MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012848	GCGCC	2	10	372304	372313	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8002	NC_012848	GC	3	6	372381	372386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_012848	CTTC	2	8	372452	372459	0 %	50 %	0 %	50 %	241113329
8004	NC_012848	CAG	2	6	372513	372518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113329
8005	NC_012848	GCC	2	6	372642	372647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113329
8006	NC_012848	TGA	2	6	372680	372685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113329
8007	NC_012848	T	6	6	372718	372723	0 %	100 %	0 %	0 %	241113329
8008	NC_012848	GCC	2	6	372750	372755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113329
8009	NC_012848	CCG	2	6	372785	372790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113329
8010	NC_012848	AAG	2	6	372799	372804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113329
8011	NC_012848	GAA	2	6	372852	372857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113329
8012	NC_012848	AGT	2	6	372863	372868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113329
8013	NC_012848	CGC	2	6	372879	372884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113329
8014	NC_012848	GTT	2	6	372906	372911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113329
8015	NC_012848	CGA	2	6	372914	372919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113329
8016	NC_012848	TTC	2	6	372988	372993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113329
8017	NC_012848	TGA	2	6	373001	373006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113329
8018	NC_012848	TCTGG	2	10	373130	373139	0 %	40 %	40 %	20 %	241113329
8019	NC_012848	GAA	2	6	373146	373151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113329
8020	NC_012848	CGG	2	6	373185	373190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113329
8021	NC_012848	GTA	2	6	373332	373337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113329
8022	NC_012848	GAA	2	6	373383	373388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113329
8023	NC_012848	ACTG	2	8	373436	373443	25 %	25 %	25 %	25 %	241113329
8024	NC_012848	CGA	2	6	373448	373453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113329
8025	NC_012848	AGA	2	6	373610	373615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113329
8026	NC_012848	TCC	2	6	373707	373712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_012848	TCC	2	6	373765	373770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_012848	GTG	2	6	373774	373779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_012848	TCC	2	6	373793	373798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_012848	GCC	2	6	373971	373976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_012848	TCA	2	6	373983	373988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_012848	GC	3	6	374060	374065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_012848	CT	3	6	374080	374085	0 %	50 %	0 %	50 %	241113330
8034	NC_012848	GGC	2	6	374118	374123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113330
8035	NC_012848	GC	3	6	374141	374146	0 %	0 %	50 %	50 %	241113330
8036	NC_012848	AT	3	6	374165	374170	50 %	50 %	0 %	0 %	241113330
8037	NC_012848	GGC	2	6	374242	374247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113330
8038	NC_012848	G	6	6	374261	374266	0 %	0 %	100 %	0 %	241113330
8039	NC_012848	CAG	2	6	374280	374285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113330
8040	NC_012848	CGG	2	6	374310	374315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113330
8041	NC_012848	GCC	2	6	374374	374379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113330
8042	NC_012848	TCG	2	6	374398	374403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113330
8043	NC_012848	GTGC	2	8	374443	374450	0 %	25 %	50 %	25 %	241113330
8044	NC_012848	CCA	2	6	374498	374503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113330
8045	NC_012848	CTCG	2	8	374663	374670	0 %	25 %	25 %	50 %	241113330
8046	NC_012848	GGA	2	6	374778	374783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012848	GAG	2	6	374850	374855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113331
8048	NC_012848	GCG	2	6	374883	374888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113331
8049	NC_012848	GGC	2	6	374889	374894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113331
8050	NC_012848	CCG	2	6	374935	374940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
8051	NC_012848	GGC	2	6	374963	374968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113331
8052	NC_012848	CG	3	6	375047	375052	0 %	0 %	50 %	50 %	241113331
8053	NC_012848	GGAGGC	2	12	375099	375110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241113331
8054	NC_012848	TGA	2	6	375223	375228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113331
8055	NC_012848	CGC	2	6	375287	375292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
8056	NC_012848	CGGG	3	12	375451	375462	0 %	0 %	75 %	25 %	241113331
8057	NC_012848	ACG	2	6	375513	375518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113331
8058	NC_012848	CGG	2	6	375542	375547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113331
8059	NC_012848	TCGGT	2	10	375607	375616	0 %	40 %	40 %	20 %	241113331
8060	NC_012848	ACG	2	6	375720	375725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113331
8061	NC_012848	GC	3	6	375736	375741	0 %	0 %	50 %	50 %	241113331
8062	NC_012848	TTC	2	6	375846	375851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113331
8063	NC_012848	CGC	2	6	375866	375871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
8064	NC_012848	CGC	2	6	375878	375883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
8065	NC_012848	TAT	2	6	375920	375925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113331
8066	NC_012848	GCC	2	6	375966	375971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113331
8067	NC_012848	GA	3	6	376003	376008	50 %	0 %	50 %	0 %	241113331
8068	NC_012848	TCG	2	6	376083	376088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113332
8069	NC_012848	GGGGC	2	10	376089	376098	0 %	0 %	80 %	20 %	241113332
8070	NC_012848	GAG	2	6	376124	376129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113332
