2	8	545336	545343	25 %	0 %	25 %	50 %	241113481
12027	NC_012848	CGG	2	6	545391	545396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113481
12028	NC_012848	TCGTAT	2	12	545453	545464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113481
12029	NC_012848	GC	3	6	545475	545480	0 %	0 %	50 %	50 %	241113481
12030	NC_012848	TGT	2	6	545568	545573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113481
12031	NC_012848	GCCC	2	8	545601	545608	0 %	0 %	25 %	75 %	241113481
12032	NC_012848	GGC	2	6	545696	545701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113481
12033	NC_012848	CGG	2	6	545740	545745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113481
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12037	NC_012848	GCG	2	6	545928	545933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113481
12038	NC_012848	CAG	2	6	545944	545949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113481
12039	NC_012848	GATC	2	8	545983	545990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12040	NC_012848	CGG	2	6	546078	546083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113482
12041	NC_012848	CGC	2	6	546210	546215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113482
12042	NC_012848	ACC	2	6	546353	546358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113482
12043	NC_012848	GCCG	2	8	546400	546407	0 %	0 %	50 %	50 %	241113482
12044	NC_012848	TGG	2	6	546425	546430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113482
12045	NC_012848	CCCAG	2	10	546519	546528	20 %	0 %	20 %	60 %	241113482
12046	NC_012848	GATCG	2	10	546562	546571	20 %	20 %	40 %	20 %	241113482
12047	NC_012848	GATC	2	8	546574	546581	25 %	25 %	25 %	25 %	241113482
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12051	NC_012848	CCG	3	9	546779	546787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113482
12052	NC_012848	GAA	2	6	546820	546825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113482
12053	NC_012848	CGG	3	9	546832	546840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113482
12054	NC_012848	CGG	2	6	546897	546902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113482
12055	NC_012848	GCA	2	6	546918	546923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113482
12056	NC_012848	AGC	2	6	546971	546976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113482
12057	NC_012848	GGC	2	6	546988	546993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12058	NC_012848	CAT	2	6	547000	547005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12059	NC_012848	TGTTAC	2	12	547062	547073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113483
12060	NC_012848	CTG	2	6	547149	547154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
12061	NC_012848	TGC	2	6	547206	547211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
12062	NC_012848	CCGG	2	8	547243	547250	0 %	0 %	50 %	50 %	241113483
12063	NC_012848	GCGA	2	8	547259	547266	25 %	0 %	50 %	25 %	241113483
12064	NC_012848	GGC	2	6	547268	547273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113483
12065	NC_012848	GTC	2	6	547287	547292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
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12068	NC_012848	GGC	2	6	547429	547434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113483
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12071	NC_012848	CGT	2	6	547543	547548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
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12079	NC_012848	GGTC	2	8	547972	547979	0 %	25 %	50 %	25 %	241113483
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12087	NC_012848	CTCG	2	8	548434	548441	0 %	25 %	25 %	50 %	241113483
12088	NC_012848	GC	3	6	548480	548485	0 %	0 %	50 %	50 %	241113483
12089	NC_012848	TCG	2	6	548493	548498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
12090	NC_012848	GCT	2	6	548503	548508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113483
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12099	NC_012848	GTCC	2	8	548991	548998	0 %	25 %	25 %	50 %	241113484
12100	NC_012848	AG	3	6	549063	549068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_012848	GAAG	2	8	549073	549080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_012848	GCA	2	6	549129	549134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_012848	GGC	2	6	549157	549162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_012848	TCAG	2	8	549199	549206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12105	NC_012848	GTGC	2	8	549361	549368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12106	NC_012848	AGA	2	6	549376	549381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_012848	CCGG	2	8	549437	549444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12108	NC_012848	AGG	2	6	549450	549455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_012848	ACG	2	6	549459	549464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12111	NC_012848	CTG	2	6	549575	549580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_012848	CTT	2	6	549620	549625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_012848	GCT	2	6	549751	549756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_012848	CGT	2	6	549757	549762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_012848	GGCG	2	8	549814	549821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12116	NC_012848	CTC	2	6	549848	549853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12117	NC_012848	ACG	2	6	550013	550018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_012848	