MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 32761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
2	NC_012730	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650214
3	NC_012730	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
4	NC_012730	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
5	NC_012730	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	238650214
6	NC_012730	AAT	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
7	NC_012730	ATG	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650214
8	NC_012730	ATA	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
9	NC_012730	GTA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650214
10	NC_012730	TTA	2	6	590	595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
11	NC_012730	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650214
12	NC_012730	TAA	2	6	779	784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
13	NC_012730	AT	3	6	790	795	50 %	50 %	0 %	0 %	238650214
14	NC_012730	A	6	6	804	809	100 %	0 %	0 %	0 %	238650214
15	NC_012730	ATA	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
16	NC_012730	ATT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012730	TTTA	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012730	TGT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012730	TGT	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012730	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650215
21	NC_012730	AAAGTA	2	12	1190	1201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650215
22	NC_012730	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650215
23	NC_012730	GTA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650215
24	NC_012730	CAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650215
25	NC_012730	A	7	7	1320	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	238650215
26	NC_012730	TAA	2	6	1345	1350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650215
27	NC_012730	ATTT	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012730	TCT	2	6	1465	1470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650216
29	NC_012730	A	6	6	1473	1478	100 %	0 %	0 %	0 %	238650216
30	NC_012730	TC	3	6	1483	1488	0 %	50 %	0 %	50 %	238650216
31	NC_012730	A	6	6	1543	1548	100 %	0 %	0 %	0 %	238650216
32	NC_012730	AT	3	6	1608	1613	50 %	50 %	0 %	0 %	238650216
33	NC_012730	TA	3	6	1726	1731	50 %	50 %	0 %	0 %	238650216
34	NC_012730	ATA	3	9	1729	1737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650216
35	NC_012730	A	7	7	1755	1761	100 %	0 %	0 %	0 %	238650216
36	NC_012730	GTA	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650216
37	NC_012730	TGA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650216
38	NC_012730	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650216
39	NC_012730	AAT	2	6	1982	1987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650216
40	NC_012730	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650216
41	NC_012730	TTA	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650216
42	NC_012730	CAA	3	9	2100	2108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650216
43	NC_012730	T	8	8	2132	2139	0 %	100 %	0 %	0 %	238650217
44	NC_012730	A	6	6	2142	2147	100 %	0 %	0 %	0 %	238650217
45	NC_012730	T	6	6	2207	2212	0 %	100 %	0 %	0 %	238650217
46	NC_012730	T	6	6	2267	2272	0 %	100 %	0 %	0 %	238650217
47	NC_012730	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	238650217
48	NC_012730	GA	3	6	2294	2299	50 %	0 %	50 %	0 %	238650217
49	NC_012730	GGT	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238650217
50	NC_012730	AGC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650217
51	NC_012730	ATA	2	6	2397	2402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
52	NC_012730	A	7	7	2402	2408	100 %	0 %	0 %	0 %	238650217
53	NC_012730	T	7	7	2426	2432	0 %	100 %	0 %	0 %	238650217
54	NC_012730	TA	3	6	2458	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	238650217
55	NC_012730	TTTTA	2	10	2498	2507	20 %	80 %	0 %	0 %	238650217
56	NC_012730	ATA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
57	NC_012730	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
58	NC_012730	TG	3	6	2574	2579	0 %	50 %	50 %	0 %	238650217
59	NC_012730	TTAT	2	8	2659	2666	25 %	75 %	0 %	0 %	238650217
60	NC_012730	AT	3	6	2718	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	238650217
61	NC_012730	ATG	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650217
62	NC_012730	TAT	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650217
63	NC_012730	TTA	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650217
64	NC_012730	ATTTA	2	10	2851	2860	40 %	60 %	0 %	0 %	238650217
65	NC_012730	TTAT	2	8	2881	2888	25 %	75 %	0 %	0 %	238650217
66	NC_012730	A	6	6	2945	2950	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
67	NC_012730	CTC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238650218
68	NC_012730	TC	3	6	3031	3036	0 %	50 %	0 %	50 %	238650218
69	NC_012730	ATT	2	6	3038	3043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
70	NC_012730	ATT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
71	NC_012730	T	6	6	3094	3099	0 %	100 %	0 %	0 %	238650218
72	NC_012730	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
73	NC_012730	A	7	7	3208	3214	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
74	NC_012730	A	6	6	3225	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
75	NC_012730	AACT	2	8	3264	3271	50 %	25 %	0 %	25 %	238650218
76	NC_012730	CAAA	2	8	3310	3317	75 %	0 %	0 %	25 %	238650218
77	NC_012730	AGA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
78	NC_012730	AGA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
79	NC_012730	AGC	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
80	NC_012730	TGC	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
81	NC_012730	TG	3	6	3399	3404	0 %	50 %	50 %	0 %	238650218
82	NC_012730	A	7	7	3479	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
83	NC_012730	A	7	7	3498	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
