MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012848	GCG	2	6	298201	298206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113263
6502	NC_012848	AAT	2	6	298207	298212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113263
6503	NC_012848	TCT	2	6	298353	298358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113264
6504	NC_012848	TCG	2	6	298372	298377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113264
6505	NC_012848	GC	4	8	298575	298582	0 %	0 %	50 %	50 %	241113264
6506	NC_012848	GTT	2	6	298593	298598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113264
6507	NC_012848	GCT	2	6	298706	298711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113264
6508	NC_012848	GCG	2	6	298775	298780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113264
6509	NC_012848	GC	4	8	298791	298798	0 %	0 %	50 %	50 %	241113264
6510	NC_012848	ACC	2	6	298839	298844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113264
6511	NC_012848	CGCA	2	8	298855	298862	25 %	0 %	25 %	50 %	241113264
6512	NC_012848	GAC	2	6	298922	298927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113264
6513	NC_012848	CAT	2	6	298931	298936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113264
6514	NC_012848	GCC	2	6	299002	299007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113264
6515	NC_012848	GCG	2	6	299119	299124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113264
6516	NC_012848	CCT	2	6	299195	299200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113264
6517	NC_012848	GCC	2	6	299207	299212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113264
6518	NC_012848	GGC	2	6	299297	299302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113265
6519	NC_012848	GGC	2	6	299353	299358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113265
6520	NC_012848	TGG	2	6	299433	299438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113265
6521	NC_012848	AC	3	6	299580	299585	50 %	0 %	0 %	50 %	241113265
6522	NC_012848	GCG	2	6	299627	299632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113265
6523	NC_012848	CGC	3	9	299671	299679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113265
6524	NC_012848	GCT	2	6	299704	299709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113265
6525	NC_012848	GTC	2	6	299765	299770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113265
6526	NC_012848	ATT	2	6	299793	299798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113265
6527	NC_012848	TCT	2	6	299802	299807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113265
6528	NC_012848	ATT	2	6	299833	299838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113265
6529	NC_012848	TC	3	6	299839	299844	0 %	50 %	0 %	50 %	241113265
6530	NC_012848	CGT	2	6	299956	299961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113265
6531	NC_012848	CTGC	2	8	299968	299975	0 %	25 %	25 %	50 %	241113265
6532	NC_012848	TGC	2	6	300030	300035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113265
6533	NC_012848	GC	3	6	300062	300067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_012848	ATC	2	6	300126	300131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_012848	AGC	2	6	300136	300141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_012848	AGC	2	6	300219	300224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_012848	CTT	3	9	300227	300235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_012848	CTG	2	6	300260	300265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_012848	CAT	2	6	300274	300279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_012848	TCT	2	6	300345	300350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_012848	ACG	2	6	300365	300370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_012848	CG	3	6	300391	300396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_012848	ACG	2	6	300426	300431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_012848	GGC	2	6	300467	300472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_012848	AGGC	2	8	300543	300550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_012848	ATA	2	6	300573	300578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_012848	GCG	2	6	300595	300600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_012848	CCGG	2	8	300602	300609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_012848	AGTC	2	8	300651	300658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_012848	AGGG	2	8	300755	300762	25 %	0 %	75 %	0 %	241113266
6551	NC_012848	GAG	2	6	300764	300769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113266
6552	NC_012848	CCAT	2	8	300770	300777	25 %	25 %	0 %	50 %	241113266
6553	NC_012848	CAA	2	6	300823	300828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113266
6554	NC_012848	CTC	2	6	300833	300838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113266
6555	NC_012848	TCC	2	6	300880	300885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113266
6556	NC_012848	CG	3	6	300948	300953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_012848	CGA	2	6	300957	300962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_012848	TGC	2	6	300963	300968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_012848	CTG	2	6	300998	301003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_012848	T	6	6	301048	301053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_012848	GCT	2	6	301081	301086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113267
6562	NC_012848	GAT	2	6	301263	301268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113267
6563	NC_012848	CTC	2	6	301288	301293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_012848	GT	4	8	301307	301314	0 %	50 %	50 %	0 %	241113268
6565	NC_012848	GCT	2	6	301324	301329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113268
6566	NC_012848	CGT	3	9	301334	301342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113268
6567	NC_012848	GCC	2	6	301389	301394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113268