CGC	2	6	550145	550150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12119	NC_012848	ACC	2	6	550155	550160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12120	NC_012848	GAG	2	6	550179	550184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12121	NC_012848	GCG	2	6	550205	550210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_012848	CGG	2	6	550240	550245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12123	NC_012848	ATCT	2	8	550368	550375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12124	NC_012848	CGT	2	6	550409	550414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_012848	GCC	2	6	550424	550429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12126	NC_012848	GAGG	2	8	550434	550441	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_012848	GGC	2	6	550521	550526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12128	NC_012848	CCG	2	6	550542	550547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12129	NC_012848	ACAAGG	2	12	550552	550563	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12130	NC_012848	GAC	2	6	550569	550574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_012848	CGG	2	6	550601	550606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12132	NC_012848	GCCA	2	8	550632	550639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12133	NC_012848	CGT	2	6	550748	550753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12134	NC_012848	CCA	2	6	550762	550767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12135	NC_012848	ACG	2	6	550774	550779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12136	NC_012848	TTC	2	6	550785	550790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12137	NC_012848	GTG	2	6	550806	550811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12138	NC_012848	CG	3	6	550831	550836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12139	NC_012848	GAT	2	6	550844	550849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12140	NC_012848	CGG	2	6	550903	550908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12141	NC_012848	ACA	2	6	550993	550998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12142	NC_012848	GCG	2	6	551086	551091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12143	NC_012848	TCG	2	6	551307	551312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12144	NC_012848	AAG	2	6	551328	551333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12145	NC_012848	GAG	2	6	551385	551390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_012848	CCGA	2	8	551403	551410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12147	NC_012848	CGAAG	2	10	551504	551513	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12148	NC_012848	GAT	2	6	551523	551528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113485
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12154	NC_012848	CGAT	2	8	551813	551820	25 %	25 %	25 %	25 %	241113485
12155	NC_012848	TCG	2	6	551858	551863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113485
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12159	NC_012848	GCC	2	6	552165	552170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113485
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12161	NC_012848	GAT	2	6	552249	552254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113485
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12165	NC_012848	CGC	3	9	552384	552392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113485
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12169	NC_012848	GCGG	2	8	552498	552505	0 %	0 %	75 %	25 %	241113485
12170	NC_012848	GA	3	6	552581	552586	50 %	0 %	50 %	0 %	241113485
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12178	NC_012848	GC	3	6	552994	552999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12179	NC_012848	ATC	2	6	553032	553037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12181	NC_012848	CGA	2	6	553111	553116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12182	NC_012848	CGGG	2	8	553139	553146	0 %	0 %	75 %	25 %	241113486
12183	NC_012848	TCGG	2	8	553153	553160	0 %	25 %	50 %	25 %	241113486
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12199	NC_012848	GGAC	2	8	553593	553600	25 %	0 %	50 %	25 %	241113486
12200	NC_012848	GAC	2	6	553611	553616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113486
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12203	NC_012848	CCGA	2	8	553885	553892	25 %	0 %	25 %	50 %	241113486
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12226	NC_012848	GAAT	2	8	555090	555097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_012848	TCC	2	6	555148	555153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12228	NC_012848	GAT	2	6	555167	555172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113488
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12230	NC_012848	TG	3	6	555226	555231	0 %	50 %	50 %	0 %	241113488
12231	NC_012848	AGC	2	6	555262	555267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113488
12232	NC_012848	GAT	2	6	555272	555277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113488
12233	NC_012848	CTC	2	6	555341	555346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113488
12234	NC_012848	CTGC	2	8	555350	555357	0 %	25 %	25 %	50 %	241113488
12235	NC_012848	CAGG	2	8	555452	555459	25 %	0 %	50 %	25 %	241113488
12236	NC_012848	CGG	2	6	555476	555481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12237	NC_012848	GGC	2	6	555529	555534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12238	NC_012848	GTTG	2	8	555563	555570	0 %	50 %	50 %	0 %	241113488