84	NC_012730	GA	3	6	3506	3511	50 %	0 %	50 %	0 %	238650218
85	NC_012730	T	6	6	3535	3540	0 %	100 %	0 %	0 %	238650218
86	NC_012730	ATT	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
87	NC_012730	TATT	2	8	3577	3584	25 %	75 %	0 %	0 %	238650218
88	NC_012730	GAG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
89	NC_012730	TCGC	2	8	3707	3714	0 %	25 %	25 %	50 %	238650218
90	NC_012730	A	6	6	3750	3755	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
91	NC_012730	TAT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
92	NC_012730	GCA	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
93	NC_012730	AGA	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
94	NC_012730	AT	3	6	3968	3973	50 %	50 %	0 %	0 %	238650218
95	NC_012730	CTA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
96	NC_012730	TAT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
97	NC_012730	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
98	NC_012730	GGTCA	2	10	4098	4107	20 %	20 %	40 %	20 %	238650218
99	NC_012730	TGT	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650218
100	NC_012730	AT	3	6	4278	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	238650218
101	NC_012730	AG	3	6	4297	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	238650218
102	NC_012730	ATA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
103	NC_012730	TA	3	6	4385	4390	50 %	50 %	0 %	0 %	238650218
104	NC_012730	GGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238650218
105	NC_012730	GCA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
106	NC_012730	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
107	NC_012730	TA	3	6	4637	4642	50 %	50 %	0 %	0 %	238650218
108	NC_012730	GGA	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
109	NC_012730	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
110	NC_012730	AAG	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
111	NC_012730	AAT	2	6	4721	4726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
112	NC_012730	GAA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
113	NC_012730	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
114	NC_012730	CTA	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
115	NC_012730	TAAAT	2	10	4807	4816	60 %	40 %	0 %	0 %	238650218
116	NC_012730	GAG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
117	NC_012730	AT	3	6	4829	4834	50 %	50 %	0 %	0 %	238650218
118	NC_012730	CAAAAC	2	12	5032	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650218
119	NC_012730	GTAGT	2	10	5133	5142	20 %	40 %	40 %	0 %	238650218
120	NC_012730	AAG	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
121	NC_012730	ATA	2	6	5199	5204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
122	NC_012730	ATT	2	6	5250	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
123	NC_012730	TAA	2	6	5272	5277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
124	NC_012730	AATA	2	8	5278	5285	75 %	25 %	0 %	0 %	238650218
125	NC_012730	GAT	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650218
126	NC_012730	ATTC	2	8	5315	5322	25 %	50 %	0 %	25 %	238650218
127	NC_012730	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
128	NC_012730	T	6	6	5357	5362	0 %	100 %	0 %	0 %	238650218
129	NC_012730	ATT	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
130	NC_012730	TGC	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
131	NC_012730	CTA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
132	NC_012730	AGT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650218
133	NC_012730	TCG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
134	NC_012730	A	7	7	5567	5573	100 %	0 %	0 %	0 %	238650218
135	NC_012730	TTG	2	6	5580	5585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650218
136	NC_012730	TTA	2	6	5609	5614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
137	NC_012730	ATA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
138	NC_012730	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
139	NC_012730	ATA	2	6	5723	5728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
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270	NC_012730	AAC	2	6	10502	10507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_012730	TTG	2	6	10610	10615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012730	ATC	2	6	10716	10721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_012730	GTT	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_012730	AGGT	2	8	10821	10828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012730	ACT	2	6	10870	10875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_012730	TTG	2	6	10885	10890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012730	CTG	2	6	10959	10964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_012730	T	6	6	10976	10981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012730	T	6	6	10990	10995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_012730	ATA	2	6	10999	11004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012730	TTA	2	6	11010	11015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_012730	TAT	2	6	11029	11034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_012730	T	6	6	11070	11075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_012730	TAA	2	6	11085	11090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_012730	CTA	2	6	11120	11125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_012730	TAA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650224
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412	NC_012730	ATT	2	6	15289	15294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650225
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427	NC_012730	ATT	2	6	15883	15888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_012730	ATT	2	6	15898	15903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012730	ATT	2	6	15922	15927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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