6568	NC_012848	TGA	2	6	301493	301498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113268
6569	NC_012848	CCT	2	6	301514	301519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113268
6570	NC_012848	C	6	6	301520	301525	0 %	0 %	0 %	100 %	241113268
6571	NC_012848	CCA	2	6	301528	301533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113268
6572	NC_012848	T	6	6	301578	301583	0 %	100 %	0 %	0 %	241113268
6573	NC_012848	CCA	2	6	301642	301647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113268
6574	NC_012848	TGG	2	6	301649	301654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113268
6575	NC_012848	TCGC	2	8	301734	301741	0 %	25 %	25 %	50 %	241113268
6576	NC_012848	ATC	2	6	301830	301835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113268
6577	NC_012848	TCG	2	6	302059	302064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113268
6578	NC_012848	ATC	2	6	302077	302082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113268
6579	NC_012848	GGA	2	6	302150	302155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113268
6580	NC_012848	GCG	2	6	302181	302186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113268
6581	NC_012848	CAT	2	6	302189	302194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113268
6582	NC_012848	TCG	2	6	302284	302289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113268
6583	NC_012848	AGGG	2	8	302298	302305	25 %	0 %	75 %	0 %	241113268
6584	NC_012848	TCC	2	6	302381	302386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113268
6585	NC_012848	CG	3	6	302593	302598	0 %	0 %	50 %	50 %	241113268
6586	NC_012848	GGT	2	6	302630	302635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113268
6587	NC_012848	ATG	2	6	302798	302803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012848	GTT	2	6	303025	303030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113269
6589	NC_012848	AGA	2	6	303031	303036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113269
6590	NC_012848	TTCG	2	8	303040	303047	0 %	50 %	25 %	25 %	241113269
6591	NC_012848	CGG	2	6	303057	303062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113269
6592	NC_012848	AG	3	6	303063	303068	50 %	0 %	50 %	0 %	241113269
6593	NC_012848	CT	3	6	303153	303158	0 %	50 %	0 %	50 %	241113269
6594	NC_012848	AGG	2	6	303202	303207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113269
6595	NC_012848	CAC	2	6	303211	303216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113269
6596	NC_012848	GAG	2	6	303299	303304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113269
6597	NC_012848	TG	3	6	303384	303389	0 %	50 %	50 %	0 %	241113269
6598	NC_012848	AACG	2	8	303465	303472	50 %	0 %	25 %	25 %	241113269
6599	NC_012848	GGA	2	6	303496	303501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113269
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6601	NC_012848	CGC	2	6	303605	303610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113269
6602	NC_012848	GCA	2	6	303715	303720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113269
6603	NC_012848	TCG	2	6	303756	303761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113269
6604	NC_012848	AGC	2	6	303762	303767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113269
6605	NC_012848	CTT	2	6	303799	303804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113269
6606	NC_012848	CAGCG	2	10	303875	303884	20 %	0 %	40 %	40 %	241113269
6607	NC_012848	CGA	2	6	303917	303922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113269
6608	NC_012848	CTCGC	2	10	303968	303977	0 %	20 %	20 %	60 %	241113269
6609	NC_012848	ACAGG	2	10	303979	303988	40 %	0 %	40 %	20 %	241113269
6610	NC_012848	CCT	2	6	304027	304032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113269
6611	NC_012848	GCCG	2	8	304062	304069	0 %	0 %	50 %	50 %	241113269
6612	NC_012848	TCT	2	6	304087	304092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113269
6613	NC_012848	CAT	2	6	304093	304098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113269
6614	NC_012848	ACT	2	6	304115	304120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_012848	TCC	2	6	304170	304175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_012848	CAA	2	6	304201	304206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_012848	CCA	2	6	304230	304235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_012848	AGA	2	6	304294	304299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_012848	AGC	2	6	304404	304409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113270
6620	NC_012848	GAT	2	6	304420	304425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113270
6621	NC_012848	AC	3	6	304465	304470	50 %	0 %	0 %	50 %	241113270
6622	NC_012848	TG	3	6	304524	304529	0 %	50 %	50 %	0 %	241113270
6623	NC_012848	GGC	2	6	304530	304535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113270
6624	NC_012848	CG	3	6	304624	304629	0 %	0 %	50 %	50 %	241113271
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6632	NC_012848	AAGCC	2	10	305240	305249	40 %	0 %	20 %	40 %	241113271
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6992	NC_012848	T	6	6	324116	324121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6993	NC_012848	TCA	2	6	324228	324233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113287
6994	NC_012848	GCC	2	6	324279	324284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113287
6995	NC_012848	ACG	2	6	324300	324305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113287
6996	NC_012848	TGA	2	6	324405	324410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113287
6997	NC_012848	AAG	2	6	324420	324425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113287
6998	NC_012848	CG	3	6	324457	324462	0 %	0 %	50 %	50 %	241113287
6999	NC_012848	GGAT	2	8	324538	324545	25 %	25 %	50 %	0 %	241113287
7000	NC_012848	GTG	2	6	324567	324572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113287

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