MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012848	CGGA	2	8	478760	478767	25 %	0 %	50 %	25 %	241113429
10502	NC_012848	CCG	2	6	478835	478840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113429
10503	NC_012848	TC	3	6	478897	478902	0 %	50 %	0 %	50 %	241113429
10504	NC_012848	CTGGA	2	10	478955	478964	20 %	20 %	40 %	20 %	241113429
10505	NC_012848	GTG	2	6	478979	478984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113429
10506	NC_012848	GC	3	6	479009	479014	0 %	0 %	50 %	50 %	241113429
10507	NC_012848	AGA	2	6	479032	479037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113429
10508	NC_012848	TCG	2	6	479061	479066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10509	NC_012848	TCCA	2	8	479147	479154	25 %	25 %	0 %	50 %	241113429
10510	NC_012848	CCG	2	6	479208	479213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113429
10511	NC_012848	AGC	2	6	479238	479243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10512	NC_012848	CGT	2	6	479293	479298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10513	NC_012848	TCG	2	6	479322	479327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10514	NC_012848	GCG	2	6	479394	479399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113429
10515	NC_012848	CGA	2	6	479469	479474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10516	NC_012848	TGA	2	6	479478	479483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113429
10517	NC_012848	CGT	2	6	479548	479553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10518	NC_012848	GCT	2	6	479560	479565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10519	NC_012848	TCG	2	6	479589	479594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10520	NC_012848	GTC	2	6	479651	479656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10521	NC_012848	CG	3	6	479781	479786	0 %	0 %	50 %	50 %	241113429
10522	NC_012848	TCT	2	6	479790	479795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113429
10523	NC_012848	ATG	2	6	479816	479821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113429
10524	NC_012848	GGC	2	6	479822	479827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113429
10525	NC_012848	TCG	3	9	479829	479837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113429
10526	NC_012848	TGT	2	6	479853	479858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113429
10527	NC_012848	CCTG	2	8	479860	479867	0 %	25 %	25 %	50 %	241113429
10528	NC_012848	CGG	2	6	479974	479979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_012848	GC	3	6	480243	480248	0 %	0 %	50 %	50 %	241113430
10530	NC_012848	TCCC	2	8	480307	480314	0 %	25 %	0 %	75 %	241113430
10531	NC_012848	AGC	2	6	480391	480396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10532	NC_012848	GGC	2	6	480404	480409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113430
10533	NC_012848	GCAG	2	8	480416	480423	25 %	0 %	50 %	25 %	241113430
10534	NC_012848	AGG	2	6	480490	480495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113430
10535	NC_012848	GCG	2	6	480606	480611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113430
10536	NC_012848	GCA	2	6	480743	480748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10537	NC_012848	CGA	2	6	480752	480757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10538	NC_012848	CGC	2	6	480785	480790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113430
10539	NC_012848	GAC	2	6	480876	480881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10540	NC_012848	TGG	2	6	480889	480894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113430
10541	NC_012848	CGA	2	6	480944	480949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10542	NC_012848	TCA	2	6	480955	480960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113430
10543	NC_012848	TCGC	2	8	481047	481054	0 %	25 %	25 %	50 %	241113430
10544	NC_012848	GC	3	6	481063	481068	0 %	0 %	50 %	50 %	241113430
10545	NC_012848	CCT	2	6	481075	481080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113430
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10547	NC_012848	GCC	2	6	481134	481139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113430
10548	NC_012848	GTC	2	6	481179	481184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113430
10549	NC_012848	GAG	2	6	481400	481405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113431
10550	NC_012848	CTA	2	6	481468	481473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113431
10551	NC_012848	GGC	2	6	481477	481482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113431
10552	NC_012848	CTG	2	6	481493	481498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10553	NC_012848	TCT	2	6	481551	481556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113431
10554	NC_012848	TGA	2	6	481560	481565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113431
10555	NC_012848	GC	4	8	481616	481623	0 %	0 %	50 %	50 %	241113431
10556	NC_012848	GGT	2	6	481669	481674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113431
10557	NC_012848	GCC	2	6	481703	481708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113431
10558	NC_012848	ATG	2	6	481907	481912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113431
10559	NC_012848	GTC	2	6	481934	481939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10560	NC_012848	CG	3	6	481974	481979	0 %	0 %	50 %	50 %	241113431
10561	NC_012848	TGC	2	6	482044	482049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10562	NC_012848	GCC	2	6	482054	482059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113431
10563	NC_012848	CCT	2	6	482170	482175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113431
10564	NC_012848	TCG	2	6	482187	482192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10565	NC_012848	GAC	2	6	482200	482205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113431
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10567	NC_012848	TGC	3	9	482235	482243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10568	NC_012848	GCT	2	6	482287	482292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10569	NC_012848	CGT	2	6	482332	482337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10570	NC_012848	AT	3	6	482410	482415	50 %	50 %	0 %	0 %	241113431
10571	NC_012848	CGC	2	6	482416	482421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113431
10572	NC_012848	TGC	2	6	482467	482472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10573	NC_012848	CGA	2	6	482496	482501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113431