8071	NC_012848	GGC	2	6	376133	376138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113332
8072	NC_012848	TCA	2	6	376146	376151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113332
8073	NC_012848	CGG	2	6	376194	376199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113332
8074	NC_012848	GAG	2	6	376421	376426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113332
8075	NC_012848	GAT	2	6	376456	376461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113332
8076	NC_012848	CTG	2	6	376484	376489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113332
8077	NC_012848	ACG	2	6	376490	376495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113332
8078	NC_012848	CAT	2	6	376549	376554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113332
8079	NC_012848	CGG	2	6	376579	376584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113332
8080	NC_012848	CGA	2	6	376669	376674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113332
8081	NC_012848	GGA	2	6	376714	376719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113332
8082	NC_012848	GC	3	6	376721	376726	0 %	0 %	50 %	50 %	241113332
8083	NC_012848	GGC	2	6	376798	376803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113332
8084	NC_012848	GTC	2	6	376850	376855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113332
8085	NC_012848	GGA	2	6	376869	376874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_012848	GTC	2	6	377004	377009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113333
8087	NC_012848	GCG	2	6	377020	377025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113333
8088	NC_012848	ATC	2	6	377044	377049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113333
8089	NC_012848	GGA	2	6	377057	377062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113333
8090	NC_012848	GGCGAG	2	12	377082	377093	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241113333
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8092	NC_012848	GGC	2	6	377196	377201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113333
8093	NC_012848	CTC	2	6	377211	377216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113333
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8095	NC_012848	CTG	2	6	377277	377282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113333
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8097	NC_012848	GGA	2	6	377318	377323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_012848	AGGC	2	8	377354	377361	25 %	0 %	50 %	25 %	241113334
8099	NC_012848	GGA	2	6	377404	377409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113334
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8103	NC_012848	GC	3	6	377547	377552	0 %	0 %	50 %	50 %	241113334
8104	NC_012848	AAT	2	6	377603	377608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113334
8105	NC_012848	CGCC	2	8	377619	377626	0 %	0 %	25 %	75 %	241113334
8106	NC_012848	GCC	2	6	377657	377662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113334
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8122	NC_012848	GAT	2	6	378217	378222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113334
8123	NC_012848	CATGG	2	10	378284	378293	20 %	20 %	40 %	20 %	241113334
8124	NC_012848	ACC	2	6	378330	378335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113334
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8126	NC_012848	GAC	2	6	378400	378405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113334
8127	NC_012848	TCA	2	6	378429	378434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113334
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8244	NC_012848	GAG	2	6	382933	382938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113339
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8246	NC_012848	CGT	2	6	382956	382961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113339
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8287	NC_012848	CGC	2	6	384749	384754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8333	NC_012848	TC	3	6	386843	386848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8334	NC_012848	TC	3	6	386871	386876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8335	NC_012848	GTT	2	6	386885	386890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8338	NC_012848	CTG	2	6	387177	387182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113343
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8351	NC_012848	CGGC	2	8	387531	387538	0 %	0 %	50 %	50 %	241113343
8352	NC_012848	AGC	2	6	387574	387579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
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8357	NC_012848	CGG	2	6	387782	387787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113343
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8359	NC_012848	CG	3	6	387897	387902	0 %	0 %	50 %	50 %	241113343
8360	NC_012848	CAG	2	6	387963	387968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
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8362	NC_012848	AGC	2	6	388030	388035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
8363	NC_012848	TTG	2	6	388060	388065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113343
8364	NC_012848	TCG	2	6	388072	388077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113343
8365	NC_012848	GTG	2	6	388078	388083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113343
8366	NC_012848	TC	3	6	388097	388102	0 %	50 %	0 %	50 %	241113343
8367	NC_012848	CGA	2	6	388139	388144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
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8369	NC_012848	GCA	2	6	388211	388216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
8370	NC_012848	CGT	2	6	388245	388250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113343
8371	NC_012848	TCG	2	6	388255	388260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113343
8372	NC_012848	GGGTC	2	10	388271	388280	0 %	20 %	60 %	20 %	241113343
8373	NC_012848	GGC	2	6	388296	388301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113343
8374	NC_012848	GCC	2	6	388320	388325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113343
