MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012848	ACC	2	6	414542	414547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113366
9002	NC_012848	TGCC	2	8	414552	414559	0 %	25 %	25 %	50 %	241113366
9003	NC_012848	CGA	2	6	414624	414629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113366
9004	NC_012848	CGC	2	6	414687	414692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113366
9005	NC_012848	CGG	2	6	414732	414737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113366
9006	NC_012848	CGA	2	6	414756	414761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113366
9007	NC_012848	TCG	2	6	414941	414946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113366
9008	NC_012848	GCCG	2	8	415020	415027	0 %	0 %	50 %	50 %	241113366
9009	NC_012848	AGC	2	6	415130	415135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_012848	GCG	2	6	415159	415164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_012848	TCG	2	6	415178	415183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_012848	ACC	2	6	415310	415315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113367
9013	NC_012848	GAGT	2	8	415332	415339	25 %	25 %	50 %	0 %	241113367
9014	NC_012848	CGC	2	6	415422	415427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113367
9015	NC_012848	CGC	2	6	415440	415445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113367
9016	NC_012848	CG	3	6	415518	415523	0 %	0 %	50 %	50 %	241113367
9017	NC_012848	GAG	2	6	415555	415560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113367
9018	NC_012848	GATCG	2	10	415622	415631	20 %	20 %	40 %	20 %	241113368
9019	NC_012848	GCG	2	6	415708	415713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113368
9020	NC_012848	CAG	2	6	415715	415720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113368
9021	NC_012848	CGA	2	6	415780	415785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113368
9022	NC_012848	GCG	2	6	415869	415874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113368
9023	NC_012848	CCGG	2	8	415875	415882	0 %	0 %	50 %	50 %	241113368
9024	NC_012848	GCA	2	6	415936	415941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113368
9025	NC_012848	GGT	2	6	415958	415963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113368
9026	NC_012848	GCG	2	6	416117	416122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113368
9027	NC_012848	GCCT	2	8	416130	416137	0 %	25 %	25 %	50 %	241113368
9028	NC_012848	GCT	2	6	416167	416172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113368
9029	NC_012848	CAT	2	6	416234	416239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113368
9030	NC_012848	CAC	2	6	416267	416272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113368
9031	NC_012848	TCC	2	6	416364	416369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113368
9032	NC_012848	TGA	2	6	416383	416388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113368
9033	NC_012848	CG	4	8	416452	416459	0 %	0 %	50 %	50 %	241113368
9034	NC_012848	CGCGC	2	10	416477	416486	0 %	0 %	40 %	60 %	241113368
9035	NC_012848	TCA	2	6	416539	416544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113369
9036	NC_012848	GCG	2	6	416551	416556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9037	NC_012848	GAT	2	6	416653	416658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113369
9038	NC_012848	GC	3	6	416672	416677	0 %	0 %	50 %	50 %	241113369
9039	NC_012848	CGG	2	6	416709	416714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9040	NC_012848	GCG	2	6	416757	416762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9041	NC_012848	CGG	2	6	416766	416771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9042	NC_012848	ATG	2	6	416930	416935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113369
9043	NC_012848	GCC	2	6	416947	416952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113369
9044	NC_012848	GAG	2	6	416975	416980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113369
9045	NC_012848	CG	3	6	417012	417017	0 %	0 %	50 %	50 %	241113369
9046	NC_012848	TTCGGC	2	12	417025	417036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113369
9047	NC_012848	GCG	2	6	417134	417139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9048	NC_012848	GCTCG	2	10	417175	417184	0 %	20 %	40 %	40 %	241113369
9049	NC_012848	GAT	2	6	417187	417192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113369
9050	NC_012848	GC	3	6	417226	417231	0 %	0 %	50 %	50 %	241113369
9051	NC_012848	CGC	2	6	417246	417251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113369
9052	NC_012848	CCT	2	6	417261	417266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113369
9053	NC_012848	CCA	2	6	417312	417317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113369
9054	NC_012848	CGG	2	6	417339	417344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9055	NC_012848	GCC	2	6	417427	417432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113369
9056	NC_012848	GCG	2	6	417437	417442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113369