10574	NC_012848	CAT	2	6	482518	482523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113431
10575	NC_012848	TGG	2	6	482526	482531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113431
10576	NC_012848	CAC	2	6	482677	482682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113431
10577	NC_012848	TGG	2	6	482696	482701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113431
10578	NC_012848	GGTT	2	8	482711	482718	0 %	50 %	50 %	0 %	241113431
10579	NC_012848	CGG	2	6	482734	482739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113431
10580	NC_012848	GC	3	6	482766	482771	0 %	0 %	50 %	50 %	241113431
10581	NC_012848	CTG	2	6	482848	482853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_012848	GCAT	2	8	482882	482889	25 %	25 %	25 %	25 %	241113432
10583	NC_012848	CGAA	2	8	482929	482936	50 %	0 %	25 %	25 %	241113432
10584	NC_012848	GACT	2	8	482945	482952	25 %	25 %	25 %	25 %	241113432
10585	NC_012848	TCG	2	6	482960	482965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113432
10586	NC_012848	GCGA	2	8	483011	483018	25 %	0 %	50 %	25 %	241113432
10587	NC_012848	TGG	2	6	483048	483053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113432
10588	NC_012848	CTG	2	6	483058	483063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113432
10589	NC_012848	TGGTC	2	10	483066	483075	0 %	40 %	40 %	20 %	241113432
10590	NC_012848	TGAT	2	8	483155	483162	25 %	50 %	25 %	0 %	241113432
10591	NC_012848	TGA	2	6	483168	483173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113432
10592	NC_012848	GCC	2	6	483175	483180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113432
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10595	NC_012848	GCA	2	6	483275	483280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113432
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10597	NC_012848	AAG	2	6	483382	483387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113432
10598	NC_012848	TCG	2	6	483407	483412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113432
10599	NC_012848	TGA	2	6	483420	483425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113432
10600	NC_012848	CTG	2	6	483436	483441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113432
10601	NC_012848	TTCGG	2	10	483544	483553	0 %	40 %	40 %	20 %	241113432
10602	NC_012848	TCC	2	6	483584	483589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113432
10603	NC_012848	GCG	2	6	483593	483598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113432
10604	NC_012848	TTC	2	6	483604	483609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113432
10605	NC_012848	GCC	2	6	483617	483622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113432
10606	NC_012848	GGA	2	6	483658	483663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113432
10607	NC_012848	CCT	2	6	483812	483817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113432
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10610	NC_012848	GGC	2	6	483898	483903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113432
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10618	NC_012848	CGG	2	6	484215	484220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113432
10619	NC_012848	TTG	2	6	484223	484228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113432
10620	NC_012848	C	6	6	484301	484306	0 %	0 %	0 %	100 %	241113432
10621	NC_012848	CTT	2	6	484320	484325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113432
10622	NC_012848	TTG	2	6	484331	484336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113432
10623	NC_012848	GCT	2	6	484363	484368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113432
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10626	NC_012848	TTTTC	2	10	484503	484512	0 %	80 %	0 %	20 %	241113432
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10633	NC_012848	CGT	2	6	484837	484842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10635	NC_012848	GCT	2	6	484948	484953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10639	NC_012848	GCTG	2	8	485172	485179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10640	NC_012848	CG	3	6	485193	485198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10641	NC_012848	GGA	2	6	485203	485208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10643	NC_012848	CGT	2	6	485298	485303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113433
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10734	NC_012848	CTGCGG	2	12	489974	489985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113436
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10969	NC_012848	GC	3	6	501143	501148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10970	NC_012848	ACC	2	6	501237	501242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113444
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10973	NC_012848	TCACC	2	10	501332	501341	20 %	20 %	0 %	60 %	241113444
10974	NC_012848	AGC	2	6	501394	501399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113444
10975	NC_012848	TCG	2	6	501408	501413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113444
10976	NC_012848	CTG	2	6	501433	501438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113444
10977	NC_012848	CGA	2	6	501491	501496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113444
10978	NC_012848	CGC	2	6	501558	501563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113444
10979	NC_012848	CGTC	2	8	501608	501615	0 %	25 %	25 %	50 %	241113444
10980	NC_012848	CG	3	6	501684	501689	0 %	0 %	50 %	50 %	241113444
10981	NC_012848	CGG	2	6	501763	501768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10982	NC_012848	TA	4	8	501786	501793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10983	NC_012848	TCA	2	6	501832	501837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113445
10984	NC_012848	GTG	2	6	501898	501903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113445
10985	NC_012848	CT	3	6	501908	501913	0 %	50 %	0 %	50 %	241113445
10986	NC_012848	CAT	2	6	501930	501935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113445
10987	NC_012848	GTC	2	6	501985	501990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113445
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10992	NC_012848	GAT	2	6	502347	502352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113445
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