12239	NC_012848	GCC	2	6	555606	555611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113488
12240	NC_012848	CGC	2	6	555647	555652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113488
12241	NC_012848	GCT	2	6	555671	555676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113488
12242	NC_012848	CTT	2	6	555705	555710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113488
12243	NC_012848	GGC	2	6	555788	555793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12244	NC_012848	TGA	2	6	555853	555858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113488
12245	NC_012848	GC	3	6	555902	555907	0 %	0 %	50 %	50 %	241113488
12246	NC_012848	GGC	2	6	555909	555914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12247	NC_012848	GGC	2	6	556022	556027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12248	NC_012848	CCG	2	6	556033	556038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113488
12249	NC_012848	TCACCG	2	12	556042	556053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113488
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12252	NC_012848	GCG	3	9	556122	556130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113488
12253	NC_012848	GCT	2	6	556175	556180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113488
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12255	NC_012848	CATGG	2	10	556396	556405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12256	NC_012848	TGC	2	6	556419	556424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12259	NC_012848	GC	3	6	556547	556552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12260	NC_012848	GAG	2	6	556586	556591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12263	NC_012848	GAG	2	6	556664	556669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_012848	CAG	2	6	556858	556863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113489
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12279	NC_012848	GAG	3	9	557757	557765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12280	NC_012848	GAT	2	6	557768	557773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113490
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12282	NC_012848	CGGTG	2	10	557819	557828	0 %	20 %	60 %	20 %	241113490
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12346	NC_012848	CG	3	6	560367	560372	0 %	0 %	50 %	50 %	241113492
12347	NC_012848	TGC	2	6	560412	560417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113492
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12349	NC_012848	GATCAA	2	12	560524	560535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113492
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12352	NC_012848	GCA	2	6	560663	560668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113492
12353	NC_012848	TGC	2	6	560673	560678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113492
12354	NC_012848	CGG	2	6	560716	560721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113492
12355	NC_012848	CGT	2	6	560737	560742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113492
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12358	NC_012848	G	6	6	560861	560866	0 %	0 %	100 %	0 %	241113492
12359	NC_012848	GAT	2	6	560900	560905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113492
12360	NC_012848	AGC	2	6	560910	560915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113492
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12362	NC_012848	TCCA	2	8	561033	561040	25 %	25 %	0 %	50 %	241113492
12363	NC_012848	ACCG	2	8	561050	561057	25 %	0 %	25 %	50 %	241113492
12364	NC_012848	CGC	2	6	561058	561063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113492
12365	NC_012848	CCT	2	6	561081	561086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113492
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12367	NC_012848	CCA	2	6	561189	561194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113492
12368	NC_012848	ATC	2	6	561255	561260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113492
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12482	NC_012848	C	6	6	566436	566441	0 %	0 %	0 %	100 %	241113496
12483	NC_012848	GGC	2	6	566442	566447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113496
12484	NC_012848	GCG	2	6	566458	566463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113496
12485	NC_012848	ATG	2	6	566479	566484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113497
12486	NC_012848	CAT	3	9	566510	566518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113497
12487	NC_012848	CGG	2	6	566533	566538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
12488	NC_012848	CTG	2	6	566586	566591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113497
12489	NC_012848	CGG	2	6	566600	566605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
12490	NC_012848	GAT	2	6	566678	566683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113497
12491	NC_012848	CGG	3	9	566689	566697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
12492	NC_012848	CGGT	2	8	566711	566718	0 %	25 %	50 %	25 %	241113497
12493	NC_012848	GGC	2	6	566748	566753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113497
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12498	NC_012848	GGCTGG	2	12	566832	566843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113497
12499	NC_012848	GAC	2	6	566844	566849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113497
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