9057	NC_012848	GA	3	6	417464	417469	50 %	0 %	50 %	0 %	241113369
9058	NC_012848	CCGGG	2	10	417528	417537	0 %	0 %	60 %	40 %	241113369
9059	NC_012848	GAC	2	6	417547	417552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113369
9060	NC_012848	CCACG	2	10	417583	417592	20 %	0 %	20 %	60 %	241113369
9061	NC_012848	CGA	2	6	417612	417617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113369
9062	NC_012848	TGC	2	6	417681	417686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_012848	CGG	2	6	417696	417701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_012848	GCC	2	6	417706	417711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_012848	G	6	6	417768	417773	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_012848	TTG	2	6	417885	417890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_012848	AGG	2	6	417982	417987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_012848	GAGT	2	8	417992	417999	25 %	25 %	50 %	0 %	241113370
9069	NC_012848	TCG	2	6	418022	418027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113370
9070	NC_012848	GCAC	2	8	418080	418087	25 %	0 %	25 %	50 %	241113370
9071	NC_012848	CGAT	2	8	418163	418170	25 %	25 %	25 %	25 %	241113370
9072	NC_012848	CGGT	2	8	418229	418236	0 %	25 %	50 %	25 %	241113370
9073	NC_012848	TCA	2	6	418241	418246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113370
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9075	NC_012848	CG	3	6	418340	418345	0 %	0 %	50 %	50 %	241113370
9076	NC_012848	GC	3	6	418348	418353	0 %	0 %	50 %	50 %	241113370
9077	NC_012848	CGC	2	6	418421	418426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113370
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9079	NC_012848	CTG	3	9	418531	418539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113370
9080	NC_012848	CG	3	6	418579	418584	0 %	0 %	50 %	50 %	241113370
9081	NC_012848	CGG	2	6	418612	418617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113370
9082	NC_012848	TGT	2	6	418644	418649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113370
9083	NC_012848	GC	3	6	418651	418656	0 %	0 %	50 %	50 %	241113370
9084	NC_012848	CGT	2	6	418677	418682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113370
9085	NC_012848	CCGC	2	8	418683	418690	0 %	0 %	25 %	75 %	241113370
9086	NC_012848	GAC	2	6	418797	418802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113370
9087	NC_012848	CTG	2	6	418978	418983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113371
9088	NC_012848	CCG	2	6	419038	419043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113371
9089	NC_012848	ATCG	2	8	419074	419081	25 %	25 %	25 %	25 %	241113371
9090	NC_012848	ATC	2	6	419144	419149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113371
9091	NC_012848	TCA	2	6	419160	419165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_012848	CG	3	6	419186	419191	0 %	0 %	50 %	50 %	241113372
9093	NC_012848	CATC	2	8	419244	419251	25 %	25 %	0 %	50 %	241113372
9094	NC_012848	TCGA	2	8	419347	419354	25 %	25 %	25 %	25 %	241113372
9095	NC_012848	CGA	2	6	419400	419405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113372
9096	NC_012848	TTC	2	6	419482	419487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113372
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9098	NC_012848	T	6	6	419523	419528	0 %	100 %	0 %	0 %	241113372
9099	NC_012848	CAC	2	6	419533	419538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113372
9100	NC_012848	CGGC	2	8	419633	419640	0 %	0 %	50 %	50 %	241113372
9101	NC_012848	GCA	2	6	419649	419654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113372
9102	NC_012848	GAT	2	6	419664	419669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113372
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9104	NC_012848	GTT	2	6	419742	419747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113372
9105	NC_012848	GAC	2	6	419764	419769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113372
9106	NC_012848	CATG	2	8	419811	419818	25 %	25 %	25 %	25 %	241113372
9107	NC_012848	TTTCT	2	10	419881	419890	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9108	NC_012848	TCG	2	6	419893	419898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_012848	TTC	2	6	419944	419949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_012848	TC	4	8	419980	419987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9111	NC_012848	AGGG	2	8	419993	420000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_012848	GCC	2	6	420006	420011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_012848	CT	4	8	420035	420042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_012848	CTCA	2	8	420061	420068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9115	NC_012848	ATA	2	6	420079	420084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_012848	GAG	2	6	420122	420127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_012848	TGA	2	6	420186	420191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_012848	TGC	2	6	420289	420294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_012848	GCC	2	6	420414	420419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113373