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8382	NC_012848	TCAGGG	2	12	388631	388642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113343
8383	NC_012848	CGA	2	6	388682	388687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113343
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8385	NC_012848	GCCG	2	8	388736	388743	0 %	0 %	50 %	50 %	241113343
8386	NC_012848	GGT	2	6	388749	388754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113343
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8395	NC_012848	GC	3	6	389105	389110	0 %	0 %	50 %	50 %	241113344
8396	NC_012848	TGA	2	6	389116	389121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113344
8397	NC_012848	GAG	2	6	389217	389222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113344
8398	NC_012848	CGA	2	6	389233	389238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113344
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8400	NC_012848	CCAG	2	8	389305	389312	25 %	0 %	25 %	50 %	241113344
8401	NC_012848	CCG	2	6	389313	389318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113344
8402	NC_012848	ACG	2	6	389343	389348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113344
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8404	NC_012848	GAGCC	2	10	389448	389457	20 %	0 %	40 %	40 %	241113344
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8414	NC_012848	GC	3	6	389990	389995	0 %	0 %	50 %	50 %	241113345
8415	NC_012848	ATC	2	6	390005	390010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113345
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8423	NC_012848	TCG	2	6	390419	390424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113345
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8425	NC_012848	TCG	2	6	390486	390491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113345
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8427	NC_012848	CGA	2	6	390561	390566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113345
8428	NC_012848	GGA	2	6	390652	390657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8429	NC_012848	GCC	2	6	390741	390746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113346
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8431	NC_012848	CG	3	6	390893	390898	0 %	0 %	50 %	50 %	241113346
8432	NC_012848	GCCG	2	8	391104	391111	0 %	0 %	50 %	50 %	241113346
8433	NC_012848	TCGA	2	8	391132	391139	25 %	25 %	25 %	25 %	241113346
8434	NC_012848	GCC	2	6	391144	391149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113346
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8436	NC_012848	CGA	2	6	391361	391366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113346
8437	NC_012848	TTG	2	6	391375	391380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113346
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8439	NC_012848	CGA	2	6	391466	391471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113346
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8444	NC_012848	CGA	2	6	391703	391708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113346
8445	NC_012848	GTTT	2	8	391777	391784	0 %	75 %	25 %	0 %	241113346
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8453	NC_012848	GAGC	2	8	392115	392122	25 %	0 %	50 %	25 %	241113346
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8459	NC_012848	ACG	2	6	392241	392246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113346
8460	NC_012848	GTC	2	6	392268	392273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113346
8461	NC_012848	TG	3	6	392323	392328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8462	NC_012848	GC	4	8	392374	392381	0 %	0 %	50 %	50 %	241113347
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8472	NC_012848	GCG	2	6	392773	392778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113347
8473	NC_012848	GTC	2	6	392889	392894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113347
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8476	NC_012848	GAA	3	9	393127	393135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8477	NC_012848	GT	3	6	393215	393220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8478	NC_012848	GCACC	2	10	393226	393235	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8479	NC_012848	CAT	2	6	393252	393257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8480	NC_012848	GGC	2	6	393260	393265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8481	NC_012848	CGC	2	6	393316	393321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113348
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8483	NC_012848	CGA	2	6	393368	393373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113348
8484	NC_012848	GCA	2	6	393396	393401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113348
8485	NC_012848	GCG	2	6	393404	393409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8486	NC_012848	GCG	2	6	393480	393485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8487	NC_012848	CGG	2	6	393494	393499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8488	NC_012848	CGG	2	6	393545	393550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8489	NC_012848	GCCGCG	2	12	393558	393569	0 %	0 %	50 %	50 %	241113348
8490	NC_012848	CGA	2	6	393578	393583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113348
8491	NC_012848	GAT	2	6	393587	393592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113348
8492	NC_012848	CGG	2	6	393734	393739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8493	NC_012848	TGAGG	2	10	393813	393822	20 %	20 %	60 %	0 %	241113348
8494	NC_012848	GTC	2	6	393832	393837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113348
8495	NC_012848	GC	3	6	393935	393940	0 %	0 %	50 %	50 %	241113348
8496	NC_012848	CGG	2	6	393975	393980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8497	NC_012848	CGC	2	6	393989	393994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113348
8498	NC_012848	GGC	2	6	394023	394028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113348
8499	NC_012848	GCA	2	6	394069	394074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113348
8500	NC_012848	GAT	2	6	394086	394091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113348

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