9120	NC_012848	CGG	2	6	420427	420432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113373
9121	NC_012848	TCG	2	6	420462	420467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113373
9122	NC_012848	CGC	2	6	420473	420478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113373
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9124	NC_012848	CGA	2	6	420571	420576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113373
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9369	NC_012848	GCC	2	6	430992	430997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113387
9370	NC_012848	GCA	2	6	431012	431017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113387
9371	NC_012848	GTC	2	6	431052	431057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113387
9372	NC_012848	CGGG	2	8	431095	431102	0 %	0 %	75 %	25 %	241113387
9373	NC_012848	AT	3	6	431106	431111	50 %	50 %	0 %	0 %	241113387
9374	NC_012848	GTCA	2	8	431252	431259	25 %	25 %	25 %	25 %	241113388
9375	NC_012848	GGC	2	6	431300	431305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113388
9376	NC_012848	CCT	2	6	431353	431358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113388
9377	NC_012848	CAT	2	6	431410	431415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113388
9378	NC_012848	CTG	2	6	431455	431460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113388
9379	NC_012848	TGA	2	6	431485	431490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113388
9380	NC_012848	CGA	2	6	431653	431658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113388
9381	NC_012848	GCA	2	6	431674	431679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113388
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9399	NC_012848	CGATGT	2	12	432193	432204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113388
9400	NC_012848	GCC	2	6	432212	432217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113388
9401	NC_012848	ATC	2	6	432234	432239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113388
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9403	NC_012848	CGC	2	6	432404	432409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113388
9404	NC_012848	C	6	6	432443	432448	0 %	0 %	0 %	100 %	241113388
9405	NC_012848	ATC	2	6	432486	432491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9406	NC_012848	CGTCT	2	10	432515	432524	0 %	40 %	20 %	40 %	241113389
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9410	NC_012848	CGG	2	6	432686	432691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113389
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9413	NC_012848	GCG	2	6	432742	432747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113389
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9441	NC_012848	CG	3	6	434041	434046	0 %	0 %	50 %	50 %	241113390
9442	NC_012848	GGACG	2	10	434147	434156	20 %	0 %	60 %	20 %	241113390
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9479	NC_012848	ACG	2	6	435616	435621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113392
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9482	NC_012848	GGT	2	6	435768	435773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113392
9483	NC_012848	GCA	2	6	435821	435826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113392
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9485	NC_012848	TCGG	2	8	435886	435893	0 %	25 %	50 %	25 %	241113392
9486	NC_012848	CAGA	2	8	435948	435955	50 %	0 %	25 %	25 %	241113392
9487	NC_012848	GTT	2	6	435972	435977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113392
9488	NC_012848	CAG	2	6	435996	436001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113392
9489	NC_012848	TGG	2	6	436040	436045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113392
9490	NC_012848	GCA	2	6	436130	436135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113392
9491	NC_012848	GAT	2	6	436143	436148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113392
9492	NC_012848	ATG	2	6	436315	436320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113392
9493	NC_012848	TCC	2	6	436398	436403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113393
9494	NC_012848	GAA	2	6	436445	436450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113393
9495	NC_012848	GACGAG	2	12	436520	436531	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113393
9496	NC_012848	GCCC	2	8	436546	436553	0 %	0 %	25 %	75 %	241113393
9497	NC_012848	GAA	2	6	436616	436621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113393
9498	NC_012848	GTC	2	6	436623	436628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113393
9499	NC_012848	CGG	2	6	436690	436695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113393
9500	NC_012848	GGCC	2	8	436726	436733	0 %	0 %	50 %	50 %	241113393

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